tests/image/RegionGrow_BinaryThreshold.cxx

   1 #include "BaseFunctions.h"
   2 #include <itkImage.h>
   3 #include <fpa/Image/RegionGrow.h>
   4 #include <fpa/Base/Functors/RegionGrow/BinaryThreshold.h>
   5
   6 // -------------------------------------------------------------------------
   7 const unsigned int Dim = 3;
   8 typedef short         TInputPixel;
   9 typedef unsigned char TOutputPixel;
  10
  11 typedef itk::Image< TInputPixel, Dim >                      TInputImage;
  12 typedef itk::Image< TOutputPixel, Dim >                     TOutputImage;
  13 typedef fpa::Image::RegionGrow< TInputImage, TOutputImage > TFilter;
  14 typedef fpa::Base::Functors::RegionGrow::BinaryThreshold< TInputPixel > TPredicate;
  15
  16 // -------------------------------------------------------------------------
  17 int main( int argc, char* argv[] )
  18 {
  19   // Get arguments
  20   if( argc < 8 + Dim )
  21   {
  22     std::cerr
  23       << "Usage: " << argv[ 0 ]
  24       << " input_image output_image output_marks"
  25       << " lower upper strict [index/point] ..."
  26       << std::endl;
  27     return( 1 );
  28
  29   } // fi
  30   std::string input_image_filename = argv[ 1 ];
  31   std::string output_image_filename = argv[ 2 ];
  32   std::string output_marks_filename = argv[ 3 ];
  33   TInputPixel lower = TInputPixel( std::atof( argv[ 4 ] ) );
  34   TInputPixel upper = TInputPixel( std::atof( argv[ 5 ] ) );
  35   bool strict = ( argv[ 6 ][ 0 ] == '1' );
  36   std::string seeds_type = argv[ 7 ];
  37
  38   // Create image
  39   TInputImage::Pointer input_image;
  40   std::string err0 =
  41     fpa::tests::image::Read( input_image, input_image_filename );
  42   if( err0 != "" ) std::cerr << err0 << std::endl;
  43
  44   // Prepare predicate
  45   TPredicate::Pointer predicate = TPredicate::New( );
  46   predicate->SetLower( lower );
  47   predicate->SetUpper( upper );
  48   predicate->SetStrict( strict );
  49
  50   // Prepare filter
  51   TFilter::Pointer filter = TFilter::New( );
  52   filter->SetInput( input_image );
  53   filter->SetPredicate( predicate );
  54   filter->SetInsideValue( 255 );
  55   filter->SetOutsideValue( 0 );
  56
  57   // Get all seeds
  58   for( int i = 8; i < argc; i += Dim )
  59   {
  60     if( seeds_type == "index" )
  61     {
  62       TInputImage::IndexType seed;
  63       for( unsigned int d = 0; d < Dim; ++d )
  64         seed[ d ] = std::atoi( argv[ i + d ] );
  65       filter->AddSeed( seed );
  66     }
  67     else
  68     {
  69       TInputImage::PointType seed;
  70       for( unsigned int d = 0; d < Dim; ++d )
  71         seed[ d ] = std::atof( argv[ i + d ] );
  72       filter->AddSeed( seed );
  73
  74     } // fi
  75   } // rof
  76
  77   // Execute filter
  78   filter->Update( );
  79
  80   // Save results
  81   std::string err1 =
  82     fpa::tests::image::Write( filter->GetOutput( ), output_image_filename );
  83   std::string err2 =
  84     fpa::tests::image::Write( filter->GetMarks( ), output_marks_filename );
  85   if( err1 != "" ) std::cerr << err1 << std::endl;
  86   if( err2 != "" ) std::cerr << err2 << std::endl;
  87
  88   return( 0 );
  89 }
  90
  91 // eof - $RCSfile$