From 840bfdc0bf081a680040c0a68f8d68db399cec2a Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Daniel Gonzalez <daniel.gonzalez@creatis.insa-lyon.fr>
Date: Wed, 29 May 2013 15:47:29 +0200
Subject: [PATCH] By Leonardo Florez
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=utf8
Content-Transfer-Encoding: 8bit

Bonjour à tous,

Aujourd'hui je me suis plongé dans la compilation des creaTools avec ITK 4.3 et VTK 5.10. La chose marque plutôt pas mal, mais il m'a fallu introduire des changements dans le code. J'ai fait ces ajouts avec du code "différentiel" (en utilisant le preprocesseur de C++ pour détecter la version d'ITK et donc laisser le code utilisable depuis itk 3 ou itk 4). Je vous joins un "patch" avec les changements (je n'ai pas accès git pour faire un "commit" depuis ici...). Pour appliquer le patch, il faut aller au repertoire avec les sources de creatools (là où il y a un repertoire par projet), copier ici le patch ci-joint et executer la commande: "patch -p1 < patch_creatools". L'explication des changements est:

- Il faut compiler ITK 4 avec l'option "ITK_USE_CONCEPT_CHECKING" en "OFF". La cause c'est le système de "demangling" des pointeurs vers des objets "itk::Image" utilisé dans bbitk, qui est peu trop générique. J'ai une idée pour le faire marcher d'une façon plus propre, mais il me faudrait quelques jours de plus.
- bbtk, bbfy: j'ai rajouté un "tag" xml: verbosePreprocessor. Cela pour permettre au programmeur de jouer avec le preprocesseur (#if et cie.) de C++ et avoir du code "différentiel" (par exemple, pour utiliser des filtres itk 3 qui n'existent plus dans itk 4).
- bbtk, BBTKConfigurePackage_src.cmake: la variable d'environnement LD_LIBRARY_PATH était effacée au moment d'invoquer bbfy, donc bbfy ne marchait plus.
- bbtk, bbitkDICOMSeriesFileNames.xml: le nouveau "tag" xml est utilisé ici (itkDICOMSeriesFileNames n'existe plus dans itk 3, dans itk 4 s'appelle itkGDCMSeriesFileNames).
- crea: CDMUtilities.*: un template n'était pas bien utilisé (une instantiation explicite était nécessaire).
- crea: modelCDMProjectsTreeNode.h: une méthode manquait.
- creaBruker/testBruker2Dicom: les librairies de BOOST doivent être enchaînées en dernier... Magique!
- creaImageIO/TestWxGimmickReaderDialog/CMakeLists.txt: il y manquait l'enchaînement vers les librairies ITK.
- creaImageIO/src/creaImageIOWxAnySimpleDlg.cpp: des classes itk 3 qui n'existent plus dans itk 4.

Voilà! J'espère que ça peut vous être utile.

Amicalement,

Leo
---
 lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.cpp        | 31 -------------------
 lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.h          | 24 +++++++++++++-
 .../modelCDMProjectsTreeNode.h                |  2 +-
 3 files changed, 24 insertions(+), 33 deletions(-)

diff --git a/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.cpp b/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.cpp
index cc64ee3..37f4deb 100644
--- a/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.cpp
+++ b/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.cpp
@@ -46,37 +46,6 @@
 
 namespace CDMUtilities
 {
-  template <typename Container>
-  Container& splitter::split
-  (
-      Container& result,
-      const typename Container::value_type& s,
-      const typename Container::value_type& delimiters,
-      empties_t empties
-  )
-  {
-    result.clear();
-    size_t current;
-    size_t next = -1;
-    do
-      {
-        if (empties == no_empties)
-          {
-            next = s.find_first_not_of(delimiters, next + 1);
-            if (next == Container::value_type::npos)
-              {
-                break;
-              }
-            next -= 1;
-          }
-        current = next + 1;
-        next = s.find_first_of(delimiters, current);
-        result.push_back(s.substr(current, next - current));
-      }
-    while (next != Container::value_type::npos);
-    return result;
-  }
-
   const std::string fixPath(const std::string& path)
   {
     std::string pathFixed = "";
diff --git a/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.h b/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.h
index 92fe3d0..8ec6967 100644
--- a/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.h
+++ b/lib/creaDevManagerLib/CDMUtilities.h
@@ -118,7 +118,29 @@ namespace CDMUtilities
         const typename Container::value_type& s,
         const typename Container::value_type& delimiters,
         empties_t empties = empties_ok
-    );
+      )
+      {
+        result.clear();
+        size_t current;
+        size_t next = -1;
+        do
+        {
+          if (empties == no_empties)
+          {
+            next = s.find_first_not_of(delimiters, next + 1);
+            if (next == Container::value_type::npos)
+            {
+              break;
+            }
+            next -= 1;
+          }
+          current = next + 1;
+          next = s.find_first_of(delimiters, current);
+          result.push_back(s.substr(current, next - current));
+        }
+        while (next != Container::value_type::npos);
+        return result;
+      }
   };
 
   /**
diff --git a/lib/creaDevManagerLib/modelCDMProjectsTreeNode.h b/lib/creaDevManagerLib/modelCDMProjectsTreeNode.h
index 25ec959..aa27b18 100755
--- a/lib/creaDevManagerLib/modelCDMProjectsTreeNode.h
+++ b/lib/creaDevManagerLib/modelCDMProjectsTreeNode.h
@@ -42,7 +42,7 @@
 class modelCDMProjectsTreeNode
 {
 public:
-  modelCDMProjectsTreeNode();
+  modelCDMProjectsTreeNode() { }
   modelCDMProjectsTreeNode(std::string path, std::string name, unsigned char type, int level);
   ~modelCDMProjectsTreeNode();
 
-- 
2.45.0