tests/image/Dijkstra_Gaussian.cxx

   1 #include "BaseFunctions.h"
   2 #include <itkImage.h>
   3 #include <fpa/Image/Dijkstra.h>
   4 #include <fpa/Image/Functors/Dijkstra/Gaussian.h>
   5
   6 // -------------------------------------------------------------------------
   7 const unsigned int Dim = 3;
   8 typedef short TPixel;
   9 typedef float TScalar;
  10
  11 typedef itk::Image< TPixel, Dim >                                    TInputImage;
  12 typedef itk::Image< TScalar, Dim >                                  TScalarImage;
  13 typedef fpa::Image::Dijkstra< TInputImage, TScalarImage >                TFilter;
  14 typedef fpa::Image::Functors::Dijkstra::Gaussian< TInputImage, TScalar > TWeight;
  15
  16 // -------------------------------------------------------------------------
  17 int main( int argc, char* argv[] )
  18 {
  19   // Get arguments
  20   if( argc < 7 )
  21   {
  22     std::cerr
  23       << "Usage: " << argv[ 0 ]
  24       << " input_image output_image output_marks alpha beta"
  25       << " stop_at_one_front ..."
  26       << std::endl;
  27     return( 1 );
  28
  29   } // fi
  30   std::string input_image_filename = argv[ 1 ];
  31   std::string output_image_filename = argv[ 2 ];
  32   std::string output_marks_filename = argv[ 3 ];
  33   double alpha = std::atoi( argv[ 4 ] );
  34   double beta = std::atoi( argv[ 5 ] );
  35   bool stop_at_one_front = ( argv[ 6 ][ 0 ] == '1' );
  36
  37   // Create image
  38   TInputImage::Pointer image;
  39   std::string err0 = fpa::tests::image::Read( image, input_image_filename );
  40   if( err0 != "" )
  41   {
  42     std::cerr << "Error caught: " << err0 << std::endl;
  43     return( 1 );
  44
  45   } // fi
  46
  47   // Prepare weight
  48   TWeight::Pointer weight = TWeight::New( );
  49   weight->SetAlpha( alpha );
  50   weight->SetBeta( beta );
  51
  52   // Prepare filter
  53   TFilter::Pointer filter = TFilter::New( );
  54   filter->SetInput( image );
  55   filter->SetWeightFunction( weight );
  56   filter->SetStopAtOneFront( stop_at_one_front );
  57
  58   // Get all seeds
  59   for( int i = 7; i < argc; i += 3 )
  60   {
  61     if( i + 1 < argc )
  62     {
  63       TInputImage::IndexType seed;
  64       seed[ 0 ] = std::atoi( argv[ i ] );
  65       seed[ 1 ] = std::atoi( argv[ i + 1 ] );
  66       seed[ 2 ] = std::atoi( argv[ i + 2 ] );
  67       filter->AddSeed( seed );
  68
  69     } // fi
  70
  71   } // rof
  72
  73   // Execute filter
  74   filter->Update( );
  75
  76   // Save results
  77   std::string err1 =
  78     fpa::tests::image::Write( filter->GetOutput( ), output_image_filename );
  79   std::string err2 =
  80     fpa::tests::image::Write( filter->GetMarks( ), output_marks_filename );
  81   if( err1 != "" ) std::cerr << "Error caught: " << err1 << std::endl;
  82   if( err2 != "" ) std::cerr << "Error caught: " << err2 << std::endl;
  83
  84   return( 0 );
  85 }
  86
  87 // eof - $RCSfile$