char *[] instead of char ** to avoid M$ troubles

Port Mathieu's modif for writting JPEG2000

Forgot to commit/upload some valEntry,BinEntry vs DataEntry usefull info

Add small utility to convert 'Dense' file format iamges into DICOM images
(will be usefull to anybody that have such images ...)

Avoid warnings Darwin-gcc

comment out Txt2Mat

'Acr-NEMA' data elements
0008,0001 Length to End
0008,0010 Recognition Code
0028,0005 Image Dimension
are now automaically pushed out by FileHelper::CheckMandatoryElements
when somebody rewrittes ACR into DICOM.
Thx to Mathieu for reporting the pb.

Port Mathieu's patch from gdcm 1.2 (in gdcmValEntry.cxx)
ENH: Better patch. Always pad with space except if VR is UI
(Shouldn't we think in unifying gdcm1.3 an cvs version -post gdcm1.3-
a lot of work is done twice; interesting enhencements are now in gdcm1.3
The only pb is New vs new, right?

Add WriteDicomAsJPEG

Port Mathieu'a modif in gdcm1.2
ENH: More work toward JPEG support

Works for more old ACR-NEMA images

Display Spacings

Add uint64_t related checks

Add comments/warnings

Add verbosity

Avoid warnings

Try to remove valgrind useless warnings

Add comments on the use od Rescale Slope / Intercept

Doxygenation

Add verbosity when something wrong happens

Hope, on a day, GetYSpacing will return accurate info, for any image

Some US images have NO Pixel Spacing nor Pixel Ratio
:-(

Try to take into account 'Pixel Aspect Ratio', etc to compute Spacings.
(More to be added)

 Little patch for strange PMS Gyroscan Intera images
( Item 'starter' has a tag : 0x3f3f,0x3f00, for no apparent reason )
'PMS' means 'Philips Medical Systems', as you can guess !

Fix misstyping

Avoid messing written Dicom images when no Study UID is found

Add some comments about pixel spacing

Forgot commenting out

avoid 'type qualifier on return type is meaningless' warning with
dash8.kitware -- GDCM-ecc-64bits

Avoid some warnings

Avois some warnings

Add a *really* empty test, to know if gdcm dll is loadable or not :-(

Fix misstyping

BUG: Report bug

Add a (very) small User Guide.
More is comming.

Add some DICOM 2005 entries
(remaining ones to come)

Black outing the burnt-in number of some MRI images

avoid warnings

Waiting for the final removal of MagnetomVisionToBrucker.cxx, commented out.

Avoid Warning

Follow Mathieu's advice on #include

Avoid warnings

Check MD5

Use ToInTag
Drop PhilipsToBrucker2

Replace stupid name 'PhilipsToBrucker2' by 'ToInTag'

use AnonymizeMultiPatient.cxx

Fix troubles in AnonymizeMultiPatient.
(It ensures (hope so) that all the Patient names will be different
after anonymization.
It will probabely replace AnonymizeNoLoad

Comment out over verbose messages

Add an open source code for MD5.
This will allowed to use a rough way to anonymize Patient's name, instead of
writing an arbitrary value.
(When we anonymized a multi-patient Directory, it leaded to a mees -all the
patients with the same name-)

Fix trouble with BCC
Thx to Luca Picello for the fix.

Forget to comment out InTag

Remove PhilipsToBrucker

Rmove now useless PhilipsToBrucker.cxx (use PhilipsToBrucker2.cxx instead)

Add an application to allow anonymizing a 'multi patient' dictionnary

Move comments

Comment out GDCM_LEGACY_REMOVE function

Add huge comment on the meaning of RETired fields around Orientation and Position

Add some comments

Comment out some deprecated function (instead of GDCM_LEGACY, that seems to be
dealt with in a mood-dependant way by swig), to be able to compile everywhere.

ENH: hopefully fixed swig wrapping

BUG: Do some voodoo magic do please SWIG -buggy- c++ parser

ENH: Remove valgrind/debian false jump report

ENH: Adding a secret test to test install

ENH: Remove Install dir

COMP: I always forgot this change of API

COMP: Fix compilation against VTK CVS

ENH: Adding a test for install

COMP: Fix compilation on SunOS

ENH: Trying to cleanup oj warnings

COMP: Fix comp on dash8 (gcc296)

BUG: resultPath could be empty, cannot access char -1 in an array

ENH: Adding an option (hidden) to not install the gdcm dicts

BUG: There was still a file not installed at the proper place

Port Mathieu's modif from gdcm1.2

ENH: Structure of the dictionary was changed but not everywhere...

ENH: vtkgdcmSerieViewer2 looks like it's completely duplicated code. oh god we love duplicated code in gdcm, do we. Fix a minor warning (perf reason cast to bool thing)

ENH: Rework the GDCM_LEGACY mechanism to allow use of stronger warnings flags

BUG: Wrong install path

BUG: getenv return is not supposed to be freed

COMP: Fix comp on 64bits machine and VTK5

BUG: Wrong var

SetMedicalImageInformation is available only for VTK Major Version >= 5

BUG: On Win32 you cannot pass NULL os any ostream

ENH: On unix system path are case sensitive, using GDCM broke backward compatibility. Should be fixed now

COMP: Fix compilation, remove warning

ENH: Fix DATA_DIR install path

ENH: This time for real. Install is ok. STYLE: some minor stuff

ENH: Some more install stuff

ENH: Wrong install loc

ENH: Some cleanups

ENH: Gather the installation stuff in one place

Add some comments about
   // Description:
   // Aware user is allowed to pass his own gdcm::File *, so he may set *any Dicom field* he wants.
   // (including his own Shadow Eleents, or any gdcm::SeqEntry)
   // gdcm::FileHelper::CheckMandatoryElements() will check inconsistencies, as far as it knows how.
   // Sorry, not yet available under Python.
vtkSetMacro(GdcmFile, gdcm::File *);

and

   // gdcm cannot guess how user built his image (and therefore cannot be clever about some Dicom fields)
   // It's up to the user to tell gdcm what he did.
   // -1) user created ex nihilo his own image and wants to write it as a Dicom image.
   // USER_OWN_IMAGE
   // -2) user modified the pixels of an existing image.
   // FILTERED_IMAGE
   // -3) user created a new image, using existing a set of images (eg MIP, MPR, cartography image)
   //  CREATED_IMAGE
   // -4) user modified/added some tags *without processing* the pixels (anonymization..
   //  UNMODIFIED_PIXELS_IMAGE
   // -Probabely some more to be added
   //(see gdcmFileHelper.h for more explanations)

   void SetContentTypeToUserOwnImage()         {SetContentType(VTK_GDCM_WRITE_TYPE_USER_OWN_IMAGE);}
   void SetContentTypeToFilteredImage()        {SetContentType(VTK_GDCM_WRITE_TYPE_FILTERED_IMAGE);}
   void SetContentTypeToUserCreatedImage()     {SetContentType(VTK_GDCM_WRITE_TYPE_CREATED_IMAGE);}
   void SetContentTypeToUnmodifiedPixelsImage(){SetContentType(VTK_GDCM_WRITE_TYPE_UNMODIFIED_PIXELS_IMAGE);}

Upgrade FileHelper.InsertEntryString() to be consistent
   with DocEntrySet.InsertEntryString()

Replace deprecated InsertValEntryString method by  InsertEntryString()

Propagate Mathieu's modif around GDCM_DATA_ROOT

Propagate Mathieu's modif from 1.2 to CVS version.

ENH: A few stuff:
Do not call ResetCameraClippingRange in VTK5 and above (fixed)
Update to new API for the ZSlicer stuff in vtkImageViewer2
Add a vtkMedicalImageProperties to the writer to pass in medical information from VTK context (pretty neat...)
Minor style, avoid including too many header files

URL : http://cvs.creatis.insa-lyon.fr/viewcvs/viewcvs.cgi/gdcm/?view=query&branch=&who=malaterre&date=explicit&mindate=2006-04-20%2021:20&maxdate=2006-04-20%2021:22

BUG: AT is not supported

Minor fix in FileHelper::CheckMandatoryElements :
At write time, when we re write an old ACR-NEMA file as a DICOM one,
   // Replace deprecated 0028 0012 US Planes
   // by new             0028 0008 IS Number of Frames

ReWrite now allows user to 'rubout' a part of the image
(to remove a burnt-in Patient name, for instance)
use
rubout=xBegin,xEnd,yBegin,yEnd

Avoid tiny memory leak
(huge ones still pending :-( )