tools/clitkRelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter.txx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
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  19 //--------------------------------------------------------------------
  20 template<class ArgsInfoType>
  21 clitk::RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter<ArgsInfoType>::
  22 RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter():
  23   ImageToImageGenericFilter<Self>("RelativePositionDataBaseBuilder")
  24 {
  25   // Default values
  26   cmdline_parser_clitkRelativePositionDataBaseBuilder_init(&mArgsInfo);
  27   InitializeImageType<3>();
  28 }
  29 //--------------------------------------------------------------------
  30
  31
  32 //--------------------------------------------------------------------
  33 template<class ArgsInfoType>
  34 template<unsigned int Dim>
  35 void clitk::RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter<ArgsInfoType>::
  36 InitializeImageType()
  37 {
  38   ADD_IMAGE_TYPE(Dim, uchar);
  39 }
  40 //--------------------------------------------------------------------
  41
  42
  43 //--------------------------------------------------------------------
  44 template<class ArgsInfoType>
  45 void clitk::RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter<ArgsInfoType>::
  46 SetArgsInfo(const ArgsInfoType & a)
  47 {
  48   mArgsInfo=a;
  49   SetIOVerbose(mArgsInfo.verbose_flag);
  50   if (mArgsInfo.imagetypes_flag) this->PrintAvailableImageTypes();
  51 }
  52 //--------------------------------------------------------------------
  53
  54
  55 //--------------------------------------------------------------------
  56 // Update with the number of dimensions and the pixeltype
  57 //--------------------------------------------------------------------
  58 template<class ArgsInfoType>
  59 template<class FilterType>
  60 void clitk::RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter<ArgsInfoType>::
  61 SetOptionsFromArgsInfoToFilter(FilterType * f)
  62 {
  63   f->SetAFDBFilename(mArgsInfo.afdb_arg);
  64   f->SetAFDBPath(mArgsInfo.afdb_path_arg);
  65   f->SetNumberOfBins(mArgsInfo.bins_arg);
  66   f->SetNumberOfAngles(mArgsInfo.nb_arg);
  67   f->SetAreaLossTolerance(mArgsInfo.tol_arg);
  68   f->SetSupportName(mArgsInfo.supportName_arg);
  69   f->SetTargetName(mArgsInfo.targetName_arg);
  70   for(unsigned int i=0; i<mArgsInfo.objectName_given; i++)
  71     f->AddObjectName(mArgsInfo.objectName_arg[i]);
  72 }
  73 //--------------------------------------------------------------------
  74
  75
  76 //--------------------------------------------------------------------
  77 // Update with the number of dimensions and the pixeltype
  78 //--------------------------------------------------------------------
  79 template<class ArgsInfoType>
  80 template<class ImageType>
  81 void clitk::RelativePositionDataBaseBuilderGenericFilter<ArgsInfoType>::
  82 UpdateWithInputImageType()
  83 {
  84   // Create filter
  85   typedef clitk::RelativePositionDataBaseBuilderFilter<ImageType> FilterType;
  86   typename FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
  87
  88   // Set global Options
  89   SetOptionsFromArgsInfoToFilter<FilterType>(filter);
  90
  91   // Go !
  92   filter->Update();
  93
  94   // Write/Save results
  95   //  typename ImageType::Pointer output = filter->GetOutput();
  96   //this->template SetNextOutput<ImageType>(output);
  97
  98 }
  99 //--------------------------------------------------------------------
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