]> Creatis software - CreaPhase.git/blob - octave_packages/m/general/interpn.m
update packages
[CreaPhase.git] / octave_packages / m / general / interpn.m
1 ## Copyright (C) 2007-2012 David Bateman
2 ##
3 ## This file is part of Octave.
4 ##
5 ## Octave is free software; you can redistribute it and/or modify it
6 ## under the terms of the GNU General Public License as published by
7 ## the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8 ## your option) any later version.
9 ##
10 ## Octave is distributed in the hope that it will be useful, but
11 ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12 ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13 ## General Public License for more details.
14 ##
15 ## You should have received a copy of the GNU General Public License
16 ## along with Octave; see the file COPYING.  If not, see
17 ## <http://www.gnu.org/licenses/>.
18
19 ## -*- texinfo -*-
20 ## @deftypefn  {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{v}, @var{y1}, @var{y2}, @dots{})
21 ## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v}, @var{y1}, @var{y2}, @dots{})
22 ## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v}, @var{m})
23 ## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@var{v})
24 ## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@dots{}, @var{method})
25 ## @deftypefnx {Function File} {@var{vi} =} interpn (@dots{}, @var{method}, @var{extrapval})
26 ##
27 ## Perform @var{n}-dimensional interpolation, where @var{n} is at least two.
28 ## Each element of the @var{n}-dimensional array @var{v} represents a value
29 ## at a location given by the parameters @var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{xn}.
30 ## The parameters @var{x1}, @var{x2}, @dots{}, @var{xn} are either
31 ## @var{n}-dimensional arrays of the same size as the array @var{v} in
32 ## the 'ndgrid' format or vectors.  The parameters @var{y1}, etc. respect a
33 ## similar format to @var{x1}, etc., and they represent the points at which
34 ## the array @var{vi} is interpolated.
35 ##
36 ## If @var{x1}, @dots{}, @var{xn} are omitted, they are assumed to be
37 ## @code{x1 = 1 : size (@var{v}, 1)}, etc.  If @var{m} is specified, then
38 ## the interpolation adds a point half way between each of the interpolation
39 ## points.  This process is performed @var{m} times.  If only @var{v} is
40 ## specified, then @var{m} is assumed to be @code{1}.
41 ##
42 ## Method is one of:
43 ##
44 ## @table @asis
45 ## @item 'nearest'
46 ## Return the nearest neighbor.
47 ##
48 ## @item 'linear'
49 ## Linear interpolation from nearest neighbors.
50 ##
51 ## @item 'cubic'
52 ## Cubic interpolation from four nearest neighbors (not implemented yet).
53 ##
54 ## @item 'spline'
55 ## Cubic spline interpolation---smooth first and second derivatives
56 ## throughout the curve.
57 ## @end table
58 ##
59 ## The default method is 'linear'.
60 ##
61 ## If @var{extrapval} is the scalar value, use it to replace the values
62 ## beyond the endpoints with that number.  If @var{extrapval} is missing,
63 ## assume NA.
64 ## @seealso{interp1, interp2, spline, ndgrid}
65 ## @end deftypefn
66
67 function vi = interpn (varargin)
68
69   method = "linear";
70   extrapval = NA;
71   nargs = nargin;
72
73   if (nargin < 1 || ! isnumeric (varargin{1}))
74     print_usage ();
75   endif
76
77   if (ischar (varargin{end}))
78     method = varargin{end};
79     nargs = nargs - 1;
80   elseif (nargs > 1 && ischar (varargin{end - 1}))
81     if (! isnumeric (varargin{end}) || ! isscalar (varargin{end}))
82       error ("interpn: extrapal is expected to be a numeric scalar");
83     endif
84     method = varargin{end - 1};
85     extrapval = varargin{end};
86     nargs = nargs - 2;
87   endif
88
89   if (nargs < 3)
90     v = varargin{1};
91     m = 1;
92     if (nargs == 2)
93       if (ischar (varargin{2}))
94         method = varargin{2};
95       elseif (isnumeric (m) && isscalar (m) && fix (m) == m)
96         m = varargin{2};
97       else
98         print_usage ();
99       endif
100     endif
101     sz = size (v);
102     nd = ndims (v);
103     x = cell (1, nd);
104     y = cell (1, nd);
105     for i = 1 : nd;
106       x{i} = 1 : sz(i);
107       y{i} = 1 : (1 / (2 ^ m)) : sz(i);
108     endfor
109     y{1} = y{1}.';
110     [y{:}] = ndgrid (y{:});
111   elseif (! isvector (varargin{1}) && nargs == (ndims (varargin{1}) + 1))
112     v = varargin{1};
113     sz = size (v);
114     nd = ndims (v);
115     x = cell (1, nd);
116     y = varargin (2 : nargs);
117     for i = 1 : nd;
118       x{i} = 1 : sz(i);
119     endfor
120   elseif (rem (nargs, 2) == 1 && nargs ==
121           (2 * ndims (varargin{ceil (nargs / 2)})) + 1)
122     nv = ceil (nargs / 2);
123     v = varargin{nv};
124     sz = size (v);
125     nd = ndims (v);
126     x = varargin (1 : (nv - 1));
127     y = varargin ((nv + 1) : nargs);
128   else
129     error ("interpn: wrong number or incorrectly formatted input arguments");
130   endif
131
132   if (any (! cellfun ("isvector", x)))
133     for i = 2 : nd
134       if (! size_equal (x{1}, x{i}) || ! size_equal (x{i}, v))
135         error ("interpn: dimensional mismatch");
136       endif
137       idx (1 : nd) = {1};
138       idx (i) = ":";
139       x{i} = x{i}(idx{:})(:);
140     endfor
141     idx (1 : nd) = {1};
142     idx (1) = ":";
143     x{1} = x{1}(idx{:})(:);
144   endif
145
146   method = tolower (method);
147
148   all_vectors = all (cellfun ("isvector", y));
149   different_lengths = numel (unique (cellfun ("numel", y))) > 1;
150   if (all_vectors && different_lengths)
151     [foobar(1:numel(y)).y] = ndgrid (y{:});
152     y = {foobar.y};
153   endif
154
155   if (strcmp (method, "linear"))
156     vi = __lin_interpn__ (x{:}, v, y{:});
157     vi (isna (vi)) = extrapval;
158   elseif (strcmp (method, "nearest"))
159     yshape = size (y{1});
160     yidx = cell (1, nd);
161     for i = 1 : nd
162       y{i} = y{i}(:);
163       yidx{i} = lookup (x{i}, y{i}, "lr");
164     endfor
165     idx = cell (1,nd);
166     for i = 1 : nd
167       idx{i} = yidx{i} + (y{i} - x{i}(yidx{i})(:) >= x{i}(yidx{i} + 1)(:) - y{i});
168     endfor
169     vi = v (sub2ind (sz, idx{:}));
170     idx = zeros (prod (yshape), 1);
171     for i = 1 : nd
172       idx |= y{i} < min (x{i}(:)) | y{i} > max (x{i}(:));
173     endfor
174     vi(idx) = extrapval;
175     vi = reshape (vi, yshape);
176   elseif (strcmp (method, "spline"))
177     if (any (! cellfun ("isvector", y)))
178       for i = 2 : nd
179         if (! size_equal (y{1}, y{i}))
180           error ("interpn: dimensional mismatch");
181         endif
182         idx (1 : nd) = {1};
183         idx (i) = ":";
184         y{i} = y{i}(idx{:});
185       endfor
186       idx (1 : nd) = {1};
187       idx (1) = ":";
188       y{1} = y{1}(idx{:});
189     endif
190
191     vi = __splinen__ (x, v, y, extrapval, "interpn");
192
193     if (size_equal (y{:}))
194       ly = length (y{1});
195       idx = cell (1, ly);
196       q = cell (1, nd);
197       for i = 1 : ly
198         q(:) = i;
199         idx {i} = q;
200       endfor
201       vi = vi (cellfun (@(x) sub2ind (size(vi), x{:}), idx));
202       vi = reshape (vi, size(y{1}));
203     endif
204   elseif (strcmp (method, "cubic"))
205     error ("interpn: cubic interpolation not yet implemented");
206   else
207     error ("interpn: unrecognized interpolation METHOD");
208   endif
209
210 endfunction
211
212 %!demo
213 %! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
214 %! x=[0,1,4]; y=[10,11,12];
215 %! xi=linspace(min(x),max(x),17);
216 %! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
217 %! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"linear").');
218 %! [x,y] = meshgrid(x,y);
219 %! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
220
221 %!demo
222 %! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
223 %! x=[0,1,4]; y=[10,11,12];
224 %! xi=linspace(min(x),max(x),17);
225 %! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
226 %! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"nearest").');
227 %! [x,y] = meshgrid(x,y);
228 %! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
229
230 %!#demo
231 %! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
232 %! x=[0,1,2]; y=[10,11,12];
233 %! xi=linspace(min(x),max(x),17);
234 %! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
235 %! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"cubic").');
236 %! [x,y] = meshgrid(x,y);
237 %! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
238
239 %!demo
240 %! A=[13,-1,12;5,4,3;1,6,2];
241 %! x=[0,1,2]; y=[10,11,12];
242 %! xi=linspace(min(x),max(x),17);
243 %! yi=linspace(min(y),max(y),26)';
244 %! mesh(xi,yi,interpn(x,y,A.',xi,yi,"spline").');
245 %! [x,y] = meshgrid(x,y);
246 %! hold on; plot3(x(:),y(:),A(:),"b*"); hold off;
247
248
249 %!demo
250 %! x = y = z = -1:1;
251 %! f = @(x,y,z) x.^2 - y - z.^2;
252 %! [xx, yy, zz] = meshgrid (x, y, z);
253 %! v = f (xx,yy,zz);
254 %! xi = yi = zi = -1:0.1:1;
255 %! [xxi, yyi, zzi] = ndgrid (xi, yi, zi);
256 %! vi = interpn(x, y, z, v, xxi, yyi, zzi, 'spline');
257 %! mesh (yi, zi, squeeze (vi(1,:,:)));
258
259
260 %!test
261 %! [x,y,z] = ndgrid(0:2);
262 %! f = x+y+z;
263 %! assert (interpn(x,y,z,f,[.5 1.5],[.5 1.5],[.5 1.5]), [1.5, 4.5])
264 %! assert (interpn(x,y,z,f,[.51 1.51],[.51 1.51],[.51 1.51],'nearest'), [3, 6])
265 %! assert (interpn(x,y,z,f,[.5 1.5],[.5 1.5],[.5 1.5],'spline'), [1.5, 4.5])
266 %! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z), f)
267 %! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z,'nearest'), f)
268 %! assert (interpn(x,y,z,f,x,y,z,'spline'), f)
269
270 %!test
271 %! [x, y, z] = ndgrid (0:2, 1:4, 2:6);
272 %! f = x + y + z;
273 %! xi = [0.5 1.0 1.5];
274 %! yi = [1.5 2.0 2.5 3.5];
275 %! zi = [2.5 3.5 4.0 5.0 5.5];
276 %! fi = interpn (x, y, z, f, xi, yi, zi);
277 %! [xi, yi, zi] = ndgrid (xi, yi, zi);
278 %! assert (fi, xi + yi + zi)
279
280 %!test
281 %! xi = 0:2;
282 %! yi = 1:4;
283 %! zi = 2:6;
284 %! [x, y, z] = ndgrid (xi, yi, zi);
285 %! f = x + y + z;
286 %! fi = interpn (x, y, z, f, xi, yi, zi, "nearest");
287 %! assert (fi, x + y + z)
288
289 %!test
290 %! [x,y,z] = ndgrid(0:2);
291 %! f = x.^2+y.^2+z.^2;
292 %! assert (interpn(x,y,-z,f,1.5,1.5,-1.5), 7.5)
293
294 %!test % for Matlab-compatible rounding for 'nearest'
295 %! X = meshgrid (1:4);
296 %! assert (interpn (X, 2.5, 2.5, 'nearest'), 3);
297
298 %!shared z, zout, tol
299 %! z = zeros (3, 3, 3);
300 %! zout = zeros (5, 5, 5);
301 %! z(:,:,1) = [1 3 5; 3 5 7; 5 7 9];
302 %! z(:,:,2) = z(:,:,1) + 2;
303 %! z(:,:,3) = z(:,:,2) + 2;
304 %! for n = 1:5
305 %!   zout(:,:,n) = [1 2 3 4 5;
306 %!                  2 3 4 5 6; 
307 %!                  3 4 5 6 7;
308 %!                  4 5 6 7 8;
309 %!                  5 6 7 8 9] + (n-1);
310 %! end
311 %! tol = 10 * eps;
312 %!assert (interpn (z), zout, tol)
313 %!assert (interpn (z, "linear"), zout, tol)
314 %!assert (interpn (z, "spline"), zout, tol)