reintroduce testing

update ChangeLog

Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce new concepts
(and new classes) :
a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
  - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
  - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
    a Sequence is composed of Items.
    Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)

The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
(never taken into account)
Our unability to add a new 'entry' in the header
    at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap), nor in
    the Chained List is also due to this recursivity.

Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources : nothing is
finished.
We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.

 * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
     -- BeNours

Cosmetic clean up

Better implementation of the black list

Add a black list of broken dicom images

 * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
       file prefix (SetFilePrefix)
     -- BeNours

*** empty log message ***

 * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
       file pattern (SetFilePattern)
     -- BeNours

to avoid compile time warning

Minor cleanup for toplevel CMakeLists

Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
       GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.

ENH: Now gdcmVersion.py is automatically generated

Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
       checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
       baseline.

Remove using namespace, + clean up the CMakeLists

update

DOC + cleanup

Rename bug1.cxx by copying the comma v file to PrintBug.cxx

DOC: Comment

update

ENH: Add Example stuff with real main:
1. Should be easier to use
2. This is a real example on how to read + write a dicom image, thus make sense to have it

Update so that exe are forced to a unique place, rename gdcmCxxTest to gdcmTest

Doxygenation.

 * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
       between the developper and user version.
     * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
     * src/gdcmParser.h: doxygenation

Updated.

gdcmParser doesn't loop any longer inside the Pixel element

 Doxygenation.

   Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)

Adding new test: TestReadWrite

Remove complex style install stuff, was never used

Slight modification

Resolve conflict in ChangeLog

 * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
       when using cmake.

Split the old makeDicomDir.cxx into makeDicomDir.cxx and BuildUpDicomDir.cxx

ENH: 1. Now the test suite is working for real
2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory (this was not true before)

ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in src director, now generated in the build dir.
2. Tests as mentionned smarter
3. Some clean up
4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name this is intersting for 3rd party lib like ITK, where we could set the institution anme / patient name...

Adding gdcmConfigure.h for install and ITK

Adding std::

update ChangeLog

 * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
           tree-like structure of a Dicom Header
     * FIX Test code cleaning

2004-04-28  Jean-Pierre Roux
     * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow
           SeQuence indented printing of Dicom Header
     * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
           into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose
   Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor

test

FIX: Building on cygwin is fine now

Fix: Python/vtk build again

ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
       one file instead of seven + some small cleanup

Propagate GDCM_DATA_ROOT into other tests

Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing

Fix warnings, add a GDCM_DATA_ROOT to CMake

update

ENH: Adding automatic testing
1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
2. Add a test driver gdcmTest.cxx
3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes intersting when we add more and more tests, thus dsw don't have to load too many projects

2004-04-22  Jean-Pierre Roux
     * ENH Minor changes to the Print() methods
     * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
           Header printing. Example given with :
   PrintHeader fileName  2 new
          (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)

minor modif to gdcmHeaderEntry::Print()

update

ENH: change malloc/calloc/free with there c++ equivalent

some cosmetic cleanup so that compilation : -W -Wall -Werror can pass.
1. I have added some unsigned where needed
2. Some function parameter not used -> (void)
3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
4. g++ don't like character '\' in comment
5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress this really need to be fixed
6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); this also really need to be fixed
8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, remove compression file (as we only do decompression, right ?)

Comments added

update change log

2004-21-02  Jean-Pierre Roux
     * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
           when a single value is found, xpacing is now defaulted to yspacing

doxygenation

2004-19-02  Jean-Pierre Roux
     * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
     * ENH add parameters :
               bool  exception_on_error = false,
               bool  enable_sequences   = false,
       bool  ignore_shadow      = false
           to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
     * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
           to allow reading of PAPYRUS 3.0 files

For vtk prior to vtk 4.2.5

Change default behavior to set a good range value

update license

FIX: Don't know what the heck are those files !

update CMakeLists

Update ChangeLog

Added a lot of comments to explain the tricks about multivaluated
'integer' fields.
HTH

update ChangeLog

 * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
             for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files

ChangeLog

FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more (hope so...)

Zilch.

 * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
       in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
       moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
       in gdcmHeader.
     * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
       trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
       allready does the job.
     * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
       (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).

*** empty log message ***

 * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
       upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
       case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
     -- BeNours

update ChangeLog

FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly when end-of-list is reached

 Preliminary work to subsequent work.

 * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
       equivalent to ExplicitVR in existing code).
     * code clean up.

 * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.

Check whether we want ACR or not if moved fro of WriteEntry to WriteEntries,

 * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.

Zilch.

 * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
       now contains all the gdcmGlobal related code.
     * minor coding style and doxygenation changes.

 * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
       CreateCleanString) removed.
     * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
     * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
     * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
     * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
       src/gdcmDirList.cxx)

some more doxygenation

Zilch.

 * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
       now contains all the Debug related code.
     * minor clean-up of includes in src/*.cxx

new features added for doxygen 1.3.6

2004-03-24  Jean-Pierre Roux
     * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant

2004-03-23  Jean-Pierre Roux
     * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
           big endian made volumes
     * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
           end user to instanciate class gdcmParser
   (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)

doxygenation

 * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
     * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
             gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
     -- BeNours

update ChangeLog

some more doxygenation

update ChangeLog

Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from an already
existing DICOMDIR file is consistent with the home-made tree-like structure
build ex-nihilo or build from the files held (recursively) in a Directory
(function gdcmDicomDir::CheckBoundaries() added)

passed some std::string as 'reference'

 * FIX now file names and directory name are written properly in the
                      DICOMDIR
           now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
              about the name