]> Creatis software - creaImageIO.git/commitdiff
*** empty log message ***
authorguigues <guigues>
Tue, 10 Feb 2009 08:18:20 +0000 (08:18 +0000)
committerguigues <guigues>
Tue, 10 Feb 2009 08:18:20 +0000 (08:18 +0000)
12 files changed:
src2/creaImageIOGimmick.cpp
src2/creaImageIOGimmick.h
src2/creaImageIOImageReader.cpp
src2/creaImageIOImageReader.h
src2/creaImageIOSQLiteTreeHandler.cpp
src2/creaImageIOSystem.h
src2/creaImageIOTreeAttributeDescriptor.cpp
src2/creaImageIOTreeAttributeDescriptor.h
src2/creaImageIOTreeDescriptor.cpp
src2/doxygen/CMakeLists.txt [new file with mode: 0644]
src2/doxygen/DoxyMainPage.txt.in [new file with mode: 0644]
src2/doxygen/Doxyfile.txt.in [new file with mode: 0644]

index a317684829b85cd088ac11fe807d8ab6d2a60b15..b7cc5f7b5ad1874e36fdd725515fdf2d569a3faa 100644 (file)
@@ -155,4 +155,20 @@ namespace creaImageIO
   }
   //========================================================================
 
+
+  //========================================================================
+  /// Sets debug mode
+  void Gimmick::SetDebugMode(bool m)
+  {
+    if (m) 
+      {
+       crea::MessageManager::SetMessageLevel("Gimmick!",9);
+      }
+    else 
+      {
+       crea::MessageManager::SetMessageLevel("Gimmick!",1);
+      }
+  }
+  //========================================================================
+
 }
index 7a984a39987daef964e955ee3e752b7242362da8..126ff09da4d3a8e645c98ca8ee003c115dd4db20 100644 (file)
@@ -23,6 +23,8 @@ namespace creaImageIO
     bool Finalize();
 
 
+    /// Sets debug mode
+    void SetDebugMode(bool );
 
     const std::string& GetHomeDirectory();
     const std::string& GetUserSettingsDirectory();
index 2480a47d921ebe5a19747a0b3c68bcf3c04ccadb..63a87ce515b6db8261a0391a22a59e37aa7e95e3 100644 (file)
@@ -317,7 +317,7 @@ namespace creaImageIO
          std::map<std::string,std::string>::iterator i;
          for (i=attr.begin();i!=attr.end();++i)
            {
-             if ( i->first == "Full File Name" )
+             if ( i->first == "FullFileName" )
                {
                  boost::filesystem::path full_path(filename);
                  std::string f = full_path.leaf();
@@ -325,9 +325,9 @@ namespace creaImageIO
                }
              else
                {
-                 tree::AttributeDescriptor a(i->first);
-                 uint16_t gr = a.GetGroup();
-                 uint16_t el = a.GetElement();
+                 uint16_t gr;
+                 uint16_t el;
+                 tree::AttributeDescriptor::GetDicomGroupElementFromKey(i->first,gr,el);
                  if ( ( gr!=0 ) && ( el!=0 ) )
                    {
                      std::string val = file->GetEntryString(gr,el);
index e36f2269fc33d34d1d4a9f88fe71f111a34ad2a1..f05b6d4f404b964384250beb1835059b0314a2bd 100644 (file)
@@ -26,9 +26,7 @@ namespace creaImageIO
     ImageReader();
     ~ImageReader();
 
-    /// Returns the known extensions
-    const std::vector<std::string>& GetKnownExtensions()  
-    { return mKnownExtensions; }
     /// Returns true iff the file is readable
     bool CanRead( const std::string& filename, 
                  const std::string& exclude = "");
@@ -45,6 +43,10 @@ namespace creaImageIO
     void ReadAttributes(const std::string& filename, 
                        std::map<std::string,std::string>& attr);
 
+    /// Returns the known extensions
+    const std::vector<std::string>& GetKnownExtensions()  
+    { return mKnownExtensions; }
+
   protected:
     
     void Register(SpecificImageReader*);
index 509aa90429e4c1f3e9e4447bc7f5f522a88f9e2d..4d0d49eae165825a158b77f9788857c54d07a3a1 100644 (file)
@@ -1,4 +1,5 @@
 #include <creaImageIOSQLiteTreeHandler.h>
+#include <creaImageIOSystem.h>
 
 #include "CppSQLite3.h"
 
@@ -35,28 +36,9 @@ namespace creaImageIO
   SQLiteTreeHandler::SQLiteTreeHandler(const std::string& filename)
     : mFileName(filename)
   {
-    /*
-    mSQLiteTreeHandler = this;
-    NodeTypeDescription::FieldDescriptionMapType& M = 
-      mNodeTypeDescription[Node::Database].GetFieldDescriptionMap();
-
-    boost::filesystem::path full_path(location);
-    mName = full_path.leaf();
-    Field::Description fname("Name",0,0,"Name",0);
-    M[fname.key] = fname;
-    UnsafeSetFieldValue(fname.key,mName);
-    Field::Description flocation("File name",0,0,"File name",0);
-    M[flocation.key] = flocation;
-    UnsafeSetFieldValue(flocation.key,location);
-    */
-    //    Field::Description ftype("Type",0,0,"Type",0);
-    //    M[ftype.key] = ftype;
-    //    UnsafeSetFieldValue(ftype.key,"Invalid location");
-
     mDB = new CppSQLite3DB;
-    //    std::cout << "** SQLite Version: " << mDB->SQLiteVersion() << std::endl;
-
-
+    GimmickMessage(1,"SQLite version : "
+                  <<std::string(mDB->SQLiteVersion())<< std::endl);
   }
   //=============================================================
 
@@ -64,14 +46,6 @@ namespace creaImageIO
   SQLiteTreeHandler::~SQLiteTreeHandler()
   {
     delete mDB;
-    /*
-      Already done in Node now that SQLiteTreeHandler inherits from it
-    ChildrenListType::iterator i;
-    for (i=GetChildrenList().begin(); i!=GetChildrenList().end(); i++)
-      {
-       delete *i;
-      }
-    */
   }
   //=============================================================
   
@@ -133,14 +107,17 @@ namespace creaImageIO
 #define QUERYDB(QUER,RES)                                              \
     try                                                                        \
       {                                                                        \
+       GimmickMessage(2,"SQL: '"<<QUER<<"'"<<std::endl);               \
        RES = mDB->execQuery(QUER.c_str());                             \
       }                                                                        \
     catch (CppSQLite3Exception& e)                                     \
       {                                                                        \
-       std::cout << "SQLite query '"<<QUER<<"' : "<< e.errorCode() << ":" \
+       std::cout << "SQLite query '"<<QUER<<"' : "                     \
+                 << e.errorCode() << ":"                               \
                  << e.errorMessage()<<std::endl;                       \
-       creaError("SQLite query '"<<QUER<<"' : "<< e.errorCode() << ":" \
-                  << e.errorMessage() );                               \
+       creaError("SQLite query '"<<QUER<<"' : "                        \
+                 << e.errorCode() << ":"                               \
+                 << e.errorMessage() );                                \
       }                                                                        \
     
   //=====================================================================
@@ -149,14 +126,17 @@ namespace creaImageIO
 #define UPDATEDB(UP)                                                   \
   try                                                                  \
     {                                                                  \
+      GimmickMessage(2,"SQL: '"<<UP<<"'"<<std::endl);                  \
       mDB->execDML(UP.c_str());                                                \
     }                                                                  \
   catch (CppSQLite3Exception& e)                                       \
     {                                                                  \
-      std::cout << "SQLite update '"<<UP<<"' Error : "<< e.errorCode() << ":" \
+      std::cout << "SQLite update '"<<UP<<"' Error : "                 \
+               << e.errorCode() << ":"                                 \
                << e.errorMessage()<<std::endl;                         \
-      creaError("SQLite update '"<<UP<<"' Error : "<< e.errorCode() << ":" \
-                << e.errorMessage() );                                 \
+      creaError("SQLite update '"<<UP<<"' Error : "                    \
+               << e.errorCode() << ":"                                 \
+               << e.errorMessage() );                                  \
     }                                                                  
   //=====================================================================
 
@@ -241,7 +221,7 @@ namespace creaImageIO
   //=====================================================================
   bool SQLiteTreeHandler::DBOpen()
   {
-    //    std::cout << "### Opening SQLite database '"<<GetFileName()<<std::endl;
+    GimmickMessage(2,"Opening SQLite database '"<<GetFileName()<<std::endl);
     // OPENING FILE
     if (!boost::filesystem::exists(GetFileName())) 
       {
@@ -303,10 +283,20 @@ namespace creaImageIO
     try
       {
        std::string command;
+       // Create LEVELS table
+       command = "create table LEVELS\n";
+       command += "( Name text )\n";
+       UPDATEDB(command);
+
        // Level 0
-       command = "create table ";
+       command = "INSERT INTO Levels (Name) VALUES ('";
+       command += GetTree().GetLevelDescriptor(0).GetName();
+       command += "')";
+       UPDATEDB(command);
+
+       command = "CREATE TABLE ";
        command += GetTree().GetLevelDescriptor(0).GetName();
-       command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY,\n";
+       command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY";
        AppendAttributesSQLDefinition(0,command);
        command += "\n)";
        UPDATEDB(command);
@@ -314,9 +304,14 @@ namespace creaImageIO
        // Iterate the other Levels
        for (int l=1; l<GetTree().GetNumberOfLevels(); ++l)
          {
-           command = "create table ";
+           command = "INSERT INTO LEVELS (Name) VALUES ('";
            command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
-           command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY,\nPARENT_ID int not null,\n";       
+           command += "')";
+           UPDATEDB(command);
+           
+           command = "CREATE TABLE ";
+           command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
+           command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY,\nPARENT_ID int not null";  
            AppendAttributesSQLDefinition(l,command);
            command +=",\n";
            command +="constraint FK_PARENT foreign key (PARENT_ID) references PATIENT(ID) on delete restrict on update restrict\n)";
@@ -324,20 +319,7 @@ namespace creaImageIO
          }
        
        // Create tables *_ATTRIBUTES
-       for (int l=1; l<GetTree().GetNumberOfLevels(); ++l)
-         {
-           command = "create table ";
-           command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
-           command += "_ATTRIBUTES\n(\n";
-           command += "Key text,\n";
-           command += "Group int,\n";
-           command += "Element int,\n";            
-           command += "Name text,\n";      
-           command += "Flags int\n";       
-           command += "\n)";
-           UPDATEDB(command);
-         }
-       // Fill the tables *_ATTRIBUTES
+       // and fill the tables *_ATTRIBUTES
        DBExportTreeDescription();
        
       }
@@ -367,68 +349,68 @@ namespace creaImageIO
   void SQLiteTreeHandler::AppendAttributesSQLDefinition(int level,
                                                        std::string& s)
   {
-    /*
-    std::vector<std::string*> keys;
-    NodeTypeDescription::FieldDescriptionMapType::iterator i;
-    for (i  = GetNodeTypeDescription(c).GetFieldDescriptionMap().begin();
-        i != GetNodeTypeDescription(c).GetFieldDescriptionMap().end();
+    LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
+    for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).begin();
+        i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).end();
         ++i)
       {
-       if (i->second.flags==1) continue;
-       keys.push_back(&(i->second.key));
-      }
-    std::vector<std::string*>::iterator j;
-    for (j=keys.begin();j!=keys.end();)
-      {
-       s += **j + " text";
-       ++j;
-       if (j!=keys.end())
-         s += ",\n";
+       //      if (i->second.flags==1) continue;
+       s += ",\n";
+       s += i->GetKey();
+       s += " text";
       }
-    */
   }
   //=====================================================================
   
   //=====================================================================
   void SQLiteTreeHandler::DBExportTreeDescription()
   {
-    /*
-    //    std::cout<<"ExportNodeTypeDescriptionsToDB()"<<std::endl;
-    for (Node::Type type=Node::Patient; 
-        type<=Node::Image; 
-        type++)
+    for (int level=0; level<GetTree().GetNumberOfLevels(); ++level)
       {
-       NodeTypeDescription::FieldDescriptionMapType::iterator i;
-       for (i = GetNodeTypeDescription(type).GetFieldDescriptionMap().begin();
-            i!= GetNodeTypeDescription(type).GetFieldDescriptionMap().end();
-            i++)
+       std::string command;
+       command = "CREATE TABLE ";
+       command += GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName();
+       command += "_Attributes\n(\n";
+       command += "Key text,\n";
+       command += "Name text,\n";          
+       command += "DicomGroup int,\n";
+       command += "DicomElement int,\n";           
+       command += "Flags int\n";           
+       command += "\n)";
+       UPDATEDB(command);
+       LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
+       for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).begin();
+            i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).end();
+            ++i)
          {
            
            std::stringstream insert;
            insert << "INSERT INTO "
-                  << std::string(SQLiteTreeHandlerStructure::Table(type))
-                  << "_FIELDS (Key,DicomGroup,DicomElement,Name,Flags) "
+                  << GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName()
+                  << "_Attributes (Key,Name,DicomGroup,DicomElement,Flags) "
                   << "VALUES ('"
-                  << (*i).second.GetKey() << "',"
-                  << (*i).second.GetGroup() << ","
-                  << (*i).second.GetElement() << ",'"
-                  << (*i).second.GetName() << "',"
-                  << (*i).second.GetFlags() << ");";
+                  << i->GetKey() << "','"
+                  << i->GetName() << "',"
+                  << i->GetGroup() << ","
+                  << i->GetElement() << ","
+                  << i->GetFlags() << ");";
 
-           //      std::cout << "** SQL = '"<<insert.str()<<"'"<<std::endl;
-           
            UPDATEDB(insert.str());
          }
       }
-    */
+    
   }
   //=====================================================================
   
   //=====================================================================
   void SQLiteTreeHandler::DBImportTreeDescription()
   {
-    //    std::cout<<"ImportNodeTypeDescriptionsFromDB()"<<std::endl;
+    GimmickMessage(3,"ImportTreeDescription"<<std::endl);
+    
+    //    tree::Description& desc = GetTree().GetDescription();
     /*
+
     for (Node::Type type=Node::Patient; 
         type<=Node::Image; 
         type++)
@@ -464,7 +446,7 @@ namespace creaImageIO
     //=====================================================================
   bool SQLiteTreeHandler::DBStructureIsValid()
   {
-    bool success = false; //true;
+    bool success = true;
 
     // TO DO : TABLE WHICH STORES THE LEVELS
     /*
index c98f7b8cc1bff3eba1c5b838bbf756b697cf412c..df2bdd1fb0c17524cca258efcee32d75d2cbd0ad 100644 (file)
@@ -1,7 +1,7 @@
 #ifndef __creaImageIOSystem_INCLUDED__
 #define __creaImageIOSystem_INCLUDED__
 
-
+#include <creaMessageManager.h>
 
 #if defined(_WIN32)
   #ifdef CREAIMAGEIO_EXPORT_SYMBOLS
   #define CREAIMAGEIO_CDECL
 #endif // defined(_WIN32)
 
+
+#define GimmickMessage(LEV,MESS) \
+  creaMessage("Gimmick!",LEV,"[Gimmick!] "<<MESS);
+#define GimmickDebugMessage(LEV,MESS) \
+  creaDebugMessage("Gimmick!",LEV,"[Gimmick!] "<<MESS);
+
 #endif
 
index f01e26000b1b1c6a6cf9b0946c54b04facc77a28..5a3e5b47f6559dd09c95709b3a611c89ce320a40 100644 (file)
 #include <creaImageIOTreeAttributeDescriptor.h>
+#include <creaImageIOSystem.h>
 
 #include <gdcmGlobal.h>
 #include <gdcmDictSet.h>
 
+#include <boost/algorithm/string/replace.hpp>
+
 namespace creaImageIO
 {
 
   namespace tree
   {
 
+    //========================================================================
+    void AttributeDescriptor::CleanName(std::string& str) const
+    {
+      // quote must be doubled for SQL
+      //    crea::Utils::Replace( str, "'", "''" );
+      boost::algorithm::replace_all(str,"'","''");
+      // Found strange strings which contained NULL char INSIDE string 
+      int i,size=str.size();
+      for (i=0;i<size;++i) 
+       {
+         if (str[i]==0) 
+           {
+             str = str.substr(0,i);
+             break;
+           }
+       }
+    }
+    //========================================================================
+
+    //=====================================================================
+    // Ctor with key, name and flags
+     AttributeDescriptor::AttributeDescriptor(const std::string& key,
+                                            const std::string& name,
+                                            unsigned int flags)
+      : mKey(key), mName(name), mGroup(0), mElement(0), mFlags(flags)
+    {
+
+      CleanName(mName);
+      GimmickDebugMessage(3,"AttributeDescriptor : '"<<key
+                         <<"' ["<<flags<<"]"<<std::endl);
+      GimmickDebugMessage(3,"='"<<mName<<"'"<<std::endl);
+    }
 
-    // Ctor with name and flags
-    // If the name is of the form "1056|8948" (a pipe at 5th position)
-    // it is interpreted as a Dicom Tag 
+    //=====================================================================
+
+     //=====================================================================
+   // Ctor with dicom group, elem and flags
+    // The key is built as 'Dgroup_elem'
     // The user name is retreived from dicom dictionnary
-    // and the group and elem are filled
-    AttributeDescriptor::AttributeDescriptor(const std::string& key,
+    AttributeDescriptor::AttributeDescriptor(unsigned short group,
+                                            unsigned short element,
                                             unsigned int flags)
-      : mKey(key), mGroup(0), mElement(0), mFlags(flags)
+      : mGroup(group), mElement(element), mFlags(flags)
     {
-      // Is the key a Dicom tag ?
-      if ((key.size()==9)&&(key[4]=='|'))
+      
+      //GDCM_NAME_SPACE::TagKey tag(group,element);
+      char ctag[12];
+      sprintf(ctag,"D%04x_%04x",group,element);
+      std::string tag(ctag);
+
+      GimmickDebugMessage(3,"AttributeDescriptor : '"<<tag
+                         <<"' ["<<flags<<"]"<<std::endl);
+
+      mKey = "D" + tag;
+
+      // Retrieve the name from gdcm dict
+      GDCM_NAME_SPACE::DictEntry* entry =
+       GDCM_NAME_SPACE::Global::GetDicts()
+       ->GetDefaultPubDict()->GetEntry(mGroup,mElement);
+
+      if (entry)
        {
-         // Decode group & elem
-         sscanf(key.c_str(),"%04x|%04x",&mGroup,&mElement);
-         // Retrieve the name from gdcm dict
-         GDCM_NAME_SPACE::DictEntry* entry =
-           GDCM_NAME_SPACE::Global::GetDicts()
-           ->GetDefaultPubDict()->GetEntry(mGroup,mElement);
          mName = entry->GetName();
+         CleanName(mName);
+         GimmickDebugMessage(3,"='"<<mName<<"'"<<std::endl);
        }
       else
        {
-         mName = mKey;
+         GimmickMessage(1,"!! WARNING : tag '"<<tag
+                        <<"' is not in DICOM dictionnary ! "
+                        <<"Considering it as a user attribute"
+                        << std::endl);
+         mName = "UNKNOWN";
+         mGroup = mElement = 0;
        }
+      
     }
+    //=====================================================================
 
 
+    //=====================================================================
+    /// Extracts group and element from a key of the form "Dgroup_elem" 
+    void AttributeDescriptor::GetDicomGroupElementFromKey(const std::string& key,
+                                                         unsigned short& group,
+                                                         unsigned short& elem)
+    {
+      group = elem = 0;
+      if ( (key.size()==10) &&
+          (key[0] == 'D') &&
+          (key[5] == '_') )
+       {
+         sscanf(key.c_str(),"D%04x_%04x",&group,&elem);
+       }
+      return;
+    }
+    //=====================================================================
 
   } // EO namespace tree
 
index cc78838797e437fc2193ec36ad388aeef20a79f9..dc734bd62964469ef4d4600890d1366d5192866d 100644 (file)
@@ -27,15 +27,18 @@ namespace creaImageIO
        : mKey(""), mName(""), mGroup(0), mElement(0), mFlags(0)
       {
       }
-      // Ctor with key and flags
-      // If the key is of the form "0020|000E" 
-      // (Two hex short separated by a pipe at 5th position)
-      // it is interpreted as a Dicom Tag 
-      // The user name is retreived from dicom dictionnary
-      // and the group and elem are filled
-      // Else the name is set to the key
+      // Ctor with key, name and flags
       AttributeDescriptor(const std::string& key,
+                         const std::string& name,
+                         unsigned int flags = 0);
+      // Ctor with dicom group, elem and flags
+      // The key is built as 'Dgroup_elem'
+      // The user name is retreived from dicom dictionnary
+      AttributeDescriptor(unsigned short group,
+                         unsigned short element,
                          unsigned int flags = 0);
+      /// Returns the key of the attribute
+      const std::string& GetKey() const { return mKey; }
       /// Returns the name of the attribute
       const std::string& GetName() const { return mName; }
       /// Returns the DICOM group code of the attribute
@@ -45,6 +48,14 @@ namespace creaImageIO
       /// Returns the flags of the attribute
       unsigned int GetFlags() const { return mFlags; }
     
+      /// Extracts group and element from a key of the form "Dgroup_elem" 
+      static void GetDicomGroupElementFromKey(const std::string& key,
+                                             unsigned short& group,
+                                             unsigned short& elem);
+      /// Cleans the name:
+      /// Replace simple quote by double quotes
+      /// Cut string at NULL chars 
+      void CleanName(std::string& str) const;
     private:
       std::string mKey;
       std::string mName;
index fc4166f7d0b327046fa1ff8dfd2295e92b968c94..6c253ba1286a1f235a7d2e16cc882094a75d9723 100644 (file)
@@ -45,84 +45,86 @@ namespace creaImageIO
       // Creates the level 0 descriptor 
       CreateLevel0Descriptor();
       // Creates the attribute "Name"
-      GetAttributeDescriptorList(0).push_back(AttributeDescriptor("Name"));
+      GetAttributeDescriptorList(0).push_back(AttributeDescriptor("Name","Name"));
       
       // Patient level
       GetLevelDescriptorList().push_back(LevelDescriptor("Patient"));
-      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor("0010|0010",   // Patient name
+      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor(0x0010,0x0010,   // Patient name
                                                                   AttributeDescriptor::LABEL));
-      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor("0010|0040")); // Patient sex
-      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor("0010|0030")); // Patient birthday
-      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor("0010|0020",   // Patient ID
+      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor(0x0010,0x0040)); // Patient sex
+      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor(0x0010,0x0030)); // Patient birthday
+      GetAttributeDescriptorList(1).push_back(AttributeDescriptor(0x0010,0x0020,   // Patient ID
                                                                  AttributeDescriptor::KEY));
  
       // Study-series level
       GetLevelDescriptorList().push_back(LevelDescriptor("Series"));
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0060",    // Modality
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0060,    // Modality
                                                                  AttributeDescriptor::LABEL));
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|1030")); // Study Description
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|103E")); // Description
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0080")); // Institution Name
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0081")); // Institution Adress
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|1010")); // Station Name
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|1048")); // Physician of Record
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|1050")); // Performing Physician's Name
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0018|1030")); // Protocol Name
-
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0020|0010")); // Study ID
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0020")); // Study Date
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0030")); // Study Time
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0050")); // Study Accession Number
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0005")); // Specific character set
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0021")); // Series Date
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0008|0031")); // Series time
-
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0020|000D",   // Study Instance UID  
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x1030)); // Study Description
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x103E)); // Description
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0080)); // Institution Name
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0081)); // Institution Adress
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x1010)); // Station Name
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x1048)); // Physician of Record
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x1050)); // Performing Physician's Name
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0018,0x1030)); // Protocol Name
+
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x0010)); // Study ID
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0020)); // Study Date
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0030)); // Study Time
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0050)); // Study Accession Number
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0005)); // Specific character set
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0021)); // Series Date
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0031)); // Series time
+
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x000D,   // Study Instance UID  
                                                                  AttributeDescriptor::KEY));
-      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor("0020|000E",   // Series Instance UID  
-                                                                 AttributeDescriptor::KEY | 
+      GetAttributeDescriptorList(2).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x000E,   // Series Instance UID  
+                                                                 AttributeDescriptor::KEY |
                                                                  AttributeDescriptor::LABEL));
      
 
       // Image level
       GetLevelDescriptorList().push_back(LevelDescriptor("Image"));
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|0013")); // Image Number
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x0013)); // Image Number
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0010")); // Rows
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0011")); // Columns
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0012")); // Planes
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0002")); // Sample per pixels
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0008")); // Number of Frames 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0004")); // Photometric Interpretation
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0103")); // Pixel Representation
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0010)); // Rows
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0011)); // Columns
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0012)); // Planes
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0002)); // Sample per pixels
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0008)); // Number of Frames 
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0004)); // Photometric Interpretation
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0103)); // Pixel Representation
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|0032")); // Image Position Patient
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|0037")); // Image Orientation Patient
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|1041")); // Slice Location
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0006")); // Planar Configuration
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x0032)); // Image Position Patient
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x0037)); // Image Orientation Patient
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x1041)); // Slice Location
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0006)); // Planar Configuration
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0030")); // Pixel Spacing
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0100")); // AlocatedBits
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0028|0101")); // StoredBits
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0030)); // Pixel Spacing
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0100)); // AlocatedBits
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x0101)); // StoredBits
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0008|0008")); // Image Type
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0008|0023")); // Content Date
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0008|0033")); // Content Time
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0008)); // Image Type
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0023)); // Content Date
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0033)); // Content Time
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|4000")); // Image Comments
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x4000)); // Image Comments
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0004|1500",   // File Name
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0004,0x1500,   // File Name
                                                                  AttributeDescriptor::LABEL));
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0004|1052")); // Rescale Intercept
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0004|1053")); // Rescale Slope
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x1052)); // Rescale Intercept
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0028,0x1053)); // Rescale Slope
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0050|0004")); // Calibration Image
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0050,0x0004)); // Calibration Image
 
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0020|0052",   // Frame Reference UID
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0020,0x0052,   // Frame Reference UID
                                                                  AttributeDescriptor::KEY));
-      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("0008|0016")); // SOP Class UID
-      
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor(0x0008,0x0016)); // SOP Class UID
+      GetAttributeDescriptorList(3).push_back(AttributeDescriptor("FullFileName",  // Full file name
+                                                                 "Full file name")); 
+                                                                 
      
     }
     //==================================================================
diff --git a/src2/doxygen/CMakeLists.txt b/src2/doxygen/CMakeLists.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6d19d78
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,98 @@
+
+
+MACRO(CREA_BUILD_DOXYGEN_DOC NAME INPUT DOC_RELATIVE_INSTALL_PATH PREDEFINED)
+
+  #--------------------------------------------------------------------------
+  SET(USE_DOXYGEN ON CACHE BOOL "" FORCE)
+  
+  # Name
+  SET(DOXYGEN_PROJECT_NAME "${NAME}")
+
+  # Inputs
+  STRING(REGEX REPLACE ";" " " DOXYGEN_INPUT "${INPUT}")
+
+  # Output dirs
+  SET(DOXYGEN_HTML_OUTPUT ".")
+  SET(DOXYGEN_OUTPUT ${PROJECT_BINARY_DIR}/${DOC_RELATIVE_INSTALL_PATH})
+  IF(NOT IS_DIRECTORY ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT})
+    FILE(MAKE_DIRECTORY ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT})
+  ENDIF(NOT IS_DIRECTORY ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT})
+
+  # Doc exclude
+  SET(DOXYGEN_EXCLUDE "")
+  STRING(REGEX REPLACE ";" " " DOXYGEN_EXCLUDE "${DOXYGEN_EXCLUDE}")
+
+  # Log file name 
+  SET(DOXYGEN_LOGFILE "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/doxygen.log")
+
+  # Predefined symbols
+  STRING(REGEX REPLACE ";" " " DOXYGEN_DOC_PREDEFINED "${PREDEFINED}")
+  
+  #---------------------------------------------------------------------------
+  # DOT verification
+  IF(DOT)
+    GET_FILENAME_COMPONENT(DOXYGEN_DOT_PATH ${DOT} PATH)
+    SET(DOXYGEN_HAVE_DOT "YES")
+  ELSE(DOT)
+    SET(DOXYGEN_DOT_PATH "")
+    SET(DOXYGEN_HAVE_DOT "NO")
+  ENDIF(DOT)
+  
+  #---------------------------------------------------------------------------
+  # Create file and project
+  CONFIGURE_FILE(
+    ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/Doxyfile.txt.in
+    ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/Doxyfile.txt
+    @ONLY IMMEDIATE
+    )
+  
+  ADD_CUSTOM_COMMAND(
+    OUTPUT ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT}/index.html
+    COMMAND 
+    ${DOXYGEN}
+    ARGS
+    ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/Doxyfile.txt
+    #  DEPENDS bbtk bbi 
+    )
+  
+  ADD_CUSTOM_TARGET(doxygen_${NAME} ALL
+    DEPENDS  ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT}/index.html
+    )
+  
+#  INSTALL(
+#    DIRECTORY
+#    ${DOXYGEN_OUTPUT}/${DOXYGEN_HTML_OUTPUT}
+#    DESTINATION
+#    ${BBTK_DOXYGEN_INSTALL_PATH}/${DOC_RELATIVE_INSTALL_PATH}
+#    )
+  #--------------------------------------------------------------------------
+
+ENDMACRO(CREA_BUILD_DOXYGEN_DOC)
+
+
+
+#CONFIGURE_FILE(
+#  ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/CodingStyle.html
+#  ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/CodingStyle.html
+#  IMMEDIATE
+#  )
+CONFIGURE_FILE(
+  ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/DoxyMainPage.txt.in
+  ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/DoxyMainPage.txt
+  @ONLY IMMEDIATE
+  )
+
+SET(INPUT 
+  ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/DoxyMainPage.txt
+  ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src
+#  ${PROJECT_SOURCE_DIR}/appli
+  )
+
+CREA_BUILD_DOXYGEN_DOC(
+  "CreaImageIO" 
+  "${INPUT}" 
+  "doxygen" 
+  "${DOXYGEN_DOC_PREDEFINED}"
+  )
+
diff --git a/src2/doxygen/DoxyMainPage.txt.in b/src2/doxygen/DoxyMainPage.txt.in
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b52ee6f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,14 @@
+/**
+ * \mainpage creaImageIO documentation
+
+\htmlonly 
+
+
+\endhtmlonly
+
+
+
+
+         
+ */
diff --git a/src2/doxygen/Doxyfile.txt.in b/src2/doxygen/Doxyfile.txt.in
new file mode 100644 (file)
index 0000000..44afa2a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1358 @@
+# Doxyfile 1.5.5
+
+# This file describes the settings to be used by the documentation system
+# doxygen (www.doxygen.org) for a project
+#
+# All text after a hash (#) is considered a comment and will be ignored
+# The format is:
+#       TAG = value [value, ...]
+# For lists items can also be appended using:
+#       TAG += value [value, ...]
+# Values that contain spaces should be placed between quotes (" ")
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Project related configuration options
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# This tag specifies the encoding used for all characters in the config file 
+# that follow. The default is UTF-8 which is also the encoding used for all 
+# text before the first occurrence of this tag. Doxygen uses libiconv (or the 
+# iconv built into libc) for the transcoding. See 
+# http://www.gnu.org/software/libiconv for the list of possible encodings.
+
+DOXYFILE_ENCODING      = UTF-8
+
+# The PROJECT_NAME tag is a single word (or a sequence of words surrounded 
+# by quotes) that should identify the project.
+
+PROJECT_NAME           = @DOXYGEN_PROJECT_NAME@
+
+# The PROJECT_NUMBER tag can be used to enter a project or revision number. 
+# This could be handy for archiving the generated documentation or 
+# if some version control system is used.
+
+PROJECT_NUMBER         = @PROJECT_VERSION@
+
+# The OUTPUT_DIRECTORY tag is used to specify the (relative or absolute) 
+# base path where the generated documentation will be put. 
+# If a relative path is entered, it will be relative to the location 
+# where doxygen was started. If left blank the current directory will be used.
+
+OUTPUT_DIRECTORY       = @DOXYGEN_OUTPUT@
+
+# If the CREATE_SUBDIRS tag is set to YES, then doxygen will create 
+# 4096 sub-directories (in 2 levels) under the output directory of each output 
+# format and will distribute the generated files over these directories. 
+# Enabling this option can be useful when feeding doxygen a huge amount of 
+# source files, where putting all generated files in the same directory would 
+# otherwise cause performance problems for the file system.
+
+CREATE_SUBDIRS         = NO
+
+# The OUTPUT_LANGUAGE tag is used to specify the language in which all 
+# documentation generated by doxygen is written. Doxygen will use this 
+# information to generate all constant output in the proper language. 
+# The default language is English, other supported languages are: 
+# Afrikaans, Arabic, Brazilian, Catalan, Chinese, Chinese-Traditional, 
+# Croatian, Czech, Danish, Dutch, Farsi, Finnish, French, German, Greek, 
+# Hungarian, Italian, Japanese, Japanese-en (Japanese with English messages), 
+# Korean, Korean-en, Lithuanian, Norwegian, Macedonian, Persian, Polish, 
+# Portuguese, Romanian, Russian, Serbian, Slovak, Slovene, Spanish, Swedish, 
+# and Ukrainian.
+
+OUTPUT_LANGUAGE        = English
+
+# If the BRIEF_MEMBER_DESC tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# include brief member descriptions after the members that are listed in 
+# the file and class documentation (similar to JavaDoc). 
+# Set to NO to disable this.
+
+BRIEF_MEMBER_DESC      = YES
+
+# If the REPEAT_BRIEF tag is set to YES (the default) Doxygen will prepend 
+# the brief description of a member or function before the detailed description. 
+# Note: if both HIDE_UNDOC_MEMBERS and BRIEF_MEMBER_DESC are set to NO, the 
+# brief descriptions will be completely suppressed.
+
+REPEAT_BRIEF           = YES
+
+# This tag implements a quasi-intelligent brief description abbreviator 
+# that is used to form the text in various listings. Each string 
+# in this list, if found as the leading text of the brief description, will be 
+# stripped from the text and the result after processing the whole list, is 
+# used as the annotated text. Otherwise, the brief description is used as-is. 
+# If left blank, the following values are used ("$name" is automatically 
+# replaced with the name of the entity): "The $name class" "The $name widget" 
+# "The $name file" "is" "provides" "specifies" "contains" 
+# "represents" "a" "an" "the"
+
+ABBREVIATE_BRIEF       = 
+
+# If the ALWAYS_DETAILED_SEC and REPEAT_BRIEF tags are both set to YES then 
+# Doxygen will generate a detailed section even if there is only a brief 
+# description.
+
+ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
+
+# If the INLINE_INHERITED_MEMB tag is set to YES, doxygen will show all 
+# inherited members of a class in the documentation of that class as if those 
+# members were ordinary class members. Constructors, destructors and assignment 
+# operators of the base classes will not be shown.
+
+INLINE_INHERITED_MEMB  = YES
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
+# path before files name in the file list and in the header files. If set 
+# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used.
+
+FULL_PATH_NAMES        = YES
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then the STRIP_FROM_PATH tag 
+# can be used to strip a user-defined part of the path. Stripping is 
+# only done if one of the specified strings matches the left-hand part of 
+# the path. The tag can be used to show relative paths in the file list. 
+# If left blank the directory from which doxygen is run is used as the 
+# path to strip.
+
+STRIP_FROM_PATH        = 
+
+# The STRIP_FROM_INC_PATH tag can be used to strip a user-defined part of 
+# the path mentioned in the documentation of a class, which tells 
+# the reader which header file to include in order to use a class. 
+# If left blank only the name of the header file containing the class 
+# definition is used. Otherwise one should specify the include paths that 
+# are normally passed to the compiler using the -I flag.
+
+STRIP_FROM_INC_PATH    = 
+
+# If the SHORT_NAMES tag is set to YES, doxygen will generate much shorter 
+# (but less readable) file names. This can be useful is your file systems 
+# doesn't support long names like on DOS, Mac, or CD-ROM.
+
+SHORT_NAMES            = NO
+
+# If the JAVADOC_AUTOBRIEF tag is set to YES then Doxygen 
+# will interpret the first line (until the first dot) of a JavaDoc-style 
+# comment as the brief description. If set to NO, the JavaDoc 
+# comments will behave just like regular Qt-style comments 
+# (thus requiring an explicit @brief command for a brief description.)
+
+JAVADOC_AUTOBRIEF      = NO
+
+# If the QT_AUTOBRIEF tag is set to YES then Doxygen will 
+# interpret the first line (until the first dot) of a Qt-style 
+# comment as the brief description. If set to NO, the comments 
+# will behave just like regular Qt-style comments (thus requiring 
+# an explicit \brief command for a brief description.)
+
+QT_AUTOBRIEF           = NO
+
+# The MULTILINE_CPP_IS_BRIEF tag can be set to YES to make Doxygen 
+# treat a multi-line C++ special comment block (i.e. a block of //! or /// 
+# comments) as a brief description. This used to be the default behaviour. 
+# The new default is to treat a multi-line C++ comment block as a detailed 
+# description. Set this tag to YES if you prefer the old behaviour instead.
+
+MULTILINE_CPP_IS_BRIEF = NO
+
+# If the DETAILS_AT_TOP tag is set to YES then Doxygen 
+# will output the detailed description near the top, like JavaDoc.
+# If set to NO, the detailed description appears after the member 
+# documentation.
+
+DETAILS_AT_TOP         = NO
+
+# If the INHERIT_DOCS tag is set to YES (the default) then an undocumented 
+# member inherits the documentation from any documented member that it 
+# re-implements.
+
+INHERIT_DOCS           = YES
+
+# If the SEPARATE_MEMBER_PAGES tag is set to YES, then doxygen will produce 
+# a new page for each member. If set to NO, the documentation of a member will 
+# be part of the file/class/namespace that contains it.
+
+SEPARATE_MEMBER_PAGES  = NO
+
+# The TAB_SIZE tag can be used to set the number of spaces in a tab. 
+# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments.
+
+TAB_SIZE               = 8
+
+# This tag can be used to specify a number of aliases that acts 
+# as commands in the documentation. An alias has the form "name=value". 
+# For example adding "sideeffect=\par Side Effects:\n" will allow you to 
+# put the command \sideeffect (or @sideeffect) in the documentation, which 
+# will result in a user-defined paragraph with heading "Side Effects:". 
+# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
+
+ALIASES                = 
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C 
+# sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
+# For instance, some of the names that are used will be different. The list 
+# of all members will be omitted, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C  = NO
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA tag to YES if your project consists of Java 
+# sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for 
+# Java. For instance, namespaces will be presented as packages, qualified 
+# scopes will look different, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA   = NO
+
+# Set the OPTIMIZE_FOR_FORTRAN tag to YES if your project consists of Fortran 
+# sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for 
+# Fortran.
+
+OPTIMIZE_FOR_FORTRAN   = NO
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_VHDL tag to YES if your project consists of VHDL 
+# sources. Doxygen will then generate output that is tailored for 
+# VHDL.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_VHDL   = NO
+
+# If you use STL classes (i.e. std::string, std::vector, etc.) but do not want 
+# to include (a tag file for) the STL sources as input, then you should 
+# set this tag to YES in order to let doxygen match functions declarations and 
+# definitions whose arguments contain STL classes (e.g. func(std::string); v.s. 
+# func(std::string) {}). This also make the inheritance and collaboration 
+# diagrams that involve STL classes more complete and accurate.
+
+BUILTIN_STL_SUPPORT    = NO
+
+# If you use Microsoft's C++/CLI language, you should set this option to YES to
+# enable parsing support.
+
+CPP_CLI_SUPPORT        = NO
+
+# Set the SIP_SUPPORT tag to YES if your project consists of sip sources only. 
+# Doxygen will parse them like normal C++ but will assume all classes use public 
+# instead of private inheritance when no explicit protection keyword is present.
+
+SIP_SUPPORT            = NO
+
+# If member grouping is used in the documentation and the DISTRIBUTE_GROUP_DOC 
+# tag is set to YES, then doxygen will reuse the documentation of the first 
+# member in the group (if any) for the other members of the group. By default 
+# all members of a group must be documented explicitly.
+
+DISTRIBUTE_GROUP_DOC   = NO
+
+# Set the SUBGROUPING tag to YES (the default) to allow class member groups of 
+# the same type (for instance a group of public functions) to be put as a 
+# subgroup of that type (e.g. under the Public Functions section). Set it to 
+# NO to prevent subgrouping. Alternatively, this can be done per class using 
+# the \nosubgrouping command.
+
+SUBGROUPING            = YES
+
+# When TYPEDEF_HIDES_STRUCT is enabled, a typedef of a struct, union, or enum 
+# is documented as struct, union, or enum with the name of the typedef. So 
+# typedef struct TypeS {} TypeT, will appear in the documentation as a struct 
+# with name TypeT. When disabled the typedef will appear as a member of a file, 
+# namespace, or class. And the struct will be named TypeS. This can typically 
+# be useful for C code in case the coding convention dictates that all compound 
+# types are typedef'ed and only the typedef is referenced, never the tag name.
+
+TYPEDEF_HIDES_STRUCT   = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Build related configuration options
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the EXTRACT_ALL tag is set to YES doxygen will assume all entities in 
+# documentation are documented, even if no documentation was available. 
+# Private class members and static file members will be hidden unless 
+# the EXTRACT_PRIVATE and EXTRACT_STATIC tags are set to YES
+
+EXTRACT_ALL            = YES
+
+# If the EXTRACT_PRIVATE tag is set to YES all private members of a class 
+# will be included in the documentation.
+
+EXTRACT_PRIVATE        = YES
+
+# If the EXTRACT_STATIC tag is set to YES all static members of a file 
+# will be included in the documentation.
+
+EXTRACT_STATIC         = YES
+
+# If the EXTRACT_LOCAL_CLASSES tag is set to YES classes (and structs) 
+# defined locally in source files will be included in the documentation. 
+# If set to NO only classes defined in header files are included.
+
+EXTRACT_LOCAL_CLASSES  = YES
+
+# This flag is only useful for Objective-C code. When set to YES local 
+# methods, which are defined in the implementation section but not in 
+# the interface are included in the documentation. 
+# If set to NO (the default) only methods in the interface are included.
+
+EXTRACT_LOCAL_METHODS  = NO
+
+# If this flag is set to YES, the members of anonymous namespaces will be 
+# extracted and appear in the documentation as a namespace called 
+# 'anonymous_namespace{file}', where file will be replaced with the base 
+# name of the file that contains the anonymous namespace. By default 
+# anonymous namespace are hidden.
+
+EXTRACT_ANON_NSPACES   = NO
+
+# If the HIDE_UNDOC_MEMBERS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# undocumented members of documented classes, files or namespaces. 
+# If set to NO (the default) these members will be included in the 
+# various overviews, but no documentation section is generated. 
+# This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
+
+HIDE_UNDOC_MEMBERS     = NO
+
+# If the HIDE_UNDOC_CLASSES tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# undocumented classes that are normally visible in the class hierarchy. 
+# If set to NO (the default) these classes will be included in the various 
+# overviews. This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
+
+HIDE_UNDOC_CLASSES     = NO
+
+# If the HIDE_FRIEND_COMPOUNDS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# friend (class|struct|union) declarations. 
+# If set to NO (the default) these declarations will be included in the 
+# documentation.
+
+HIDE_FRIEND_COMPOUNDS  = NO
+
+# If the HIDE_IN_BODY_DOCS tag is set to YES, Doxygen will hide any 
+# documentation blocks found inside the body of a function. 
+# If set to NO (the default) these blocks will be appended to the 
+# function's detailed documentation block.
+
+HIDE_IN_BODY_DOCS      = NO
+
+# The INTERNAL_DOCS tag determines if documentation 
+# that is typed after a \internal command is included. If the tag is set 
+# to NO (the default) then the documentation will be excluded. 
+# Set it to YES to include the internal documentation.
+
+INTERNAL_DOCS          = NO
+
+# If the CASE_SENSE_NAMES tag is set to NO then Doxygen will only generate 
+# file names in lower-case letters. If set to YES upper-case letters are also 
+# allowed. This is useful if you have classes or files whose names only differ 
+# in case and if your file system supports case sensitive file names. Windows 
+# and Mac users are advised to set this option to NO.
+
+CASE_SENSE_NAMES       = YES
+
+# If the HIDE_SCOPE_NAMES tag is set to NO (the default) then Doxygen 
+# will show members with their full class and namespace scopes in the 
+# documentation. If set to YES the scope will be hidden.
+
+HIDE_SCOPE_NAMES       = NO
+
+# If the SHOW_INCLUDE_FILES tag is set to YES (the default) then Doxygen 
+# will put a list of the files that are included by a file in the documentation 
+# of that file.
+
+SHOW_INCLUDE_FILES     = YES
+
+# If the INLINE_INFO tag is set to YES (the default) then a tag [inline] 
+# is inserted in the documentation for inline members.
+
+INLINE_INFO            = YES
+
+# If the SORT_MEMBER_DOCS tag is set to YES (the default) then doxygen 
+# will sort the (detailed) documentation of file and class members 
+# alphabetically by member name. If set to NO the members will appear in 
+# declaration order.
+
+SORT_MEMBER_DOCS       = YES
+
+# If the SORT_BRIEF_DOCS tag is set to YES then doxygen will sort the 
+# brief documentation of file, namespace and class members alphabetically 
+# by member name. If set to NO (the default) the members will appear in 
+# declaration order.
+
+SORT_BRIEF_DOCS        = NO
+
+# If the SORT_GROUP_NAMES tag is set to YES then doxygen will sort the 
+# hierarchy of group names into alphabetical order. If set to NO (the default) 
+# the group names will appear in their defined order.
+
+SORT_GROUP_NAMES       = NO
+
+# If the SORT_BY_SCOPE_NAME tag is set to YES, the class list will be 
+# sorted by fully-qualified names, including namespaces. If set to 
+# NO (the default), the class list will be sorted only by class name, 
+# not including the namespace part. 
+# Note: This option is not very useful if HIDE_SCOPE_NAMES is set to YES.
+# Note: This option applies only to the class list, not to the 
+# alphabetical list.
+
+SORT_BY_SCOPE_NAME     = NO
+
+# The GENERATE_TODOLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the todo list. This list is created by putting \todo 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_TODOLIST      = YES
+
+# The GENERATE_TESTLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the test list. This list is created by putting \test 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_TESTLIST      = YES
+
+# The GENERATE_BUGLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the bug list. This list is created by putting \bug 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_BUGLIST       = YES
+
+# The GENERATE_DEPRECATEDLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the deprecated list. This list is created by putting 
+# \deprecated commands in the documentation.
+
+GENERATE_DEPRECATEDLIST= YES
+
+# The ENABLED_SECTIONS tag can be used to enable conditional 
+# documentation sections, marked by \if sectionname ... \endif.
+
+ENABLED_SECTIONS       = 
+
+# The MAX_INITIALIZER_LINES tag determines the maximum number of lines 
+# the initial value of a variable or define consists of for it to appear in 
+# the documentation. If the initializer consists of more lines than specified 
+# here it will be hidden. Use a value of 0 to hide initializers completely. 
+# The appearance of the initializer of individual variables and defines in the 
+# documentation can be controlled using \showinitializer or \hideinitializer 
+# command in the documentation regardless of this setting.
+
+MAX_INITIALIZER_LINES  = 30
+
+# Set the SHOW_USED_FILES tag to NO to disable the list of files generated 
+# at the bottom of the documentation of classes and structs. If set to YES the 
+# list will mention the files that were used to generate the documentation.
+
+SHOW_USED_FILES        = YES
+
+# If the sources in your project are distributed over multiple directories 
+# then setting the SHOW_DIRECTORIES tag to YES will show the directory hierarchy 
+# in the documentation. The default is NO.
+
+SHOW_DIRECTORIES       = YES
+
+# The FILE_VERSION_FILTER tag can be used to specify a program or script that 
+# doxygen should invoke to get the current version for each file (typically from 
+# the version control system). Doxygen will invoke the program by executing (via 
+# popen()) the command <command> <input-file>, where <command> is the value of 
+# the FILE_VERSION_FILTER tag, and <input-file> is the name of an input file 
+# provided by doxygen. Whatever the program writes to standard output 
+# is used as the file version. See the manual for examples.
+
+FILE_VERSION_FILTER    = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to warning and progress messages
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The QUIET tag can be used to turn on/off the messages that are generated 
+# by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
+
+QUIET                  = YES
+
+# The WARNINGS tag can be used to turn on/off the warning messages that are 
+# generated by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank 
+# NO is used.
+
+WARNINGS               = YES
+
+# If WARN_IF_UNDOCUMENTED is set to YES, then doxygen will generate warnings 
+# for undocumented members. If EXTRACT_ALL is set to YES then this flag will 
+# automatically be disabled.
+
+WARN_IF_UNDOCUMENTED   = YES
+
+# If WARN_IF_DOC_ERROR is set to YES, doxygen will generate warnings for 
+# potential errors in the documentation, such as not documenting some 
+# parameters in a documented function, or documenting parameters that 
+# don't exist or using markup commands wrongly.
+
+WARN_IF_DOC_ERROR      = YES
+
+# This WARN_NO_PARAMDOC option can be abled to get warnings for 
+# functions that are documented, but have no documentation for their parameters 
+# or return value. If set to NO (the default) doxygen will only warn about 
+# wrong or incomplete parameter documentation, but not about the absence of 
+# documentation.
+
+WARN_NO_PARAMDOC       = NO
+
+# The WARN_FORMAT tag determines the format of the warning messages that 
+# doxygen can produce. The string should contain the $file, $line, and $text 
+# tags, which will be replaced by the file and line number from which the 
+# warning originated and the warning text. Optionally the format may contain 
+# $version, which will be replaced by the version of the file (if it could 
+# be obtained via FILE_VERSION_FILTER)
+
+WARN_FORMAT            = "$file:$line: $text"
+
+# The WARN_LOGFILE tag can be used to specify a file to which warning 
+# and error messages should be written. If left blank the output is written 
+# to stderr.
+
+WARN_LOGFILE           = @DOXYGEN_LOGFILE@
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the input files
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The INPUT tag can be used to specify the files and/or directories that contain 
+# documented source files. You may enter file names like "myfile.cpp" or 
+# directories like "/usr/src/myproject". Separate the files or directories 
+# with spaces.
+
+INPUT                  = @DOXYGEN_INPUT@
+
+# This tag can be used to specify the character encoding of the source files 
+# that doxygen parses. Internally doxygen uses the UTF-8 encoding, which is 
+# also the default input encoding. Doxygen uses libiconv (or the iconv built 
+# into libc) for the transcoding. See http://www.gnu.org/software/libiconv for 
+# the list of possible encodings.
+
+INPUT_ENCODING         = UTF-8
+
+# If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
+# FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
+# and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
+# blank the following patterns are tested: 
+# *.c *.cc *.cxx *.cpp *.c++ *.java *.ii *.ixx *.ipp *.i++ *.inl *.h *.hh *.hxx 
+# *.hpp *.h++ *.idl *.odl *.cs *.php *.php3 *.inc *.m *.mm *.py *.f90
+
+FILE_PATTERNS          = *.h \
+                         *.cxx \
+                         *.txx
+
+# The RECURSIVE tag can be used to turn specify whether or not subdirectories 
+# should be searched for input files as well. Possible values are YES and NO. 
+# If left blank NO is used.
+
+RECURSIVE              = YES
+
+# The EXCLUDE tag can be used to specify files and/or directories that should 
+# excluded from the INPUT source files. This way you can easily exclude a 
+# subdirectory from a directory tree whose root is specified with the INPUT tag.
+
+EXCLUDE                = @DOXYGEN_EXCLUDE@
+
+# The EXCLUDE_SYMLINKS tag can be used select whether or not files or 
+# directories that are symbolic links (a Unix filesystem feature) are excluded 
+# from the input.
+
+EXCLUDE_SYMLINKS       = NO
+
+# If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
+# EXCLUDE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard patterns to exclude 
+# certain files from those directories. Note that the wildcards are matched 
+# against the file with absolute path, so to exclude all test directories 
+# for example use the pattern */test/*
+
+EXCLUDE_PATTERNS       = 
+
+# The EXCLUDE_SYMBOLS tag can be used to specify one or more symbol names 
+# (namespaces, classes, functions, etc.) that should be excluded from the 
+# output. The symbol name can be a fully qualified name, a word, or if the 
+# wildcard * is used, a substring. Examples: ANamespace, AClass, 
+# AClass::ANamespace, ANamespace::*Test
+
+EXCLUDE_SYMBOLS        = 
+
+# The EXAMPLE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
+# directories that contain example code fragments that are included (see 
+# the \include command).
+
+EXAMPLE_PATH           = 
+
+# If the value of the EXAMPLE_PATH tag contains directories, you can use the 
+# EXAMPLE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
+# and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
+# blank all files are included.
+
+EXAMPLE_PATTERNS       = *.cxx
+
+# If the EXAMPLE_RECURSIVE tag is set to YES then subdirectories will be 
+# searched for input files to be used with the \include or \dontinclude 
+# commands irrespective of the value of the RECURSIVE tag. 
+# Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
+
+EXAMPLE_RECURSIVE      = NO
+
+# The IMAGE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
+# directories that contain image that are included in the documentation (see 
+# the \image command).
+
+IMAGE_PATH             = 
+
+# The INPUT_FILTER tag can be used to specify a program that doxygen should 
+# invoke to filter for each input file. Doxygen will invoke the filter program 
+# by executing (via popen()) the command <filter> <input-file>, where <filter> 
+# is the value of the INPUT_FILTER tag, and <input-file> is the name of an 
+# input file. Doxygen will then use the output that the filter program writes 
+# to standard output.  If FILTER_PATTERNS is specified, this tag will be 
+# ignored.
+
+INPUT_FILTER           = 
+
+# The FILTER_PATTERNS tag can be used to specify filters on a per file pattern 
+# basis.  Doxygen will compare the file name with each pattern and apply the 
+# filter if there is a match.  The filters are a list of the form: 
+# pattern=filter (like *.cpp=my_cpp_filter). See INPUT_FILTER for further 
+# info on how filters are used. If FILTER_PATTERNS is empty, INPUT_FILTER 
+# is applied to all files.
+
+FILTER_PATTERNS        = 
+
+# If the FILTER_SOURCE_FILES tag is set to YES, the input filter (if set using 
+# INPUT_FILTER) will be used to filter the input files when producing source 
+# files to browse (i.e. when SOURCE_BROWSER is set to YES).
+
+FILTER_SOURCE_FILES    = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to source browsing
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the SOURCE_BROWSER tag is set to YES then a list of source files will 
+# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources. 
+# Note: To get rid of all source code in the generated output, make sure also 
+# VERBATIM_HEADERS is set to NO.
+
+SOURCE_BROWSER         = YES
+
+# Setting the INLINE_SOURCES tag to YES will include the body 
+# of functions and classes directly in the documentation.
+
+INLINE_SOURCES         = YES
+
+# Setting the STRIP_CODE_COMMENTS tag to YES (the default) will instruct 
+# doxygen to hide any special comment blocks from generated source code 
+# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible.
+
+STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
+
+# If the REFERENCED_BY_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented 
+# functions referencing it will be listed.
+
+REFERENCED_BY_RELATION = YES
+
+# If the REFERENCES_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented entities 
+# called/used by that function will be listed.
+
+REFERENCES_RELATION    = YES
+
+# If the REFERENCES_LINK_SOURCE tag is set to YES (the default)
+# and SOURCE_BROWSER tag is set to YES, then the hyperlinks from
+# functions in REFERENCES_RELATION and REFERENCED_BY_RELATION lists will
+# link to the source code.  Otherwise they will link to the documentstion.
+
+REFERENCES_LINK_SOURCE = YES
+
+# If the USE_HTAGS tag is set to YES then the references to source code 
+# will point to the HTML generated by the htags(1) tool instead of doxygen 
+# built-in source browser. The htags tool is part of GNU's global source 
+# tagging system (see http://www.gnu.org/software/global/global.html). You 
+# will need version 4.8.6 or higher.
+
+USE_HTAGS              = NO
+
+# If the VERBATIM_HEADERS tag is set to YES (the default) then Doxygen 
+# will generate a verbatim copy of the header file for each class for 
+# which an include is specified. Set to NO to disable this.
+
+VERBATIM_HEADERS       = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the alphabetical class index
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the ALPHABETICAL_INDEX tag is set to YES, an alphabetical index 
+# of all compounds will be generated. Enable this if the project 
+# contains a lot of classes, structs, unions or interfaces.
+
+ALPHABETICAL_INDEX     = YES
+
+# If the alphabetical index is enabled (see ALPHABETICAL_INDEX) then 
+# the COLS_IN_ALPHA_INDEX tag can be used to specify the number of columns 
+# in which this list will be split (can be a number in the range [1..20])
+
+COLS_IN_ALPHA_INDEX    = 3
+
+# In case all classes in a project start with a common prefix, all 
+# classes will be put under the same header in the alphabetical index. 
+# The IGNORE_PREFIX tag can be used to specify one or more prefixes that 
+# should be ignored while generating the index headers.
+
+IGNORE_PREFIX          = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the HTML output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_HTML tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate HTML output.
+
+GENERATE_HTML          = YES
+
+# The HTML_OUTPUT tag is used to specify where the HTML docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `html' will be used as the default path.
+
+HTML_OUTPUT            = @DOXYGEN_HTML_OUTPUT@
+
+# The HTML_FILE_EXTENSION tag can be used to specify the file extension for 
+# each generated HTML page (for example: .htm,.php,.asp). If it is left blank 
+# doxygen will generate files with .html extension.
+
+HTML_FILE_EXTENSION    = .html
+
+# The HTML_HEADER tag can be used to specify a personal HTML header for 
+# each generated HTML page. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard header.
+
+HTML_HEADER            = 
+
+# The HTML_FOOTER tag can be used to specify a personal HTML footer for 
+# each generated HTML page. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard footer.
+
+HTML_FOOTER            = 
+
+# The HTML_STYLESHEET tag can be used to specify a user-defined cascading 
+# style sheet that is used by each HTML page. It can be used to 
+# fine-tune the look of the HTML output. If the tag is left blank doxygen 
+# will generate a default style sheet. Note that doxygen will try to copy 
+# the style sheet file to the HTML output directory, so don't put your own 
+# stylesheet in the HTML output directory as well, or it will be erased!
+
+HTML_STYLESHEET        = 
+
+# If the HTML_ALIGN_MEMBERS tag is set to YES, the members of classes, 
+# files or namespaces will be aligned in HTML using tables. If set to 
+# NO a bullet list will be used.
+
+HTML_ALIGN_MEMBERS     = YES
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, additional index files 
+# will be generated that can be used as input for tools like the 
+# Microsoft HTML help workshop to generate a compiled HTML help file (.chm) 
+# of the generated HTML documentation.
+
+GENERATE_HTMLHELP      = NO
+
+# If the GENERATE_DOCSET tag is set to YES, additional index files 
+# will be generated that can be used as input for Apple's Xcode 3 
+# integrated development environment, introduced with OSX 10.5 (Leopard). 
+# To create a documentation set, doxygen will generate a Makefile in the 
+# HTML output directory. Running make will produce the docset in that 
+# directory and running "make install" will install the docset in 
+# ~/Library/Developer/Shared/Documentation/DocSets so that Xcode will find 
+# it at startup.
+
+GENERATE_DOCSET        = NO
+
+# When GENERATE_DOCSET tag is set to YES, this tag determines the name of the 
+# feed. A documentation feed provides an umbrella under which multiple 
+# documentation sets from a single provider (such as a company or product suite) 
+# can be grouped.
+
+DOCSET_FEEDNAME        = "Doxygen generated docs"
+
+# When GENERATE_DOCSET tag is set to YES, this tag specifies a string that 
+# should uniquely identify the documentation set bundle. This should be a 
+# reverse domain-name style string, e.g. com.mycompany.MyDocSet. Doxygen 
+# will append .docset to the name.
+
+DOCSET_BUNDLE_ID       = org.doxygen.Project
+
+# If the HTML_DYNAMIC_SECTIONS tag is set to YES then the generated HTML 
+# documentation will contain sections that can be hidden and shown after the 
+# page has loaded. For this to work a browser that supports 
+# JavaScript and DHTML is required (for instance Mozilla 1.0+, Firefox 
+# Netscape 6.0+, Internet explorer 5.0+, Konqueror, or Safari).
+
+HTML_DYNAMIC_SECTIONS  = NO
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the CHM_FILE tag can 
+# be used to specify the file name of the resulting .chm file. You 
+# can add a path in front of the file if the result should not be 
+# written to the html output directory.
+
+CHM_FILE               = 
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the HHC_LOCATION tag can 
+# be used to specify the location (absolute path including file name) of 
+# the HTML help compiler (hhc.exe). If non-empty doxygen will try to run 
+# the HTML help compiler on the generated index.hhp.
+
+HHC_LOCATION           = 
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the GENERATE_CHI flag 
+# controls if a separate .chi index file is generated (YES) or that 
+# it should be included in the master .chm file (NO).
+
+GENERATE_CHI           = NO
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the BINARY_TOC flag 
+# controls whether a binary table of contents is generated (YES) or a 
+# normal table of contents (NO) in the .chm file.
+
+BINARY_TOC             = NO
+
+# The TOC_EXPAND flag can be set to YES to add extra items for group members 
+# to the contents of the HTML help documentation and to the tree view.
+
+TOC_EXPAND             = NO
+
+# The DISABLE_INDEX tag can be used to turn on/off the condensed index at 
+# top of each HTML page. The value NO (the default) enables the index and 
+# the value YES disables it.
+
+DISABLE_INDEX          = NO
+
+# This tag can be used to set the number of enum values (range [1..20]) 
+# that doxygen will group on one line in the generated HTML documentation.
+
+ENUM_VALUES_PER_LINE   = 4
+
+# If the GENERATE_TREEVIEW tag is set to YES, a side panel will be
+# generated containing a tree-like index structure (just like the one that 
+# is generated for HTML Help). For this to work a browser that supports 
+# JavaScript, DHTML, CSS and frames is required (for instance Mozilla 1.0+, 
+# Netscape 6.0+, Internet explorer 5.0+, or Konqueror). Windows users are 
+# probably better off using the HTML help feature.
+
+GENERATE_TREEVIEW      = YES
+
+# If the treeview is enabled (see GENERATE_TREEVIEW) then this tag can be 
+# used to set the initial width (in pixels) of the frame in which the tree 
+# is shown.
+
+TREEVIEW_WIDTH         = 250
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the LaTeX output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_LATEX tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate Latex output.
+
+GENERATE_LATEX         = NO
+
+# The LATEX_OUTPUT tag is used to specify where the LaTeX docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `latex' will be used as the default path.
+
+LATEX_OUTPUT           = latex
+
+# The LATEX_CMD_NAME tag can be used to specify the LaTeX command name to be 
+# invoked. If left blank `latex' will be used as the default command name.
+
+LATEX_CMD_NAME         = latex
+
+# The MAKEINDEX_CMD_NAME tag can be used to specify the command name to 
+# generate index for LaTeX. If left blank `makeindex' will be used as the 
+# default command name.
+
+MAKEINDEX_CMD_NAME     = makeindex
+
+# If the COMPACT_LATEX tag is set to YES Doxygen generates more compact 
+# LaTeX documents. This may be useful for small projects and may help to 
+# save some trees in general.
+
+COMPACT_LATEX          = NO
+
+# The PAPER_TYPE tag can be used to set the paper type that is used 
+# by the printer. Possible values are: a4, a4wide, letter, legal and 
+# executive. If left blank a4wide will be used.
+
+PAPER_TYPE             = a4wide
+
+# The EXTRA_PACKAGES tag can be to specify one or more names of LaTeX 
+# packages that should be included in the LaTeX output.
+
+EXTRA_PACKAGES         = 
+
+# The LATEX_HEADER tag can be used to specify a personal LaTeX header for 
+# the generated latex document. The header should contain everything until 
+# the first chapter. If it is left blank doxygen will generate a 
+# standard header. Notice: only use this tag if you know what you are doing!
+
+LATEX_HEADER           = 
+
+# If the PDF_HYPERLINKS tag is set to YES, the LaTeX that is generated 
+# is prepared for conversion to pdf (using ps2pdf). The pdf file will 
+# contain links (just like the HTML output) instead of page references 
+# This makes the output suitable for online browsing using a pdf viewer.
+
+PDF_HYPERLINKS         = NO
+
+# If the USE_PDFLATEX tag is set to YES, pdflatex will be used instead of 
+# plain latex in the generated Makefile. Set this option to YES to get a 
+# higher quality PDF documentation.
+
+USE_PDFLATEX           = NO
+
+# If the LATEX_BATCHMODE tag is set to YES, doxygen will add the \\batchmode. 
+# command to the generated LaTeX files. This will instruct LaTeX to keep 
+# running if errors occur, instead of asking the user for help. 
+# This option is also used when generating formulas in HTML.
+
+LATEX_BATCHMODE        = NO
+
+# If LATEX_HIDE_INDICES is set to YES then doxygen will not 
+# include the index chapters (such as File Index, Compound Index, etc.) 
+# in the output.
+
+LATEX_HIDE_INDICES     = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the RTF output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_RTF tag is set to YES Doxygen will generate RTF output 
+# The RTF output is optimized for Word 97 and may not look very pretty with 
+# other RTF readers or editors.
+
+GENERATE_RTF           = NO
+
+# The RTF_OUTPUT tag is used to specify where the RTF docs will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `rtf' will be used as the default path.
+
+RTF_OUTPUT             = rtf
+
+# If the COMPACT_RTF tag is set to YES Doxygen generates more compact 
+# RTF documents. This may be useful for small projects and may help to 
+# save some trees in general.
+
+COMPACT_RTF            = NO
+
+# If the RTF_HYPERLINKS tag is set to YES, the RTF that is generated 
+# will contain hyperlink fields. The RTF file will 
+# contain links (just like the HTML output) instead of page references. 
+# This makes the output suitable for online browsing using WORD or other 
+# programs which support those fields. 
+# Note: wordpad (write) and others do not support links.
+
+RTF_HYPERLINKS         = NO
+
+# Load stylesheet definitions from file. Syntax is similar to doxygen's 
+# config file, i.e. a series of assignments. You only have to provide 
+# replacements, missing definitions are set to their default value.
+
+RTF_STYLESHEET_FILE    = 
+
+# Set optional variables used in the generation of an rtf document. 
+# Syntax is similar to doxygen's config file.
+
+RTF_EXTENSIONS_FILE    = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the man page output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_MAN tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate man pages
+
+GENERATE_MAN           = NO
+
+# The MAN_OUTPUT tag is used to specify where the man pages will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `man' will be used as the default path.
+
+MAN_OUTPUT             = man
+
+# The MAN_EXTENSION tag determines the extension that is added to 
+# the generated man pages (default is the subroutine's section .3)
+
+MAN_EXTENSION          = .3
+
+# If the MAN_LINKS tag is set to YES and Doxygen generates man output, 
+# then it will generate one additional man file for each entity 
+# documented in the real man page(s). These additional files 
+# only source the real man page, but without them the man command 
+# would be unable to find the correct page. The default is NO.
+
+MAN_LINKS              = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the XML output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_XML tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an XML file that captures the structure of 
+# the code including all documentation.
+
+GENERATE_XML           = NO
+
+# The XML_OUTPUT tag is used to specify where the XML pages will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `xml' will be used as the default path.
+
+XML_OUTPUT             = xml
+
+# The XML_SCHEMA tag can be used to specify an XML schema, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_SCHEMA             = 
+
+# The XML_DTD tag can be used to specify an XML DTD, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_DTD                = 
+
+# If the XML_PROGRAMLISTING tag is set to YES Doxygen will 
+# dump the program listings (including syntax highlighting 
+# and cross-referencing information) to the XML output. Note that 
+# enabling this will significantly increase the size of the XML output.
+
+XML_PROGRAMLISTING     = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options for the AutoGen Definitions output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_AUTOGEN_DEF tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an AutoGen Definitions (see autogen.sf.net) file 
+# that captures the structure of the code including all 
+# documentation. Note that this feature is still experimental 
+# and incomplete at the moment.
+
+GENERATE_AUTOGEN_DEF   = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the Perl module output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_PERLMOD tag is set to YES Doxygen will 
+# generate a Perl module file that captures the structure of 
+# the code including all documentation. Note that this 
+# feature is still experimental and incomplete at the 
+# moment.
+
+GENERATE_PERLMOD       = NO
+
+# If the PERLMOD_LATEX tag is set to YES Doxygen will generate 
+# the necessary Makefile rules, Perl scripts and LaTeX code to be able 
+# to generate PDF and DVI output from the Perl module output.
+
+PERLMOD_LATEX          = NO
+
+# If the PERLMOD_PRETTY tag is set to YES the Perl module output will be 
+# nicely formatted so it can be parsed by a human reader.  This is useful 
+# if you want to understand what is going on.  On the other hand, if this 
+# tag is set to NO the size of the Perl module output will be much smaller 
+# and Perl will parse it just the same.
+
+PERLMOD_PRETTY         = YES
+
+# The names of the make variables in the generated doxyrules.make file 
+# are prefixed with the string contained in PERLMOD_MAKEVAR_PREFIX. 
+# This is useful so different doxyrules.make files included by the same 
+# Makefile don't overwrite each other's variables.
+
+PERLMOD_MAKEVAR_PREFIX = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration options related to the preprocessor   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# evaluate all C-preprocessor directives found in the sources and include 
+# files.
+
+ENABLE_PREPROCESSING   = YES
+
+# If the MACRO_EXPANSION tag is set to YES Doxygen will expand all macro 
+# names in the source code. If set to NO (the default) only conditional 
+# compilation will be performed. Macro expansion can be done in a controlled 
+# way by setting EXPAND_ONLY_PREDEF to YES.
+
+MACRO_EXPANSION        = YES
+
+# If the EXPAND_ONLY_PREDEF and MACRO_EXPANSION tags are both set to YES 
+# then the macro expansion is limited to the macros specified with the 
+# PREDEFINED and EXPAND_AS_DEFINED tags.
+
+EXPAND_ONLY_PREDEF     = NO
+
+# If the SEARCH_INCLUDES tag is set to YES (the default) the includes files 
+# in the INCLUDE_PATH (see below) will be search if a #include is found.
+
+SEARCH_INCLUDES        = YES
+
+# The INCLUDE_PATH tag can be used to specify one or more directories that 
+# contain include files that are not input files but should be processed by 
+# the preprocessor.
+
+INCLUDE_PATH           = 
+
+# You can use the INCLUDE_FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard 
+# patterns (like *.h and *.hpp) to filter out the header-files in the 
+# directories. If left blank, the patterns specified with FILE_PATTERNS will 
+# be used.
+
+INCLUDE_FILE_PATTERNS  = 
+
+# The PREDEFINED tag can be used to specify one or more macro names that 
+# are defined before the preprocessor is started (similar to the -D option of 
+# gcc). The argument of the tag is a list of macros of the form: name 
+# or name=definition (no spaces). If the definition and the = are 
+# omitted =1 is assumed. To prevent a macro definition from being 
+# undefined via #undef or recursively expanded use the := operator 
+# instead of the = operator.
+
+PREDEFINED             = @DOXYGEN_DOC_PREDEFINED@
+
+# If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_ONLY_PREDEF tags are set to YES then 
+# this tag can be used to specify a list of macro names that should be expanded. 
+# The macro definition that is found in the sources will be used. 
+# Use the PREDEFINED tag if you want to use a different macro definition.
+
+EXPAND_AS_DEFINED      = 
+
+# If the SKIP_FUNCTION_MACROS tag is set to YES (the default) then 
+# doxygen's preprocessor will remove all function-like macros that are alone 
+# on a line, have an all uppercase name, and do not end with a semicolon. Such 
+# function macros are typically used for boiler-plate code, and will confuse 
+# the parser if not removed.
+
+SKIP_FUNCTION_MACROS   = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration::additions related to external references   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The TAGFILES option can be used to specify one or more tagfiles. 
+# Optionally an initial location of the external documentation 
+# can be added for each tagfile. The format of a tag file without 
+# this location is as follows: 
+#   TAGFILES = file1 file2 ... 
+# Adding location for the tag files is done as follows: 
+#   TAGFILES = file1=loc1 "file2 = loc2" ... 
+# where "loc1" and "loc2" can be relative or absolute paths or 
+# URLs. If a location is present for each tag, the installdox tool 
+# does not have to be run to correct the links.
+# Note that each tag file must have a unique name
+# (where the name does NOT include the path)
+# If a tag file is not located in the directory in which doxygen 
+# is run, you must also specify the path to the tagfile here.
+
+TAGFILES               = 
+
+# When a file name is specified after GENERATE_TAGFILE, doxygen will create 
+# a tag file that is based on the input files it reads.
+
+GENERATE_TAGFILE       = 
+
+# If the ALLEXTERNALS tag is set to YES all external classes will be listed 
+# in the class index. If set to NO only the inherited external classes 
+# will be listed.
+
+ALLEXTERNALS           = NO
+
+# If the EXTERNAL_GROUPS tag is set to YES all external groups will be listed 
+# in the modules index. If set to NO, only the current project's groups will 
+# be listed.
+
+EXTERNAL_GROUPS        = YES
+
+# The PERL_PATH should be the absolute path and name of the perl script 
+# interpreter (i.e. the result of `which perl').
+
+PERL_PATH              = /usr/bin/perl
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration options related to the dot tool   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the CLASS_DIAGRAMS tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate a inheritance diagram (in HTML, RTF and LaTeX) for classes with base 
+# or super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. Note that 
+# this option is superseded by the HAVE_DOT option below. This is only a 
+# fallback. It is recommended to install and use dot, since it yields more 
+# powerful graphs.
+
+CLASS_DIAGRAMS         = YES
+
+# You can define message sequence charts within doxygen comments using the \msc 
+# command. Doxygen will then run the mscgen tool (see 
+# http://www.mcternan.me.uk/mscgen/) to produce the chart and insert it in the 
+# documentation. The MSCGEN_PATH tag allows you to specify the directory where 
+# the mscgen tool resides. If left empty the tool is assumed to be found in the 
+# default search path.
+
+MSCGEN_PATH            = 
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will hide 
+# inheritance and usage relations if the target is undocumented 
+# or is not a class.
+
+HIDE_UNDOC_RELATIONS   = YES
+
+# If you set the HAVE_DOT tag to YES then doxygen will assume the dot tool is 
+# available from the path. This tool is part of Graphviz, a graph visualization 
+# toolkit from AT&T and Lucent Bell Labs. The other options in this section 
+# have no effect if this option is set to NO (the default)
+
+HAVE_DOT               = @DOXYGEN_HAVE_DOT@
+
+# If the CLASS_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for each documented class showing the direct and 
+# indirect inheritance relations. Setting this tag to YES will force the 
+# the CLASS_DIAGRAMS tag to NO.
+
+CLASS_GRAPH            = YES
+
+# If the COLLABORATION_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for each documented class showing the direct and 
+# indirect implementation dependencies (inheritance, containment, and 
+# class references variables) of the class with other documented classes.
+
+COLLABORATION_GRAPH    = YES
+
+# If the GROUP_GRAPHS and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for groups, showing the direct groups dependencies
+
+GROUP_GRAPHS           = YES
+
+# If the UML_LOOK tag is set to YES doxygen will generate inheritance and 
+# collaboration diagrams in a style similar to the OMG's Unified Modeling 
+# Language.
+
+UML_LOOK               = NO
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will show the 
+# relations between templates and their instances.
+
+TEMPLATE_RELATIONS     = YES
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDE_GRAPH, and HAVE_DOT 
+# tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each documented 
+# file showing the direct and indirect include dependencies of the file with 
+# other documented files.
+
+INCLUDE_GRAPH          = YES
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDED_BY_GRAPH, and 
+# HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each 
+# documented header file showing the documented files that directly or 
+# indirectly include this file.
+
+INCLUDED_BY_GRAPH      = YES
+
+# If the CALL_GRAPH and HAVE_DOT options are set to YES then 
+# doxygen will generate a call dependency graph for every global function 
+# or class method. Note that enabling this option will significantly increase 
+# the time of a run. So in most cases it will be better to enable call graphs 
+# for selected functions only using the \callgraph command.
+
+CALL_GRAPH             = YES
+
+# If the CALLER_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then 
+# doxygen will generate a caller dependency graph for every global function 
+# or class method. Note that enabling this option will significantly increase 
+# the time of a run. So in most cases it will be better to enable caller 
+# graphs for selected functions only using the \callergraph command.
+
+CALLER_GRAPH           = YES
+
+# If the GRAPHICAL_HIERARCHY and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will graphical hierarchy of all classes instead of a textual one.
+
+GRAPHICAL_HIERARCHY    = YES
+
+# If the DIRECTORY_GRAPH, SHOW_DIRECTORIES and HAVE_DOT tags are set to YES 
+# then doxygen will show the dependencies a directory has on other directories 
+# in a graphical way. The dependency relations are determined by the #include
+# relations between the files in the directories.
+
+DIRECTORY_GRAPH        = YES
+
+# The DOT_IMAGE_FORMAT tag can be used to set the image format of the images 
+# generated by dot. Possible values are png, jpg, or gif
+# If left blank png will be used.
+
+DOT_IMAGE_FORMAT       = png
+
+# The tag DOT_PATH can be used to specify the path where the dot tool can be 
+# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found in the path.
+
+DOT_PATH               = "@DOXYGEN_DOT_PATH@"
+
+# The DOTFILE_DIRS tag can be used to specify one or more directories that 
+# contain dot files that are included in the documentation (see the 
+# \dotfile command).
+
+DOTFILE_DIRS           = 
+
+# The MAX_DOT_GRAPH_MAX_NODES tag can be used to set the maximum number of 
+# nodes that will be shown in the graph. If the number of nodes in a graph 
+# becomes larger than this value, doxygen will truncate the graph, which is 
+# visualized by representing a node as a red box. Note that doxygen if the 
+# number of direct children of the root node in a graph is already larger than 
+# DOT_GRAPH_MAX_NODES then the graph will not be shown at all. Also note 
+# that the size of a graph can be further restricted by MAX_DOT_GRAPH_DEPTH.
+
+DOT_GRAPH_MAX_NODES    = 50
+
+# The MAX_DOT_GRAPH_DEPTH tag can be used to set the maximum depth of the 
+# graphs generated by dot. A depth value of 3 means that only nodes reachable 
+# from the root by following a path via at most 3 edges will be shown. Nodes 
+# that lay further from the root node will be omitted. Note that setting this 
+# option to 1 or 2 may greatly reduce the computation time needed for large 
+# code bases. Also note that the size of a graph can be further restricted by 
+# DOT_GRAPH_MAX_NODES. Using a depth of 0 means no depth restriction.
+
+MAX_DOT_GRAPH_DEPTH    = 0
+
+# Set the DOT_TRANSPARENT tag to YES to generate images with a transparent 
+# background. This is enabled by default, which results in a transparent 
+# background. Warning: Depending on the platform used, enabling this option 
+# may lead to badly anti-aliased labels on the edges of a graph (i.e. they 
+# become hard to read).
+
+DOT_TRANSPARENT        = NO
+
+# Set the DOT_MULTI_TARGETS tag to YES allow dot to generate multiple output 
+# files in one run (i.e. multiple -o and -T options on the command line). This 
+# makes dot run faster, but since only newer versions of dot (>1.8.10) 
+# support this, this feature is disabled by default.
+
+DOT_MULTI_TARGETS      = NO
+
+# If the GENERATE_LEGEND tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate a legend page explaining the meaning of the various boxes and 
+# arrows in the dot generated graphs.
+
+GENERATE_LEGEND        = YES
+
+# If the DOT_CLEANUP tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# remove the intermediate dot files that are used to generate 
+# the various graphs.
+
+DOT_CLEANUP            = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Configuration::additions related to the search engine   
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# The SEARCHENGINE tag specifies whether or not a search engine should be 
+# used. If set to NO the values of all tags below this one will be ignored.
+
+SEARCHENGINE           = NO