Data/Parsers/Simu_Parser.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
   2 <!--
   3         experimentPath     : Absolute path to the folder containing all the experiment data
   4         imageExtension     : Extension of the image files. There is no default value, has to be specified.
   5         commonRoot         : The beginning of the image file names has to be the same. The images should be noted "commonRoot"+"timePoint"+"imageExtension"
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   7         ### listInput ###
   8         inputFolder        : Folder containing the input image sequence
   9         numberOfTimePoints : Number of time points in the sequence. The time points should be comprised between 1 and numberOfTimePoints.
  10         maskImage          : Specify a mask image if you want to process STMS only with the mask pixel values. It has to be stored in the "Mask" folder and to be a binary image (0/1). Set tu null if no mask.
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  12         ### listOutput ###
  13         outputFolder        : Folder containing the output image sequence
  14         commonRoot         : The beginning of the image file names has to be the same. The images will be saved as "commonRoot"+"timePoint"+"scaleParameters"+"imageExtension"
  15 -->
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  17 <STMS_ProcessInfo
  18         experimentPath="/run/media/mure/HDD/Recherche/These/Repositories/Mure/Dev/Cpp/itkSTMS/Data/Images/"
  19         imageExtension=".nii.gz" >
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  21         <listInput
  22                 inputFolder="Simu/"
  23                 commonRoot="Simu"
  24                 maskImage="null"
  25         />
  26
  27         <listOutput
  28                 outputFolder="Simu_Outputs/"
  29                 commonRoot="Simu_STMS_"
  30         />
  31 </STMS_ProcessInfo>