]> Creatis software - CreaPhase.git/blobdiff - octave_packages/m/general/interpn.m
update packages
[CreaPhase.git] / octave_packages / m / general / interpn.m
diff --git a/octave_packages/m/general/interpn.m b/octave_packages/m/general/interpn.m
new file mode 100644 (file)
index 0000000..91afe95
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,314 @@
+## Copyright (C) 2007-2012 David Bateman
+##
+## This file is part of Octave.
+##
+## Octave is free software; you can redistribute it and/or modify it
+## under the terms of the GNU General Public License as published by
+## the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
+## your option) any later version.
+##
+## Octave is distributed in the hope that it will be useful, but
+## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+## General Public License for more details.
+##
+## You should have received a copy of the GNU General Public License
+## along with Octave; see the file COPYING.  If not, see
+## <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+## -*- texinfo -*-
+## @deftypefn  {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{v}, @var{y1}, @var{y2}, @dots{})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v}, @var{y1}, @var{y2}, @dots{})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v}, @var{m})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@dots{}, @var{method})
+## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@dots{}, @var{method}, @var{extrapval})
+##
+## Perform @var{n}-dimensional interpolation, where @var{n} is at least two.
+## Each element of the @var{n}-dimensional array @var{v} represents a value
+## at a location given by the parameters @var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{xn}.
+## The parameters @var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{xn} are either
+## @var{n}-dimensional arrays of the same size as the array @var{v} in
+## the 'ndgrid' format or vectors.  The parameters @var{y1}, etc. respect a
+## similar format to @var{x1}, etc., and they represent the points at which
+## the array @var{vi} is interpolated.
+##
+## If @var{x1}, @dots{}, @var{xn} are omitted, they are assumed to be
+## @code{x1 = 1 : size (@var{v}, 1)}, etc.  If @var{m} is specified, then
+## the interpolation adds a point half way between each of the interpolation
+## points.  This process is performed @var{m} times.  If only @var{v} is
+## specified, then @var{m} is assumed to be @code{1}.
+##
+## Method is one of:
+##
+## @table @asis
+## @item 'nearest'
+## Return the nearest neighbor.
+##
+## @item 'linear'
+## Linear interpolation from nearest neighbors.
+##
+## @item 'cubic'
+## Cubic interpolation from four nearest neighbors (not implemented yet).
+##
+## @item 'spline'
+## Cubic spline interpolation---smooth first and second derivatives
+## throughout the curve.
+## @end table
+##
+## The default method is 'linear'.
+##
+## If @var{extrapval} is the scalar value, use it to replace the values
+## beyond the endpoints with that number.  If @var{extrapval} is missing,
+## assume NA.
+## @seealso{interp1, interp2, spline, ndgrid}
+## @end deftypefn
+
+function vi = interpn (varargin)
+
+  method = "linear";
+  extrapval = NA;
+  nargs = nargin;
+
+  if (nargin < 1 || ! isnumeric (varargin{1}))
+    print_usage ();
+  endif
+
+  if (ischar (varargin{end}))
+    method = varargin{end};
+    nargs = nargs - 1;
+  elseif (nargs > 1 && ischar (varargin{end - 1}))
+    if (! isnumeric (varargin{end}) || ! isscalar (varargin{end}))
+      error ("interpn: extrapal is expected to be a numeric scalar");
+    endif
+    method = varargin{end - 1};
+    extrapval = varargin{end};
+    nargs = nargs - 2;
+  endif
+
+  if (nargs < 3)
+    v = varargin{1};
+    m = 1;
+    if (nargs == 2)
+      if (ischar (varargin{2}))
+        method = varargin{2};
+      elseif (isnumeric (m) && isscalar (m) && fix (m) == m)
+        m = varargin{2};
+      else
+        print_usage ();
+      endif
+    endif
+    sz = size (v);
+    nd = ndims (v);
+    x = cell (1, nd);
+    y = cell (1, nd);
+    for i = 1 : nd;
+      x{i} = 1 : sz(i);
+      y{i} = 1 : (1 / (2 ^ m)) : sz(i);
+    endfor
+    y{1} = y{1}.';
+    [y{:}] = ndgrid (y{:});
+  elseif (! isvector (varargin{1}) && nargs == (ndims (varargin{1}) + 1))
+    v = varargin{1};
+    sz = size (v);
+    nd = ndims (v);
+    x = cell (1, nd);
+    y = varargin (2 : nargs);
+    for i = 1 : nd;
+      x{i} = 1 : sz(i);
+    endfor
+  elseif (rem (nargs, 2) == 1 && nargs ==
+          (2 * ndims (varargin{ceil (nargs / 2)})) + 1)
+    nv = ceil (nargs / 2);
+    v = varargin{nv};
+    sz = size (v);
+    nd = ndims (v);
+    x = varargin (1 : (nv - 1));
+    y = varargin ((nv + 1) : nargs);
+  else
+    error ("interpn: wrong number or incorrectly formatted input arguments");
+  endif
+
+  if (any (! cellfun ("isvector", x)))
+    for i = 2 : nd
+      if (! size_equal (x{1}, x{i}) || ! size_equal (x{i}, v))
+        error ("interpn: dimensional mismatch");
+      endif
+      idx (1 : nd) = {1};
+      idx (i) = ":";
+      x{i} = x{i}(idx{:})(:);
+    endfor
+    idx (1 : nd) = {1};
+    idx (1) = ":";
+    x{1} = x{1}(idx{:})(:);
+  endif
+
+  method = tolower (method);
+
+  all_vectors = all (cellfun ("isvector", y));
+  different_lengths = numel (unique (cellfun ("numel", y))) > 1;
+  if (all_vectors && different_lengths)
+    [foobar(1:numel(y)).y] = ndgrid (y{:});
+    y = {foobar.y};
+  endif
+
+  if (strcmp (method, "linear"))
+    vi = __lin_interpn__ (x{:}, v, y{:});
+    vi (isna (vi)) = extrapval;
+  elseif (strcmp (method, "nearest"))
+    yshape = size (y{1});
+    yidx = cell (1, nd);
+    for i = 1 : nd
+      y{i} = y{i}(:);
+      yidx{i} = lookup (x{i}, y{i}, "lr");
+    endfor
+    idx = cell (1,nd);
+    for i = 1 : nd
+      idx{i} = yidx{i} + (y{i} - x{i}(yidx{i})(:) >= x{i}(yidx{i} + 1)(:) - y{i});
+    endfor
+    vi = v (sub2ind (sz, idx{:}));
+    idx = zeros (prod (yshape), 1);
+    for i = 1 : nd
+      idx |= y{i} < min (x{i}(:)) | y{i} > max (x{i}(:));
+    endfor
+    vi(idx) = extrapval;
+    vi = reshape (vi, yshape);
+  elseif (strcmp (method, "spline"))
+    if (any (! cellfun ("isvector", y)))
+      for i = 2 : nd
+        if (! size_equal (y{1}, y{i}))
+          error ("interpn: dimensional mismatch");
+        endif
+        idx (1 : nd) = {1};
+        idx (i) = ":";
+        y{i} = y{i}(idx{:});
+      endfor
+      idx (1 : nd) = {1};
+      idx (1) = ":";
+      y{1} = y{1}(idx{:});
+    endif
+
+    vi = __splinen__ (x, v, y, extrapval, "interpn");
+
+    if (size_equal (y{:}))
+      ly = length (y{1});
+      idx = cell (1, ly);
+      q = cell (1, nd);
+      for i = 1 : ly
+        q(:) = i;
+        idx {i} = q;
+      endfor
+      vi = vi (cellfun (@(x) sub2ind (size(vi), x{:}), idx));
+      vi = reshape (vi, size(y{1}));
+    endif
+  elseif (strcmp (method, "cubic"))
+    error ("interpn: cubic interpolation not yet implemented");
+  else
+    error ("interpn: unrecognized interpolation METHOD");
+  endif
+
+endfunction
+
+%!demo
+%! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
+%! x=[0,1,4]; y=[10,11,12];
+%! xi=linspace(min(x),max(x),17);
+%! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
+%! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"linear").');
+%! [x,y] = meshgrid(x,y);
+%! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
+
+%!demo
+%! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
+%! x=[0,1,4]; y=[10,11,12];
+%! xi=linspace(min(x),max(x),17);
+%! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
+%! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"nearest").');
+%! [x,y] = meshgrid(x,y);
+%! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
+
+%!#demo
+%! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
+%! x=[0,1,2]; y=[10,11,12];
+%! xi=linspace(min(x),max(x),17);
+%! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
+%! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"cubic").');
+%! [x,y] = meshgrid(x,y);
+%! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
+
+%!demo
+%! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
+%! x=[0,1,2]; y=[10,11,12];
+%! xi=linspace(min(x),max(x),17);
+%! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
+%! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"spline").');
+%! [x,y] = meshgrid(x,y);
+%! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
+
+
+%!demo
+%! x = y = z = -1:1;
+%! f = @(x,y,z) x.^2 - y - z.^2;
+%! [xx, yy, zz] = meshgrid (x, y, z);
+%! v = f (xx,yy,zz);
+%! xi = yi = zi = -1:0.1:1;
+%! [xxi, yyi, zzi] = ndgrid (xi, yi, zi);
+%! vi = interpn(x, y, z, v, xxi, yyi, zzi, 'spline');
+%! mesh (yi, zi, squeeze (vi(1,:,:)));
+
+
+%!test
+%! [x,y,z] = ndgrid(0:2);
+%! f = x+y+z;
+%! assert (interpn(x,y,z,f,[.5 1.5],[.5 1.5],[.5 1.5]), [1.5, 4.5])
+%! assert (interpn(x,y,z,f,[.51 1.51],[.51 1.51],[.51 1.51],'nearest'), [3, 6])
+%! assert (interpn(x,y,z,f,[.5 1.5],[.5 1.5],[.5 1.5],'spline'), [1.5, 4.5])
+%! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z), f)
+%! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z,'nearest'), f)
+%! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z,'spline'), f)
+
+%!test
+%! [x, y, z] = ndgrid (0:2, 1:4, 2:6);
+%! f = x + y + z;
+%! xi = [0.5 1.0 1.5];
+%! yi = [1.5 2.0 2.5 3.5];
+%! zi = [2.5 3.5 4.0 5.0 5.5];
+%! fi = interpn (x, y, z, f, xi, yi, zi);
+%! [xi, yi, zi] = ndgrid (xi, yi, zi);
+%! assert (fi, xi + yi + zi)
+
+%!test
+%! xi = 0:2;
+%! yi = 1:4;
+%! zi = 2:6;
+%! [x, y, z] = ndgrid (xi, yi, zi);
+%! f = x + y + z;
+%! fi = interpn (x, y, z, f, xi, yi, zi, "nearest");
+%! assert (fi, x + y + z)
+
+%!test
+%! [x,y,z] = ndgrid(0:2);
+%! f = x.^2+y.^2+z.^2;
+%! assert (interpn(x,y,-z,f,1.5,1.5,-1.5), 7.5)
+
+%!test % for Matlab-compatible rounding for 'nearest'
+%! X = meshgrid (1:4);
+%! assert (interpn (X, 2.5, 2.5, 'nearest'), 3);
+
+%!shared z, zout, tol
+%! z = zeros (3, 3, 3);
+%! zout = zeros (5, 5, 5);
+%! z(:,:,1) = [1 3 5; 3 5 7; 5 7 9];
+%! z(:,:,2) = z(:,:,1) + 2;
+%! z(:,:,3) = z(:,:,2) + 2;
+%! for n = 1:5
+%!   zout(:,:,n) = [1 2 3 4 5;
+%!                  2 3 4 5 6; 
+%!                  3 4 5 6 7;
+%!                  4 5 6 7 8;
+%!                  5 6 7 8 9] + (n-1);
+%! end
+%! tol = 10 * eps;
+%!assert (interpn (z), zout, tol)
+%!assert (interpn (z, "linear"), zout, tol)
+%!assert (interpn (z, "spline"), zout, tol)