Second version of databse of rel pos

First version of rel pos database builder

First version of the builder of relpos database

Explicit units for Angle (rad or deg)

Second version of clitkRelativePositionAnalyzer

Add afdb_path option

Add --afdb_path option

Add --afdb_path option

Add path when loading an image

First version of the clitkRelativePositionDataBase struct

Add the tool clitkRelativePositionDataBaseAnalyzer

Add first version of clitkRelativePositionDataBaseAnalyzer

Second version of RelativePositionAnalyzer

Add New(), GetValueTag and Path (to search for image)

Cosmetic

Change comments

Add MapToVec (first/second) functions.

Add ComputeBBUnion

Add ResizeImageLike with region or bb

Add SliceBySliceRelativePosition with angles

Add code for computing FuzzyMap only (without threshold)

Add FloatSliceType

Correct but when using LimitsWithTrachea (not taken into account)

First version of RelativePositionAnalyzer

Add AFDB support

Add AFDB support

Remove comments

Correct the way to set angles

First version of clitkLabelImageOverlapMeasure

Add GetAngle

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Add clitkLabelImageOverlapMeasure and clitkRelativePositionAnalyzer

Check VTK_VERSION with a valid syntax

Don't use VTK_LIBRAARIES with old VTK versions

Remove old scripts from CMakeLists

- Remove installation of scripts thathas been removed of the repository.

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Change include (clitkBoundingBoxUtils)

Remove ResizeImageLike (put in CropLikeImageFilter) and BoundingBox (put in clitkBoundingBoxUtils)

Utils for bounding box calculation (formerly in clitkSegmentationUtils)

Add CropLikeImageFilter include

Add a convenient function

Add first version of RelativePositionAnalyzer

Set the inverse orientation flag after the addorientation

Correct the #define

Remove debug

Remove unused files

Add one slice for the S1RL support

Write dilated Aorta in afdb

Add clitkMeshToBinaryImage tool

- Add clitkMeshToBinaryImage tool based on the filter of the same name.

Add Extrude option to clitkMeshToBinaryImageFilter

- Set default value to true for backward compatibility

Add missing include

Read CricoidCartilag image or Point position (simpler)

Add VerboseTracking for debug

Add VerboseTracking for debug

Protect 'crop' if given parameters are larger than image size

Remove debug

Add info in the command line help

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

calculation of motion amplitude itself...

- that is, (max - min) over time

Comment temporary stuf (station 7,8)

Order stations, remove debug, correct structures names

Change mhd to mha

Remove debug

Correct structures names

Correct structures names

Correct structures names

Remove debug

Change mhd to mha

Enhance the warning output

create_sequence.sh and dcm_sort_by_field.sh removed

clitk header added

correction in motion mask script

now compatible with GDCM 1.x and GDCM 2.x

correction in motion mask script

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Make clitkDicomWave2Text compile with itk4

- Protect the code with GDCM_MAJOR_VERSION < 2 and print an error
  message when compiled with 2.x GDCM version.

removing stray characters from beginning of files

- patch sent by Joël Schaerer

Compilation error related to GDCM-2

Remove debug and correct slice position for CaudlaMarginOf BV

Add comment (future changes todo)

Change comments

SaveScreenshotAllSlices : filenames correction and correct update to force the display of ROI.

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

clitkDicomWave2Text tool added

install of motion_amplitude script

calculation of an RTstruct's motion amplitude

clitkImageStatistics - small robustness issue

clitkImageStatistics - support for 4D images

- label mask may also be (n-1)D

Add an option to the screenshots menu to save all slices (with ROI and transparency)

Remove debug and check that options are correct

Add station 5 and 6

Add Station 5 and 6

Correct bug in support for 4RL

Station 4RL is not ok

Correct PrintOptions

Add "SliceBySliceBuildLineSegmentAccordingToMinimalDistanceBetweenStructures" (and win the best price for the longest function name in clitk)
Add DistanceMap
Add ComputeClosestPoint
Correct JoinSlices (with ImageBase instead of Image as option)

clitkImageStatistics supports multi-channel images

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server