]> Creatis software - gdcm.git/commitdiff
new test
authorjpr <jpr>
Wed, 9 Feb 2005 16:41:51 +0000 (16:41 +0000)
committerjpr <jpr>
Wed, 9 Feb 2005 16:41:51 +0000 (16:41 +0000)
Testing/TestAnonymize.cxx [new file with mode: 0644]

diff --git a/Testing/TestAnonymize.cxx b/Testing/TestAnonymize.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7d6b3e1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,263 @@
+/*=========================================================================
+                                                                                
+  Program:   gdcm
+  Module:    $RCSfile: TestAnonymize.cxx,v $
+  Language:  C++
+  Date:      $Date: 2005/02/09 16:41:51 $
+  Version:   $Revision: 1.1 $
+                                                                                
+  Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
+  l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
+  http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
+                                                                                
+     This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
+     the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
+     PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
+                                                                                
+=========================================================================*/
+#include "gdcmFile.h"
+#include "gdcmFileHelper.h"
+#include "gdcmValEntry.h"
+#include "gdcmBinEntry.h"
+#include "gdcmGlobal.h"
+#include "gdcmDebug.h"
+
+//Generated file:
+#include "gdcmDataImages.h"
+
+#ifndef _WIN32
+#include <unistd.h> //for access, unlink
+#else
+#include <io.h> //for _access on Win32
+#endif
+
+
+bool FileExists(const char *filename);
+bool RemoveFile(const char *source);
+
+// ---------------------------------------------------------
+
+int Anonymize(std::string const &filename, 
+              std::string const &output )
+{
+      std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
+
+      if( FileExists( output.c_str() ) )
+      {
+         if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
+         {
+            std::cout << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" 
+                      << std::endl;
+            return 1;
+         }
+      }
+
+      //////////////// Step 1:
+      std::cout << "      1...";
+      std::cout << std::endl;
+      gdcm::File *f1 = new gdcm::File( filename );
+      std::cout << " ... Read !" << std::endl;   
+      // ============================================================
+      //   Load the pixels in memory.
+      //   Write a new file
+      // ============================================================
+
+      // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels        
+      gdcm::FileHelper *fh1 = new gdcm::FileHelper(f1);
+
+      // --- Don't forget to load the Pixels ...
+      // We shall not use them, but we have to load them
+  
+      fh1->GetImageData();
+
+      std::cout << " Image Data... Got ! " << std::endl;
+
+      // Institution name 
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0008, 0x0080, "Xanadoo" ); 
+      // Patient's name 
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0010, "Fantomas" );   
+      // Patient's ID
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"1515" );   
+      // Study Instance UID
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0020, 0x000d, "9.99.999.9999" );
+      // Telephone
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x2154, "3615" );
+
+      std::cout << " Anonymize list... Done ! " << std::endl;
+
+      f1->AnonymizeFile();
+
+      std::cout << " Anonymize File... Done ! " << std::endl;
+      fh1->WriteDcmExplVR(output);  
+      std::cout << " Anonymized File... Written ! " << std::endl;
+
+      f1->ClearAnonymizeList();
+      std::cout << " Anonymize list... Cleared ! " << std::endl;
+    
+      delete f1;
+      delete fh1;
+
+      // Read the file we just wrote
+      f1 = new gdcm::File( output );
+
+      std::cout << " Anonymized File... Re-Read ! " << std::endl;
+
+      std::string v;
+      bool plouf = false;
+
+      // Compare and abort if different.
+      v = f1->GetEntryValue(0x0008, 0x0080);
+      if ( v != gdcm::GDCM_UNFOUND ) 
+         if (v.find("Xanadoo") >= v.length() )
+            plouf = true;
+
+      v = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x0010);
+      if ( v != gdcm::GDCM_UNFOUND ) 
+         if (v.find("Fantomas") >= v.length() )
+            plouf = true;
+
+      if ( v != gdcm::GDCM_UNFOUND )
+         v = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x0020);
+         if (v.find("1515") >= v.length() )
+            plouf = true;
+
+       if ( v != gdcm::GDCM_UNFOUND )
+         v = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x000d);
+         if (v.find("9.99.999.9999") >= v.length() )
+            plouf = true;
+      
+      delete f1;
+
+      if ( !plouf)
+      { 
+         return 1;
+      } 
+
+   // ============================================================
+   //   Don't load the pixels in memory.
+   //   Overwrite the file
+   // ============================================================
+
+      // Read the file we just anonymize and check
+
+      f1 = new gdcm::File( output );
+
+      // First, we set values to replace the ones we want to hide
+   
+      // Patient's name 
+      f1->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x0010, "XXL");  
+      std::cout << " replace Patient's Name " << std::endl;
+      // Patient's ID
+      f1->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"007" );
+      std::cout << " replace Patient's ID " << std::endl;
+      // Study Instance UID
+      f1->AddAnonymizeElement(0x0020, 0x000d, "6.66.666.6666" );
+      std::cout << " replace Study ID " << std::endl;
+
+      // --------------------- we overwrite the file
+
+      // No need to load the pixels.
+      // The gdcm::File remains untouched in memory
+
+      std::cout <<"Let's AnonymizeNoLoad " << std::endl;;
+      f1->AnonymizeNoLoad();
+
+      std::cout <<"End AnonymizeNoLoad" << std::endl;
+      // No need to write the File : modif were done on disc !
+      delete f1;
+      f1 = new gdcm::File( output );
+
+      std::string val;
+      plouf = false;
+
+      val = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x0010);
+      if ( val != gdcm::GDCM_UNFOUND ) 
+         if (val.find("XXL") >= v.length() )
+            plouf = true;
+     
+      if ( val != gdcm::GDCM_UNFOUND )
+         val = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x0020);
+         if (val.find("007") >= v.length() )
+      plouf = true;
+
+      if ( val != gdcm::GDCM_UNFOUND )
+         val = f1->GetEntryValue(0x0010, 0x000d);
+         if (val.find("6.66.666.6666") >= v.length() )
+      plouf = true;
+      
+      delete f1;
+
+      if ( !plouf)
+      { 
+         return 1;
+      }                       
+
+      return 0; // no fail
+}
+
+// Here we load a gdcmFile we anonymize it with and without loading the pixels,
+
+int TestAnonymize(int argc, char *argv[])
+{
+   //gdcm::Debug::DebugOn();
+
+   if ( argc == 3 )
+   {
+      // The test is specified a specific filename, use it instead of looping
+      // over all images
+      const std::string input = argv[1];
+      const std::string reference = argv[2];
+      return Anonymize( input, reference );
+   }
+   else if ( argc > 3 || argc == 2 )
+   {
+      std::cout << "   Usage: " << argv[0]
+                << " (no arguments needed)." << std::endl;
+      std::cout << "or   Usage: " << argv[0]
+                << " filename.dcm reference.dcm" << std::endl;
+      return 1;
+   }
+   // else other cases:
+
+   std::cout << "   Description (Test::TestAnonymize): "
+             << std::endl;
+   std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
+                "Test/CMakeLists.txt)"
+             << std::endl;
+   std::cout << "   apply the following to each filename.xxx: "
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - Create a new file " 
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - Anonymize the file (creates a new file) " 
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - Read this new file " 
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - Check if the written values are ok" 
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - AnonymizeNoLoad the new file (it s overwritten)" 
+             << std::endl;
+   std::cout << "   - Check if the written values are ok" 
+             << std::endl;
+   std::cout << std::endl;
+
+   int i =0;
+   int retVal = 0;  //by default this is an error
+   while( gdcmDataImages[i] != 0 )
+   {
+      std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
+      filename += "/";  //doh!
+      filename += gdcmDataImages[i];
+
+      std::string output = "output.dcm";
+
+      if( Anonymize( filename, output ) != 0 )
+      {
+         retVal++;
+      }
+      i++;
+   }
+   return retVal;
+}