Corrected bugs regarding the rigid case and the initialization.

Removed default template implementation of GetBackwardAffineMatrix

Added templated version of GetBackwardAffineMatrix for clitkAffineRegistration (sr+bharath)

gdcm stuff doesn't compile with recent ITK releases. Should not be in clitkImageCommon anyway => commented out.

Added Varian OBI file format

Added png support with window/level options to clitkSplitImage

*** empty log message ***

*** empty log message ***

*** empty log message ***

some small corrections

some small correction

textbox for loading initial transform included

Added Loading initial transformation functionality

commented affinetransf header

Loaded Initial Transform functionality

SetTransform has been removed from vvImage since we obtain a pointer to the transform with GetTransform and we can act on it directly.

Modified transform in vvImage. Now a vtkGeneralTransform which composes a vtkGridTransform with the (already there) vtkTransform.
Removed CLITK_EXPERIMENTAL condition.

extract a slice from a 3D image

relative position 2D slice by slice (attempt)

correct output bug

plastimatch icons

load binary image widget

widget to load binary image

add Extract Lung Tool (experimental)

Plastimatch tool

add plastimatch tool

add Plastimatch icon

cosmetic

add static "AddImage" to load ROI from other tools

correct GetScalarTypeAsITKString

always set trachea as output

change "SegFunction" to "SegUtils"

correct "Has" -> "Have"

prevent padding if same size/spacing

correct output bug

add resample function

add AutoCrop function

correct GetScalarTypeAsITKString

add "havesamespacing" utility

change GetScalarTypeAsString to GetScalarTypeAsITKString to make explicit that type name string is the convention of ITK (not VTK)

add conversion utility from vtk to itk

cosmetic

move parsing utilities to clitkCommon as we are using them more and more

files merged in SegmentationUtils

add seg folder

remove segFilter

roi tool icon

ROI tool GUI

add roi tool

add possibility to display one ROI by FG value

add ROI icon

Manage current selected image

manage a ROI actor

display ROI

trial to put tool in tab (failed)

autocrop

cosmetic

min max (to remove)

autocrop tool

some segmentation tools (most from jef)

autocrop tool

temporary

cosmetic

add autocrop tool

constraint a binary image to be at a relative position of an object

auto crop of binary image

boolean operator between 2 images (take into account overlapping region)

segmentation utils (jef)

reconstruct with dilatation (jef)

some utilities for segmentation

add Bloch's filter (relative position)

filter base (trial)

FG and BG values

set and get macro like itk

add "HasSameSize" utils

cosmetic

add FilterBase (trial)

Fixed linked navigation with mouse wheel

fix crash when origin is negative

Added linked navigation (zoom and pan)

Precision consistant with clitkVoxImageIO.cxx

ported my changes to the new filter. Need to port the vv tool to use it, and add the automatic gaussian filter stuff

will do so a day when simon + david are available :)

Added clitkAffineRegistration from Jef's file. Also does translations only and rigid only.

Replaced round function with portable rint function

add windowed sinc function

fix blut resample

Corrected bug introduced in release 1.28: was crashing when image was not opened

remove references to BDCM

Removed default vtk key handling

Put console back for windows

Corrected bug in landmarks with negative spacing

Check extents before adding landmark

Now reads in ASCII matrix file to set the image transform (filename +".mat").

Change cpack options to have shortcuts working. Removed architecture specific option.

shortcut to remove overlay

removal transformation order, added storing and retrival of transforms, minor textedit changes

removed transformations order

resized textedit

comment out "future" feature :)

remove unuseful Render (faster)