tests/image/Dijkstra/Identity.cxx

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   2 // @author Leonardo Florez Valencia
   3 // @email florez-l@javeriana.edu.co
   4 // =========================================================================
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   6 #include <itkImage.h>
   7 #include <itkImageFileWriter.h>
   8 #include <fpa/Filters/Image/Dijkstra.h>
   9
  10 // -------------------------------------------------------------------------
  11 const unsigned int Dim = 2;
  12 typedef unsigned char TInputPixel;
  13 typedef float         TOutputPixel;
  14 typedef itk::Image< TInputPixel, Dim >  TInputImage;
  15 typedef itk::Image< TOutputPixel, Dim > TOutputImage;
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  17 // -------------------------------------------------------------------------
  18 int main( int argc, char* argv[] )
  19 {
  20   // Get arguments
  21   if( argc < 5 )
  22   {
  23     std::cerr
  24       << "Usage: " << argv[ 0 ]
  25       << " output_image output_marks output_mst size [seeds]"
  26       << std::endl;
  27     return( 1 );
  28
  29   } // fi
  30   std::string output_image_filename = argv[ 1 ];
  31   std::string output_marks_filename = argv[ 2 ];
  32   std::string output_mst_filename = argv[ 3 ];
  33   TInputImage::SizeType size;
  34   size.Fill( std::atoi( argv[ 4 ] ) );
  35
  36   // Create image
  37   TInputImage::Pointer image = TInputImage::New( );
  38   image->SetRegions( size );
  39   image->Allocate( );
  40   image->FillBuffer( TInputPixel( 1 ) );
  41
  42   // Prepare filter
  43   typedef fpa::Filters::Image::Dijkstra< TInputImage, TOutputImage > TFilter;
  44   TFilter::Pointer filter = TFilter::New( );
  45   filter->SetInput( image );
  46
  47   // Get all seeds
  48   for( int i = 5; i < argc; i += Dim )
  49   {
  50     TInputImage::IndexType seed;
  51     for( int j = 0; j < Dim; ++j )
  52       if( i + j < argc )
  53         seed[ j ] = std::atoi( argv[ i + j ] );
  54     filter->AddSeed( seed );
  55
  56   } // rof
  57
  58   // Execute filter
  59   filter->Update( );
  60
  61   // Save results
  62   typedef itk::ImageFileWriter< TFilter::TOutputImage > TOutputWriter;
  63   TOutputWriter::Pointer output_writer = TOutputWriter::New( );
  64   output_writer->SetInput( filter->GetOutput( ) );
  65   output_writer->SetFileName( output_image_filename );
  66
  67   typedef itk::ImageFileWriter< TFilter::TMarksImage > TMarksWriter;
  68   TMarksWriter::Pointer marks_writer = TMarksWriter::New( );
  69   marks_writer->SetInput( filter->GetMarks( ) );
  70   marks_writer->SetFileName( output_marks_filename );
  71
  72   typedef itk::ImageFileWriter< TFilter::TMST > TMSTWriter;
  73   TMSTWriter::Pointer mst_writer = TMSTWriter::New( );
  74   mst_writer->SetInput( filter->GetMinimumSpanningTree( ) );
  75   mst_writer->SetFileName( output_mst_filename );
  76
  77   try
  78   {
  79     output_writer->Update( );
  80     marks_writer->Update( );
  81     mst_writer->Update( );
  82   }
  83   catch( std::exception& err )
  84   {
  85     std::cerr << "Error caught: " << err.what( ) << std::endl;
  86     return( 1 );
  87
  88   } // yrt
  89
  90   return( 0 );
  91 }
  92
  93 // eof - $RCSfile$