]> Creatis software - gdcm.git/commitdiff
* Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
authorfrog <frog>
Wed, 19 Feb 2003 23:37:47 +0000 (23:37 +0000)
committerfrog <frog>
Wed, 19 Feb 2003 23:37:47 +0000 (23:37 +0000)
        README file for usage added.
      * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
        test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
        testing the proper parsing of a Dicom related file.
        testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
      * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
      * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
        - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
          whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
          Dicom public dictionnary were not accessible without an
          instance of class gdcmHeader.
        - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
          require no instances at all to be invocated.
        - within gdcmDictSet this change required to change some method
          to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
          (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
      * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
        the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
      * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
        the above to be effective.
      * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
        for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
      * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
        configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
        contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
        Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
        (for python dectection).
      * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
        now avoids publishing the empty entries.   --- Frog

15 files changed:
ChangeLog
Dicts/dicomV3.dic
Doc/.cvsignore [new file with mode: 0644]
Doc/Doxyfile [new file with mode: 0644]
Doc/README [new file with mode: 0644]
INSTALL
README
TODO
Testing/.cvsignore
Testing/ExceptionAndPython/.cvsignore
Testing/ExceptionAndPython/README
Testing/TestBug.cxx [new file with mode: 0644]
src/gdcm.h
src/gdcmDictSet.cxx
src/gdcmHeader.cxx

index 239493043c040652fcd33a23d313548129b4bdae..450accfc539f2645da88c7bbf3bc80af22c785e7 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,3 +1,39 @@
+2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+      * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
+        looks like we can move back to original usage of exception within
+        src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
+        as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
+      * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
+        README file for usage added.
+      * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
+        test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
+        testing the proper parsing of a Dicom related file.
+        testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
+      * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
+      * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
+        - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
+          whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
+          Dicom public dictionnary were not accessible without an
+          instance of class gdcmHeader.
+        - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
+          require no instances at all to be invocated.
+        - within gdcmDictSet this change required to change some method
+          to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
+          (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
+      * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
+        the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
+      * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
+        the above to be effective.
+      * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
+        for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
+      * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
+        configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
+        contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
+        Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
+        (for python dectection).
+      * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
+        now avoids publishing the empty entries.
+
 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
         ExtraPath reused :-P
 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
         ExtraPath reused :-P
index 48c9e41804965eda7a88cb1752c20dccb4589460..25b94a9796414ab3542bd9744e2ccde2b2e2ece2 100644 (file)
@@ -2,7 +2,7 @@
 0000 0002 UI CMD Affected SOP Class UID
 0000 0003 UI CMD Requested SOP Class UID
 0000 0100 US CMD Command Field
 0000 0002 UI CMD Affected SOP Class UID
 0000 0003 UI CMD Requested SOP Class UID
 0000 0100 US CMD Command Field
-0000 0110 US CMD Message ID
+0000 0110 US CMD Message ID (first)
 0000 0120 US CMD Message ID Responded to
 0000 0600 AE CMD Move Destination
 0000 0700 US CMD Priority
 0000 0120 US CMD Message ID Responded to
 0000 0600 AE CMD Move Destination
 0000 0700 US CMD Priority
@@ -20,7 +20,7 @@
 0000 1022 US CMD Failed Suboperations
 0000 1023 US CMD Warning Suboperations
 0000 1030 AE CMD AE Title
 0000 1022 US CMD Failed Suboperations
 0000 1023 US CMD Warning Suboperations
 0000 1030 AE CMD AE Title
-0000 1031 US CMD Message ID
+0000 1031 US CMD Message ID (second)
 0000 1005 AT CMD Attribute Identifier List
 0002 0000 UL META Meta Group Length
 0002 0001 OB META File Meta Information Version
 0000 1005 AT CMD Attribute Identifier List
 0002 0000 UL META Meta Group Length
 0002 0001 OB META File Meta Information Version
diff --git a/Doc/.cvsignore b/Doc/.cvsignore
new file mode 100644 (file)
index 0000000..1936cc1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1 @@
+html
diff --git a/Doc/Doxyfile b/Doc/Doxyfile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e2bceaa
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,921 @@
+# Doxyfile 1.2.14
+
+# This file describes the settings to be used by the documentation system
+# doxygen (www.doxygen.org) for a project
+#
+# All text after a hash (#) is considered a comment and will be ignored
+# The format is:
+#       TAG = value [value, ...]
+# For lists items can also be appended using:
+#       TAG += value [value, ...]
+# Values that contain spaces should be placed between quotes (" ")
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# General configuration options
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The PROJECT_NAME tag is a single word (or a sequence of words surrounded 
+# by quotes) that should identify the project.
+
+PROJECT_NAME           = gdcm
+
+# The PROJECT_NUMBER tag can be used to enter a project or revision number. 
+# This could be handy for archiving the generated documentation or 
+# if some version control system is used.
+
+PROJECT_NUMBER         = 
+
+# The OUTPUT_DIRECTORY tag is used to specify the (relative or absolute) 
+# base path where the generated documentation will be put. 
+# If a relative path is entered, it will be relative to the location 
+# where doxygen was started. If left blank the current directory will be used.
+
+OUTPUT_DIRECTORY       = 
+
+# The OUTPUT_LANGUAGE tag is used to specify the language in which all 
+# documentation generated by doxygen is written. Doxygen will use this 
+# information to generate all constant output in the proper language. 
+# The default language is English, other supported languages are: 
+# Brazilian, Chinese, Croatian, Czech, Danish, Dutch, Finnish, French, 
+# German, Greek, Hungarian, Italian, Japanese, Korean, Norwegian, Polish, 
+# Portuguese, Romanian, Russian, Slovak, Slovene, Spanish and Swedish.
+
+OUTPUT_LANGUAGE        = English
+
+# If the EXTRACT_ALL tag is set to YES doxygen will assume all entities in 
+# documentation are documented, even if no documentation was available. 
+# Private class members and static file members will be hidden unless 
+# the EXTRACT_PRIVATE and EXTRACT_STATIC tags are set to YES
+
+EXTRACT_ALL            = YES
+
+# If the EXTRACT_PRIVATE tag is set to YES all private members of a class 
+# will be included in the documentation.
+
+EXTRACT_PRIVATE        = YES
+
+# If the EXTRACT_STATIC tag is set to YES all static members of a file 
+# will be included in the documentation.
+
+EXTRACT_STATIC         = YES
+
+# If the EXTRACT_LOCAL_CLASSES tag is set to YES classes (and structs) 
+# defined locally in source files will be included in the documentation. 
+# If set to NO only classes defined in header files are included.
+
+EXTRACT_LOCAL_CLASSES  = YES
+
+# If the HIDE_UNDOC_MEMBERS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# undocumented members of documented classes, files or namespaces. 
+# If set to NO (the default) these members will be included in the 
+# various overviews, but no documentation section is generated. 
+# This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
+
+HIDE_UNDOC_MEMBERS     = NO
+
+# If the HIDE_UNDOC_CLASSES tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# undocumented classes that are normally visible in the class hierarchy. 
+# If set to NO (the default) these class will be included in the various 
+# overviews. This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
+
+HIDE_UNDOC_CLASSES     = NO
+
+# If the BRIEF_MEMBER_DESC tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# include brief member descriptions after the members that are listed in 
+# the file and class documentation (similar to JavaDoc). 
+# Set to NO to disable this.
+
+BRIEF_MEMBER_DESC      = YES
+
+# If the REPEAT_BRIEF tag is set to YES (the default) Doxygen will prepend 
+# the brief description of a member or function before the detailed description. 
+# Note: if both HIDE_UNDOC_MEMBERS and BRIEF_MEMBER_DESC are set to NO, the 
+# brief descriptions will be completely suppressed.
+
+REPEAT_BRIEF           = YES
+
+# If the ALWAYS_DETAILED_SEC and REPEAT_BRIEF tags are both set to YES then 
+# Doxygen will generate a detailed section even if there is only a brief 
+# description.
+
+ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
+
+# If the INLINE_INHERITED_MEMB tag is set to YES, doxygen will show all inherited 
+# members of a class in the documentation of that class as if those members were 
+# ordinary class members. Constructors, destructors and assignment operators of 
+# the base classes will not be shown.
+
+INLINE_INHERITED_MEMB  = YES
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
+# path before files name in the file list and in the header files. If set 
+# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used.
+
+FULL_PATH_NAMES        = NO
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then the STRIP_FROM_PATH tag 
+# can be used to strip a user defined part of the path. Stripping is 
+# only done if one of the specified strings matches the left-hand part of 
+# the path. It is allowed to use relative paths in the argument list.
+
+STRIP_FROM_PATH        = 
+
+# The INTERNAL_DOCS tag determines if documentation 
+# that is typed after a \internal command is included. If the tag is set 
+# to NO (the default) then the documentation will be excluded. 
+# Set it to YES to include the internal documentation.
+
+INTERNAL_DOCS          = NO
+
+# Setting the STRIP_CODE_COMMENTS tag to YES (the default) will instruct 
+# doxygen to hide any special comment blocks from generated source code 
+# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible.
+
+STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
+
+# If the CASE_SENSE_NAMES tag is set to NO then Doxygen will only generate 
+# file names in lower case letters. If set to YES upper case letters are also 
+# allowed. This is useful if you have classes or files whose names only differ 
+# in case and if your file system supports case sensitive file names. Windows 
+# users are adviced to set this option to NO.
+
+CASE_SENSE_NAMES       = YES
+
+# If the SHORT_NAMES tag is set to YES, doxygen will generate much shorter 
+# (but less readable) file names. This can be useful is your file systems 
+# doesn't support long names like on DOS, Mac, or CD-ROM.
+
+SHORT_NAMES            = NO
+
+# If the HIDE_SCOPE_NAMES tag is set to NO (the default) then Doxygen 
+# will show members with their full class and namespace scopes in the 
+# documentation. If set to YES the scope will be hidden.
+
+HIDE_SCOPE_NAMES       = NO
+
+# If the VERBATIM_HEADERS tag is set to YES (the default) then Doxygen 
+# will generate a verbatim copy of the header file for each class for 
+# which an include is specified. Set to NO to disable this.
+
+VERBATIM_HEADERS       = YES
+
+# If the SHOW_INCLUDE_FILES tag is set to YES (the default) then Doxygen 
+# will put list of the files that are included by a file in the documentation 
+# of that file.
+
+SHOW_INCLUDE_FILES     = YES
+
+# If the JAVADOC_AUTOBRIEF tag is set to YES then Doxygen 
+# will interpret the first line (until the first dot) of a JavaDoc-style 
+# comment as the brief description. If set to NO, the JavaDoc 
+# comments  will behave just like the Qt-style comments (thus requiring an 
+# explict @brief command for a brief description.
+
+JAVADOC_AUTOBRIEF      = NO
+
+# If the INHERIT_DOCS tag is set to YES (the default) then an undocumented 
+# member inherits the documentation from any documented member that it 
+# reimplements.
+
+INHERIT_DOCS           = YES
+
+# If the INLINE_INFO tag is set to YES (the default) then a tag [inline] 
+# is inserted in the documentation for inline members.
+
+INLINE_INFO            = YES
+
+# If the SORT_MEMBER_DOCS tag is set to YES (the default) then doxygen 
+# will sort the (detailed) documentation of file and class members 
+# alphabetically by member name. If set to NO the members will appear in 
+# declaration order.
+
+SORT_MEMBER_DOCS       = YES
+
+# If member grouping is used in the documentation and the DISTRIBUTE_GROUP_DOC 
+# tag is set to YES, then doxygen will reuse the documentation of the first 
+# member in the group (if any) for the other members of the group. By default 
+# all members of a group must be documented explicitly.
+
+DISTRIBUTE_GROUP_DOC   = NO
+
+# The TAB_SIZE tag can be used to set the number of spaces in a tab. 
+# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments.
+
+TAB_SIZE               = 8
+
+# The GENERATE_TODOLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the todo list. This list is created by putting \todo 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_TODOLIST      = YES
+
+# The GENERATE_TESTLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the test list. This list is created by putting \test 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_TESTLIST      = YES
+
+# The GENERATE_BUGLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the bug list. This list is created by putting \bug 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_BUGLIST       = YES
+
+# This tag can be used to specify a number of aliases that acts 
+# as commands in the documentation. An alias has the form "name=value". 
+# For example adding "sideeffect=\par Side Effects:\n" will allow you to 
+# put the command \sideeffect (or @sideeffect) in the documentation, which 
+# will result in a user defined paragraph with heading "Side Effects:". 
+# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
+
+ALIASES                = 
+
+# The ENABLED_SECTIONS tag can be used to enable conditional 
+# documentation sections, marked by \if sectionname ... \endif.
+
+ENABLED_SECTIONS       = 
+
+# The MAX_INITIALIZER_LINES tag determines the maximum number of lines 
+# the initial value of a variable or define consist of for it to appear in 
+# the documentation. If the initializer consists of more lines than specified 
+# here it will be hidden. Use a value of 0 to hide initializers completely. 
+# The appearance of the initializer of individual variables and defines in the 
+# documentation can be controlled using \showinitializer or \hideinitializer 
+# command in the documentation regardless of this setting.
+
+MAX_INITIALIZER_LINES  = 30
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C sources 
+# only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
+# For instance some of the names that are used will be different. The list 
+# of all members will be omitted, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C  = NO
+
+# Set the SHOW_USED_FILES tag to NO to disable the list of files generated 
+# at the bottom of the documentation of classes and structs. If set to YES the 
+# list will mention the files that were used to generate the documentation.
+
+SHOW_USED_FILES        = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to warning and progress messages
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The QUIET tag can be used to turn on/off the messages that are generated 
+# by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
+
+QUIET                  = NO
+
+# The WARNINGS tag can be used to turn on/off the warning messages that are 
+# generated by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank 
+# NO is used.
+
+WARNINGS               = YES
+
+# If WARN_IF_UNDOCUMENTED is set to YES, then doxygen will generate warnings 
+# for undocumented members. If EXTRACT_ALL is set to YES then this flag will 
+# automatically be disabled.
+
+WARN_IF_UNDOCUMENTED   = YES
+
+# The WARN_FORMAT tag determines the format of the warning messages that 
+# doxygen can produce. The string should contain the $file, $line, and $text 
+# tags, which will be replaced by the file and line number from which the 
+# warning originated and the warning text.
+
+WARN_FORMAT            = "$file:$line: $text"
+
+# The WARN_LOGFILE tag can be used to specify a file to which warning 
+# and error messages should be written. If left blank the output is written 
+# to stderr.
+
+WARN_LOGFILE           = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the input files
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The INPUT tag can be used to specify the files and/or directories that contain 
+# documented source files. You may enter file names like "myfile.cpp" or 
+# directories like "/usr/src/myproject". Separate the files or directories 
+# with spaces.
+
+INPUT                  = ../src
+
+# If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
+# FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
+# and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
+# blank the following patterns are tested: 
+# *.c *.cc *.cxx *.cpp *.c++ *.java *.ii *.ixx *.ipp *.i++ *.inl *.h *.hh *.hxx *.hpp 
+# *.h++ *.idl *.odl
+
+FILE_PATTERNS          = *.cxx *.h
+
+# The RECURSIVE tag can be used to turn specify whether or not subdirectories 
+# should be searched for input files as well. Possible values are YES and NO. 
+# If left blank NO is used.
+
+RECURSIVE              = NO
+
+# The EXCLUDE tag can be used to specify files and/or directories that should 
+# excluded from the INPUT source files. This way you can easily exclude a 
+# subdirectory from a directory tree whose root is specified with the INPUT tag.
+
+EXCLUDE                = 
+
+# The EXCLUDE_SYMLINKS tag can be used select whether or not files or directories 
+# that are symbolic links (a Unix filesystem feature) are excluded from the input.
+
+EXCLUDE_SYMLINKS       = NO
+
+# If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
+# EXCLUDE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard patterns to exclude 
+# certain files from those directories.
+
+EXCLUDE_PATTERNS       = 
+
+# The EXAMPLE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
+# directories that contain example code fragments that are included (see 
+# the \include command).
+
+EXAMPLE_PATH           = 
+
+# If the value of the EXAMPLE_PATH tag contains directories, you can use the 
+# EXAMPLE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
+# and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
+# blank all files are included.
+
+EXAMPLE_PATTERNS       = 
+
+# If the EXAMPLE_RECURSIVE tag is set to YES then subdirectories will be 
+# searched for input files to be used with the \include or \dontinclude 
+# commands irrespective of the value of the RECURSIVE tag. 
+# Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
+
+EXAMPLE_RECURSIVE      = NO
+
+# The IMAGE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
+# directories that contain image that are included in the documentation (see 
+# the \image command).
+
+IMAGE_PATH             = 
+
+# The INPUT_FILTER tag can be used to specify a program that doxygen should 
+# invoke to filter for each input file. Doxygen will invoke the filter program 
+# by executing (via popen()) the command <filter> <input-file>, where <filter> 
+# is the value of the INPUT_FILTER tag, and <input-file> is the name of an 
+# input file. Doxygen will then use the output that the filter program writes 
+# to standard output.
+
+INPUT_FILTER           = 
+
+# If the FILTER_SOURCE_FILES tag is set to YES, the input filter (if set using 
+# INPUT_FILTER) will be used to filter the input files when producing source 
+# files to browse.
+
+FILTER_SOURCE_FILES    = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to source browsing
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the SOURCE_BROWSER tag is set to YES then a list of source files will 
+# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources.
+
+SOURCE_BROWSER         = YES
+
+# Setting the INLINE_SOURCES tag to YES will include the body 
+# of functions and classes directly in the documentation.
+
+INLINE_SOURCES         = YES
+
+# If the REFERENCED_BY_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented 
+# functions referencing it will be listed.
+
+REFERENCED_BY_RELATION = YES
+
+# If the REFERENCES_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented entities 
+# called/used by that function will be listed.
+
+REFERENCES_RELATION    = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the alphabetical class index
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the ALPHABETICAL_INDEX tag is set to YES, an alphabetical index 
+# of all compounds will be generated. Enable this if the project 
+# contains a lot of classes, structs, unions or interfaces.
+
+ALPHABETICAL_INDEX     = YES
+
+# If the alphabetical index is enabled (see ALPHABETICAL_INDEX) then 
+# the COLS_IN_ALPHA_INDEX tag can be used to specify the number of columns 
+# in which this list will be split (can be a number in the range [1..20])
+
+COLS_IN_ALPHA_INDEX    = 5
+
+# In case all classes in a project start with a common prefix, all 
+# classes will be put under the same header in the alphabetical index. 
+# The IGNORE_PREFIX tag can be used to specify one or more prefixes that 
+# should be ignored while generating the index headers.
+
+IGNORE_PREFIX          = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the HTML output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_HTML tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate HTML output.
+
+GENERATE_HTML          = YES
+
+# The HTML_OUTPUT tag is used to specify where the HTML docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `html' will be used as the default path.
+
+HTML_OUTPUT            = html
+
+# The HTML_FILE_EXTENSION tag can be used to specify the file extension for 
+# each generated HTML page (for example: .htm,.php,.asp). If it is left blank 
+# doxygen will generate files with .html extension.
+
+HTML_FILE_EXTENSION    = .html
+
+# The HTML_HEADER tag can be used to specify a personal HTML header for 
+# each generated HTML page. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard header.
+
+HTML_HEADER            = 
+
+# The HTML_FOOTER tag can be used to specify a personal HTML footer for 
+# each generated HTML page. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard footer.
+
+HTML_FOOTER            = 
+
+# The HTML_STYLESHEET tag can be used to specify a user defined cascading 
+# style sheet that is used by each HTML page. It can be used to 
+# fine-tune the look of the HTML output. If the tag is left blank doxygen 
+# will generate a default style sheet
+
+HTML_STYLESHEET        = 
+
+# If the HTML_ALIGN_MEMBERS tag is set to YES, the members of classes, 
+# files or namespaces will be aligned in HTML using tables. If set to 
+# NO a bullet list will be used.
+
+HTML_ALIGN_MEMBERS     = YES
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, additional index files 
+# will be generated that can be used as input for tools like the 
+# Microsoft HTML help workshop to generate a compressed HTML help file (.chm) 
+# of the generated HTML documentation.
+
+GENERATE_HTMLHELP      = NO
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the GENERATE_CHI flag 
+# controls if a separate .chi index file is generated (YES) or that 
+# it should be included in the master .chm file (NO).
+
+GENERATE_CHI           = NO
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the BINARY_TOC flag 
+# controls whether a binary table of contents is generated (YES) or a 
+# normal table of contents (NO) in the .chm file.
+
+BINARY_TOC             = NO
+
+# The TOC_EXPAND flag can be set to YES to add extra items for group members 
+# to the contents of the Html help documentation and to the tree view.
+
+TOC_EXPAND             = NO
+
+# The DISABLE_INDEX tag can be used to turn on/off the condensed index at 
+# top of each HTML page. The value NO (the default) enables the index and 
+# the value YES disables it.
+
+DISABLE_INDEX          = NO
+
+# This tag can be used to set the number of enum values (range [1..20]) 
+# that doxygen will group on one line in the generated HTML documentation.
+
+ENUM_VALUES_PER_LINE   = 4
+
+# If the GENERATE_TREEVIEW tag is set to YES, a side panel will be
+# generated containing a tree-like index structure (just like the one that 
+# is generated for HTML Help). For this to work a browser that supports 
+# JavaScript and frames is required (for instance Mozilla, Netscape 4.0+, 
+# or Internet explorer 4.0+). Note that for large projects the tree generation 
+# can take a very long time. In such cases it is better to disable this feature. 
+# Windows users are probably better off using the HTML help feature.
+
+GENERATE_TREEVIEW      = NO
+
+# If the treeview is enabled (see GENERATE_TREEVIEW) then this tag can be 
+# used to set the initial width (in pixels) of the frame in which the tree 
+# is shown.
+
+TREEVIEW_WIDTH         = 250
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the LaTeX output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_LATEX tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate Latex output.
+
+GENERATE_LATEX         = NO
+
+# The LATEX_OUTPUT tag is used to specify where the LaTeX docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `latex' will be used as the default path.
+
+LATEX_OUTPUT           = latex
+
+# If the COMPACT_LATEX tag is set to YES Doxygen generates more compact 
+# LaTeX documents. This may be useful for small projects and may help to 
+# save some trees in general.
+
+COMPACT_LATEX          = NO
+
+# The PAPER_TYPE tag can be used to set the paper type that is used 
+# by the printer. Possible values are: a4, a4wide, letter, legal and 
+# executive. If left blank a4wide will be used.
+
+PAPER_TYPE             = a4wide
+
+# The EXTRA_PACKAGES tag can be to specify one or more names of LaTeX 
+# packages that should be included in the LaTeX output.
+
+EXTRA_PACKAGES         = 
+
+# The LATEX_HEADER tag can be used to specify a personal LaTeX header for 
+# the generated latex document. The header should contain everything until 
+# the first chapter. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard header. Notice: only use this tag if you know what you are doing!
+
+LATEX_HEADER           = 
+
+# If the PDF_HYPERLINKS tag is set to YES, the LaTeX that is generated 
+# is prepared for conversion to pdf (using ps2pdf). The pdf file will 
+# contain links (just like the HTML output) instead of page references 
+# This makes the output suitable for online browsing using a pdf viewer.
+
+PDF_HYPERLINKS         = NO
+
+# If the USE_PDFLATEX tag is set to YES, pdflatex will be used instead of 
+# plain latex in the generated Makefile. Set this option to YES to get a 
+# higher quality PDF documentation.
+
+USE_PDFLATEX           = NO
+
+# If the LATEX_BATCHMODE tag is set to YES, doxygen will add the \\batchmode. 
+# command to the generated LaTeX files. This will instruct LaTeX to keep 
+# running if errors occur, instead of asking the user for help. 
+# This option is also used when generating formulas in HTML.
+
+LATEX_BATCHMODE        = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the RTF output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_RTF tag is set to YES Doxygen will generate RTF output 
+# The RTF output is optimised for Word 97 and may not look very pretty with 
+# other RTF readers or editors.
+
+GENERATE_RTF           = NO
+
+# The RTF_OUTPUT tag is used to specify where the RTF docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `rtf' will be used as the default path.
+
+RTF_OUTPUT             = rtf
+
+# If the COMPACT_RTF tag is set to YES Doxygen generates more compact 
+# RTF documents. This may be useful for small projects and may help to 
+# save some trees in general.
+
+COMPACT_RTF            = NO
+
+# If the RTF_HYPERLINKS tag is set to YES, the RTF that is generated 
+# will contain hyperlink fields. The RTF file will 
+# contain links (just like the HTML output) instead of page references. 
+# This makes the output suitable for online browsing using WORD or other 
+# programs which support those fields. 
+# Note: wordpad (write) and others do not support links.
+
+RTF_HYPERLINKS         = NO
+
+# Load stylesheet definitions from file. Syntax is similar to doxygen's 
+# config file, i.e. a series of assigments. You only have to provide 
+# replacements, missing definitions are set to their default value.
+
+RTF_STYLESHEET_FILE    = 
+
+# Set optional variables used in the generation of an rtf document. 
+# Syntax is similar to doxygen's config file.
+
+RTF_EXTENSIONS_FILE    = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the man page output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_MAN tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate man pages
+
+GENERATE_MAN           = NO
+
+# The MAN_OUTPUT tag is used to specify where the man pages will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `man' will be used as the default path.
+
+MAN_OUTPUT             = man
+
+# The MAN_EXTENSION tag determines the extension that is added to 
+# the generated man pages (default is the subroutine's section .3)
+
+MAN_EXTENSION          = .3
+
+# If the MAN_LINKS tag is set to YES and Doxygen generates man output, 
+# then it will generate one additional man file for each entity 
+# documented in the real man page(s). These additional files 
+# only source the real man page, but without them the man command 
+# would be unable to find the correct page. The default is NO.
+
+MAN_LINKS              = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the XML output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_XML tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an XML file that captures the structure of 
+# the code including all documentation. Note that this 
+# feature is still experimental and incomplete at the 
+# moment.
+
+GENERATE_XML           = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options for the AutoGen Definitions output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_AUTOGEN_DEF tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an AutoGen Definitions (see autogen.sf.net) file 
+# that captures the structure of the code including all 
+# documentation. Note that this feature is still experimental 
+# and incomplete at the moment.
+
+GENERATE_AUTOGEN_DEF   = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration options related to the preprocessor   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# evaluate all C-preprocessor directives found in the sources and include 
+# files.
+
+ENABLE_PREPROCESSING   = YES
+
+# If the MACRO_EXPANSION tag is set to YES Doxygen will expand all macro 
+# names in the source code. If set to NO (the default) only conditional 
+# compilation will be performed. Macro expansion can be done in a controlled 
+# way by setting EXPAND_ONLY_PREDEF to YES.
+
+MACRO_EXPANSION        = NO
+
+# If the EXPAND_ONLY_PREDEF and MACRO_EXPANSION tags are both set to YES 
+# then the macro expansion is limited to the macros specified with the 
+# PREDEFINED and EXPAND_AS_PREDEFINED tags.
+
+EXPAND_ONLY_PREDEF     = NO
+
+# If the SEARCH_INCLUDES tag is set to YES (the default) the includes files 
+# in the INCLUDE_PATH (see below) will be search if a #include is found.
+
+SEARCH_INCLUDES        = YES
+
+# The INCLUDE_PATH tag can be used to specify one or more directories that 
+# contain include files that are not input files but should be processed by 
+# the preprocessor.
+
+INCLUDE_PATH           = 
+
+# You can use the INCLUDE_FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard 
+# patterns (like *.h and *.hpp) to filter out the header-files in the 
+# directories. If left blank, the patterns specified with FILE_PATTERNS will 
+# be used.
+
+INCLUDE_FILE_PATTERNS  = 
+
+# The PREDEFINED tag can be used to specify one or more macro names that 
+# are defined before the preprocessor is started (similar to the -D option of 
+# gcc). The argument of the tag is a list of macros of the form: name 
+# or name=definition (no spaces). If the definition and the = are 
+# omitted =1 is assumed.
+
+PREDEFINED             = 
+
+# If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_PREDEF_ONLY tags are set to YES then 
+# this tag can be used to specify a list of macro names that should be expanded. 
+# The macro definition that is found in the sources will be used. 
+# Use the PREDEFINED tag if you want to use a different macro definition.
+
+EXPAND_AS_DEFINED      = 
+
+# If the SKIP_FUNCTION_MACROS tag is set to YES (the default) then 
+# doxygen's preprocessor will remove all function-like macros that are alone 
+# on a line and do not end with a semicolon. Such function macros are typically 
+# used for boiler-plate code, and will confuse the parser if not removed.
+
+SKIP_FUNCTION_MACROS   = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration::addtions related to external references   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The TAGFILES tag can be used to specify one or more tagfiles.
+
+TAGFILES               = 
+
+# When a file name is specified after GENERATE_TAGFILE, doxygen will create 
+# a tag file that is based on the input files it reads.
+
+GENERATE_TAGFILE       = 
+
+# If the ALLEXTERNALS tag is set to YES all external classes will be listed 
+# in the class index. If set to NO only the inherited external classes 
+# will be listed.
+
+ALLEXTERNALS           = NO
+
+# If the EXTERNAL_GROUPS tag is set to YES all external groups will be listed 
+# in the modules index. If set to NO, only the current project's groups will 
+# be listed.
+
+EXTERNAL_GROUPS        = YES
+
+# The PERL_PATH should be the absolute path and name of the perl script 
+# interpreter (i.e. the result of `which perl').
+
+PERL_PATH              = /usr/bin/perl
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration options related to the dot tool   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the CLASS_DIAGRAMS tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate a inheritance diagram (in Html, RTF and LaTeX) for classes with base or 
+# super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. Note that this 
+# option is superceded by the HAVE_DOT option below. This is only a fallback. It is 
+# recommended to install and use dot, since it yield more powerful graphs.
+
+CLASS_DIAGRAMS         = YES
+
+# If you set the HAVE_DOT tag to YES then doxygen will assume the dot tool is 
+# available from the path. This tool is part of Graphviz, a graph visualization 
+# toolkit from AT&T and Lucent Bell Labs. The other options in this section 
+# have no effect if this option is set to NO (the default)
+
+HAVE_DOT               = NO
+
+# If the CLASS_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for each documented class showing the direct and 
+# indirect inheritance relations. Setting this tag to YES will force the 
+# the CLASS_DIAGRAMS tag to NO.
+
+CLASS_GRAPH            = YES
+
+# If the COLLABORATION_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for each documented class showing the direct and 
+# indirect implementation dependencies (inheritance, containment, and 
+# class references variables) of the class with other documented classes.
+
+COLLABORATION_GRAPH    = YES
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will show the 
+# relations between templates and their instances.
+
+TEMPLATE_RELATIONS     = YES
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will hide 
+# inheritance and usage relations if the target is undocumented 
+# or is not a class.
+
+HIDE_UNDOC_RELATIONS   = YES
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDE_GRAPH, and HAVE_DOT 
+# tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each documented 
+# file showing the direct and indirect include dependencies of the file with 
+# other documented files.
+
+INCLUDE_GRAPH          = YES
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDED_BY_GRAPH, and 
+# HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each 
+# documented header file showing the documented files that directly or 
+# indirectly include this file.
+
+INCLUDED_BY_GRAPH      = YES
+
+# If the GRAPHICAL_HIERARCHY and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will graphical hierarchy of all classes instead of a textual one.
+
+GRAPHICAL_HIERARCHY    = YES
+
+# The DOT_IMAGE_FORMAT tag can be used to set the image format of the images 
+# generated by dot. Possible values are gif, jpg, and png
+# If left blank gif will be used.
+
+DOT_IMAGE_FORMAT       = png
+
+# The tag DOT_PATH can be used to specify the path where the dot tool can be 
+# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found on the path.
+
+DOT_PATH               = 
+
+# The DOTFILE_DIRS tag can be used to specify one or more directories that 
+# contain dot files that are included in the documentation (see the 
+# \dotfile command).
+
+DOTFILE_DIRS           = 
+
+# The MAX_DOT_GRAPH_WIDTH tag can be used to set the maximum allowed width 
+# (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
+# this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
+# the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
+# large images.
+
+MAX_DOT_GRAPH_WIDTH    = 1024
+
+# The MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT tag can be used to set the maximum allows height 
+# (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
+# this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
+# the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
+# large images.
+
+MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT   = 1024
+
+# If the GENERATE_LEGEND tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate a legend page explaining the meaning of the various boxes and 
+# arrows in the dot generated graphs.
+
+GENERATE_LEGEND        = YES
+
+# If the DOT_CLEANUP tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# remove the intermedate dot files that are used to generate 
+# the various graphs.
+
+DOT_CLEANUP            = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration::addtions related to the search engine   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The SEARCHENGINE tag specifies whether or not a search engine should be 
+# used. If set to NO the values of all tags below this one will be ignored.
+
+SEARCHENGINE           = NO
+
+# The CGI_NAME tag should be the name of the CGI script that 
+# starts the search engine (doxysearch) with the correct parameters. 
+# A script with this name will be generated by doxygen.
+
+CGI_NAME               = search.cgi
+
+# The CGI_URL tag should be the absolute URL to the directory where the 
+# cgi binaries are located. See the documentation of your http daemon for 
+# details.
+
+CGI_URL                = 
+
+# The DOC_URL tag should be the absolute URL to the directory where the 
+# documentation is located. If left blank the absolute path to the 
+# documentation, with file:// prepended to it, will be used.
+
+DOC_URL                = 
+
+# The DOC_ABSPATH tag should be the absolute path to the directory where the 
+# documentation is located. If left blank the directory on the local machine 
+# will be used.
+
+DOC_ABSPATH            = 
+
+# The BIN_ABSPATH tag must point to the directory where the doxysearch binary 
+# is installed.
+
+BIN_ABSPATH            = /usr/local/bin/
+
+# The EXT_DOC_PATHS tag can be used to specify one or more paths to 
+# documentation generated for other projects. This allows doxysearch to search 
+# the documentation for these projects as well.
+
+EXT_DOC_PATHS          = 
diff --git a/Doc/README b/Doc/README
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a6c806f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,4 @@
+Documentation can be build with doxygen:
+doxygen Doxyfile
+mozilla html/index.html
+
diff --git a/INSTALL b/INSTALL
index 93ffa792a2773615e0880a16322b0e5c1ef7ba69..e9072f5794374212e3e1038dfddf3dc86bb139db 100644 (file)
--- a/INSTALL
+++ b/INSTALL
@@ -23,3 +23,8 @@ python testSuite.py (test suite written in unittest, you should use python2)
 * For manual test in python:
 cd python/demo
 python test.py ../../Data/CR-MONO1-10-chest.dcm (or any other file)
 * For manual test in python:
 cd python/demo
 python test.py ../../Data/CR-MONO1-10-chest.dcm (or any other file)
+
+
+-----------------------------------------------------------------------------
+Documentation can be found in the Doc sub-directory. Please refer to 
+README file within Doc.
diff --git a/README b/README
index a1d5c20d35997d8715af0623c2d8afc0ced0997d..d6743f6395c9acecdb7354832cef75ad043e4634 100644 (file)
--- a/README
+++ b/README
@@ -1 +1,2 @@
-Requires Swig version >= 1.3.11 for handling member overloading.
+Requires Swig version >= 1.3.17 for handling member overloading, and
+static methods.
diff --git a/TODO b/TODO
index 42235948c17e1961c6524bd43c7bf5235805d538..1b0dc98a8386027b79171a008a4b28d4c04ea9b5 100644 (file)
--- a/TODO
+++ b/TODO
@@ -1,3 +1,16 @@
+* As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it looks
+  like we can move back to the exceptions and remove the errno stuff from
+  src/gdcm* !
+* adapt python/gdcmPython/Makefile to automake/autoconf tools
+* Fix the bug in Test/bug1.cxx (see first comment line): Win32 only.
+* All (or at least many of) the methods of gdcmHeader whose only arguments
+  are an ElValue* (e.g.  FindLength, FindVR, LoadElementValue...) can
+  be moved away to ElValue class on condition of transmitting the
+  gdcmHeader.fp attribute. This change should be considered since it
+  would allow those method to avoid artificial calls to ElValue::GetElement(),
+  ElValue::GetVR()...
+* Eat leanding_trailing_whitespace (found in python/gdcmPython/gdcmi) should
+  be used when parsing the dictionary in C++ !
 * Group length is not a unique tag in a file. Hence avoid putting it
   in the element values dictionary without doing something smarter
   (say, instead of storing the length store the group and the length
 * Group length is not a unique tag in a file. Hence avoid putting it
   in the element values dictionary without doing something smarter
   (say, instead of storing the length store the group and the length
index 2cad7ce3fe7d39564c9c6a48ca4bd63057392c9d..bd1fe827ddeed3bdbdc04b6f94b78cf398d8c20b 100644 (file)
@@ -1,9 +1,11 @@
-test
+*.o
 .deps
 .libs
 Makefile.in
 Makefile
 .deps
 .libs
 Makefile.in
 Makefile
+test
+testWrite
 hashtest
 hashtest
+bug1
 image.dcm
 image.raw
 image.dcm
 image.raw
-
index 5b6861ed6174ba9f1cc206d8a933619149b94384..d76c3fd290603ac151e00d10bc662a61a22fb7fd 100644 (file)
@@ -5,3 +5,4 @@ main
 *.o
 *.so
 *.pyc
 *.o
 *.so
 *.pyc
+*_wrap.doc
index 6e9fd69ee566f4e52a6549a4d360567ac5bde1da..09fa1d87e9e1b5e61f4c867993843232e5baa1a5 100644 (file)
@@ -1,3 +1,7 @@
+READ THIS FIRST:
+the oddities described below are NOT present when using
+wxPythonGTK-py2.2-2.4.0.2-2 but are present when wxPythonGTK-py2.2-2.3.4.2-1.
+-------------------------------------------------------------------------
 The purpous of this set of files is to illustrate an unexpected behavior
 of exception handling of swig wrapped c++ libraries with wxPython.
 Context:
 The purpous of this set of files is to illustrate an unexpected behavior
 of exception handling of swig wrapped c++ libraries with wxPython.
 Context:
diff --git a/Testing/TestBug.cxx b/Testing/TestBug.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0d67a97
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,17 @@
+// The following crashes on Win32
+#include "gdcm.h"
+
+int main(int argc, char* argv[])
+{  
+       gdcmHeader* e1;
+       
+       if (argc > 1)
+               e1 = new gdcmHeader(argv[1]);
+       else
+               e1 = new gdcmHeader("test.acr");
+       e1->LoadElements();
+       e1->PrintPubDict();
+}
+
+
+
index aea4edc5c3a450ef9a9d4570a0b5af1ee7b45e92..735bd98c326ee678b33756a2d727c4a70bfc3aa7 100644 (file)
@@ -170,13 +170,19 @@ typedef map<DictKey, gdcmDict*> DictSetHT;
 
 class GDCM_EXPORT gdcmDictSet {
 private:
 
 class GDCM_EXPORT gdcmDictSet {
 private:
-       string DictPath;      // Directory path to dictionaries
        DictSetHT dicts;
        int AppendDict(gdcmDict* NewDict);
        DictSetHT dicts;
        int AppendDict(gdcmDict* NewDict);
-       int LoadDictFromFile(string filename, DictKey);
-       void SetDictPath(void);
+       void LoadDictFromFile(string filename, DictKey);
+private:
+       static string DictPath;      // Directory path to dictionaries
+       static string BuildDictPath(void);
+       static gdcmDict* DefaultPubDict;
 public:
 public:
-       gdcmDictSet(void);    // loads THE DICOM v3 dictionary
+       static list<string> * GetPubDictTagNames(void);
+       static map<string, list<string> >* GetPubDictTagNamesByCategory(void);
+       static gdcmDict* LoadDefaultPubDict(void);
+
+       gdcmDictSet(void);
        // TODO Swig int LoadDictFromFile(string filename);
    // QUESTION: the following function might not be thread safe !? Maybe
    //           we need some mutex here, to avoid concurent creation of
        // TODO Swig int LoadDictFromFile(string filename);
    // QUESTION: the following function might not be thread safe !? Maybe
    //           we need some mutex here, to avoid concurent creation of
@@ -185,14 +191,9 @@ public:
        // TODO Swig int LoadAllDictFromDirectory(string DirectoryName);
        // TODO Swig string* GetAllDictNames();
        //
        // TODO Swig int LoadAllDictFromDirectory(string DirectoryName);
        // TODO Swig string* GetAllDictNames();
        //
-       // Question : ne faudra-t-il pas mettre LE dictionnaire DICOM dans un Directory
-       // et les eventuels 'dictionnaires prives' dans un autre?
-       // (pour eviter a un utilisateur mal dégourdi de tout saccager ?)
-       //
-       int LoadDicomV3Dict(void);
        void Print(ostream&);
        gdcmDict* GetDict(DictKey DictName);
        void Print(ostream&);
        gdcmDict* GetDict(DictKey DictName);
-       gdcmDict* GetDefaultPublicDict(void);
+       gdcmDict* GetDefaultPubDict(void);
 };
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 };
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
@@ -294,7 +295,7 @@ private:
        static VRHT *dicom_vr;
        // Dictionaries of data elements:
 
        static VRHT *dicom_vr;
        // Dictionaries of data elements:
 
-       static gdcmDictSet* Dicts;  // global dictionary container
+       gdcmDictSet* Dicts;         // global dictionary container
        gdcmDict* RefPubDict;       // public dictionary
        gdcmDict* RefShaDict;       // shadow dictionary (optional)
        // Parsed element values:
        gdcmDict* RefPubDict;       // public dictionary
        gdcmDict* RefShaDict;       // shadow dictionary (optional)
        // Parsed element values:
@@ -386,14 +387,7 @@ public:
        // an additional specific dictionary to access extra information.
        // TODO Swig int SetShaDict(string filename);
 
        // an additional specific dictionary to access extra information.
        // TODO Swig int SetShaDict(string filename);
 
-       // Retrieve all potentially available tag [tag = (group, element)] names
-       // from the standard (or public) dictionary. Typical usage : enable the
-       // user of a GUI based interface to select his favorite fields for sorting
-       // or selecting.
-       list<string> * GetPubTagNames(void);
-       map<string, list<string> > * GetPubTagNamesByCategory(void);
        // Get the element values themselves:
        // Get the element values themselves:
-       
        string GetPubElValByName(string TagName);
        string GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element);
 
        string GetPubElValByName(string TagName);
        string GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element);
 
@@ -406,7 +400,7 @@ public:
 
        TagElValueHT & GetPubElVal(void) { return PubElVals.GetTagHt(); };
        void   PrintPubElVal(ostream & os = cout);
 
        TagElValueHT & GetPubElVal(void) { return PubElVals.GetTagHt(); };
        void   PrintPubElVal(ostream & os = cout);
-       void   PrintPubDict(ostream &);
+       void   PrintPubDict(ostream & os = cout);
          
        // Same thing with the shadow :
        // TODO Swig string* GetShaTagNames(); 
          
        // Same thing with the shadow :
        // TODO Swig string* GetShaTagNames(); 
index e24e8d0a9a3f4237bf89db1720bc65eb931db82d..56482cb300f1d2e505c96d93873bbc5dc6c9f05a 100644 (file)
 #endif
 #define PUB_DICT_FILENAME "dicomV3.dic"
 
 #endif
 #define PUB_DICT_FILENAME "dicomV3.dic"
 
-gdcmDictSet::gdcmDictSet(void) {
-       SetDictPath();
-       if (! LoadDicomV3Dict())
-                         return;
-}
-
-void gdcmDictSet::SetDictPath(void) {
-       const char* EnvPath = (char*)0;
-       EnvPath = getenv("GDCM_DICT_PATH");
-       if (EnvPath && (strlen(EnvPath) != 0)) {
-               DictPath = EnvPath;
-               if (DictPath[DictPath.length() -1] != '/' )
-                       DictPath += '/';
-               dbg.Verbose(1, "gdcmDictSet::SetDictPath:",
+string gdcmDictSet::DictPath = gdcmDictSet::BuildDictPath();
+gdcmDict* gdcmDictSet::DefaultPubDict = gdcmDictSet::LoadDefaultPubDict();
+
+/** 
+ * \ingroup gdcmDictSet
+ * \brief   Consider all the entries of the public dicom dictionnary. 
+ *          Build all list of all the tag names of all those entries.
+ * \sa      gdcmDictSet::GetPubDictTagNamesByCategory
+ * @return  A list of all entries of the public dicom dictionnary.
+ */
+list<string> * gdcmDictSet::GetPubDictTagNames(void) {
+   list<string> * Result = new list<string>;
+   TagKeyHT entries = gdcmDictSet::DefaultPubDict->GetEntries();
+   
+   for (TagKeyHT::iterator tag = entries.begin(); tag != entries.end(); ++tag){
+      Result->push_back( tag->second->GetName() );
+   }
+   return Result;
+}
+
+/** 
+ * \ingroup gdcmDictSet
+ * \brief   Consider all the entries of the public dicom dictionnary.
+ *          Build an hashtable whose keys are the names of the groups
+ *          (fourth field in each line of dictionary) and whose corresponding
+ *          values are lists of all the dictionnary entries among that
+ *          group. Note that apparently the Dicom standard doesn't explicitely
+ *          define a name (as a string) for each group.
+ *          A typical usage of this method would be to enable a dynamic
+ *          configuration of a Dicom file browser: the admin/user can
+ *          select in the interface which Dicom tags should be displayed.
+ * @return  An hashtable: whose keys are the names of the groups and whose
+ *          corresponding values are lists of all the dictionnary entries
+ *          among that group.
+ */
+map<string, list<string> > * gdcmDictSet::GetPubDictTagNamesByCategory(void) {
+   map<string, list<string> > * Result = new map<string, list<string> >;
+   TagKeyHT entries = gdcmDictSet::DefaultPubDict->GetEntries();
+
+   for (TagKeyHT::iterator tag = entries.begin(); tag != entries.end(); ++tag){
+      (*Result)[tag->second->GetFourth()].push_back(tag->second->GetName());
+   }
+   return Result;
+}
+
+/**
+ * \ingroup gdcmDictSet
+ * \brief   Obtain from the GDCM_DICT_PATH environnement variable the
+ *          path to directory containing the dictionnaries. When
+ *          the environnement variable is absent the path is defaulted
+ *          to "../Dicts/".
+ */
+string gdcmDictSet::BuildDictPath(void) {
+   string ResultPath;
+   const char* EnvPath = (char*)0;
+   EnvPath = getenv("GDCM_DICT_PATH");
+   if (EnvPath && (strlen(EnvPath) != 0)) {
+      ResultPath = EnvPath;
+      if (ResultPath[ResultPath.length() -1] != '/' )
+         ResultPath += '/';
+      dbg.Verbose(1, "gdcmDictSet::BuildDictPath:",
                      "Dictionary path set from environnement");
                      "Dictionary path set from environnement");
-       } else
-               DictPath = PUB_DICT_PATH;
+   } else
+      ResultPath = PUB_DICT_PATH;
+   return ResultPath;
 }
 
 }
 
-int gdcmDictSet::LoadDicomV3Dict(void) {
-       if (dicts.count(PUB_DICT_NAME))
-               return 1;
-       return LoadDictFromFile(DictPath + PUB_DICT_FILENAME, PUB_DICT_NAME);
+gdcmDict* gdcmDictSet::LoadDefaultPubDict(void) {
+   string PubDictFile = gdcmDictSet::DictPath + PUB_DICT_FILENAME;
+   return new gdcmDict(PubDictFile.c_str());
+}
+
+/** 
+ * \ingroup gdcmDictSet
+ * \brief   The Dictionnary Set obtained with this constructor simply
+ *          contains the Default Public dictionnary.
+ */
+gdcmDictSet::gdcmDictSet(void) {
+   dicts[PUB_DICT_NAME] = DefaultPubDict;
 }
 
 }
 
-int gdcmDictSet::LoadDictFromFile(string FileName, DictKey Name) {
-       gdcmDict *NewDict = new gdcmDict(FileName.c_str());
-       dicts[Name] = NewDict;
-       return 0;   //FIXME if this is a dummy return make the method void
+void gdcmDictSet::LoadDictFromFile(string FileName, DictKey Name) {
+   gdcmDict *NewDict = new gdcmDict(FileName.c_str());
+   dicts[Name] = NewDict;
 }
 
 void gdcmDictSet::Print(ostream& os) {
 }
 
 void gdcmDictSet::Print(ostream& os) {
-       for (DictSetHT::iterator dict = dicts.begin(); dict != dicts.end(); ++dict){
-               os << "Printing dictionary " << dict->first << " \n";
-               dict->second->Print(os);
-       }
+   for (DictSetHT::iterator dict = dicts.begin(); dict != dicts.end(); ++dict){
+      os << "Printing dictionary " << dict->first << " \n";
+      dict->second->Print(os);
+   }
 }
 
 gdcmDict * gdcmDictSet::GetDict(DictKey DictName) {
 }
 
 gdcmDict * gdcmDictSet::GetDict(DictKey DictName) {
-       DictSetHT::iterator dict = dicts.find(DictName);
-       return dict->second;
+   DictSetHT::iterator dict = dicts.find(DictName);
+   return dict->second;
 }
 
 }
 
-gdcmDict * gdcmDictSet::GetDefaultPublicDict() {
-       return GetDict(PUB_DICT_NAME);
+gdcmDict * gdcmDictSet::GetDefaultPubDict() {
+   return GetDict(PUB_DICT_NAME);
 }
 }
index a79be6e602c1ae967073a8830c379b703333cefd..9246c4523b2cb3a3f696c545cd99813c73c3f5f8 100644 (file)
 // je suis preneur
 
 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
 // je suis preneur
 
 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
-gdcmDictSet* gdcmHeader::Dicts = new gdcmDictSet();
 
 void gdcmHeader::Initialise(void) {
        if (!gdcmHeader::dicom_vr)
                InitVRDict();
 
 void gdcmHeader::Initialise(void) {
        if (!gdcmHeader::dicom_vr)
                InitVRDict();
-       RefPubDict = gdcmHeader::Dicts->GetDefaultPublicDict();
+       Dicts = new gdcmDictSet();
+       RefPubDict = Dicts->GetDefaultPubDict();
        RefShaDict = (gdcmDict*)0;
 }
 
        RefShaDict = (gdcmDict*)0;
 }
 
@@ -255,20 +255,7 @@ void gdcmHeader::GetPixels(size_t lgrTotale, void* _Pixels) {
 /**
  * \ingroup   gdcmHeader
  * \brief     Find the value representation of the current tag.
 /**
  * \ingroup   gdcmHeader
  * \brief     Find the value representation of the current tag.
- *
- * @param sw  code swap
- * @param skippedLength  pointeur sur nombre d'octets que l'on a saute qd
- *                       la lecture est finie
- * @param longueurLue    pointeur sur longueur (en nombre d'octets) 
- *                       effectivement lue
- * @return               longueur retenue pour le champ 
  */
  */
-// -->
-// --> Oops
-// --> C'etait la description de quoi, ca?
-// -->
-
 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
        if (filetype != ExplicitVR)
                return;
 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
        if (filetype != ExplicitVR)
                return;
@@ -701,12 +688,9 @@ void gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue(long NewSize) {
 
 /**
  * \ingroup       gdcmHeader
 
 /**
  * \ingroup       gdcmHeader
- * \brief         Loads the element if it's size is not to big.
- * @param ElVal   Element whose value shall be loaded. 
- * @param MaxSize Size treshold above which the element value is not
- *                loaded in memory. The element value is allways loaded
- *                when MaxSize is equal to UINT32_MAX.
- * @return  
+ * \brief         Loads the element content if it's length is not bigger
+ *                than the value specified with
+ *                gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue()
  */
 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
        size_t item_read;
  */
 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
        size_t item_read;
@@ -755,17 +739,14 @@ void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
                return;
        }
 
                return;
        }
 
-       // Values bigger than specified are not loaded.
-       //
-       // En fait, c'est les elements dont la longueur est superieure 
-       // a celle fixee qui ne sont pas charges
-       //
+       // The elements whose length is bigger than the specified upper bound
+       // are not loaded. Instead we leave a short notice of the offset of
+       // the element content and it's length.
        if (length > MaxSizeLoadElementValue) {
                ostringstream s;
                s << "gdcm::NotLoaded.";
                s << " Address:" << (long)ElVal->GetOffset();
                s << " Length:"  << ElVal->GetLength();
        if (length > MaxSizeLoadElementValue) {
                ostringstream s;
                s << "gdcm::NotLoaded.";
                s << " Address:" << (long)ElVal->GetOffset();
                s << " Length:"  << ElVal->GetLength();
-               //mesg += " Length:"  + ElVal->GetLength();
                ElVal->SetValue(s.str());
                return;
        }
                ElVal->SetValue(s.str());
                return;
        }
@@ -1005,7 +986,7 @@ size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
  *          group and element. The public dictionary has precedence on the
  *          shadow one.
  * @param   group   group of the searched DictEntry
  *          group and element. The public dictionary has precedence on the
  *          shadow one.
  * @param   group   group of the searched DictEntry
- * @earam   element element of the searched DictEntry
+ * @param   element element of the searched DictEntry
  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
  */
 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByKey(guint16 group, guint16 element) {
  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
  */
 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByKey(guint16 group, guint16 element) {
@@ -1054,26 +1035,6 @@ gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByName(string Name) {
        return found;
 }
 
        return found;
 }
 
-list<string> * gdcmHeader::GetPubTagNames(void) {
-       list<string> * Result = new list<string>;
-       TagKeyHT entries = RefPubDict->GetEntries();
-
-       for (TagKeyHT::iterator tag = entries.begin(); tag != entries.end(); ++tag){
-      Result->push_back( tag->second->GetName() );
-       }
-       return Result;
-}
-
-map<string, list<string> > * gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory(void) {
-       map<string, list<string> > * Result = new map<string, list<string> >;
-       TagKeyHT entries = RefPubDict->GetEntries();
-
-       for (TagKeyHT::iterator tag = entries.begin(); tag != entries.end(); ++tag){
-               (*Result)[tag->second->GetFourth()].push_back(tag->second->GetName());
-       }
-       return Result;
-}
-
 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
        return PubElVals.GetElValueByNumber(group, element);
 }
 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
        return PubElVals.GetElValueByNumber(group, element);
 }