]> Creatis software - CreaPhase.git/blobdiff - octave_packages/nan-2.5.5/geomean.m
Add a useful package (from Source forge) for octave
[CreaPhase.git] / octave_packages / nan-2.5.5 / geomean.m
diff --git a/octave_packages/nan-2.5.5/geomean.m b/octave_packages/nan-2.5.5/geomean.m
new file mode 100644 (file)
index 0000000..449c377
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,53 @@
+function [y] = geomean(x,DIM,W)
+% GEOMEAN calculates the geomentric mean of data elements. 
+% 
+%      y = geomean(x [,DIM [,W]])   is the same as 
+%      y = mean(x,'G' [,DIM]) 
+%
+% DIM  dimension
+%      1 STD of columns
+%      2 STD of rows
+%      default or []: first DIMENSION, with more than 1 element
+% W    weights to compute weighted mean (default: [])
+%      if W=[], all weights are 1. 
+%      number of elements in W must match size(x,DIM) 
+%
+% features:
+% - can deal with NaN's (missing values)
+% - weighting of data 
+% - dimension argument also in Octave
+% - compatible to Matlab and Octave
+%
+% see also: SUMSKIPNAN, MEAN, HARMMEAN
+%
+%    This program is free software; you can redistribute it and/or modify
+%    it under the terms of the GNU General Public License as published by
+%    the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or
+%    (at your option) any later version.
+%
+%    This program is distributed in the hope that it will be useful,
+%    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+%    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+%    GNU General Public License for more details.
+%
+%    You should have received a copy of the GNU General Public License
+%    along with this program; If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+
+%      $Id: geomean.m 8223 2011-04-20 09:16:06Z schloegl $ 
+%      Copyright (C) 2000-2002,2009 by Alois Schloegl <alois.schloegl@gmail.com>
+%      This is part of the NaN-toolbox. For more details see
+%       http://pub.ist.ac.at/~schloegl/matlab/NaN/
+
+
+if nargin<2
+        DIM=min(find(size(x)>1));
+        if isempty(DIM), DIM=1; end;
+end
+if nargin<3
+       W = [];
+end;
+
+[y, n] = sumskipnan(log(x),DIM,W);
+y = exp (y./n);
+