]> Creatis software - gdcm.git/commitdiff
inclusion of code for jpeg compression
authorjpr <jpr>
Fri, 17 Sep 2004 08:54:25 +0000 (08:54 +0000)
committerjpr <jpr>
Fri, 17 Sep 2004 08:54:25 +0000 (08:54 +0000)
(user intended methods not yet commited)

Testing/CMakeLists.txt
src/gdcmDocEntry.cxx
src/gdcmFile.h
src/gdcmJpeg.cxx
src/gdcmJpeg12.cxx
src/jpeg/libijg/CMakeLists.txt
src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt
vtk/vtkGdcmReader.cxx

index 13f23bc32815d7699212de6c31611389c2f94d2a..4a973db9a9eebe2d22d65ccb4f4ad8217901ece1 100644 (file)
@@ -32,7 +32,7 @@ IF (GDCM_DATA_ROOT)
       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
       )
     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
-      ShowDicom.cxx    
+      #ShowDicom.cxx    
       )
   ENDIF(GDCM_VTK)
 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
index 5f313486e8e6065d719c6daaaca6605c57ba9bf6..ed0a9e8b7f7e5631b28b2a505bc8b0045ccd7c84 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDocEntry.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/09/13 12:10:53 $
-  Version:   $Revision: 1.19 $
+  Date:      $Date: 2004/09/17 08:54:26 $
+  Version:   $Revision: 1.20 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -69,7 +69,7 @@ void gdcmDocEntry::Print(std::ostream & os)
        
    if (PrintLevel >= 2)
    {
-      s << "lg : ";
+      s << " lg : ";
       lgth = GetReadLength(); // ReadLength, as opposed to UsableLength
       if (lgth == 0xffffffff)
       {
index 90ea66afd248678bfd8c2d678af2cbe0bdb38765..667bb2d551a5cb1a8177c45efc38fac22e173e5b 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmFile.h,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/09/13 07:49:36 $
-  Version:   $Revision: 1.47 $
+  Date:      $Date: 2004/09/17 08:54:26 $
+  Version:   $Revision: 1.48 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -99,18 +99,27 @@ private:
    
    // For JPEG 8 Bits, body in file gdcmJpeg.cxx
    bool gdcm_read_JPEG_file     (FILE *fp, void * image_buffer); 
-   static int gdcm_read_RLE_fragment(char **areaToRead, long lengthToDecode, 
-                                     long uncompressedSegmentSize, FILE *fp);
+   bool gdcm_write_JPEG_file    (FILE *fp, void * image_buffer, 
+                                 int image_width, int image_heigh,
+                                 int quality);
 
    // For JPEG 12 Bits, body in file gdcmJpeg12.cxx
    bool gdcm_read_JPEG_file12   (FILE *fp, void* image_buffer);
+   bool gdcm_write_JPEG_file12  (FILE *fp, void* image_buffer, 
+                                 int image_width, int image_height,
+                                 int quality);
 
    // For JPEG 2000, body in file gdcmJpeg2000.cxx
    bool gdcm_read_JPEG2000_file (FILE *fp, void* image_buffer);
 
    // For Run Length Encoding
-   bool gdcm_read_RLE_file      (FILE *fp, void* image_buffer); 
-
+   bool gdcm_read_RLE_file      (FILE *fp, void* image_buffer);
+// FIXME : *sure* it's NOT static (C++)
+// (would be static in C, or embedded in ADA)
+// It's NOT a method, but a not user intended fonction.
+// How do we write that in C++ ?)
+   static int gdcm_read_RLE_fragment(char **areaToRead, long lengthToDecode, 
+                                     long uncompressedSegmentSize, FILE *fp);
 // members variables:
 
    /// \brief Header to use to load the file
index 4c8f850352334dfeb0d6ed79ef78f024f2ebbfde..a2c3250ca8dbd2bb73fae5f9735cad103b4515a3 100644 (file)
@@ -81,6 +81,202 @@ extern "C" {
 #include <setjmp.h>
 }
 
+
+/******************** JPEG COMPRESSION SAMPLE INTERFACE *******************/
+
+/* This half of the example shows how to feed data into the JPEG compressor.
+ * We present a minimal version that does not worry about refinements such
+ * as error recovery (the JPEG code will just exit() if it gets an error).
+ */
+
+/*
+ * IMAGE DATA FORMATS:
+ *
+ * The standard input image format is a rectangular array of pixels, with
+ * each pixel having the same number of "component" values (color channels).
+ * Each pixel row is an array of JSAMPLEs (which typically are unsigned chars).
+ * If you are working with color data, then the color values for each pixel
+ * must be adjacent in the row; for example, R,G,B,R,G,B,R,G,B,... for 24-bit
+ * RGB color.
+ *
+ * For this example, we'll assume that this data structure matches the way
+ * our application has stored the image in memory, so we can just pass a
+ * pointer to our image buffer.  In particular, let's say that the image is
+ * RGB color and is described by:
+ */
+
+// FIXME : JPR
+
+//extern JSAMPLE * image_buffer; /* Points to large array of R,G,B-order data */
+//extern int image_height;       /* Number of rows in image */
+//extern int image_width;        /* Number of columns in image */
+
+
+
+/*
+ * Sample routine for JPEG compression.  We assume that the target file name
+ * and a compression quality factor are passed in.
+ */
+
+ /**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief   routine for JPEG decompression 
+ * @param fp pointer to an already open file descriptor 
+ *                      8 significant bits per pixel
+ * @param image_buffer Points to array (of R,G,B-order) data to compress
+ * @param quality compression quality
+ * @param image_height Number of rows in image 
+ * @param image_width Number of columns in image
+ * @return 1 on success, 0 on error
+ */
+bool gdcm_write_JPEG_file (FILE *fp, void * im_buf, 
+                           int image_width, int image_height, int quality)
+{
+
+   JSAMPLE* image_buffer = (JSAMPLE*) im_buf;
+
+  /* This struct contains the JPEG compression parameters and pointers to
+   * working space (which is allocated as needed by the JPEG library).
+   * It is possible to have several such structures, representing multiple
+   * compression/decompression processes, in existence at once.  We refer
+   * to any one struct (and its associated working data) as a "JPEG object".
+   */
+  struct jpeg_compress_struct cinfo;
+  /* This struct represents a JPEG error handler.  It is declared separately
+   * because applications often want to supply a specialized error handler
+   * (see the second half of this file for an example).  But here we just
+   * take the easy way out and use the standard error handler, which will
+   * print a message on stderr and call exit() if compression fails.
+   * Note that this struct must live as long as the main JPEG parameter
+   * struct, to avoid dangling-pointer problems.
+   */
+  struct jpeg_error_mgr jerr;
+  /* More stuff */
+  //FILE * outfile;    /* target file */
+  JSAMPROW row_pointer[1];   /* pointer to JSAMPLE row[s] */
+  int row_stride;            /* physical row width in image buffer */
+
+  /* Step 1: allocate and initialize JPEG compression object */
+
+  /* We have to set up the error handler first, in case the initialization
+   * step fails.  (Unlikely, but it could happen if you are out of memory.)
+   * This routine fills in the contents of struct jerr, and returns jerr's
+   * address which we place into the link field in cinfo.
+   */
+  cinfo.err = jpeg_std_error(&jerr);
+  /* Now we can initialize the JPEG compression object. */
+  jpeg_create_compress(&cinfo);
+
+  /* Step 2: specify data destination (eg, a file) */
+  /* Note: steps 2 and 3 can be done in either order. */
+
+  /* Here we use the library-supplied code to send compressed data to a
+   * stdio stream.  You can also write your own code to do something else.
+   * VERY IMPORTANT: use "b" option to fopen() if you are on a machine that
+   * requires it in order to write binary files.
+   */
+ // if ((outfile = fopen(filename, "wb")) == NULL) {
+ //   fprintf(stderr, "can't open %s\n", filename);
+ //   exit(1);
+ //
+ // }
+  jpeg_stdio_dest(&cinfo, fp);
+
+  /* Step 3: set parameters for compression */
+
+  /* First we supply a description of the input image.
+   * Four fields of the cinfo struct must be filled in:
+   */
+  cinfo.image_width = image_width;/* image width and height, in pixels */
+  cinfo.image_height = image_height;
+  cinfo.input_components = 3;     /* # of color components per pixel */
+  cinfo.in_color_space = JCS_RGB; /* colorspace of input image */
+  /* Now use the library's routine to set default compression parameters.
+   * (You must set at least cinfo.in_color_space before calling this,
+   * since the defaults depend on the source color space.)
+   */
+  jpeg_set_defaults(&cinfo);
+  /* Now you can set any non-default parameters you wish to.
+   * Here we just illustrate the use of quality (quantization table) scaling:
+   */
+  jpeg_set_quality(&cinfo, quality, TRUE /* limit to baseline-JPEG values */);
+
+  /* Step 4: Start compressor */
+
+  /* TRUE ensures that we will write a complete interchange-JPEG file.
+   * Pass TRUE unless you are very sure of what you're doing.
+   */
+  jpeg_start_compress(&cinfo, TRUE);
+
+  /* Step 5: while (scan lines remain to be written) */
+  /*           jpeg_write_scanlines(...); */
+
+  /* Here we use the library's state variable cinfo.next_scanline as the
+   * loop counter, so that we don't have to keep track ourselves.
+   * To keep things simple, we pass one scanline per call; you can pass
+   * more if you wish, though.
+   */
+  row_stride = image_width * 3;/* JSAMPLEs per row in image_buffer */
+
+  while (cinfo.next_scanline < cinfo.image_height) {
+    /* jpeg_write_scanlines expects an array of pointers to scanlines.
+     * Here the array is only one element long, but you could pass
+     * more than one scanline at a time if that's more convenient.
+     */
+    row_pointer[0] = & image_buffer[cinfo.next_scanline * row_stride];
+
+    (void) jpeg_write_scanlines(&cinfo, row_pointer, 1);
+  }
+
+  /* Step 6: Finish compression */
+
+  jpeg_finish_compress(&cinfo);
+  
+  /* After finish_compress, we can close the output file. */
+  
+ // fclose(fp); --> the caller will close (multiframe treatement)
+
+  /* Step 7: release JPEG compression object */
+
+  /* This is an important step since it will release a good deal of memory. */
+  jpeg_destroy_compress(&cinfo);
+
+  /* And we're done! */
+}
+
+
+
+/*
+ * SOME FINE POINTS:
+ *
+ * In the above loop, we ignored the return value of jpeg_write_scanlines,
+ * which is the number of scanlines actually written.  We could get away
+ * with this because we were only relying on the value of cinfo.next_scanline,
+ * which will be incremented correctly.  If you maintain additional loop
+ * variables then you should be careful to increment them properly.
+ * Actually, for output to a stdio stream you needn't worry, because
+ * then jpeg_write_scanlines will write all the lines passed (or else exit
+ * with a fatal error).  Partial writes can only occur if you use a data
+ * destination module that can demand suspension of the compressor.
+ * (If you don't know what that's for, you don't need it.)
+ *
+ * If the compressor requires full-image buffers (for entropy-coding
+ * optimization or a multi-scan JPEG file), it will create temporary
+ * files for anything that doesn't fit within the maximum-memory setting.
+ * (Note that temp files are NOT needed if you use the default parameters.)
+ * On some systems you may need to set up a signal handler to ensure that
+ * temporary files are deleted if the program is interrupted.  See libjpeg.doc.
+ *
+ * Scanlines MUST be supplied in top-to-bottom order if you want your JPEG
+ * files to be compatible with everyone else's.  If you cannot readily read
+ * your data in that order, you'll need an intermediate array to hold the
+ * image.  See rdtarga.c or rdbmp.c for examples of handling bottom-to-top
+ * source data using the JPEG code's internal virtual-array mechanisms.
+ */
+
+
+
 /******************** JPEG DECOMPRESSION SAMPLE INTERFACE *******************/
 
 /* This half of the example shows how to read data from the JPEG decompressor.
@@ -194,7 +390,7 @@ bool gdcmFile::gdcm_read_JPEG_file (FILE *fp,void * image_buffer) {
    int row_stride;/* physical row width in output buffer */
   
 #ifdef GDCM_JPG_DEBUG
-   printf("entree dans gdcmFile::gdcm_read_JPEG_file12, depuis gdcmJpeg\n");
+   printf("entree dans gdcmFile::gdcm_read_JPEG_file (i.e. 8), depuis gdcmJpeg\n");
 #endif //GDCM_JPG_DEBUG
 
    /* In this example we want to open the input file before doing anything else,
@@ -375,6 +571,7 @@ bool gdcmFile::gdcm_read_JPEG_file (FILE *fp,void * image_buffer) {
    return(true);
 }
 
+
 /*
  * SOME FINE POINTS:
  *
index 97d7a77a66c3e829a3898b427cdbe1e227e2e360..956cda503be396b7221794954a14085643525787 100644 (file)
@@ -92,6 +92,16 @@ extern "C" {
 #include "jpeg/libijg12/jpeglib12.h"
 #include <setjmp.h>
 }
+/******************** JPEG COMPRESSION SAMPLE INTERFACE *******************/
+
+//
+//  TODO
+//
+
+bool gdcm_write_JPEG_file12 (FILE *fp, void * im_buff, 
+                             int image_width, int image_heigh, int quality)
+{
+}
 
 /******************** JPEG DECOMPRESSION SAMPLE INTERFACE *******************/
 
index 421db1029b4265195ddde91175ff428a60c96889..f327e65308e75391c3ea41cb4a829989e5fec53a 100644 (file)
@@ -5,68 +5,68 @@
 ##CXXFLAGS = @CXXFLAGS@\r
 \r
 SET(libgdcmijpeg8_la_SOURCES\r
-#      jcapimin.c \r
-#      jcapistd.c \r
-#      jctrans.c \r
-#      jcparam.c\r
-#      jdatadst.c \r
-#      jcinit.c \r
-#      jcmaster.c \r
-#      jcmarker.c \r
-#      jcmainct.c \r
-#      jcprepct.c \r
-#      jccoefct.c \r
-#      jccolor.c \r
-#      jcsample.c \r
-#      jchuff.c \r
-#      jcphuff.c \r
-#      jcdctmgr.c \r
-       jfdctfst.c \r
-       jfdctflt.c \r
-       jfdctint.c \r
-       jdapimin.c \r
-       jdapistd.c \r
-       jdtrans.c \r
-       jdatasrc.c \r
-       jdmaster.c \r
-       jdinput.c \r
-       jdmarker.c \r
-       jdhuff.c \r
-       jdphuff.c \r
-       jdmainct.c \r
-       jdcoefct.c \r
-       jdpostct.c \r
-       jddctmgr.c \r
-       jidctfst.c \r
-       jidctflt.c \r
-       jidctint.c \r
-       jidctred.c \r
-       jdsample.c \r
-       jdcolor.c \r
-       jquant1.c \r
-       jquant2.c \r
-       jdmerge.c \r
-       jcomapi.c \r
-       jutils.c \r
-       jerror.c \r
-       jmemmgr.c \r
-       jmemnobs.c \r
-       rdrle.c\r
+jcapimin.c \r
+jcapistd.c \r
+jctrans.c \r
+jcparam.c\r
+jdatadst.c \r
+jcinit.c \r
+jcmaster.c \r
+jcmarker.c \r
+jcmainct.c \r
+jcprepct.c \r
+jccoefct.c \r
+jccolor.c \r
+jcsample.c \r
+jchuff.c \r
+jcphuff.c \r
+jcdctmgr.c # where commented out till here\r
+jfdctfst.c \r
+jfdctflt.c \r
+jfdctint.c \r
+jdapimin.c \r
+jdapistd.c \r
+jdtrans.c \r
+jdatasrc.c \r
+jdmaster.c \r
+jdinput.c \r
+jdmarker.c \r
+jdhuff.c \r
+jdphuff.c \r
+jdmainct.c \r
+jdcoefct.c \r
+jdpostct.c \r
+jddctmgr.c \r
+jidctfst.c \r
+jidctflt.c \r
+jidctint.c \r
+jidctred.c \r
+jdsample.c \r
+jdcolor.c \r
+jquant1.c \r
+jquant2.c \r
+jdmerge.c \r
+jcomapi.c \r
+jutils.c \r
+jerror.c \r
+jmemmgr.c \r
+jmemnobs.c \r
+# rdrle.c\r
 )\r
 \r
 #libgdcmijpeg8includedir = $(includedir)\r
 SET(libgdcmijpeg8include_HEADERS\r
-       jchuff.h  \r
-       jconfig.h  \r
-       jdct.h  \r
-       jdhuff.h  \r
-       jerror.h  \r
-       jinclude.h  \r
-       jmemsys.h  \r
-       jmorecfg.h  \r
-       jpegint.h  \r
-       jpeglib.h  \r
-       jversion.h \r
+jchuff.h  \r
+jconfig.h  \r
+jdct.h  \r
+jdhuff.h  \r
+jerror.h  \r
+jinclude.h  \r
+jmemsys.h  \r
+jmorecfg.h  \r
+jpegint.h  \r
+jpeglib.h  \r
+jversion.h \r
 )\r
 \r
 #EXTRA_DIST = \\r
index 421db1029b4265195ddde91175ff428a60c96889..f327e65308e75391c3ea41cb4a829989e5fec53a 100644 (file)
@@ -5,68 +5,68 @@
 ##CXXFLAGS = @CXXFLAGS@\r
 \r
 SET(libgdcmijpeg8_la_SOURCES\r
-#      jcapimin.c \r
-#      jcapistd.c \r
-#      jctrans.c \r
-#      jcparam.c\r
-#      jdatadst.c \r
-#      jcinit.c \r
-#      jcmaster.c \r
-#      jcmarker.c \r
-#      jcmainct.c \r
-#      jcprepct.c \r
-#      jccoefct.c \r
-#      jccolor.c \r
-#      jcsample.c \r
-#      jchuff.c \r
-#      jcphuff.c \r
-#      jcdctmgr.c \r
-       jfdctfst.c \r
-       jfdctflt.c \r
-       jfdctint.c \r
-       jdapimin.c \r
-       jdapistd.c \r
-       jdtrans.c \r
-       jdatasrc.c \r
-       jdmaster.c \r
-       jdinput.c \r
-       jdmarker.c \r
-       jdhuff.c \r
-       jdphuff.c \r
-       jdmainct.c \r
-       jdcoefct.c \r
-       jdpostct.c \r
-       jddctmgr.c \r
-       jidctfst.c \r
-       jidctflt.c \r
-       jidctint.c \r
-       jidctred.c \r
-       jdsample.c \r
-       jdcolor.c \r
-       jquant1.c \r
-       jquant2.c \r
-       jdmerge.c \r
-       jcomapi.c \r
-       jutils.c \r
-       jerror.c \r
-       jmemmgr.c \r
-       jmemnobs.c \r
-       rdrle.c\r
+jcapimin.c \r
+jcapistd.c \r
+jctrans.c \r
+jcparam.c\r
+jdatadst.c \r
+jcinit.c \r
+jcmaster.c \r
+jcmarker.c \r
+jcmainct.c \r
+jcprepct.c \r
+jccoefct.c \r
+jccolor.c \r
+jcsample.c \r
+jchuff.c \r
+jcphuff.c \r
+jcdctmgr.c # where commented out till here\r
+jfdctfst.c \r
+jfdctflt.c \r
+jfdctint.c \r
+jdapimin.c \r
+jdapistd.c \r
+jdtrans.c \r
+jdatasrc.c \r
+jdmaster.c \r
+jdinput.c \r
+jdmarker.c \r
+jdhuff.c \r
+jdphuff.c \r
+jdmainct.c \r
+jdcoefct.c \r
+jdpostct.c \r
+jddctmgr.c \r
+jidctfst.c \r
+jidctflt.c \r
+jidctint.c \r
+jidctred.c \r
+jdsample.c \r
+jdcolor.c \r
+jquant1.c \r
+jquant2.c \r
+jdmerge.c \r
+jcomapi.c \r
+jutils.c \r
+jerror.c \r
+jmemmgr.c \r
+jmemnobs.c \r
+# rdrle.c\r
 )\r
 \r
 #libgdcmijpeg8includedir = $(includedir)\r
 SET(libgdcmijpeg8include_HEADERS\r
-       jchuff.h  \r
-       jconfig.h  \r
-       jdct.h  \r
-       jdhuff.h  \r
-       jerror.h  \r
-       jinclude.h  \r
-       jmemsys.h  \r
-       jmorecfg.h  \r
-       jpegint.h  \r
-       jpeglib.h  \r
-       jversion.h \r
+jchuff.h  \r
+jconfig.h  \r
+jdct.h  \r
+jdhuff.h  \r
+jerror.h  \r
+jinclude.h  \r
+jmemsys.h  \r
+jmorecfg.h  \r
+jpegint.h  \r
+jpeglib.h  \r
+jversion.h \r
 )\r
 \r
 #EXTRA_DIST = \\r
index 97d0115c83fc4db6327a175eee7803ba52f3e08c..fdbb9c8509a35742d8f88349c248b732d93447b1 100644 (file)
@@ -1,7 +1,7 @@
 // vtkGdcmReader.cxx
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // //////////////////////////////////////////////////////////////
-// WARNING TODO CLENAME 
+// WARNING TODO CLEANME 
 // Actual limitations of this code:
 //
 // /////// Redundant and unnecessary header parsing
@@ -58,7 +58,7 @@
 #include <vtkPointData.h>
 #include <vtkLookupTable.h>
 
-vtkCxxRevisionMacro(vtkGdcmReader, "$Revision: 1.49 $");
+vtkCxxRevisionMacro(vtkGdcmReader, "$Revision: 1.50 $");
 vtkStandardNewMacro(vtkGdcmReader);
 
 //-----------------------------------------------------------------------------