octave_packages/m/statistics/distributions/hygecdf.m

   1 ## Copyright (C) 2012 Rik Wehbring
   2 ## Copyright (C) 1997-2012 Kurt Hornik
   3 ##
   4 ## This file is part of Octave.
   5 ##
   6 ## Octave is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7 ## under the terms of the GNU General Public License as published by
   8 ## the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   9 ## your option) any later version.
  10 ##
  11 ## Octave is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13 ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14 ## General Public License for more details.
  15 ##
  16 ## You should have received a copy of the GNU General Public License
  17 ## along with Octave; see the file COPYING.  If not, see
  18 ## <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19
  20 ## -*- texinfo -*-
  21 ## @deftypefn {Function File} {} hygecdf (@var{x}, @var{t}, @var{m}, @var{n})
  22 ## Compute the cumulative distribution function (CDF) at @var{x} of the
  23 ## hypergeometric distribution with parameters @var{t}, @var{m}, and
  24 ## @var{n}.  This is the probability of obtaining not more than @var{x}
  25 ## marked items when randomly drawing a sample of size @var{n} without
  26 ## replacement from a population of total size @var{t} containing
  27 ## @var{m} marked items.
  28 ##
  29 ## The parameters @var{t}, @var{m}, and @var{n} must be positive integers
  30 ## with @var{m} and @var{n} not greater than @var{t}.
  31 ## @end deftypefn
  32
  33 ## Author: KH <Kurt.Hornik@wu-wien.ac.at>
  34 ## Description: CDF of the hypergeometric distribution
  35
  36 function cdf = hygecdf (x, t, m, n)
  37
  38   if (nargin != 4)
  39     print_usage ();
  40   endif
  41
  42   if (!isscalar (t) || !isscalar (m) || !isscalar (n))
  43     [retval, x, t, m, n] = common_size (x, t, m, n);
  44     if (retval > 0)
  45       error ("hygecdf: X, T, M, and N must be of common size or scalars");
  46     endif
  47   endif
  48
  49   if (iscomplex (x) || iscomplex (t) || iscomplex (m) || iscomplex (n))
  50     error ("hygecdf: X, T, M, and N must not be complex");
  51   endif
  52
  53   if (isa (x, "single") || isa (t, "single") || isa (m, "single") || isa (n, "single"))
  54     cdf = NaN (size (x), "single");
  55   else
  56     cdf = NaN (size (x));
  57   endif
  58
  59   ok = ((t >= 0) & (m >= 0) & (n > 0) & (m <= t) & (n <= t) &
  60         (t == fix (t)) & (m == fix (m)) & (n == fix (n)));
  61
  62   if (isscalar (t))
  63     if (ok)
  64       cdf = discrete_cdf (x, 0 : n, hygepdf (0 : n, t, m, n));
  65     endif
  66   else
  67     for i = find (ok(:)')  # Must be row vector arg to for loop
  68       v = 0 : n(i);
  69       cdf(i) = discrete_cdf (x(i), v, hygepdf (v, t(i), m(i), n(i)));
  70     endfor
  71   endif
  72
  73 endfunction
  74
  75
  76 %!shared x,y
  77 %! x = [-1 0 1 2 3];
  78 %! y = [0 1/6 5/6 1 1];
  79 %!assert(hygecdf (x, 4*ones(1,5), 2, 2), y, eps);
  80 %!assert(hygecdf (x, 4, 2*ones(1,5), 2), y, eps);
  81 %!assert(hygecdf (x, 4, 2, 2*ones(1,5)), y, eps);
  82 %!assert(hygecdf (x, 4*[1 -1 NaN 1.1 1], 2, 2), [y(1) NaN NaN NaN y(5)], eps);
  83 %!assert(hygecdf (x, 4, 2*[1 -1 NaN 1.1 1], 2), [y(1) NaN NaN NaN y(5)], eps);
  84 %!assert(hygecdf (x, 4, 5, 2), [NaN NaN NaN NaN NaN]);
  85 %!assert(hygecdf (x, 4, 2, 2*[1 -1 NaN 1.1 1]), [y(1) NaN NaN NaN y(5)], eps);
  86 %!assert(hygecdf (x, 4, 2, 5), [NaN NaN NaN NaN NaN]);
  87 %!assert(hygecdf ([x(1:2) NaN x(4:5)], 4, 2, 2), [y(1:2) NaN y(4:5)], eps);
  88
  89 %% Test class of input preserved
  90 %!assert(hygecdf ([x, NaN], 4, 2, 2), [y, NaN], eps);
  91 %!assert(hygecdf (single([x, NaN]), 4, 2, 2), single([y, NaN]), eps("single"));
  92 %!assert(hygecdf ([x, NaN], single(4), 2, 2), single([y, NaN]), eps("single"));
  93 %!assert(hygecdf ([x, NaN], 4, single(2), 2), single([y, NaN]), eps("single"));
  94 %!assert(hygecdf ([x, NaN], 4, 2, single(2)), single([y, NaN]), eps("single"));
  95
  96 %% Test input validation
  97 %!error hygecdf ()
  98 %!error hygecdf (1)
  99 %!error hygecdf (1,2)
 100 %!error hygecdf (1,2,3)
 101 %!error hygecdf (1,2,3,4,5)
 102 %!error hygecdf (ones(2), ones(3), 1, 1)
 103 %!error hygecdf (1, ones(2), ones(3), 1)
 104 %!error hygecdf (1, 1, ones(2), ones(3))
 105 %!error hygecdf (i, 2, 2, 2)
 106 %!error hygecdf (2, i, 2, 2)
 107 %!error hygecdf (2, 2, i, 2)
 108 %!error hygecdf (2, 2, 2, i)
 109