ENH: Much better patch suggest by Brad King to solve the ctrlM on Win32

*never* forget to re-compile just *before* committing!

new News

First commit on the post 1.0 (Version? / Tag? / Branch?) :
Fix Doxygen warnings

*** empty log message ***

Add some tests

remove useless comments

Remove some useless mask operations, to save CPU time

remove some useless mask operations, to save CPU time

   * Activate Debug mode
   -- BeNours

ENH: Paranoid rebuild each time something change...should help problem on a continuous + VTK

BUG: Doh this one should not be changed. The reading of file should remain fully little endian...

BUG: Verbose->Warning

ENH: Since this is available for everyone warn dummy user.

ENH: Adding new option in CMake: GDCM_FORCE_BIGENDIAN_EMULATION. You are now able to change this option in cmake to turn your little endian machine into a big endian one. This is extremly alpha for now, but should allow much easier debugging...hopefully

ENH: Code simplification

BUG: Ok I really need to compile before committing stuff

BUG: val/binArea16 mixup

BUG: lgr -> len

ENH: First pass at my big endian emulation on little endian

BUG: Sorry I patched too quickly...

BUG: Apparently when you cvs up in DOS mode the .dic files it creates file with ctrlM+EOF, thus ctrlM was being taken into account and this is pretty bad in a c++ code...

Typo

Comments

news

update News

I tried to make a Test for gdcm::Exception
I never could even compile.
Replace by myExecption ...
How can it work?

Comments

Typo, comments, doxygenation

Update Doc

   * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
   -- BeNours

correct misstyping

Add a test : creating an "Icon Image Sequence"

Default Photometric Interpretation is now MONOCHROME2 (low values=dark !)

Update Conformance Statement

new News.html

BUG: In c++ you are never garantee your var is initialized to 0

STLYE: Remove unused stuff...

   * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memroy leaks
   -- BeNours

The following gdcm::DocEntrySet methods, no re-definable is child classes are no
longer virtual
    virtual ValEntry *GetValEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual BinEntry *GetBinEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual SeqEntry *GetSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual bool SetValEntry(std::string const &content,
    virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth,
    virtual bool SetValEntry(std::string const &content, ValEntry *entry);
    virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth, BinEntry *entry);
    virtual ValEntry *InsertValEntry(std::string const &value,
    virtual BinEntry *InsertBinEntry(uint8_t *binArea, int lgth,
    virtual SeqEntry *InsertSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);

AnonymizeNoLoad improvement

Now TestWriteSimple checks also 'signed' values

commit

Duplicate Matthieu's hack to prevent bombing in Anonymize

BUG: Hopefully fix problem on the SUN. On SunOS ulimit -a for fd is /only/ 256 and the test was poorly written so all files openned were not closed.

BUG: Remove seg fault from the nightly test.

STYLE: Minor tweaks

BUG: Remove Benoit bomb

   * src/gdcmFileHelper.cxx : bug fix when having RGB ACR files... there is
     24 bits allocated
   -- BeNours

update

new test

   * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when
     writting the file
   -- BeNours

   * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
   -- BeNours

   * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
     Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
   -- BeNours

Some more examples

typo + comments

Hope-to-be fully commented example

Update exAnonymise.cxx

ENH: Apparently the new Free .Net compiler complains also about the dll heritance stuff. Adding yet another pragma to please him. STYLE: a best -> a better

   * Testing/TestWriteSimple.cxx : fix bug... sorry
   -- BeNours

BUG: Remove my previous hack now this is properly fixed in gdcmBinEntry by JPR

Add some commented out lines to prepare future version of 'Full DICOMDIR' stuff

   * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
     we have the same serie or the same study UID
   -- BeNours

fix misstyping (while removing spurious tab characters :-(

   * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
     string type
   * src/gdcmDict.h : remove commented code
   * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
   * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
   * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
   -- BeNours

   * Remove useless methods added by JPR for Python users. All was already
     made in the swig wrapping (gdcm.i)... promotion to the good type : Bin, Val
     or Seq Entry !!!
   -- BeNours

Add an example to Anonymize a file (Loadong or not the pixels)

Typo

* Add method File::AnonymizeNoLoad, to allow anomymizing files
           even when the pixels are not gdcm Readable
 * Add methods File::AddAnonymizeElement and File::ClearAnonymizeList
            to allow user to choose the elements whose value
he wants to white out / replace

Update comments for DicomDir stuff

After scanning DICOMDIR from 17 different sources, add a few entries
   DicomDir.dic

COMP: Fix warnings about unused function

BUG: ctest is parsing the ouput of the test and was finding the keyword /Error/ thus believed the test is failing...

COMP: Remove warning about unused var

ENH: It's 10pm gdcm is working on big endian plateform, thanks to a special kludge. I dont care how you fix it, I am not working anymore on the big endian thingy !

ENH: Need to include iostream

BUG: JP, please next time reread your code or at least TRY IT !
     Anyway I still have no clue what OB is versue OW. It seems TestWriteSimple should be explicitely setting it. Or gdcm should be smart enought so that in case of 16 biuts image to set it properly...

BUG: Apparently on Borland uses unsigned char to store boolean, all other plateformns uses int for some reason. STYLE: Reneme gdcmVerboseMacro to gdcmWarningMacro it makes more sense to me

STYLE: Please stop using cout, you have a much more enhance version: gdcmDebug/Verbose/ErrorMacro

BUG: Please disable copy/paste from your editor

BUG: Solve seg fault with SerieHelper by properly using sort algorithm when needed. STL rocks. Also removed weird Print method that borke consistency and properly redo it according to other classes.

BUG: For some reason the Sun compiler produce incoherent warnings... Borland was complaining about uc vs int cast

ENH: Ease the work for people when they try cross compiling gdcm for Win32 on linux (using gcc)

COMP: Fix -other people- warnings. I guess this is too hard to put proper flags in the ccmake interface...

ENH: Adding jpeg error handling. As quoted we could be more fancy and throw an exception instead of using the gdcmErrorMacro

ENH: Slightly better patch since it avoid reinterpret_cast and ugly typedef

BUG: Fix compilation warning on SunOS-CC: Warning (Anachronism): Assigning void(*)(jpeg_decompress_struct*,long) to extern C void(*)(jpeg_decompress_struct*,long). This is not safe to pass a function pointer from a C context to a C++ context. Explicitely reinterpret_cast it.

Some more Doxygenation

 * Add GetFirstValEntry + GetNexxtValEntry, for Python users
 * Some more Doxygenation + typo fixing

   * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
     The static array contained pointers to non-static values (comming from
     strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
     static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
     been replaced by repeted lines to insert values in the File. Finally,
     it removes memory leaks.
   -- BeNours

   * oups, revert my last commit

   * FIX : bug for a bad directory

Fix Doxygen warning

FIX: replaced gdcmSerieHeader.h by gdcmSerieHelper.h

Name normalization

Add a skeletton program for newbees

Typo normalization

To improve test coverage

ENH: Adding two different viewer. One using vtkImageViewer and the other vtkImageViewer2, I guess this should be more intelligent to only have one executable + switch...

ENH: Long time I wanted to do that: rename Test into Testing. So that 'make test' can also work on non case sensitive system like Mac and Win32. Everything was done on the server side so no history has been lost.