X-Git-Url: https://git.creatis.insa-lyon.fr/pubgit/?a=blobdiff_plain;f=src%2FgdcmElValSet.cxx;h=184513937ae20f2cb8680e81c5c217d3c05ae638;hb=f41fb331c46df02fd4e284960f0473d7155573a2;hp=6c140ae11eac05b9ac122a172d0497d1ee198bbb;hpb=1f5594f4e2bc55ccc70ff04cd66acc7cd8da74c8;p=gdcm.git diff --git a/src/gdcmElValSet.cxx b/src/gdcmElValSet.cxx index 6c140ae1..18451393 100644 --- a/src/gdcmElValSet.cxx +++ b/src/gdcmElValSet.cxx @@ -1,13 +1,10 @@ -// $Header: /cvs/public/gdcm/src/Attic/gdcmElValSet.cxx,v 1.17 2003/03/12 21:33:20 frog Exp $ +// gdcmElValSet.cxx +#include #include "gdcmUtil.h" #include "gdcmElValSet.h" -#include -static void Tokenize (const string& str, vector& tokens, const string& delimiters = " "); - - TagElValueHT & gdcmElValSet::GetTagHt(void) { return tagHt; } @@ -17,6 +14,26 @@ void gdcmElValSet::Add(gdcmElValue * newElValue) { NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue; } +// TODO : faire un gdcmElValSet::ReplaceOrCreate qui remplace si ça existe, qui cree sinon + +void gdcmElValSet::ReplaceOrCreate(gdcmElValue * newElValue) { + + TagKey key = newElValue->GetKey(); + + if (tagHt.count(key) > 1) + dbg.Verbose(0, "gdcmElValSet::GetElValueByNumber", + "multiple entries for this key (FIXME) !"); + + if (tagHt.count(key)) { + tagHt.erase(key); + tagHt.erase(newElValue->GetName()); + } + + tagHt [key] = newElValue; + NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue; +} + + void gdcmElValSet::Print(ostream & os) { for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin(); tag != tagHt.end(); @@ -24,7 +41,9 @@ void gdcmElValSet::Print(ostream & os) { os << tag->first << ": "; os << "[" << tag->second->GetValue() << "]"; os << "[" << tag->second->GetName() << "]"; - os << "[" << tag->second->GetVR() << "]" << endl; + os << "[" << tag->second->GetVR() << "]"; + os << " lgr : " << tag->second->GetLength(); + os << endl; } } @@ -111,6 +130,23 @@ int gdcmElValSet::SetElValueByName(string content, string TagName) { return(1); } +/** + * \ingroup gdcmElValSet + * \brief Generate a free TagKey i.e. a TagKey that is not present + * in the TagHt dictionary. One of the potential usage is + * to add gdcm generated additional informartion to the ElValSet + * (see gdcmHeader::AddAndDefaultElements). + * @param group The generated tag must belong to this group. + * @return The element of tag with given group which is fee. + */ +guint32 gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup(guint32 group) { + for (guint32 elem = 0; elem < UINT32_MAX; elem++) { + TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, elem); + if (tagHt.count(key) == 0) + return elem; + } + return UINT32_MAX; +} int gdcmElValSet::SetElValueLengthByNumber(guint32 l, guint32 group, guint32 element) { @@ -122,8 +158,6 @@ int gdcmElValSet::SetElValueLengthByNumber(guint32 l, "multiple entries for this key (FIXME) !"); return (0); } - // FIXME JPR: comments in English please ! - // m à j LgrElem tagHt[key]->SetLength(l); return(1); } @@ -141,6 +175,8 @@ int gdcmElValSet::SetElValueLengthByName(guint32 l, string TagName) { return(1); } +// Sorry for the DEBUG's, but tomorow is gonna be hoter than today +#define DEBUG 0 int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) { @@ -153,17 +189,18 @@ int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) { guint32 val_uint32; gint32 val_int32; guint16 val_uint16; - gint16 val_int16; + gint16 val_int16;; vector tokens; void *ptr; char str_lgrCalcGroupe[10]; + string implicitVRTransfertSyntax = "1.2.840.10008.1.2"; // Utilisées pour le calcul Group Length - int deja = 0; + int deja = 0, prem=0; guint32 lgrCalcGroupe=0; gdcmElValue *elem, *elemZ, *elemZPrec; guint16 grCourant = 0; @@ -179,60 +216,77 @@ int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) { // // cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c - if (0) // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment! +if (1) { // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment! + + // On fait de l'implicit VR little Endian + // (pour moins se fairche sur processeur INTEL) + // On force le TRANSFERT SYNTAX UID + + SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010); + SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010); // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas + + TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin(); - for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin(); + elem = tag->second; + gr = elem->GetGroup(); + el = elem->GetElement(); + + if (el != 0x0000) { + if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO premiere fois\n"); + gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); + elemZPrec = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree + elemZPrec->SetLength(4); + Add(elemZPrec); // On l'accroche à sa place + } else { + elemZPrec = elem; + if(DEBUG)printf("Pas d'ajout elem OOOO premiere fois\n"); + } + lgrCalcGroupe = 0; + if(DEBUG)printf("init-1 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); + grCourant = gr; + + for (tag = ++tagHt.begin(); tag != tagHt.end(); ++tag){ - + elem = tag->second; - printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength()); - - if ( (elem->GetGroup() != grCourant) && - (elem->GetGroup() != 0xfffe) ) { // On arrive sur un nv Groupe - - printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement()); - - elemZ = elem; - - if(elemZ->GetElement() != 0x0000) { // pas d'element 'Lgr groupe' - // On crée - gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL"); + gr = elem->GetGroup(); + el = elem->GetElement(); + + if ( (gr != grCourant) /*&& // On arrive sur un nv Groupe + (el != 0xfffe) */ ) { + + if (el != 0x0000) { + gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); elemZ = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree elemZ->SetLength(4); - Add(elemZ); // On l'accroche à sa place - } - - if (deja) { - //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe); - elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe); - lgrCalcGroupe = 0; + Add(elemZ); // On l'accroche à sa place + if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO pour gr %04x\n",gr); + } else { + elemZ=elem; + if(DEBUG)printf("maj elmeZ\n"); } - deja = 1; - - lgrCalcGroupe = 12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe - printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe); - elemZPrec = elemZ; - grCourant = elem->GetGroup(); - - } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe - - printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength()); - - lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem - - printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe); + ostringstream fock; + fock << lgrCalcGroupe; + //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe); + elemZPrec->SetValue(fock.str()); + if(DEBUG)printf("ecriture lgr (%d, %s) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, fock.str().c_str(), grCourant); + if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s]\n",elemZPrec->GetGroup(), elemZPrec->GetElement(),elemZPrec->GetValue().c_str()); + if(DEBUG)cout << "Addresse elemZPrec " << elemZPrec<< endl; + elemZPrec=elemZ; + lgrCalcGroupe = 0; + grCourant = gr; + if(DEBUG)printf("init-2 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); + } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe + lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem + if(DEBUG)printf("increment (%d) el %04x-->lgr (%d) pour gr %04x\n",elem->GetLength(), el, lgrCalcGroupe, gr); } } - // Si on fait de l'implicit VR little Endian - // (pour moins se fairche sur processeur INTEL) - // penser a forcer le TRANSFERT SYNTAX UID - - SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010); - SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010); // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas - +} // fin if (1) + + // restent à tester les echecs en écriture (apres chaque fwrite) for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin(); @@ -244,6 +298,7 @@ int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) { lgr = tag2->second->GetLength(); val = tag2->second->GetValue().c_str(); vr = tag2->second->GetVR(); + if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val); fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //group fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //element @@ -252,47 +307,28 @@ int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) { // si on n'est pas en IMPLICIT VR voir pb (lgr + VR) - fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); //lgr + fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); //lgr tokens.erase(tokens.begin(),tokens.end()); Tokenize (tag2->second->GetValue(), tokens, "\\"); - //printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val); //if (tokens.size() > 1) { printf ("size : %d\n",tokens.size());} - if (vr == "US" || vr == "SS") { - /* - val_int16 = atoi(val); - ptr = &val_int16; - fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); - continue; - */ - for (unsigned int i=0; isecond; + gr = elem->GetGroup(); + el = elem->GetElement(); + + if (el != 0x0000) { + if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO premiere fois\n"); + gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); + elemZPrec = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree + elemZPrec->SetLength(4); + Add(elemZPrec); // On l'accroche à sa place + } else { + elemZPrec = elem; + if(DEBUG)printf("Pas d'ajout elem OOOO premiere fois\n"); + } + lgrCalcGroupe = 0; + if(DEBUG)printf("init-1 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); + grCourant = gr; + + for (tag = ++tagHt.begin(); tag != tagHt.end(); ++tag){ - + elem = tag->second; - //printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength()); - - if ( (elem->GetGroup() != grCourant) && - (elem->GetGroup() != 0xfffe) ) { // On arrive sur un nv Groupe - - //printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement()); - - elemZ = elem; - - if(elemZ->GetElement() != 0x0000) { // pas d'element 'Lgr groupe' - // On crée - gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL"); + gr = elem->GetGroup(); + el = elem->GetElement(); + + if ( (gr != grCourant) /*&& // On arrive sur un nv Groupe + (el != 0xfffe) */ ) { + + if (el != 0x0000) { + gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); elemZ = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree elemZ->SetLength(4); - Add(elemZ); // On l'accroche à sa place - } - - if (deja) { - //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe); - elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe); - lgrCalcGroupe = 0; + Add(elemZ); // On l'accroche à sa place + if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO pour gr %04x\n",gr); + } else { + elemZ=elem; + if(DEBUG)printf("maj elmeZ\n"); } - deja = 1; - lgrCalcGroupe = 12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe - //printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe); - - elemZPrec = elemZ; - grCourant = elem->GetGroup(); - - } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe - - //printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength()); - - lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem - - //printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe); + ostringstream fock; + fock << lgrCalcGroupe; + //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe); + elemZPrec->SetValue(fock.str()); + if(DEBUG)printf("ecriture lgr (%d, %s) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, fock.str().c_str(), grCourant); + if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s]\n",elemZPrec->GetGroup(), elemZPrec->GetElement(),elemZPrec->GetValue().c_str()); + if(DEBUG)cout << "Addresse elemZPrec " << elemZPrec<< endl; + elemZPrec=elemZ; + lgrCalcGroupe = 0; + grCourant = gr; + if(DEBUG)printf("init-2 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); + } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe + lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem + if(DEBUG)printf("increment (%d) el %04x-->lgr (%d) pour gr %04x\n",elem->GetLength(), el, lgrCalcGroupe, gr); } } @@ -457,19 +507,3 @@ int gdcmElValSet::WriteAcr(FILE * _fp) { return(1); } - - - - -// mettre ça dans une bibliothèque d'utilitaires ? -// ca peut servir - -static void Tokenize (const string& str, vector& tokens, const string& delimiters = " ") { - string::size_type lastPos = str.find_first_not_of(delimiters,0); - string::size_type pos = str.find_first_of(delimiters,lastPos); - while (string::npos != pos || string::npos != lastPos) { - tokens.push_back(str.substr(lastPos, pos - lastPos)); - lastPos = str.find_first_not_of(delimiters, pos); - pos = str.find_first_of(delimiters, lastPos); - } -}