ENH: Getting closer to USE_GDCM_FILE

ENH: Getting closer to USE_GDCM_FILE

BUG: Could not build on Sun + gcc 2.95

ADD: New file needed

BUG: Fix typoes

ENH: First shot at the UseGDCM file. Very usefull indeed

Fix English mistakes

ENH: I believe we have to enter floating point values with fixed number instead of using default stryule of ostringstream

ENH: Backport change from ITK. Fix compilation warnings

   * remove compilation warnings
   -- BeNours

   * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
   -- BeNours

ENH: Remove the jpeg internal stuff... not user friendly

Typo

* Replace method CheckMetaElements by CheckManadatoryElements
  To deal with the pb of UID's, and with Type 1 an Type 2 Entries
  (probably some stuff still missing)
 * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Serie UID
      between a given call and the next one (to add images to a Serie he just
created)
 * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Study UID
      between a given call and the next one, or to reuse an already existing
Study UID (i he wants to add his own Series to an already existing Study)

   * Might test the swig version before launch it
   -- BeNours

To avoid further pb, Initialize defaults now Photochromatic Interpretation tp
MONOCHROME2 (low values = dark), better than MONOCHRONE1.
Thx to Benoit for reporting bug

Add some more tests

Fix comments

Group 0002 management

Prepare FileMetaInformationVersion (group 0002) management

Fix misstyping

Fix wrong comment (-> wrong Doxygenation) about the meaning of
SetWriteModeToRaw() :
    Tells the writer we want to keep 'Grey pixels + Palettes color'
    when possible (as opposed to convert 'Palettes color' to RGB)
 NOT
    Tells the writer we want to write only the pixels (no header)

Doxygenation

Taking into account MONOCHROME1 + Signed Pixels (?!)

   * Bug fix for .Net2003... see now on other platforms ?
   -- BeNours

ENH: More testing using D Clunie tools

new News

Taking into account the difference between MONOCHROME1 (low values = bright)
 and MONOCHROME2 (low values = dark)

correct misstyping

Commit old versions UML class diagram, to help users migrations

new News

BUG: Couldnt find dicom3tools properly

STYLE: Typo

COMP: Fix stupid VS6 bug

BUG: This should solve the last Seg Fault. In a loop you need to reinitalizaze your pointer if you are incrementing it. Also style change buffer to a char* type this clean up the code a little.

BUG: Remove crappy code... disgusted

BUG: Solve JP feature, and at the same time avoid allocating a billion time the very same buffer which we know the size at compile time, should save some time.

ENH: Much better patch suggest by Brad King to solve the ctrlM on Win32

*never* forget to re-compile just *before* committing!

new News

First commit on the post 1.0 (Version? / Tag? / Branch?) :
Fix Doxygen warnings

*** empty log message ***

Add some tests

remove useless comments

Remove some useless mask operations, to save CPU time

remove some useless mask operations, to save CPU time

   * Activate Debug mode
   -- BeNours

ENH: Paranoid rebuild each time something change...should help problem on a continuous + VTK

BUG: Doh this one should not be changed. The reading of file should remain fully little endian...

BUG: Verbose->Warning

ENH: Since this is available for everyone warn dummy user.

ENH: Adding new option in CMake: GDCM_FORCE_BIGENDIAN_EMULATION. You are now able to change this option in cmake to turn your little endian machine into a big endian one. This is extremly alpha for now, but should allow much easier debugging...hopefully

ENH: Code simplification

BUG: Ok I really need to compile before committing stuff

BUG: val/binArea16 mixup

BUG: lgr -> len

ENH: First pass at my big endian emulation on little endian

BUG: Sorry I patched too quickly...

BUG: Apparently when you cvs up in DOS mode the .dic files it creates file with ctrlM+EOF, thus ctrlM was being taken into account and this is pretty bad in a c++ code...

Typo

Comments

news

update News

I tried to make a Test for gdcm::Exception
I never could even compile.
Replace by myExecption ...
How can it work?

Comments

Typo, comments, doxygenation

Update Doc

   * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
   -- BeNours

correct misstyping

Add a test : creating an "Icon Image Sequence"

Default Photometric Interpretation is now MONOCHROME2 (low values=dark !)

Update Conformance Statement

new News.html

BUG: In c++ you are never garantee your var is initialized to 0

STLYE: Remove unused stuff...

   * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memroy leaks
   -- BeNours

The following gdcm::DocEntrySet methods, no re-definable is child classes are no
longer virtual
    virtual ValEntry *GetValEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual BinEntry *GetBinEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual SeqEntry *GetSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual bool SetValEntry(std::string const &content,
    virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth,
    virtual bool SetValEntry(std::string const &content, ValEntry *entry);
    virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth, BinEntry *entry);
    virtual ValEntry *InsertValEntry(std::string const &value,
    virtual BinEntry *InsertBinEntry(uint8_t *binArea, int lgth,
    virtual SeqEntry *InsertSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);

AnonymizeNoLoad improvement

Now TestWriteSimple checks also 'signed' values

commit

Duplicate Matthieu's hack to prevent bombing in Anonymize

BUG: Hopefully fix problem on the SUN. On SunOS ulimit -a for fd is /only/ 256 and the test was poorly written so all files openned were not closed.

BUG: Remove seg fault from the nightly test.

STYLE: Minor tweaks

BUG: Remove Benoit bomb

   * src/gdcmFileHelper.cxx : bug fix when having RGB ACR files... there is
     24 bits allocated
   -- BeNours

update

new test

   * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when
     writting the file
   -- BeNours

   * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
   -- BeNours

   * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
     Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
   -- BeNours

Some more examples

typo + comments

Hope-to-be fully commented example

Update exAnonymise.cxx

ENH: Apparently the new Free .Net compiler complains also about the dll heritance stuff. Adding yet another pragma to please him. STYLE: a best -> a better

   * Testing/TestWriteSimple.cxx : fix bug... sorry
   -- BeNours

BUG: Remove my previous hack now this is properly fixed in gdcmBinEntry by JPR

Add some commented out lines to prepare future version of 'Full DICOMDIR' stuff

   * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
     we have the same serie or the same study UID
   -- BeNours