tests/image/Dijkstra_Gaussian.cxx

   1 #include "BaseFunctions.h"
   2 #include <itkImage.h>
   3 #include <fpa/Image/Dijkstra.h>
   4 #include <fpa/Image/Functors/Dijkstra/Gaussian.h>
   5
   6 // -------------------------------------------------------------------------
   7 const unsigned int Dim = 2;
   8 typedef unsigned char TPixel;
   9 typedef float         TScalar;
  10
  11 typedef itk::Image< TPixel, Dim >                                    TInputImage;
  12 typedef itk::Image< TScalar, Dim >                                  TScalarImage;
  13 typedef fpa::Image::Dijkstra< TInputImage, TScalarImage >                TFilter;
  14 typedef fpa::Image::Functors::Dijkstra::Gaussian< TInputImage, TScalar > TWeight;
  15
  16 // -------------------------------------------------------------------------
  17 int main( int argc, char* argv[] )
  18 {
  19   // Get arguments
  20   if( argc < 8 )
  21   {
  22     std::cerr
  23       << "Usage: " << argv[ 0 ]
  24       << " input_image output_image output_marks alpha beta"
  25       << " stop_at_one_front visual_debug ..."
  26       << std::endl;
  27     return( 1 );
  28
  29   } // fi
  30   std::string input_image_filename = argv[ 1 ];
  31   std::string output_image_filename = argv[ 2 ];
  32   std::string output_marks_filename = argv[ 3 ];
  33   double alpha = std::atoi( argv[ 4 ] );
  34   double beta = std::atoi( argv[ 5 ] );
  35   bool stop_at_one_front = ( argv[ 6 ][ 0 ] == '1' );
  36   bool visual_debug = ( argv[ 7 ][ 0 ] == '1' );
  37
  38   // Create image
  39   TInputImage::Pointer image;
  40   std::string err0 = fpa::tests::image::Read( image, input_image_filename );
  41   if( err0 != "" )
  42   {
  43     std::cerr << "Error caught: " << err0 << std::endl;
  44     return( 1 );
  45
  46   } // fi
  47
  48   // Interact with image
  49   fpa::tests::image::Viewer< TFilter > viewer( image );
  50   if( visual_debug )
  51   {
  52     viewer.ActivateSeedWidget( );
  53     viewer.Show( );
  54
  55   } // fi
  56
  57   // Prepare weight
  58   TWeight::Pointer weight = TWeight::New( );
  59   weight->SetAlpha( alpha );
  60   weight->SetBeta( beta );
  61
  62   // Prepare filter
  63   TFilter::Pointer filter = TFilter::New( );
  64   filter->SetInput( image );
  65   filter->SetWeightFunction( weight );
  66   filter->SetStopAtOneFront( stop_at_one_front );
  67
  68   // Get all seeds
  69   for( int i = 8; i < argc; i += 2 )
  70   {
  71     if( i + 1 < argc )
  72     {
  73       TInputImage::IndexType seed;
  74       seed[ 0 ] = std::atoi( argv[ i ] );
  75       seed[ 1 ] = std::atoi( argv[ i + 1 ] );
  76       filter->AddSeed( seed );
  77
  78     } // fi
  79
  80   } // rof
  81   viewer.AssociateSeedsTo( filter );
  82
  83   // Prepare visual debug and update
  84   if( visual_debug )
  85     viewer.ObserveFilter( filter );
  86   filter->Update( );
  87
  88   // Save results
  89   std::string err1 =
  90     fpa::tests::image::Write( filter->GetOutput( ), output_image_filename );
  91   std::string err2 =
  92     fpa::tests::image::Write( filter->GetMarks( ), output_marks_filename );
  93   if( err1 != "" ) std::cerr << "Error caught: " << err1 << std::endl;
  94   if( err2 != "" ) std::cerr << "Error caught: " << err2 << std::endl;
  95
  96   return( 0 );
  97 }
  98
  99 // eof - $RCSfile$