Update server

To see at a glance what are the most time consuming images

Comment out TestAllEntryVerify.cxx during the transient phase of reorg gdcmData

To avoid warning
(due to strange vtk method SetFilePrefix prototype that receives a 'char *'
instead of 'const char *'

To avoid warning.
(this time, it's wasn(t dangerous a run time)

Fix misstyping

To avoid warnings

FIX possible troubles when checking
    'Hight Bit Position' vs 'Bits Allocated' and 'Bits Stored'
 Thx to Mathieu for reporting bug

Fix : now dcm deals with 'No preamble', Big Endian Explicit VR group 0002.
Thx to Dennis Hu for providing a sample image to fix the bug.

ENH : Now, FileHelper::CheckMandatoryElements() makes some consistency checking,
      at LTTG (Least Time To Go)
      around Bits Allocated, Bits Stored, High Bit Position,
to avoid unaware user to mess up the stuff.

ENH : According to David Clunie's advice, we check now 'Imager Pixel Spacing'
      before 'Pixel Spacing', when we want to get X or Y Spacing.

COMP: or not...

ENH: Add a note about cmake version, since CMAKE_REQUIRE_VERSION does not take into account patch level. See bug #1854

ENH: Do some APPLE/WIN32 voodoo thing to get apps working

ENH: Should now support image with space in the origin

BUG: When Image Position Patient was exactly 0,0,0 the strategy was failing... cannot remember why I put that test ...

BUG: Fix previously instroduce cmake bug, now should compile fine even without VTK at all. Fix float/double in VTK4.2 and finally backport a patch from ITK

ENH: Some minor enhance:
1. Support compilation of gdcm against VTK 4.2 but not testing
2. Support compilation of gdcm agains VTK <= 4.4.2 but not testing
3. Complain if the version is not matched
4. minor compilation glitch

To print the CPU time with and without loading Sequences and Shadow groups.
Displayed values are a little bit strange ...

Fix misstyping

" This program allows to see at a glance"
" if the gdcm::File remains unimpaired after a Write"
" In a future step, we could move it to"
" gdcm Testing, for a systematic checking"
" of  the entire dataset"
" Later ..."

gdcm::File::IsReadable() is no usable here, because we deal with
any kind of gdcm::Readable *document*
not only gdcm::File (as opposed to gdcm::DicomDir)
BTH : how can you call a method belonging to parent class;
      when overloaded in the child class, with VS60?

Hope it compile under VS60.

Now the gdcm::File remains unimpaired after writting, in any case.

Load returns now a bool (allow user not to call IsReadable() )

ENH: Minor cleanup, also clearly specify how many pixel are tested

ENH: Set a maximum of difference to avoid generating a log bigger than mem size of the machine

COMP: Those things did not compile on VS60... dont understand what the author meant...

typo

Don't abort the prog when File not open

Fix Z dimension bug
Thx to Benoit for reporting it

Update News

Aware user (who *does* know all the files whose names
are in InternalFileNameList are 'coherent', that is to say :
- exist
- may be open,
- are gdcm-readable
- have the same sizes
- have the same 'pixel' type
- are single frame
- have the same color convention
- anything else ?
is now allowed to ask for a 'light' checking (actualy : initialization, from the
first file characteristics), using vtkGdcmReader::SetCheckFileCoherenceLight()

Fix misstyping

PrintFile gives now an accurate output for 'non gdcm::File readable' docomuments
that are 'non gdcm::Document readable'

exAnonymizeNoLoad can now anonymize any kind of document (even if they are not
File::Readable - Document::Readable is enough-)

Removal of now useless lut-related stuff

Pb of 'Bits Allocated = 12' is now dealt with in
FileHelper::CheckMandatoryElements, no longer in File::Write.
Thx to Mathieu for reporting bug.

   * Amelioration of TestAllReadCompareDicom
   -- BeNours

Prepare MPEG Dicom encapsulated processing (within a loooong future)

Fix some checking

Some checking added

Should leave gdcm::Document constructor in a much quicker
and much cleaner way when anything wrong occurs.

gdcmFile.h was included twice (second one instead of gdcmFileHelper.h), leading to gdcmFileHelper class not available in python

ENH: Minor cleanup

Update dicomTS.dic with Siemens Syngo(r)MR private SOP Class UID :
"1.3.12.2.1107.5.9.1" (CSA Non-Image Storage)

Prefixing filename by GDCM_DATA_ROOT should avoid serious troubles

Remove useless PrintHeader (replaced by PrintDocument)

BUG: A test that cannot open an image SHOULD fail

COMP: gcc 4.0 dont like ; in #define

Prepare (future) MPEG integration

Modify Print() output

correct English mistakes

   * Remove bad (unused and older) spec file for linux packaging
   -- BeNours

Preventive Black listing of ETIAM Dicom-MPEG image

Update New Features / Missing Features

Taking into account Dicom MPEG

ENH: Cannot divide by 0 on bcc55

BUG: Fix Numerical Excption on bcc55

   * FIX : on X, the python part is correctly installed. All files are
     installed in gdcm sub-directory
   -- BeNours

Should avoid some warning from Borland Compiler

Add exOverlayACR

Add a 'heavy documented' example on the way to extract 'overlays'
when they are stored in the 'ACR fashion'
(that's NOT to say in ACR-NEMA images; it still works an DICOM V3 images)

Fix some comments

   * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
   -- BeNours

Remove useless  #include "gdcmDataImages.h"

Should suppress some warnings from Borland compiler

COMP: Need to include sys/stat for stat function + IS_DIR

BUG: Need to update test due to recent change

CONP: Alrite seems like that before gcc 2.96 ios::failure was not defined. I could only find ref to ios_base::failure. This thing is really poorly documented my guess is that this is not really in c++ but just a stupid extension

ENH: Remove stuff that will not be used on win32, therefore avoid polluting the cmakecache

ENH: Patching IsDirectory and the ios::Failure pb

COMP: Could not find if ios::failure is defined in C++ or not..disabling on GNU system

BUG: Fix test

ENH: Make sure noone is passing a name ending with a / at the end

BUG: Attempt to fix borland IsDirectory

*** empty log message ***

Use new style (NO_SHADOW NO_SEQ) for making a DICOMDIR

Update comments

User new feature to skip Sequences and/or shadow groups

Now, user can ask gdcm::DicomDir to skip SeqEntries or shadow groups, when
possible :

     // Old style (still available) :
     dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);

    // new style (user is allowed no to load Sequences an/or Shadow Groups)
    dcmdir = new gdcm::DicomDir( );
    dcmdir->SetParseDir(true);
    dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);
    dcmdir->Load(dirName);

   * gdcmPython/ : amelioration to load Version with the library
   -- BeNours

BUG: Could not build static lib of gdcm properly on windows. Thanks a lot for Jean Michel patch and patience

   * string error fix
   -- BeNours

   * Dicts/DictGroupName.dic : Remove all entries defined by "???"
   * gdcmPython/gdcm.i : add equivalent to GDCM_UNFOUND and other
     string constants defined in gdcmCommon.h.
   -- BeNours

   * Builder/gdcm.iss.in : Bug fix - missing gdcmConfigure.h
   -- BeNours

BUG: Stupid gcc 2.96 does not support ios::failure

BUG: Spacing in DICOM is y first THEN x spacing

   * Amelioration on the DictGroupName class
   -- BeNours

   * src/gdcmDictGroupName.cxx : amelioration of print
   * Testing/TestDictGroupName.cxx : amelioration of code. Bug fix
   -- BeNours

   * Update version
   -- BeNours

   * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
     and it's representation name (for the NIH)
   -- BeNours

User may now choose whether he wants to load Shadow Groups and Sequences or not

Comments

   * Amelioration of demo
   -- BeNours

Fix stupid bug when writting ACR-NEMA image from 'ACR-LibIDO' one.

   * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
     conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using
     integers only
   -- BeNours

   * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : amelioration
   -- BeNours

   * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix when compiling on linux
   -- BeNours

   * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
     format) to replace 'at-run' dicom files generated by the
     TestAllReadCompareDicom test
   -- BeNours