CMakeLists.txt

   1 #=========================================================
   2 # CLITK = Command Line ITK
   3 cmake_minimum_required(VERSION 2.8)
   4 cmake_policy(VERSION 2.8)
   5 if(COMMAND cmake_policy)
   6     cmake_policy(SET CMP0003 NEW)
   7 endif(COMMAND cmake_policy)
   8 PROJECT(clitk)
   9 #=========================================================
  10
  11 #=========================================================
  12 INCLUDE(cmake/common.cmake)
  13 #=========================================================
  14
  15 #=========================================================
  16 #Support for the CTest dashboard testing system
  17 OPTION(BUILD_TESTING "Build the testing tree" OFF)
  18 IF (BUILD_TESTING)
  19   OPTION(CLITK_BUILD_TESTING "Test ITK" ON)
  20   INCLUDE(CTest)
  21 ENDIF(BUILD_TESTING)
  22 #=========================================================
  23
  24 #=========================================================
  25 # Find ITK (required)
  26 FIND_PACKAGE(ITK)
  27 IF(ITK_FOUND)
  28   INCLUDE("${ITK_USE_FILE}")
  29 ELSE(ITK_FOUND)
  30   MESSAGE(FATAL_ERROR "Cannot build without ITK.  Please set ITK_DIR.")
  31 ENDIF(ITK_FOUND)
  32 #=========================================================
  33
  34 #=========================================================
  35 # Find VTK (required)
  36 FIND_PACKAGE(VTK REQUIRED)
  37 IF(VTK_FOUND)
  38   INCLUDE("${VTK_USE_FILE}")
  39 ELSE(VTK_FOUND)
  40   MESSAGE(FATAL_ERROR "Please set VTK_DIR.")
  41 ENDIF(VTK_FOUND)
  42 #=========================================================
  43
  44 #=========================================================
  45 # Find gengetopt, will create a target exe if not found
  46 SET(CMAKE_MODULE_PATH "${PROJECT_SOURCE_DIR}/cmake" ${CMAKE_MODULE_PATH})
  47 FIND_PACKAGE(Gengetopt)
  48 #=========================================================
  49
  50 #=========================================================
  51 # Find libstatgrab is installed, add clitkMemoryUsage.cxx in the library
  52 FIND_LIBRARY(LIBSTATGRAB NAMES statgrab PATHS)
  53 IF (${LIBSTATGRAB} MATCHES "LIBSTATGRAB-NOTFOUND")
  54 #  MESSAGE("Install libstatgrab (http://www.i-scream.org/libstatgrab/) for memory usage information")
  55   SET(CLITK_MEMORY_INFO OFF)
  56 ELSE (${LIBSTATGRAB} MATCHES "LIBSTATGRAB-NOTFOUND")
  57   SET(CLITK_MEMORY_INFO ON)
  58 ENDIF (${LIBSTATGRAB} MATCHES "LIBSTATGRAB-NOTFOUND")
  59 #=========================================================
  60
  61 #=========================================================
  62 # If the user choose to build documentation, then search for Doxygen executables.
  63 OPTION(BUILD_DOXYGEN "Build Doxygen Documentation" OFF)
  64 IF(BUILD_DOXYGEN)
  65   FIND_PACKAGE(Doxygen)
  66   ADD_SUBDIRECTORY(Doxygen)
  67 ENDIF(BUILD_DOXYGEN)
  68 #=========================================================
  69
  70 #=========================================================
  71 # Building in the source tree is forbidden
  72 IF(PROJECT_BINARY_DIR STREQUAL ${PROJECT_SOURCE_DIR})
  73   MESSAGE(FATAL_ERROR "Building in the source tree is not allowed ! Quit; remove the file 'CMakeCache.txt' and the folder 'CMakeFiles' an
  74 d build outside the sources (for example 'mkdir build ; cmake <CLITK_DIR>'.")
  75 ENDIF(PROJECT_BINARY_DIR STREQUAL ${PROJECT_SOURCE_DIR})
  76 #=========================================================
  77
  78 #=========================================================
  79 # Remove some MS Visual c++ flags
  80 IF(MSVC)
  81   ADD_DEFINITIONS(-D_CRT_SECURE_NO_WARNINGS -D_CRT_NONSTDC_NO_DEPRECATE -D_SCL_SECURE_NO_WARNINGS)
  82 ENDIF(MSVC)
  83 #=========================================================
  84
  85 #=========================================================
  86 INCLUDE_DIRECTORIES(itk filters segmentation registration tools ${PROJECT_BINARY_DIR})
  87
  88 # Select what is compiled
  89 ADD_SUBDIRECTORY(common)
  90 ADD_SUBDIRECTORY(tools)
  91 ADD_SUBDIRECTORY(segmentation)
  92 ADD_SUBDIRECTORY(registration)
  93
  94
  95 # Compilation options
  96 OPTION(CLITK_EXPERIMENTAL "Enable experimental software and features" OFF)
  97 OPTION(CLITK_BUILD_TOOLS "Build command-line tools" OFF)
  98 OPTION(CLITK_BUILD_SEGMENTATION "Build command-line segmentation tools" OFF)
  99 OPTION(CLITK_BUILD_REGISTRATION "Build command-line registration tools" OFF)
 100
 101 OPTION(CLITK_BUILD_VV "Build vv the 4D visualizer (requires VTK and QT)" ON)
 102 IF (CLITK_BUILD_VV)
 103   ADD_SUBDIRECTORY(vv)
 104 ENDIF(CLITK_BUILD_VV)
 105
 106
 107 #=========================================================
 108 # Build test when vv has been compiled
 109 IF(BUILD_TESTING)
 110   ADD_SUBDIRECTORY(tests)
 111 ENDIF(BUILD_TESTING)
 112
 113 #=========================================================
 114 # Install scripts when running make install
 115 SET(SCRIPTS
 116   scripts/calculate_motion_amplitude.sh
 117   scripts/midp_common.sh
 118   scripts/registration.sh
 119   scripts/create_midP.sh
 120   scripts/create_midP-2.0.sh
 121   scripts/create_mhd_4D.sh
 122   scripts/create_mhd_4D_pattern.sh
 123   scripts/create_midP_masks.sh
 124   scripts/create_midP_masks-2.0.sh
 125   scripts/pts_to_landmarks.sh
 126   scripts/create_mhd_3D.sh
 127   scripts/dicom_info.sh
 128 )
 129
 130 INSTALL (FILES ${SCRIPTS} DESTINATION bin PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_EXECUTE WORLD_EXECUTE)
 131