By Leonardo Florez

Bonjour à tous,

Aujourd'hui je me suis plongé dans la compilation des creaTools avec ITK 4.3 et VTK 5.10. La chose marque plutôt pas mal, mais il m'a fallu introduire des changements dans le code. J'ai fait ces ajouts avec du code "différentiel" (en utilisant le preprocesseur de C++ pour détecter la version d'ITK et donc laisser le code utilisable depuis itk 3 ou itk 4). Je vous joins un "patch" avec les changements (je n'ai pas accès git pour faire un "commit" depuis ici...). Pour appliquer le patch, il faut aller au repertoire avec les sources de creatools (là où il y a un repertoire par projet), copier ici le patch ci-joint et executer la commande: "patch -p1 < patch_creatools". L'explication des changements est:

- Il faut compiler ITK 4 avec l'option "ITK_USE_CONCEPT_CHECKING" en "OFF". La cause c'est le système de "demangling" des pointeurs vers des objets "itk::Image" utilisé dans bbitk, qui est peu trop générique. J'ai une idée pour le faire marcher d'une façon plus propre, mais il me faudrait quelques jours de plus.
- bbtk, bbfy: j'ai rajouté un "tag" xml: verbosePreprocessor. Cela pour permettre au programmeur de jouer avec le preprocesseur (#if et cie.) de C++ et avoir du code "différentiel" (par exemple, pour utiliser des filtres itk 3 qui n'existent plus dans itk 4).
- bbtk, BBTKConfigurePackage_src.cmake: la variable d'environnement LD_LIBRARY_PATH était effacée au moment d'invoquer bbfy, donc bbfy ne marchait plus.
- bbtk, bbitkDICOMSeriesFileNames.xml: le nouveau "tag" xml est utilisé ici (itkDICOMSeriesFileNames n'existe plus dans itk 3, dans itk 4 s'appelle itkGDCMSeriesFileNames).
- crea: CDMUtilities.*: un template n'était pas bien utilisé (une instantiation explicite était nécessaire).
- crea: modelCDMProjectsTreeNode.h: une méthode manquait.
- creaBruker/testBruker2Dicom: les librairies de BOOST doivent être enchaînées en dernier... Magique!
- creaImageIO/TestWxGimmickReaderDialog/CMakeLists.txt: il y manquait l'enchaînement vers les librairies ITK.
- creaImageIO/src/creaImageIOWxAnySimpleDlg.cpp: des classes itk 3 qui n'existent plus dans itk 4.

Voilà! J'espère que ça peut vous être utile.

Amicalement,

Leo

BUG  #1917
 Not compiling with boost 1.52 windows

BUG  1907 Eduardo DAVILA,  BRUKER_EXPORT in .h conflict
BUG  1906 Eduardo DAVILA          Boot dependencies not needed

Feature #1792
Change of version v1_1_0

Feature #1767

new version

*** empty log message ***

Ass some comments

'local install' issues

Avoid boost 1.46 troubles

Add-subdirectories

Comment out generation of now useless testBruker2Dicom and PrintParameterFile

*** empty log message ***

Replace deprecated SUBDIRS by ADD_SUBDIRECTORY

revert to GDCM as default

change default GDCM to GDCM2

don't add wxwidgets.

Don't compile appli untill they are converted to GDCM2

- use creaBruker_EXPORT
- don't pass std::string to sprintf().
(causes warning cannot pass objects of non-POD type 'struct std::string' through '...';

upgr doxygen 1.6

no message

fix bugs

run creaBruker with gdcm2

*** empty log message ***

Use shorter names for 'Study description'

re indent

Add Bruker 'Perfusion' info to dicom header

upgrade

Remove useless stuff

Fix 'AdjResult' dir troubles

Deal with multi study directory

Unify with new CreaNewProject

First stage to allow user to pass a 'multi study' directory

avoid trouble with new version 'AdjStatePerStudy' directory

*** empty log message ***

upgrade

*** empty log message ***

create creaBruker doxygene doc

(try to) generate doc :-(

Avoid warnings

Fixes

Ugrade frp creaNewProject, to allow doc generation

Boost a un pb quand on essai de tester un match d'une expression reguliere un peu trop laxe sur une grande chaine de characteres.
plutot que de vouloir verifier si une chaine est composee d'entier, de floats ou d'un string en utilisant regexp_match() il vaut mieux essayer de trouver des caracteres qui prouvent que ce ne sont pas des entiers, des floats, donc des strings en utilisant regexp_search().

j'ai en plus rajoute une methode pour virer les newline et eventuellement les espaces.

Denis Grenier

Mon debugger n'interprete pas les lignes de commandes si les options ne commencent pas par - ou --

Try to fix method vs reco

indent

RECO_* vs PVM_*

use RECO_*, not PVM_*

Remove deprecated

Perform a desperate try when incomplete exam is supplied

*** empty log message ***

*** empty log message ***

use 'clean' Patient Name

Create 'Patient' directory + 'Study' directory
Deal with strange name '2dseq_Angio'

Rectangular pixels

*** empty log message ***

now check for 2dseq.ADC, 2dseq_ADC, 2dseq-ADC, etc

no message

Uodates

Fix bug when checking incoherences

Throw and catch exception *everywhere* (hope it's enough!)

Series Nb

Fix names

use exceptions

Use exceptions not to hand any longer on illegal files

first try for exception

replace unapropriate names 'setXXX' by 'computeXXX'

Prepare except

typo

shorten up Series Description

change exception codes

use 'unsigned int' instead of 'int' and save a lot of runtime 'if'

Code cleaning

Try double check
(boost doesn't works on Andres' PC
?!?

use  boost::filesystem::is_directory() instead of
GDCM_NAME_SPACE::DirList::IsDirectory()
(should be more robust ?)

*** empty log message ***

Generate new dir names

*** empty log message ***

Initial revision