X-Git-Url: https://git.creatis.insa-lyon.fr/pubgit/?a=blobdiff_plain;f=src%2FgdcmDicomDir.cxx;h=1ef0feab48d1fa64c560a61a5194a753e16a280b;hb=d72e3cb0326093093f99863964f8f4df382c83e1;hp=e5cc92d0d2260d147984c2bba2a8f6325387bb38;hpb=2ca09ddbc04e1ec02aa49e8815925cceb49b2402;p=gdcm.git

diff --git a/src/gdcmDicomDir.cxx b/src/gdcmDicomDir.cxx
index e5cc92d0..1ef0feab 100644
--- a/src/gdcmDicomDir.cxx
+++ b/src/gdcmDicomDir.cxx
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/12/07 17:28:50 $
-  Version:   $Revision: 1.89 $
+  Date:      $Date: 2005/01/08 15:03:59 $
+  Version:   $Revision: 1.97 $
   
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -38,13 +38,13 @@
 #include <sys/types.h>
 
 #ifdef _MSC_VER
-#define getcwd _getcwd
+#   define getcwd _getcwd
 #endif
 
-#if defined( _MSC_VER) || defined(__BORLANDC__)
-   #include <direct.h>
+#if defined(_MSC_VER) || defined(__BORLANDC__)
+#   include <direct.h>
 #else
-   #include <unistd.h>
+#   include <unistd.h>
 #endif
 
 namespace gdcm 
@@ -79,7 +79,7 @@ DicomDir::DicomDir()
  *                      - false if user passed an already built DICOMDIR file
  *                        and wants to use it 
  */
-DicomDir::DicomDir(std::string const & fileName, bool parseDir ):
+DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ):
    Document( fileName )
 {
    // Whatever user passed (a root directory or a DICOMDIR)
@@ -90,9 +90,9 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const & fileName, bool parseDir ):
    // if user passed a root directory, sure we didn't get anything
    if ( TagHT.begin() == TagHT.end() ) // when user passed a Directory to parse
    {
-      dbg.Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : entry HT empty");
+      gdcmVerboseMacro( "Entry HT empty");
 
-      if ( fileName.size() == 1 && fileName[0] == '.' )
+      if ( fileName == "." )
       {
          // user passed '.' as Name
          // we get current directory name
@@ -105,8 +105,7 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const & fileName, bool parseDir ):
       {
          MetaElems = NewMeta();
 
-         dbg.Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : Parse directory"
-                        " and create the DicomDir");
+         gdcmVerboseMacro( "Parse directory and create the DicomDir");
          ParseDirectory();
       }
       else
@@ -119,11 +118,10 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const & fileName, bool parseDir ):
    else // Only if user passed a DICOMDIR
    {
       // Directory record sequence
-      DocEntry *e = GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1220);
+      DocEntry *e = GetDocEntry(0x0004, 0x1220);
       if ( !e )
       {
-         dbg.Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : NO Directory record"
-                        " sequence (0x0004,0x1220)");
+         gdcmVerboseMacro( "NO Directory record sequence (0x0004,0x1220)");
          /// \todo FIXME : what do we do when the parsed file IS NOT a
          ///       DICOMDIR file ?         
       }
@@ -169,8 +167,8 @@ void DicomDir::Print(std::ostream &os)
                                      cc != Patients.end();
                                    ++cc)
    {
-     (*cc)->SetPrintLevel( PrintLevel );
-     (*cc)->Print( os );
+     (*cc)->SetPrintLevel(PrintLevel);
+     (*cc)->Print(os);
    }
 }
 
@@ -244,8 +242,8 @@ void DicomDir::ParseDirectory()
  * @param   argDelete    Argument 
  * \warning In python : the arg parameter isn't considered
  */
-void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, 
-                               DicomDir::Method* argDelete )
+void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
+                               DicomDir::Method *argDelete )
 {
    if( StartArg && StartMethodArgDelete )
    {
@@ -264,7 +262,7 @@ void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method* method, void* arg,
  *          class is destroyed
  * @param   method Method to call to delete the argument
  */
-void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) 
+void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method *method ) 
 {
    StartMethodArgDelete = method;
 }
@@ -278,8 +276,8 @@ void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method* method )
  * @param   argDelete    Argument  
  * \warning In python : the arg parameter isn't considered
  */
-void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, 
-                                  DicomDir::Method* argDelete )
+void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
+                                  DicomDir::Method *argDelete )
 {
    if( ProgressArg && ProgressMethodArgDelete )
    {
@@ -298,7 +296,7 @@ void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method* method, void* arg,
  *          class is destroyed          
  * @param   method Method to call to delete the argument
  */
-void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method* method )
+void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method *method )
 {
    ProgressMethodArgDelete = method;
 }
@@ -311,8 +309,8 @@ void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method* method )
  * @param   argDelete    Argument 
  * \warning In python : the arg parameter isn't considered
  */
-void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, 
-                             DicomDir::Method* argDelete )
+void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
+                             DicomDir::Method *argDelete )
 {
    if( EndArg && EndMethodArgDelete )
    {
@@ -331,7 +329,7 @@ void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method* method, void* arg,
  *          the class is destroyed
  * @param   method Method to call to delete the argument
  */
-void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method* method )
+void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method *method )
 {
    EndMethodArgDelete = method;
 }
@@ -348,17 +346,17 @@ void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method* method )
  * @return false only when fail to open
  */
  
-bool DicomDir::WriteDicomDir(std::string const& fileName) 
+bool DicomDir::WriteDicomDir(std::string const &fileName) 
 {  
    int i;
    uint16_t sq[4] = { 0x0004, 0x1220, 0xffff, 0xffff };
    uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0xffff, 0xffff };
 
-   std::ofstream* fp = new std::ofstream(fileName.c_str(),  
+   std::ofstream *fp = new std::ofstream(fileName.c_str(),  
                                          std::ios::out | std::ios::binary);
    if( !fp ) 
    {
-      dbg.Verbose(2, "Failed to open(write) File: ", fileName.c_str());
+      gdcmVerboseMacro("Failed to open(write) File: " << fileName.c_str());
       return false;
    }
 
@@ -425,10 +423,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const & path)
       header = new Header( it->c_str() );
       if( !header )
       {
-         dbg.Verbose( 1,
-                      "DicomDir::CreateDicomDirChainedList: "
-                      "failure in new Header ",
-                      it->c_str() );
+         gdcmVerboseMacro( "Failure in new Header " << it->c_str() );
          continue;
       }
       
@@ -436,9 +431,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const & path)
       {
          // Add the file header to the chained list:
          list.push_back(header);
-         dbg.Verbose( 1,
-                      "DicomDir::CreateDicomDirChainedList: readable ",
-                      it->c_str() );
+         gdcmVerboseMacro( "Readable " << it->c_str() );
        }
        else
        {
@@ -486,7 +479,7 @@ DicomDirMeta * DicomDir::NewMeta()
    }
    else  // after root directory parsing
    {
-      ListDicomDirMetaElem const & elemList = 
+      ListDicomDirMetaElem const &elemList = 
          Global::GetDicomDirElements()->GetDicomDirMetaElements();
       m->FillObject(elemList);
    }
@@ -497,7 +490,7 @@ DicomDirMeta * DicomDir::NewMeta()
 /**
  * \brief   adds a new Patient (with the basic elements) to a partially created DICOMDIR
  */
-DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient()
+DicomDirPatient *DicomDir::NewPatient()
 {
    ListDicomDirPatientElem::const_iterator it;
    uint16_t tmpGr,tmpEl;
@@ -513,7 +506,7 @@ DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient()
    {
       tmpGr     = it->Group;
       tmpEl     = it->Elem;
-      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntry(tmpGr, tmpEl);
       entry     = new ValEntry( dictEntry );
       entry->SetOffset(0); // just to avoid further missprinting
       entry->SetValue( it->Value );
@@ -534,7 +527,7 @@ DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient()
  *          GDCM_DICOMDIR_STUDY, GDCM_DICOMDIR_SERIE ...)
  * @param   header Header of the current file
  */
-void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
+void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
                           Document *header)
 {
    ListDicomDirElem elemList; //FIXME this is going to be a by copy operation
@@ -552,8 +545,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirImage();
          if( !AddDicomDirImageToEnd(static_cast<DicomDirImage *>(si)) )
          {
-            dbg.Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirImageToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirImageToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_SERIE:
@@ -561,8 +553,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirSerie();
          if( !AddDicomDirSerieToEnd(static_cast<DicomDirSerie *>(si)) )
          {
-            dbg.Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirSerieToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirSerieToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_STUDY:
@@ -570,8 +561,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirStudy();
          if( !AddDicomDirStudyToEnd(static_cast<DicomDirStudy *>(si)) )
          {
-            dbg.Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirStudyToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirStudyToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_PATIENT:
@@ -579,8 +569,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirPatient();
          if( !AddDicomDirPatientToEnd(static_cast<DicomDirPatient *>(si)) )
          {
-            dbg.Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirPatientToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirPatientToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_META:
@@ -588,8 +577,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirMeta();
          if( MetaElems )
          {
-            dbg.Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "MetaElements already exist, they will be destroyed");
+            gdcmVerboseMacro( "MetaElements already exist, they will be destroyed");
             delete MetaElems;
          }
          MetaElems = static_cast<DicomDirMeta *>(si);
@@ -611,7 +599,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
    {
       tmpGr     = it->Group;
       tmpEl     = it->Elem;
-      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntry(tmpGr, tmpEl);
 
       entry     = new ValEntry( dictEntry ); // Be sure it's never a BinEntry !
 
@@ -621,7 +609,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
       {
          // NULL when we Build Up (ex nihilo) a DICOMDIR
          //   or when we add the META elems
-         val = header->GetEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+         val = header->GetEntry(tmpGr, tmpEl);
       }
       else
       {
@@ -639,8 +627,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
          {
             if( header->GetFileName().substr(0, path.length()) != path )
             {
-               dbg.Verbose(0, "DicomDir::SetElement : the base path"
-                              " of file name is incorrect");
+               gdcmVerboseMacro( "The base path of file name is incorrect");
                val = header->GetFileName();
             }
             else
@@ -655,7 +642,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type,
       }
       else
       {
-         if ( header->GetEntryLengthByNumber(tmpGr,tmpEl) == 0 )
+         if ( header->GetEntryLength(tmpGr,tmpEl) == 0 )
             val = it->Value;
       }
 
@@ -728,19 +715,18 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
    //       + loop to 1 -
 
    // Directory record sequence
-   DocEntry *e = GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1220);
+   DocEntry *e = GetDocEntry(0x0004, 0x1220);
    if ( !e )
    {
-      dbg.Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : NO Directory record"
-                     " sequence (0x0004,0x1220)");
+      gdcmVerboseMacro( "NO Directory record sequence (0x0004,0x1220)");
       /// \todo FIXME: what to do when the parsed file IS NOT a DICOMDIR file ? 
       return;         
    }
    
-   SeqEntry* s = dynamic_cast<SeqEntry*>(e);
+   SeqEntry *s = dynamic_cast<SeqEntry *>(e);
    if ( !s )
    {
-      dbg.Verbose(0, "DicomDir::CreateDicomDir: no SeqEntry present");
+      gdcmVerboseMacro( "No SeqEntry present");
       // useless : (0x0004,0x1220) IS a Sequence !
       return;
    }
@@ -750,20 +736,20 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
 
    ListSQItem listItems = s->GetSQItems();
    
-   DocEntry * d;
+   DocEntry *d;
    std::string v;
-   SQItem * si;
+   SQItem *si;
    for( ListSQItem::iterator i = listItems.begin(); 
                              i !=listItems.end(); ++i ) 
    {
-      d = (*i)->GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1430); // Directory Record Type
-      if ( ValEntry* valEntry = dynamic_cast< ValEntry* >(d) )
+      d = (*i)->GetDocEntry(0x0004, 0x1430); // Directory Record Type
+      if ( ValEntry* valEntry = dynamic_cast<ValEntry *>(d) )
       {
          v = valEntry->GetValue();
       }
       else
       {
-         dbg.Verbose(0, "DicomDir::CreateDicomDir: not a ValEntry.");
+         gdcmVerboseMacro( "Not a ValEntry.");
          continue;
       }
 
@@ -819,7 +805,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirMeta()
 /**
  * \ingroup DicomDir
  * \brief  AddDicomDirPatientToEnd 
- * @param   s SQ Item to enqueue to the DicomPatient chained List
+ * @param   dd SQ Item to enqueue to the DicomPatient chained List
  */
 bool DicomDir::AddDicomDirPatientToEnd(DicomDirPatient *dd)
 {
@@ -830,7 +816,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirPatientToEnd(DicomDirPatient *dd)
 /**
  * \ingroup DicomDir
  * \brief  AddDicomDirStudyToEnd 
- * @param   s SQ Item to enqueue to the DicomDirStudy chained List
+ * @param   dd SQ Item to enqueue to the DicomDirStudy chained List
  */
 bool DicomDir::AddDicomDirStudyToEnd(DicomDirStudy *dd)
 {
@@ -847,7 +833,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirStudyToEnd(DicomDirStudy *dd)
 /**
  * \ingroup DicomDir
  * \brief  AddDicomDirSerieToEnd 
- * @param   s SQ Item to enqueue to the DicomDirSerie chained List
+ * @param   dd SQ Item to enqueue to the DicomDirSerie chained List
  */
 bool DicomDir::AddDicomDirSerieToEnd(DicomDirSerie *dd)
 {
@@ -871,7 +857,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirSerieToEnd(DicomDirSerie *dd)
 /**
  * \ingroup DicomDir
  * \brief   AddDicomDirImageToEnd
- * @param   s SQ Item to enqueue to the DicomDirImage chained List
+ * @param   dd SQ Item to enqueue to the DicomDirImage chained List
  */
 bool DicomDir::AddDicomDirImageToEnd(DicomDirImage *dd)
 {
@@ -922,12 +908,12 @@ void DicomDir::SetElements(std::string const & path, VectDocument const &list)
                                      it != list.end(); ++it )
    {
       // get the current file characteristics
-      patCurName         = (*it)->GetEntryByNumber(0x0010,0x0010);
-      patCurID           = (*it)->GetEntryByNumber(0x0010,0x0011);
-      studCurInstanceUID = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x000d);
-      studCurID          = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x0010);
-      serCurInstanceUID  = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x000e);
-      serCurID           = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x0011);
+      patCurName         = (*it)->GetEntry(0x0010,0x0010);
+      patCurID           = (*it)->GetEntry(0x0010,0x0011);
+      studCurInstanceUID = (*it)->GetEntry(0x0020,0x000d);
+      studCurID          = (*it)->GetEntry(0x0020,0x0010);
+      serCurInstanceUID  = (*it)->GetEntry(0x0020,0x000e);
+      serCurID           = (*it)->GetEntry(0x0020,0x0011);
 
       if( patCurName != patPrevName || patCurID != patPrevID || first )
       {
@@ -970,7 +956,7 @@ void DicomDir::SetElements(std::string const & path, VectDocument const &list)
  *          Only DocEntry's are moved
  * 
  */
-void DicomDir::MoveSQItem(SQItem* dst,SQItem *src)
+void DicomDir::MoveSQItem(SQItem *dst,SQItem *src)
 {
    DocEntry *entry;