Add missing DictEntry::SetVM method

COMP: Fix warning

Removal of now useless dicomV3VM2004.dic (renamed as dicomV3.dic)

Add accesors on VM

Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
Add         to the Dicom Dictionaty of Dicom 'Value Multiplicity' field

Commenting out of probabely useless methods :
  Dict::GetDictEntryNames()
  Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
  DictSet::GetPubDictEntryNames()
  DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()

New Dicom Dictionnaty (with Value Multiplicity) is now used

Fix misstyping in Dicom V3 Dictinary (with VR)

Removal of usless methods :
PrintByName, GetDictEntryByName

Removal of useless and dangerous methods :
GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName

Removal of useless and dangerous methods :
 GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName

COMP: Fix compilation on Win32: c:\Dashboards\My Tests\gdcm\src\gdcmDicomDir.h(78) : error C2086: 'm' : redefinition
c:\Dashboards\My Tests\gdcm\src\gdcmDicomDir.h(78) : fatal error C1903: unable to recover from previous error(s); stopping compilation

COMP: remove warning

Coding Style + Doxygenation

COMP: Adding some random lib to allow compilation

COMP: Some minor fix on Win32

COMP: on win32 sintrgs.h does not exist

ENH: GetMacAddress in Util

ENH: update test for tesing MAC adrress

ENH: Found a Win32 version that seems to be working

ENH: Saving temp code until I have time for Win32 version. This will return the MAC adress which is much more intelligent than returning the IP adress

   * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] : Remove used methods
   -- BeNours

   * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
   -- BeNours

Doxygenation
+ modif Coding style :
According with Benoit (and Doxygen) we shall use, just like anybody :
T *foo
or
T &foo
and NOT
T* foo
or
T & foo
(that was gdcm-special)

Doxygenation

Doxygenation

Doxygenation

   * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
     ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
   -- BeNours

add 1.2.840.113619.5.2       Implicit VR - Little Endian GE DLX xadc

Doxygenation

Removal of last occurence of 'GetxxxByName'

   * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
   * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
     a file
   * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
     when specifying the VR
   * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
   * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
   -- BeNours

Add Rescale Slope, Rescale Intercept

   * src/gdcmDocument.cxx : amelioration of code
   -- BeNours

Update ChangeLog

   * src/gdcmDocument.cxx : correct last JPR committed code source
   -- BeNours

removal of method WriteBase

ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
      in order to allow further VR modification by user

ADD : Method ComputeGroupLength

   * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
     replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
   * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
     gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
     gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
   * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
   -- BeNours

   ADD : Add the method IsCurrentProcessorBigEndian
      (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)

BUG: Thanks to JP for bug report.

ENH: Fixing another warning about unused var

ENH: Fixing some warning about unknown class gdcm::Base

ENH: Each time a *.dic file is changed, force a complete rebuild of Dicts/ directory

BUG: Some David Clunie's baseline image have a Pixel Spacing of 0,0

   * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
     empty Print Method
   * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
   -- BeNours

   * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
   * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
   * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
   * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
   * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
   -- BeNours

   * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
     problems when compiling with the python wrapping
   -- BeNours

   * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
     writting in ImplicitVR
   -- BeNours

COMP: Fix warnings

   * Fix few compilation warnings
   -- BeNours

  * fixed some compilation warnings, and for(;;) scope error in VS6.

ENH: update for JM

dos test

ENH: Thanks to JMR patch we can now properly read jpeg fragments images, thus un black list: GE_RHAPSODE-16-MONO2-JPEG-Fragments.dcm

ENH: Apply JMR patch for gethostname

ENH: dos2unix

BUG: On VS6 the for loop does not respect scope. Therefore we either need to rename iterator or declare it outside of the for loop

BUG: On a few platerform we cannot use ios_base, we are better of using ios, for portability (Borland 5.5 and gcc 2.96)

  * FIX: new handling of JPEG decompression, especially when dicom
    frames are split into several JPEG Fragments. This makes use of
    jpeg decompression from memory buffer.  This solves reading for
    example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.

  * FIX: modified DirList::Explore in order to make it work under
    Cygwin when GDCM_DATA_ROOT is a defined by CMake as a unix
    path. The patch consists in not using the FindFirstFile win32api
    function under cygwin but rather the open dir *nix method.

Added return status variable initialization.

ENH: a few tweaks

ENH: Thanks to Benoit example I was able to rewrite the damn thing, hopefully it should work on win32

ENH: Adding an example that only work on linux, not on Win32. It shows how to create a DICOM image from scratch, we are only allowed to copy the string based entry from a previous DICOM

   * Add a Writer from nothing test
   -- BeNours

   * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
     Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
   -- BeNours

   * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
     Rename Decompressed to Raw
   * Use the API changes in gdcm::File.
   * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
     Memory leaks fixed
   -- BeNours

   * Black listing of GE_RHAPSODE-16-MONO2-JPEG-Fragments.dcm
     because when can't correctly read it at this time.
   -- BeNours

   * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
     each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
     of Frames' field
   -- BeNours

   * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
   * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
   -- BeNours

   * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
     At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
     solve it.
   -- BeNours

   * vtk/vtkGdcm*.[h|cxx] : remove warnings. Add header to files

   * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
     DocEntry. Now use methods of the Document !
   -- BeNours

   * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
   -- BeNours

   * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
   * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
   * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
   * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
     test to 0.0
   * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
   * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
     containing found sequences
   -- BeNours

   * Bug fix.
   -- BeNours

ADD todo about gdcmDebug

   * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
     not at all time
   * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
     Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
              gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
     and tests are now made on good variables
   -- BeNours

   * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
   * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
     length
   * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
   * Add vtkGdcmWriter example and test
   -- BeNours

ENH: Adding a non-working test again

ENH: jpeg_memory_src depend on the bit depth, need to mangle the name

ENH: Temporarily add jmemsrc. Patch suggest by Jean Michel Rouet, it enhance the jpeg lib to be able to decompress jpeg stream directly from memory + remove tabs

   * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
   * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
   * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
     SetValue
   * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
   * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
   -- BeNours

   * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
   * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
   -- BeNours

   * Comment unused variables
   -- BeNours

STYLE: Minor cleanup + speedup

ENH: Rewrote the cmakelist

   * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
     by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
     file isn't readable.
   -- BeNours

   * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
   * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
   * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
   * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
     method that is redondant with AddEntry.
   * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
     SQItem
   -- BeNours

BUG: This solve the infinite loop on gcc-64bits

BUG: Could not compile with gcc 64bits

   * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
   -- BeNours

   * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
   * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
   -- BeNous

   * Example/Volume2Dicom.cxx : commit with the good format
   -- BeNours

COMP: Borland could not compile gdcm... BTW there is something fishy with the protected on Borland

ENH: * Huge cleanup:
     - Remove printf / sprintf
     - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
     - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm source
     - Also remove tons of include from header files, hopefully this should speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
     - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation (plus it is not up to date)
     - remove /using namespace std/ this is BAD

ENH: Get rid of -Wall / -W / -pedantic if present this should get rid of the warnings produced by SWIG

   * Remove memory leaks on the DicomDir
   * Remove some useless datas in DicomDirObject
   * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
   -- BeNours

ENH: Remove warnings on gcc296 about aggregate partly bracketed initializer