appli/CTBronchi/CTBronchi_process.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 input=$1
   4 dir=`dirname $input`
   5 base=`basename $1 .mhd`_florez-l
   6 output="$dir/$base"_segmentation.mhd
   7 mori="$dir/$base"_mori.mhd
   8 signal="$dir/$base"_mori_signal.txt
   9 labels="$dir/$base"_labels.mhd
  10 diff="$dir/$base"_diff.mhd
  11 seed="$dir"/seed_florez-l.txt
  12
  13 (>&2 echo -n "Processing $input... ")
  14 echo "************************************************"
  15 ./fpa_CTBronchi_Process \
  16     -in $input \
  17     -out $output \
  18     -seed `cat $seed` \
  19     -out_mori $mori \
  20     -out_signal $signal \
  21     -out_labels $labels \
  22     -out_diff $diff
  23 echo "************************************************"
  24 (>&2 echo "done.")
  25
  26 ## eof - $RCSfile$