common/clitkGateAsciiImageIO.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef CLITKGATEASCIIIMAGEIO_H
  19 #define CLITKGATEASCIIIMAGEIO_H
  20
  21 // itk include
  22 #include "itkImageIOBase.h"
  23
  24 #if defined (_MSC_VER) && (_MSC_VER < 1600)
  25 //SR: taken from
  26 //#include "msinttypes/stdint.h"
  27 typedef unsigned int uint32_t;
  28 #else
  29 #include <stdint.h>
  30 #endif
  31
  32 namespace clitk {
  33
  34     //====================================================================
  35     // Class for reading gate ascii Image file format
  36     class GateAsciiImageIO: public itk::ImageIOBase
  37     {
  38         public:
  39             /** Standard class typedefs. */
  40             typedef GateAsciiImageIO        Self;
  41             typedef itk::ImageIOBase        Superclass;
  42             typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  43             typedef signed short int        PixelType;
  44
  45             struct GateAsciiHeader {
  46                 double matrix_size[3];
  47                 int resolution[3];
  48                 double voxel_size[3];
  49                 int nb_value;
  50             };
  51
  52             GateAsciiImageIO():Superclass() {;}
  53
  54             /** Method for creation through the object factory. */
  55             itkNewMacro(Self);
  56
  57             /** Run-time type information (and related methods). */
  58             itkTypeMacro(GateAsciiImageIO, ImageIOBase);
  59
  60             /*-------- This part of the interface deals with reading data. ------ */
  61             virtual void ReadImageInformation();
  62             virtual bool CanReadFile( const char* FileNameToRead );
  63             virtual void Read(void * buffer);
  64
  65             /*-------- This part of the interfaces deals with writing data. ----- */
  66             virtual void WriteImageInformation();
  67             virtual bool CanWriteFile(const char* filename);
  68             virtual void Write(const void* buffer);
  69
  70             virtual bool SupportsDimension(unsigned long dim);
  71
  72         protected:
  73
  74             static bool ReadHeader(FILE* handle, GateAsciiHeader& header);
  75             static bool ReadLine(FILE* handle, std::string& line);
  76
  77     }; // end class GateAsciiImageIO
  78 } // end namespace
  79
  80 // explicit template instantiation
  81 //template class itk::CreateObjectFunction<clitk::GateAsciiImageIO>;
  82
  83 #endif /* end #define CLITKGATEASCIIIMAGEIO_H */
  84