packages/gdcmvtk/src/bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader.h

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la SantÈ)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27 #ifdef _USE_VTK_
  28
  29 #ifndef __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
  30 #define __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
  31
  32 #include "bbgdcmvtk_EXPORT.h"
  33 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
  34 #include "iostream"
  35
  36 #if defined(USE_GDCM)
  37 #include "vtkGdcmReader.h"
  38 #endif
  39
  40 #if defined(USE_GDCM2)
  41 #include "vtkGDCMImageReader.h"
  42 #endif
  43
  44 #include "gdcmFile.h"
  45 #include "gdcmSerieHelper.h"
  46
  47 #include "vtkImageData.h"
  48 namespace bbgdcmvtk
  49 {
  50
  51 class bbgdcmvtk_EXPORT GetXCoherentInfoGdcmReader
  52  :
  53    public bbtk::AtomicBlackBox
  54 {
  55   BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(GetXCoherentInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  56
  57   BBTK_DECLARE_INPUT(In,            std::vector<std::string>);
  58   BBTK_DECLARE_INPUT(IPPSort,       bool);
  59
  60   BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,          vtkImageData *);
  61   BBTK_DECLARE_OUTPUT(IPP,          std::vector<double>);
  62   BBTK_DECLARE_OUTPUT(IOP,          std::vector<double>);
  63   BBTK_DECLARE_OUTPUT(PixelSpacing, std::vector<double>);
  64
  65   BBTK_PROCESS(Process);
  66   void Process();
  67
  68         vtkImageData* CreateDefaultImage();
  69
  70
  71   private:
  72
  73 #if defined USE_GDCM
  74                 GDCM_NAME_SPACE::File *f;
  75                 GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper *sh;
  76                 vtkGdcmReader *reader;
  77 #endif
  78 #if defined USE_GDCM2
  79                 vtkGDCMImageReader *reader;
  80 #endif
  81 };
  82
  83   //=================================================================
  84   // UserBlackBox description
  85 BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(GetXCoherentInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  86 BBTK_NAME("GetXCoherentInfoGdcmReader");
  87 BBTK_AUTHOR("jpr, eduardo");
  88 BBTK_DESCRIPTION("Get Dicom info from a File Set (a list of Dicom image file names) and read (as a vtkImageData)");
  89 BBTK_CATEGORY("");
  90
  91 BBTK_INPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,In,     "List of Dicom image file names", std::vector<std::string>,"");
  92 BBTK_INPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IPPSort,"Sort on Image Position Patient",bool,"");
  93
  94 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,Out,         "Output image",                vtkImageData *,"");
  95 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IPP,         "Image Position (Patient)",    std::vector<double>,"");
  96 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IOP,         "Image Orientation (Patient)", std::vector<double>,"");
  97 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,PixelSpacing,"Pixel Spacing",               std::vector<double>,"");
  98 BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(GetXCoherentInfoGdcmReader);
  99 } // EO namespace bbgdcmvtk
 100
 101 #endif // __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
 102
 103 #endif //_USE_VTK_