X-Git-Url: https://git.creatis.insa-lyon.fr/pubgit/?a=blobdiff_plain;f=src%2FgdcmDicomDir.cxx;h=d8ca6287cfe254411d8b1f3294a3e0fd65a3410b;hb=03acf3c119c6657129b8aeae8cb2205e481a105b;hp=8394a498c1ec4d84b623e87d9c6483938efafc65;hpb=233c8b3ebb1aee6b1be6723d842eb2241b9ffb91;p=gdcm.git diff --git a/src/gdcmDicomDir.cxx b/src/gdcmDicomDir.cxx index 8394a498..d8ca6287 100644 --- a/src/gdcmDicomDir.cxx +++ b/src/gdcmDicomDir.cxx @@ -3,8 +3,8 @@ Program: gdcm Module: $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $ Language: C++ - Date: $Date: 2004/12/03 17:13:18 $ - Version: $Revision: 1.84 $ + Date: $Date: 2005/01/06 20:03:26 $ + Version: $Revision: 1.92 $ Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or @@ -20,6 +20,9 @@ #include "gdcmDicomDirStudy.h" #include "gdcmDicomDirSerie.h" #include "gdcmDicomDirImage.h" +#include "gdcmDicomDirPatient.h" +#include "gdcmDicomDirMeta.h" +#include "gdcmDicomDirElement.h" #include "gdcmDirList.h" #include "gdcmUtil.h" #include "gdcmDebug.h" @@ -76,7 +79,7 @@ DicomDir::DicomDir() * - false if user passed an already built DICOMDIR file * and wants to use it */ -DicomDir::DicomDir(std::string const & fileName, bool parseDir ): +DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ): Document( fileName ) { // Whatever user passed (a root directory or a DICOMDIR) @@ -166,8 +169,8 @@ void DicomDir::Print(std::ostream &os) cc != Patients.end(); ++cc) { - (*cc)->SetPrintLevel( PrintLevel ); - (*cc)->Print( os ); + (*cc)->SetPrintLevel(PrintLevel); + (*cc)->Print(os); } } @@ -241,8 +244,8 @@ void DicomDir::ParseDirectory() * @param argDelete Argument * \warning In python : the arg parameter isn't considered */ -void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, - DicomDir::Method* argDelete ) +void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, + DicomDir::Method *argDelete ) { if( StartArg && StartMethodArgDelete ) { @@ -261,7 +264,7 @@ void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, * class is destroyed * @param method Method to call to delete the argument */ -void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) +void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method *method ) { StartMethodArgDelete = method; } @@ -275,8 +278,8 @@ void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) * @param argDelete Argument * \warning In python : the arg parameter isn't considered */ -void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, - DicomDir::Method* argDelete ) +void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, + DicomDir::Method *argDelete ) { if( ProgressArg && ProgressMethodArgDelete ) { @@ -295,7 +298,7 @@ void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, * class is destroyed * @param method Method to call to delete the argument */ -void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) +void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method *method ) { ProgressMethodArgDelete = method; } @@ -308,8 +311,8 @@ void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) * @param argDelete Argument * \warning In python : the arg parameter isn't considered */ -void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, - DicomDir::Method* argDelete ) +void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, + DicomDir::Method *argDelete ) { if( EndArg && EndMethodArgDelete ) { @@ -328,7 +331,7 @@ void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method* method, void* arg, * the class is destroyed * @param method Method to call to delete the argument */ -void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) +void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method *method ) { EndMethodArgDelete = method; } @@ -345,13 +348,13 @@ void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method* method ) * @return false only when fail to open */ -bool DicomDir::WriteDicomDir(std::string const& fileName) +bool DicomDir::WriteDicomDir(std::string const &fileName) { int i; uint16_t sq[4] = { 0x0004, 0x1220, 0xffff, 0xffff }; uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0xffff, 0xffff }; - std::ofstream* fp = new std::ofstream(fileName.c_str(), + std::ofstream *fp = new std::ofstream(fileName.c_str(), std::ios::out | std::ios::binary); if( !fp ) { @@ -419,7 +422,6 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const & path) break; } -std::cerr<<"File : "<c_str()<c_str() ); if( !header ) { @@ -452,11 +454,11 @@ std::cerr<<"File : "<c_str()<(*it); + delete dynamic_cast
(*itDoc); } } @@ -479,12 +481,12 @@ DicomDirMeta * DicomDir::NewMeta() cc != lastOneButSequence; ++cc) { - m->AddDocEntry( cc->second ); + m->AddEntry( cc->second ); } } else // after root directory parsing { - ListDicomDirMetaElem const & elemList = + ListDicomDirMetaElem const &elemList = Global::GetDicomDirElements()->GetDicomDirMetaElements(); m->FillObject(elemList); } @@ -495,7 +497,7 @@ DicomDirMeta * DicomDir::NewMeta() /** * \brief adds a new Patient (with the basic elements) to a partially created DICOMDIR */ -DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient() +DicomDirPatient *DicomDir::NewPatient() { ListDicomDirPatientElem::const_iterator it; uint16_t tmpGr,tmpEl; @@ -516,29 +518,7 @@ DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient() entry->SetOffset(0); // just to avoid further missprinting entry->SetValue( it->Value ); - // dealing with value length ... - - if( dictEntry->GetGroup() == 0xfffe) - { - entry->SetLength(entry->GetValue().length()); - } - else if( dictEntry->GetVR() == "UL" || dictEntry->GetVR() == "SL" ) - { - entry->SetLength( 4 ); - } - else if( dictEntry->GetVR() == "US" || dictEntry->GetVR() == "SS" ) - { - entry->SetLength(2); - } - else if( dictEntry->GetVR() == "SQ" ) - { - entry->SetLength( 0xffffffff ); - } - else - { - entry->SetLength( entry->GetValue().length() ); - } - p->AddDocEntry( entry ); + p->AddEntry( entry ); } Patients.push_front( p ); @@ -554,7 +534,7 @@ DicomDirPatient * DicomDir::NewPatient() * GDCM_DICOMDIR_STUDY, GDCM_DICOMDIR_SERIE ...) * @param header Header of the current file */ -void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type, +void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type, Document *header) { ListDicomDirElem elemList; //FIXME this is going to be a by copy operation @@ -636,7 +616,6 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type, entry = new ValEntry( dictEntry ); // Be sure it's never a BinEntry ! entry->SetOffset(0); // just to avoid further missprinting - entry->SetLength(0); // just to avoid further missprinting if( header ) { @@ -680,34 +659,8 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const & path, DicomDirType type, val = it->Value; } - // GDCM_UNFOUND or not ! - entry->SetValue( val ); // troubles expected when vr=SQ ... - if( dictEntry ) - { - if( dictEntry->GetGroup() == 0xfffe ) - { - entry->SetLength( entry->GetValue().length() ); // FIXME - } - else if( dictEntry->GetVR() == "UL" || dictEntry->GetVR() == "SL" ) - { - entry->SetLength(4); - } - else if( dictEntry->GetVR() == "US" || dictEntry->GetVR() == "SS" ) - { - entry->SetLength(2); - } - else if( dictEntry->GetVR() == "SQ" ) - { - entry->SetLength( 0xffffffff ); - } - else - { - entry->SetLength( entry->GetValue().length() ); - } - } - if ( type == GDCM_DICOMDIR_META ) // fusible : should never print ! { std::cout << "GDCM_DICOMDIR_META ?!? should never print that" @@ -784,7 +737,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDir() return; } - SeqEntry* s = dynamic_cast(e); + SeqEntry *s = dynamic_cast(e); if ( !s ) { dbg.Verbose(0, "DicomDir::CreateDicomDir: no SeqEntry present"); @@ -797,14 +750,14 @@ void DicomDir::CreateDicomDir() ListSQItem listItems = s->GetSQItems(); - DocEntry * d; + DocEntry *d; std::string v; - SQItem * si; + SQItem *si; for( ListSQItem::iterator i = listItems.begin(); i !=listItems.end(); ++i ) { d = (*i)->GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1430); // Directory Record Type - if ( ValEntry* valEntry = dynamic_cast< ValEntry* >(d) ) + if ( ValEntry* valEntry = dynamic_cast(d) ) { v = valEntry->GetValue(); } @@ -866,7 +819,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirMeta() /** * \ingroup DicomDir * \brief AddDicomDirPatientToEnd - * @param s SQ Item to enqueue to the DicomPatient chained List + * @param dd SQ Item to enqueue to the DicomPatient chained List */ bool DicomDir::AddDicomDirPatientToEnd(DicomDirPatient *dd) { @@ -877,7 +830,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirPatientToEnd(DicomDirPatient *dd) /** * \ingroup DicomDir * \brief AddDicomDirStudyToEnd - * @param s SQ Item to enqueue to the DicomDirStudy chained List + * @param dd SQ Item to enqueue to the DicomDirStudy chained List */ bool DicomDir::AddDicomDirStudyToEnd(DicomDirStudy *dd) { @@ -894,7 +847,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirStudyToEnd(DicomDirStudy *dd) /** * \ingroup DicomDir * \brief AddDicomDirSerieToEnd - * @param s SQ Item to enqueue to the DicomDirSerie chained List + * @param dd SQ Item to enqueue to the DicomDirSerie chained List */ bool DicomDir::AddDicomDirSerieToEnd(DicomDirSerie *dd) { @@ -918,7 +871,7 @@ bool DicomDir::AddDicomDirSerieToEnd(DicomDirSerie *dd) /** * \ingroup DicomDir * \brief AddDicomDirImageToEnd - * @param s SQ Item to enqueue to the DicomDirImage chained List + * @param dd SQ Item to enqueue to the DicomDirImage chained List */ bool DicomDir::AddDicomDirImageToEnd(DicomDirImage *dd) { @@ -1017,7 +970,7 @@ void DicomDir::SetElements(std::string const & path, VectDocument const &list) * Only DocEntry's are moved * */ -void DicomDir::MoveSQItem(SQItem* dst,SQItem *src) +void DicomDir::MoveSQItem(SQItem *dst,SQItem *src) { DocEntry *entry;