create new files for new dicom study/series

auto generate dicom file UIDs when new series/study is specified

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

gdcm 1.x compatibility

First version of the superbuild CMakeLists.txt.

new options to auto-generate dcm series UIDs

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Lungs window/level is now the same as in FOCAL

- (1700,-300)

small cout bug (cast bg to int instead of char)

Cosmetic

Cosmetic

Replace floor by rint to correct link error in vv

Add -h option

Correct bug when the user cancel the color selection

Set the contour to the same color than the overlay.
Correct bug when the user cancel the color selection.

Remove unused files

The merge of copy/pasted code did not account for the fact it had not
been copy pasted

Allow for overlay images with differing temporal length

Fixed reset after sequence reading bug and put copy/pasted code in
function

Open overlay sequence as sequence

Managed opening sequence of overlay images. Parser is ready for
fusion/vf/contour

Fix transform update in sequence of overlay/fusion

Account for reslicing transform in overlay and fusion (contours and vf
        have not been tested, TODO)

Fixed bug with linked temporal images

Merge /home/bpresles/Documents/US-IGRT/vv

us vox reader

Merge branch 'master' of git://git.creatis.insa-lyon.fr/clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

itk4 compatibility

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Add possibility to resize/resample mask like input image

Allow region from a different image type

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

VF supported (SR)

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

support for new pixel types

support for new pixel types

- removed midP stuff

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

some verbose/debug messages

Merge /home/srit/src/clitk/clitk

Added doc on transforms

Merge /home/srit/src/clitk/clitk

Fix for UpdateLinkedNavigation with transforms. This also simplifies the
previous code.

Merge /home/srit/src/clitk/clitk

Allow landmarking in tilted 2D slices

Fixed slice bug when toggling between voxels and world reslicing

Manage a list of transform for image sequences

First version of reslicing transform

simplified code

Update mask size when RG

Add RegionGrowing

Moved from repository clitk to clitk.private/tests_dav

mv clitkRegionGrovwing from private to segmentation

First trial for seg

Moved from repository clitk to clitk.private/tests_dav

_WIN32 is always defined and WIN32 maybe isn't, see
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/b0084kay%28v=vs.80%29.aspx

Good old Microsoft shit pointed out by Lennert.

Remove debug

Remove debug

Form output in column

Update mask size when label is removed.

First info in gui: mask size

First gui version (draft)

First version with Merge and remove label

Add EmitKeyPressed

Add EmitKeyPressed

Replace slicer Render by a single slicermanager render

Add EmitKeyPressed to propagate the key

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git://git.creatis.insa-lyon.fr/clitk

Add a close source feature to read usf files.

Add Labelize function and the slot to get the mouse position

Add MousePositionUpdatedSignal

Add signal to propagate the mouse position has changed.

Add reference contour

Change caption of file browser

Remove Propagation checkbox

Add progress dialog for binary images

Add dicom rt struct reader (with progress dialog)

Add IsDicomRTStruct (bool)

First version of dicom-rt reader in the roi tool.

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git://git.creatis.insa-lyon.fr/clitk

removed scripts from compilation/install

Moved from repository src2 to private2/dicom_scripts/clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

using get_dicom_field_value in midp scripts

option to set the RPATH to 3rd party libs

Fixed endianness portability issue on Ben's apple

Mac compatibility patch

Missing test on VTK version for vtkMapper

Added border with new versions of VTK.

Fixed VTK version test

corrected fusion/overlay refresh

- occurred with 4D and 3D+t images

ADd first version of interactive segmentation (erode/dilate)

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk