]> Creatis software - clitk.git/commitdiff
Fix merge with the copy of mac folder and copy the mac folder in the
authorSimon Rit <simon.rit@creatis.insa-lyon.fr>
Fri, 7 Mar 2014 10:25:07 +0000 (11:25 +0100)
committerSimon Rit <simon.rit@creatis.insa-lyon.fr>
Fri, 7 Mar 2014 10:25:07 +0000 (11:25 +0100)
results directory

cluster_tools/gate_power_merge.sh

index df46813513a2947539338c24dd20dbdb70f5eae4..cc4203a6e000e5871d929cbd730196e577774760 100755 (executable)
@@ -496,7 +496,7 @@ echo "!!!! this is $0 v0.3k !!!!"
 
 rundir="${1?"provide run dir"}"
 rundir="$(echo "${rundir}" | sed 's|/*$||')"
-nboutputdirs="$(find "${rundir}" -mindepth 1 -name 'output*' -type d -o -type l  | wc -l)"
+nboutputdirs="$(find "${rundir}" -mindepth 1 -type d -name 'output*' -o -type l -name 'output*' | wc -l)"
 
 test ${nboutputdirs} -gt 0 || error "no output dir found"
 echo "found ${nboutputdirs} partial output dirs"
@@ -511,7 +511,6 @@ echo "output dir is ${outputdir}"
 
 test -d "${outputdir}" && rm -r "${outputdir}"
 mkdir "${outputdir}"
-ls ${rundir}/
 for outputfile in $(find -L "${rundir}" -regextype 'posix-extended' -type f -regex "${rundir}/output.*\.(hdr|mhd|mha|root|txt)" | awk -F '/' '{ print $NF; }' | sort | uniq)
 do
     merge_dispatcher "${outputfile}"
@@ -530,4 +529,10 @@ then
     cp "${rundir}/params.txt" "${outputdir}/params.txt"
 fi
 
+if [ -d "${rundir}/mac" ]
+then
+    echo "copying mac folder"
+    cp -r "${rundir}/mac" "${outputdir}/mac"
+fi
+
 echo "these was ${warning_count} warning(s)"