appli/CTBronchi/MoriLabelling.h

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   2 // @author Leonardo Florez Valencia
   3 // @email florez-l@javeriana.edu.co
   4 // =========================================================================
   5 #ifndef __CTBronchi__MoriLabelling__h__
   6 #define __CTBronchi__MoriLabelling__h__
   7
   8 #include <map>
   9 #include <fpa/Filters/BaseMarksInterface.h>
  10 #include <fpa/Filters/Image/SeedsFromLabelsInterface.h>
  11 #include <fpa/Filters/Image/DefaultTraits.h>
  12 #include <fpa/Filters/Image/RegionGrow.h>
  13 #include <fpa/Functors/RegionGrow/BinaryThreshold.h>
  14
  15 namespace CTBronchi
  16 {
  17   /**
  18    */
  19   template< class _TInputImage, class _TLabelImage >
  20   class MoriLabellingTraits
  21     : public fpa::Filters::Image::DefaultTraits< _TInputImage, _TLabelImage, typename _TLabelImage::PixelType >
  22   {
  23   public:
  24     typedef _TInputImage TInputImage;
  25     typedef _TLabelImage TLabelImage;
  26     typedef typename TLabelImage::PixelType TLabel;
  27     typedef fpa::Filters::Image::DefaultTraits< TInputImage, TLabelImage, TLabel > Superclass;
  28     typedef typename Superclass::TInternalTraits  TInternalTraits;
  29     typedef typename Superclass::TMarksImage      TMarksImage;
  30     typedef typename Superclass::TFilterInterface TFilterInterface;
  31
  32     typedef fpa::Filters::BaseMarksInterface< TInternalTraits >  TMarksInterface;
  33     typedef fpa::Filters::Image::SeedsFromLabelsInterface< TInternalTraits > TSeedsInterface;
  34   };
  35
  36   /**
  37    */
  38   template< class _TInputImage, class _TLabelImage >
  39   class MoriLabelling
  40     : public fpa::Filters::Image::RegionGrow< _TInputImage, _TLabelImage, typename _TLabelImage::PixelType, CTBronchi::MoriLabellingTraits< _TInputImage, _TLabelImage > >
  41   {
  42   public:
  43     typedef _TInputImage TInputImage;
  44     typedef _TLabelImage TLabelImage;
  45     typedef CTBronchi::MoriLabellingTraits< TInputImage, TLabelImage > TTraits;
  46     fpaTraitsMacro( typename TTraits );
  47
  48     typedef fpa::Filters::Image::RegionGrow< TInputImage, TLabelImage, TMark, TTraits > Superclass;
  49     typedef MoriLabelling                   Self;
  50     typedef itk::SmartPointer< Self >       Pointer;
  51     typedef itk::SmartPointer< const Self > ConstPointer;
  52     typedef fpa::Functors::RegionGrow::BinaryThreshold< TInputValue > TFunctor;
  53
  54   public:
  55     itkNewMacro( Self );
  56     itkTypeMacro( CTBronchi::MoriLabelling, fpa::Filters::Image::RegionGrow );
  57
  58     itkGetConstMacro( LastThreshold, TInputValue );
  59     itkSetMacro( LastThreshold, TInputValue );
  60
  61     fpaFilterInputMacro( InputLabels, TLabelImage );
  62
  63   public:
  64     TInputValue GetUpperThreshold( ) const;
  65     void SetUpperThreshold( TInputValue t );
  66
  67   protected:
  68     MoriLabelling( );
  69     virtual ~MoriLabelling( );
  70
  71     virtual const itk::DataObject* _GetReferenceInput( ) const override;
  72     virtual void _PostComputeOutputValue( TNode& n ) override;
  73
  74   private:
  75     // Purposely not implemented.
  76     MoriLabelling( const Self& other );
  77     Self& operator=( const Self& other );
  78
  79   protected:
  80     typename TFunctor::Pointer m_Functor;
  81     TInputValue m_LastThreshold;
  82   };
  83
  84 } // ecapseman
  85
  86 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
  87 #  include <CTBronchi/MoriLabelling.hxx>
  88 #endif // ITK_MANUAL_INSTANTIATION
  89
  90 #endif // __CTBronchi__MoriLabelling__h__
  91
  92 // eof - $RCSfile$