]> Creatis software - CreaPhase.git/blobdiff - octave_packages/image-1.0.15/nlfilter.m
Add a useful package (from Source forge) for octave
[CreaPhase.git] / octave_packages / image-1.0.15 / nlfilter.m
diff --git a/octave_packages/image-1.0.15/nlfilter.m b/octave_packages/image-1.0.15/nlfilter.m
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e11994a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,178 @@
+## Copyright (C) 2004 Josep Mones i Teixidor
+##
+## This program is free software; you can redistribute it and/or modify
+## it under the terms of the GNU General Public License as published by
+## the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
+## (at your option) any later version.
+##
+## This program is distributed in the hope that it will be useful,
+## but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+## GNU General Public License for more details.
+##
+## You should have received a copy of the GNU General Public License
+## along with this program; If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+## -*- texinfo -*-
+## @deftypefn {Function File} {@var{B} = } nlfilter (@var{A}, [@var{m},@var{n}], @var{fun})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{B} = } nlfilter (@var{A}, [@var{m},@var{n}], @var{fun}, ...)
+## @deftypefnx {Function File} {@var{B} = } nlfilter (@var{A},'indexed', ...)
+## Processes image in sliding blocks using user-supplied function.
+##
+## @code{B=nlfilter(A,[m,n],fun)} passes sliding @var{m}-by-@var{n}
+## blocks to user-supplied function @var{fun}. A block is build for
+## every pixel in @var{A}, such as it is centered within the block.
+## @var{fun} must return a scalar, and it is used to create matrix
+## @var{B}. @var{nlfilter} pads the @var{m}-by-@var{n} block at the
+## edges if necessary.
+## 
+## Center of block is taken at ceil([@var{m},@var{n}]/2).
+##
+## @code{B=nlfilter(A,[m,n],fun,...)} behaves as described above but
+## passes extra parameters to function @var{fun}.
+##
+## @code{B=nlfilter(A,'indexed',...)} assumes that @var{A} is an indexed
+## image, so it pads the image using proper value: 0 for uint8 and
+## uint16 images and 1 for double images. Keep in mind that if 'indexed'
+## is not specified padding is always done using 0.
+##
+## @seealso{colfilt,blkproc,inline}
+## @end deftypefn
+
+## Author:  Josep Mones i Teixidor <jmones@puntbarra.com>
+
+function B = nlfilter(A, varargin)
+  if(nargin<3)
+    error("nlfilter: invalid number of parameters.");
+  endif
+  
+  ## check 'indexed' presence
+  indexed=false;
+  p=1;
+  if(ischar(varargin{1}) && strcmp(varargin{1}, "indexed"))
+    indexed=true;
+    p+=1;
+    if(isa(A,"uint8") || isa(A,"uint16"))
+       padval=0;
+    else
+      padval=1; 
+    endif
+  else
+    padval=0;
+  endif
+
+  ## check [m,n]
+  if(!isvector(varargin{p}))
+    error("nlfilter: expected [m,n] but param is not a vector.");
+  endif
+  if(length(varargin{p})!=2)
+    error("nlfilter: expected [m,n] but param has wrong length.");
+  endif
+  sblk=varargin{p}(:);
+  p+=1;
+
+  ## check fun
+  ## TODO: add proper checks for this one
+  if(nargin<p)
+    error("nlfilter: required parameters haven't been supplied.");
+  endif
+  fun=varargin{p};
+  
+  ## remaining params are params to fun
+  ## extra params are p+1:nargin-1
+
+  ## We take an easy approach... feel free to optimize it (coding this
+  ## in C++ would be a great idea).
+  
+  ## Calculate center of block
+  c=ceil(sblk/2);
+  
+  ## Pre-padding
+  prepad=c-ones(2,1);
+  
+  ## Post-padding
+  postpad=sblk-c;
+  
+  ## Save A size
+  as=size(A);
+
+  ## Pad data
+  if(all(prepad==postpad))
+    if(any(prepad>0))
+      A=padarray(A,prepad,padval,'both');
+    endif
+  else
+    if(any(prepad>0))
+      A=padarray(A,prepad,padval,'pre');
+    endif
+    if(any(postpad>0))
+      A=padarray(A,postpad,padval,'post');
+    endif
+  endif
+
+  ## calc end offsets
+  me=postpad(1)+prepad(1);
+  ne=postpad(2)+prepad(2);
+       
+  ## We concatenate everything to preserve fun return type
+  for i=1:as(1)
+    r=feval(fun,A(i:i+me,1:1+ne),varargin{p+1:nargin-1});
+    for j=2:as(2)
+      r=horzcat(r,feval(fun,A(i:i+me,j:j+ne),varargin{p+1:nargin-1}));
+    endfor
+    if(i==1)
+      B=r;
+    else
+      B=vertcat(B,r);
+    endif
+  endfor
+
+endfunction
+
+%!demo
+%! nlfilter(eye(10),[3,3],inline("any(x(:)>0)","x"))
+%! # creates a "wide" diagonal 
+
+%!assert(nlfilter(eye(4),[2,3],inline("sum(x(:))","x")),[2,2,1,0;1,2,2,1;0,1,2,2;0,0,1,1]);
+%!assert(nlfilter(eye(4),'indexed',[2,3],inline("sum(x(:))","x")),[4,2,1,2;3,2,2,3;2,1,2,4;4,3,4,5]);
+%!assert(nlfilter(eye(4),'indexed',[2,3],inline("sum(x(:))==y","x","y"),2),[0,1,0,1;0,1,1,0;1,0,1,0;0,0,0,0]!=0);
+
+% Check uint8 and uint16 padding
+%!assert(nlfilter(uint8(eye(4)),'indexed',[2,3],inline("sum(x(:))","x")),[2,2,1,0;1,2,2,1;0,1,2,2;0,0,1,1]);
+%!assert(nlfilter(uint16(eye(4)),'indexed',[2,3],inline("sum(x(:))","x")),[2,2,1,0;1,2,2,1;0,1,2,2;0,0,1,1]);
+
+% Check if function class is preserved
+%!assert(nlfilter(uint8(eye(4)),'indexed',[2,3],inline("int8(sum(x(:)))","x")),int8([2,2,1,0;1,2,2,1;0,1,2,2;0,0,1,1]));
+
+
+
+%
+% $Log$
+% Revision 1.4  2007/03/23 16:14:37  adb014
+% Update the FSF address
+%
+% Revision 1.3  2007/01/04 23:50:47  hauberg
+% Put seealso before end deftypefn
+%
+% Revision 1.2  2007/01/04 23:37:54  hauberg
+% Minor changes in help text
+%
+% Revision 1.1  2006/08/20 12:59:35  hauberg
+% Changed the structure to match the package system
+%
+% Revision 1.5  2005/09/08 02:00:17  pkienzle
+% [for Bill Denney] isstr -> ischar
+%
+% Revision 1.4  2004/11/15 16:04:20  pkienzle
+% Fix tests for functions which return boolean matrices
+%
+% Revision 1.3  2004/09/03 13:28:32  jmones
+% Corrected behaviour for int* and uint* types
+%
+% Revision 1.2  2004/08/15 19:43:11  jmones
+% corrected a typo in doc
+%
+% Revision 1.1  2004/08/15 19:42:14  jmones
+% nlfilter: Processes image in siliding blocks using user-supplied function
+%
+%