Add option to detect too small CCL (stomach)

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Lungs window/level is now the same as in FOCAL

- (1700,-300)

small cout bug (cast bg to int instead of char)

Cosmetic

Cosmetic

Replace floor by rint to correct link error in vv

Add -h option

Correct bug when the user cancel the color selection

Set the contour to the same color than the overlay.
Correct bug when the user cancel the color selection.

Remove unused files

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

itk4 compatibility

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Add possibility to resize/resample mask like input image

Allow region from a different image type

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

VF supported (SR)

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

support for new pixel types

support for new pixel types

- removed midP stuff

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

some verbose/debug messages

Update mask size when RG

Add RegionGrowing

Moved from repository clitk to clitk.private/tests_dav

mv clitkRegionGrovwing from private to segmentation

First trial for seg

Moved from repository clitk to clitk.private/tests_dav

_WIN32 is always defined and WIN32 maybe isn't, see
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/b0084kay%28v=vs.80%29.aspx

Good old Microsoft shit pointed out by Lennert.

Remove debug

Remove debug

Form output in column

Update mask size when label is removed.

First info in gui: mask size

First gui version (draft)

First version with Merge and remove label

Add EmitKeyPressed

Add EmitKeyPressed

Replace slicer Render by a single slicermanager render

Add EmitKeyPressed to propagate the key

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Add a close source feature to read usf files.

Add Labelize function and the slot to get the mouse position

Add MousePositionUpdatedSignal

Add signal to propagate the mouse position has changed.

Add reference contour

Change caption of file browser

Remove Propagation checkbox

Add progress dialog for binary images

Add dicom rt struct reader (with progress dialog)

Add IsDicomRTStruct (bool)

First version of dicom-rt reader in the roi tool.

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

removed scripts from compilation/install

Moved from repository src2 to private2/dicom_scripts/clitk

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

using get_dicom_field_value in midp scripts

option to set the RPATH to 3rd party libs

Fixed endianness portability issue on Ben's apple

Mac compatibility patch

Missing test on VTK version for vtkMapper

Added border with new versions of VTK.

Fixed VTK version test

corrected fusion/overlay refresh

- occurred with 4D and 3D+t images

ADd first version of interactive segmentation (erode/dilate)

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

use of elastix in mid-P scripts

Correct contour depth bug

Correct always white contour bug.

ROI overlay is not linearly interpolated by default

VTK compatibility

- BlendImageActor issue with legacy VTK versions

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk

Attempt to fix the blend image actor for the new vtk release (5.10)

Only compute overlap if check is not set as option

Correct default constructor for super class

Add option do display required structures

Add CheckImage

Add CheckImage

Set contours depth at 100 to be in front of other objects

Slightly offset the depth of contour to be in front of the overlay

Correct false depth for contour

Remove debug

Remove debug comments

Add VerboseSlicesFlag

Cosmetic

Add RemoveNegativeIndexFromRegion function

kept only the "most relevant" vector conversions

add MHD compression to install

updates in calculation of motion mask

- new way of guessing initial ellipse

small correction in motion mask creation script

script to compress MHDs

- either one file or an entire directory
- directories processed recursively

improvement of 4D mhd creation script

support for multiple vector image conversions

- including image compression

COMP: itk4 compatibility

further corrections in 4D mhd creation

correction with compressed file names

Merge branch 'master' of git.creatis.insa-lyon.fr:clitk