lib/fpa/Common/Image/PolyLineParametricPathReader.hxx

   1 // =========================================================================
   2 // @author Leonardo Florez Valencia
   3 // @email florez-l@javeriana.edu.co
   4 // =========================================================================
   5 #ifndef __fpa__Common__Image__PolyLineParametricPathReader__hxx__
   6 #define __fpa__Common__Image__PolyLineParametricPathReader__hxx__
   7
   8 // -------------------------------------------------------------------------
   9 template< class _TPath >
  10 _TPath* fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  11 GetOutput( )
  12 {
  13   return(
  14     itkDynamicCastInDebugMode< TPath* >( this->GetPrimaryOutput( ) )
  15     );
  16 }
  17
  18 // -------------------------------------------------------------------------
  19 template< class _TPath >
  20 _TPath* fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  21 GetOutput( unsigned int i )
  22 {
  23   return(
  24     itkDynamicCastInDebugMode< TPath* >(
  25       this->itk::ProcessObject::GetOutput( i )
  26       )
  27     );
  28 }
  29
  30 // -------------------------------------------------------------------------
  31 template< class _TPath >
  32 void fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  33 GraftOutput( itk::DataObject* out )
  34 {
  35   this->GraftNthOutput( 0, out );
  36 }
  37
  38 // -------------------------------------------------------------------------
  39 template< class _TPath >
  40 void fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  41 GraftOutput(
  42   const typename Superclass::DataObjectIdentifierType& key,
  43   itk::DataObject* out
  44   )
  45 {
  46   if( out == NULL )
  47   {
  48     itkExceptionMacro(
  49       << "Requested to graft output that is a NULL pointer"
  50       );
  51
  52   } // fi
  53   itk::DataObject* output = this->itk::ProcessObject::GetOutput( key );
  54   output->Graft( out );
  55 }
  56
  57 // -------------------------------------------------------------------------
  58 template< class _TPath >
  59 void fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  60 GraftNthOutput( unsigned int i, itk::DataObject* out )
  61 {
  62   if( i >= this->GetNumberOfIndexedOutputs( ) )
  63   {
  64     itkExceptionMacro(
  65       << "Requested to graft output " << i
  66       << " but this filter only has "
  67       << this->GetNumberOfIndexedOutputs( )
  68       << " indexed Outputs."
  69       );
  70
  71   } // fi
  72   this->GraftOutput( this->MakeNameFromOutputIndex( i ), out );
  73 }
  74
  75 // -------------------------------------------------------------------------
  76 template< class _TPath >
  77 itk::DataObject::Pointer
  78 fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  79 MakeOutput( itk::ProcessObject::DataObjectPointerArraySizeType i )
  80 {
  81   return( TPath::New( ).GetPointer( ) );
  82 }
  83
  84 // -------------------------------------------------------------------------
  85 template< class _TPath >
  86 fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
  87 PolyLineParametricPathReader( )
  88   : Superclass( )
  89 {
  90   typename TPath::Pointer out =
  91     static_cast< TPath* >( this->MakeOutput( 0 ).GetPointer( ) );
  92   this->itk::ProcessObject::SetNumberOfRequiredInputs( 0 );
  93   this->itk::ProcessObject::SetNumberOfRequiredOutputs( 1 );
  94   this->itk::ProcessObject::SetNthOutput( 0, out.GetPointer( ) );
  95 }
  96
  97 // -------------------------------------------------------------------------
  98 template< class _TPath >
  99 fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
 100 ~PolyLineParametricPathReader( )
 101 {
 102 }
 103
 104 // -------------------------------------------------------------------------
 105 template< class _TPath >
 106 void fpa::Common::Image::PolyLineParametricPathReader< _TPath >::
 107 GenerateData( )
 108 {
 109   std::string buffer;
 110   std::ifstream file_stream( this->m_FileName.c_str( ) );
 111   if( !file_stream )
 112   {
 113     itkExceptionMacro(
 114       << "Error reading skeleton from \"" << this->m_FileName << "\""
 115       );
 116     return;
 117
 118   } // fi
 119   file_stream.seekg( 0, std::ios::end );
 120   buffer.reserve( ( unsigned int )( file_stream.tellg( ) ) );
 121   file_stream.seekg( 0, std::ios::beg );
 122   buffer.assign(
 123     ( std::istreambuf_iterator< char >( file_stream ) ),
 124     std::istreambuf_iterator< char >( )
 125     );
 126   file_stream.close( );
 127
 128   std::istringstream in( buffer );
 129   unsigned int dim;
 130   in >> dim;
 131   if( dim != TPath::Dimension )
 132   {
 133     itkExceptionMacro(
 134       << "Mismatched path dimension: " << dim
 135       << " != " << TPath::Dimension
 136       );
 137     return;
 138
 139   } // fi
 140
 141   // Read spatial parameters
 142   typename TPath::TSpacing spa;
 143   typename TPath::TDirection dir;
 144   typename TPath::TPoint ori;
 145   for( unsigned int d = 0; d < dim; ++d )
 146     in >> spa[ d ];
 147   for( unsigned int d = 0; d < dim; ++d )
 148     for( unsigned int e = 0; e < dim; ++e )
 149       in >> dir[ d ][ e ];
 150   for( unsigned int d = 0; d < dim; ++d )
 151     in >> ori[ d ];
 152
 153   // Read path
 154   TPath* path = this->GetOutput( );
 155   path->SetSpacing( spa );
 156   path->SetOrigin( ori );
 157   path->SetDirection( dir );
 158
 159   unsigned long pathSize;
 160   in >> pathSize;
 161   for( unsigned long id = 0; id < pathSize; ++id )
 162   {
 163     typename TPath::TIndex idx;
 164     for( unsigned int d = 0; d < dim; ++d )
 165       in >> idx[ d ];
 166     path->AddVertex( idx );
 167
 168   } // rof
 169 }
 170
 171 #endif // __fpa__Common__Image__PolyLineParametricPathReader__hxx__
 172
 173 // eof - $RCSfile$