]> Creatis software - CreaPhase.git/blob - octave_packages/signal-1.1.3/arburg.m
Add a useful package (from Source forge) for octave
[CreaPhase.git] / octave_packages / signal-1.1.3 / arburg.m
1 %% Copyright (C) 2006 Peter V. Lanspeary <pvl@mecheng.adelaide.edu.au>
2 %%
3 %% This program is free software; you can redistribute it and/or modify it under
4 %% the terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
5 %% Foundation; either version 3 of the License, or (at your option) any later
6 %% version.
7 %%
8 %% This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
9 %% ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
10 %% FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more
11 %% details.
12 %%
13 %% You should have received a copy of the GNU General Public License along with
14 %% this program; if not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
15
16 %% [a,v,k] = arburg(x,poles,criterion)
17 %%
18 %% Calculate coefficients of an autoregressive (AR) model of complex data
19 %% "x" using the whitening lattice-filter method of Burg (1968).  The inverse
20 %% of the model is a moving-average filter which reduces "x" to white noise.
21 %% The power spectrum of the AR model is an estimate of the maximum
22 %% entropy power spectrum of the data.  The function "ar_psd" calculates the
23 %% power spectrum of the AR model.
24 %%
25 %% ARGUMENTS:
26 %%   x         %% [vector] sampled data
27 %%
28 %%   poles     %% [integer scalar] number of poles in the AR model or
29 %%             %%       limit to the number of poles if a
30 %%             %%       valid "stop_crit" is provided.
31 %%
32 %%   criterion %% [optional string arg]  model-selection criterion.  Limits
33 %%             %%       the number of poles so that spurious poles are not 
34 %%             %%       added when the whitened data has no more information
35 %%             %%       in it (see Kay & Marple, 1981). Recognised values are
36 %%             %%  'AKICc' -- approximate corrected Kullback information
37 %%             %%             criterion (recommended),
38 %%             %%   'KIC'  -- Kullback information criterion
39 %%             %%   'AICc' -- corrected Akaike information criterion
40 %%             %%   'AIC'  -- Akaike information criterion
41 %%             %%   'FPE'  -- final prediction error" criterion
42 %%             %% The default is to NOT use a model-selection criterion
43 %%
44 %% RETURNED VALUES:
45 %%   a         %% [polynomial/vector] list of (P+1) autoregression coeffic-
46 %%             %%       ients; for data input x(n) and  white noise e(n),
47 %%             %%       the model is
48 %%             %%                             P+1
49 %%             %%       x(n) = sqrt(v).e(n) + SUM a(k).x(n-k)
50 %%             %%                             k=1
51 %%
52 %%   v         %% [real scalar] mean square of residual noise from the
53 %%             %%       whitening operation of the Burg lattice filter.
54 %%
55 %%   k         %% [column vector] reflection coefficients defining the
56 %%             %%       lattice-filter embodiment of the model
57 %%
58 %% HINTS:
59 %%  (1) arburg does not remove the mean from the data.  You should remove
60 %%      the mean from the data if you want a power spectrum.  A non-zero mean
61 %%      can produce large errors in a power-spectrum estimate.  See
62 %%      "help detrend".
63 %%  (2) If you don't know what the value of "poles" should be, choose the
64 %%      largest (reasonable) value you could want and use the recommended
65 %%      value, criterion='AKICc', so that arburg can find it.
66 %%      E.g. arburg(x,64,'AKICc')
67 %%      The AKICc has the least bias and best resolution of the available
68 %%      model-selection criteria.
69 %%  (3) arburg runs in octave and matlab, does not depend on octave forge
70 %%      or signal-processing-toolbox functions.
71 %%  (4) Autoregressive and moving-average filters are stored as polynomials
72 %%      which, in matlab, are row vectors.
73 %%
74 %% NOTE ON SELECTION CRITERION
75 %%   AIC, AICc, KIC and AKICc are based on information theory.  They  attempt
76 %%   to balance the complexity (or length) of the model against how well the
77 %%   model fits the data.  AIC and KIC are biassed estimates of the asymmetric
78 %%   and the symmetric Kullback-Leibler divergence respectively.  AICc and
79 %%   AKICc attempt to correct the bias. See reference [4].
80 %%
81 %%
82 %% REFERENCES
83 %% [1] John Parker Burg (1968)
84 %%   "A new analysis technique for time series data",
85 %%   NATO advanced study Institute on Signal Processing with Emphasis on
86 %%   Underwater Acoustics, Enschede, Netherlands, Aug. 12-23, 1968.
87 %%
88 %% [2] Steven M. Kay and Stanley Lawrence Marple Jr.:
89 %%   "Spectrum analysis -- a modern perspective",
90 %%   Proceedings of the IEEE, Vol 69, pp 1380-1419, Nov., 1981
91 %%
92 %% [3] William H. Press and Saul A. Teukolsky and William T. Vetterling and
93 %%               Brian P. Flannery
94 %%   "Numerical recipes in C, The art of scientific computing", 2nd edition,
95 %%   Cambridge University Press, 2002 --- Section 13.7.
96 %%
97 %% [4] Abd-Krim Seghouane and Maiza Bekara
98 %%   "A small sample model selection criterion based on Kullback's symmetric
99 %%   divergence", IEEE Transactions on Signal Processing,
100 %%   Vol. 52(12), pp 3314-3323, Dec. 2004
101
102
103 function [varargout] = arburg( x, poles, criterion )
104 %%
105 %% Check arguments
106 if ( nargin < 2 )
107   error( 'arburg(x,poles): Need at least 2 args.' );
108 elseif ( ~isvector(x) || length(x) < 3 )
109   error( 'arburg: arg 1 (x) must be vector of length >2.' );
110 elseif ( ~isscalar(poles) || ~isreal(poles) || fix(poles)~=poles || poles<=0.5)
111   error( 'arburg: arg 2 (poles) must be positive integer.' );
112 elseif ( poles >= length(x)-2 )
113   %% lattice-filter algorithm requires "poles<length(x)"
114   %% AKICc and AICc require "length(x)-poles-2">0
115   error( 'arburg: arg 2 (poles) must be less than length(x)-2.' );
116 elseif ( nargin>2 && ~isempty(criterion) && ...
117          (~ischar(criterion) || size(criterion,1)~=1 ) )
118   error( 'arburg: arg 3 (criterion) must be string.' );
119 else
120   %%
121   %%  Set the model-selection-criterion flags.
122   %%  is_AKICc, isa_KIC and is_corrected are short-circuit flags
123   if ( nargin > 2 && ~isempty(criterion) )
124     is_AKICc = strcmp(criterion,'AKICc');                 %% AKICc
125     isa_KIC  = is_AKICc || strcmp(criterion,'KIC');       %% KIC or AKICc
126     is_corrected = is_AKICc || strcmp(criterion,'AICc');  %% AKICc or AICc
127     use_inf_crit = is_corrected || isa_KIC || strcmp(criterion,'AIC');
128     use_FPE = strcmp(criterion,'FPE');
129     if ( ~use_inf_crit && ~use_FPE )
130       error( 'arburg: value of arg 3 (criterion) not recognised' );
131     end
132   else
133     use_inf_crit = 0;
134     use_FPE = 0;
135   end
136   %%
137   %% f(n) = forward prediction error
138   %% b(n) = backward prediction error
139   %% Storage of f(n) and b(n) is a little tricky. Because f(n) is always
140   %% combined with b(n-1), f(1) and b(N) are never used, and therefore are
141   %% not stored.  Not storing unused data makes the calculation of the
142   %% reflection coefficient look much cleaner :)
143   %% N.B. {initial v} = {error for zero-order model} =
144   %%      {zero-lag autocorrelation} =  E(x*conj(x)) = x*x'/N
145   %%      E = expectation operator
146   N = length(x);
147   k = [];
148   if ( size(x,1) > 1 ) % if x is column vector
149     f = x(2:N);    
150     b = x(1:N-1);
151     v = real(x'*x) / N;
152   else                 % if x is row vector
153     f = x(2:N).';
154     b = x(1:N-1).';
155     v = real(x*x') / N;
156   end
157   %% new_crit/old_crit is the mode-selection criterion
158   new_crit = abs(v);
159   old_crit = 2 * new_crit;
160   for p = 1:poles
161     %%
162     %% new reflection coeff = -2* E(f.conj(b)) / ( E(f^2)+E(b(^2) )
163     last_k= -2 * (b' * f) / ( f' * f + b' * b);
164     %%  Levinson-Durbin recursion for residual
165     new_v = v * ( 1.0 - real(last_k * conj(last_k)) );
166     if ( p > 1 )
167       %%
168       %% Apply the model-selection criterion and break out of loop if it
169       %% increases (rather than decreases).
170       %% Do it before we update the old model "a" and "v".
171       %%
172       %% * Information Criterion (AKICc, KIC, AICc, AIC)
173       if ( use_inf_crit )
174         old_crit = new_crit;
175         %% AKICc = log(new_v)+p/N/(N-p)+(3-(p+2)/N)*(p+1)/(N-p-2);
176         %% KIC   = log(new_v)+           3         *(p+1)/N;
177         %% AICc  = log(new_v)+           2         *(p+1)/(N-p-2);
178         %% AIC   = log(new_v)+           2         *(p+1)/N;
179         %% -- Calculate KIC, AICc & AIC by using is_AKICc, is_KIC and
180         %%    is_corrected to "short circuit" the AKICc calculation.
181         %%    The extra 4--12 scalar arithmetic ops should be quicker than
182         %%    doing if...elseif...elseif...elseif...elseif.  
183         new_crit = log(new_v) + is_AKICc*p/N/(N-p) + ...
184           (2+isa_KIC-is_AKICc*(p+2)/N) * (p+1) / (N-is_corrected*(p+2));
185         if ( new_crit > old_crit )
186           break;
187         end
188       %%
189       %% (FPE) Final prediction error
190       elseif ( use_FPE )
191         old_crit = new_crit;
192         new_crit = new_v * (N+p+1)/(N-p-1);
193         if ( new_crit > old_crit )
194           break;
195         end
196       end
197       %% Update model "a" and "v".
198       %% Use Levinson-Durbin recursion formula (for complex data).
199       a = [ prev_a + last_k .* conj(prev_a(p-1:-1:1))  last_k ];
200     else %% if( p==1 )
201       a = last_k;
202     end
203     k = [ k; last_k ];
204     v = new_v;
205     if ( p < poles )
206       prev_a = a;
207       %%  calculate new prediction errors (by recursion):
208       %%  f(p,n) = f(p-1,n)   + k * b(p-1,n-1)        n=2,3,...n
209       %%  b(p,n) = b(p-1,n-1) + conj(k) * f(p-1,n)    n=2,3,...n
210       %%  remember f(p,1) is not stored, so don't calculate it; make f(p,2)
211       %%  the first element in f.  b(p,n) isn't calculated either.
212       nn = N-p;
213       new_f = f(2:nn) + last_k * b(2:nn);
214       b = b(1:nn-1) + conj(last_k) * f(1:nn-1);
215       f = new_f;
216     end
217   end
218   %% end of for loop
219   %%
220   varargout{1} = [1 a];
221   varargout{2} = v;
222   if ( nargout>=3 )
223     varargout{3} = k;
224   end
225 end 
226 end 
227
228 %%