octave_packages/m/statistics/tests/run_test.m

   1 ## Copyright (C) 1995-2012 Friedrich Leisch
   2 ##
   3 ## This file is part of Octave.
   4 ##
   5 ## Octave is free software; you can redistribute it and/or modify it
   6 ## under the terms of the GNU General Public License as published by
   7 ## the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   8 ## your option) any later version.
   9 ##
  10 ## Octave is distributed in the hope that it will be useful, but
  11 ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  13 ## General Public License for more details.
  14 ##
  15 ## You should have received a copy of the GNU General Public License
  16 ## along with Octave; see the file COPYING.  If not, see
  17 ## <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18
  19 ## -*- texinfo -*-
  20 ## @deftypefn {Function File} {[@var{pval}, @var{chisq}] =} run_test (@var{x})
  21 ## Perform a chi-square test with 6 degrees of freedom based on the
  22 ## upward runs in the columns of @var{x}.  Can be used to test whether
  23 ## @var{x} contains independent data.
  24 ##
  25 ## The p-value of the test is returned in @var{pval}.
  26 ##
  27 ## If no output argument is given, the p-value is displayed.
  28 ## @end deftypefn
  29
  30 ## Author: FL <Friedrich.Leisch@ci.tuwien.ac.at>
  31 ## Description: Run test for independence
  32
  33 function [pval, chisq] = run_test (x)
  34
  35   if (nargin != 1)
  36     print_usage ();
  37   endif
  38
  39   A = [4529.4,  9044.9, 13568,  18091,  22615,  27892;
  40        9044.4, 18097,   27139,  36187,  45234,  55789;
  41       13568,   27139,   40721,  54281,  67852,  83685;
  42       18091,   36187,   54281,  72414,  90470, 111580;
  43       22615,   45234,   67852,  90470, 113262, 139476;
  44       27892,   55789,   83685, 111580, 139476, 172860];
  45
  46   b = [1/6; 5/24; 11/120; 19/720; 29/5040; 1/840];
  47
  48   n = rows (x);
  49   r = run_count (x, 6) - n * b * ones (1, columns(x));
  50
  51   chisq = diag (r' * A * r)' / n;
  52   pval  = chi2cdf (chisq, 6);
  53
  54   if (nargout == 0)
  55     printf("pval: %g\n", pval);
  56   endif
  57
  58 endfunction