packages/gdcmvtk/src/bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader.h

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la SantÈ)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 #ifdef _USE_VTK_
  27
  28 #ifndef __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
  29 #define __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
  30
  31 #include "bbgdcmvtk_EXPORT.h"
  32 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
  33 #include "iostream"
  34
  35 #if defined(USE_GDCM)
  36 #include "vtkGdcmReader.h"
  37 #endif
  38
  39 #if defined(USE_GDCM2)
  40 #include "vtkGDCMImageReader.h"
  41 #endif
  42
  43 #include "gdcmFile.h"
  44 #include "gdcmSerieHelper.h"
  45
  46 #include "vtkImageData.h"
  47 namespace bbgdcmvtk
  48 {
  49
  50 class bbgdcmvtk_EXPORT GetXCoherentInfoGdcmReader
  51  :
  52    public bbtk::AtomicBlackBox
  53 {
  54   BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(GetXCoherentInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  55
  56   BBTK_DECLARE_INPUT(In,            std::vector<std::string>);
  57   BBTK_DECLARE_INPUT(IPPSort,       bool);
  58
  59   BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,          vtkImageData *);
  60   BBTK_DECLARE_OUTPUT(IPP,          std::vector<double>);
  61   BBTK_DECLARE_OUTPUT(IOP,          std::vector<double>);
  62   BBTK_DECLARE_OUTPUT(PixelSpacing, std::vector<double>);
  63
  64   BBTK_PROCESS(Process);
  65   void Process();
  66
  67   private:
  68
  69 #if defined USE_GDCM
  70                 GDCM_NAME_SPACE::File *f;
  71                 GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper *sh;
  72                 vtkGdcmReader *reader;
  73 #endif
  74 #if defined USE_GDCM2
  75                 vtkGDCMImageReader *reader;
  76 #endif
  77 };
  78
  79   //=================================================================
  80   // UserBlackBox description
  81 BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(GetXCoherentInfoGdcmReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  82 BBTK_NAME("GetXCoherentInfoGdcmReader");
  83 BBTK_AUTHOR("jpr, eduardo");
  84 BBTK_DESCRIPTION("Get Dicom info from a File Set (a list of Dicom image file names) and read (as a vtkImageData)");
  85 BBTK_CATEGORY("");
  86
  87 BBTK_INPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,In,     "List of Dicom image file names", std::vector<std::string>,"");
  88 BBTK_INPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IPPSort,"Sort on Image Position Patient",bool,"");
  89
  90 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,Out,         "Output image",                vtkImageData *,"");
  91 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IPP,         "Image Position (Patient)",    std::vector<double>,"");
  92 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,IOP,         "Image Orientation (Patient)", std::vector<double>,"");
  93 BBTK_OUTPUT(GetXCoherentInfoGdcmReader,PixelSpacing,"Pixel Spacing",               std::vector<double>,"");
  94 BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(GetXCoherentInfoGdcmReader);
  95 } // EO namespace bbgdcmvtk
  96
  97 #endif // __bbgdcmvtkGetXCoherentInfoGdcmReader_h_INCLUDED__
  98
  99 #endif //_USE_VTK_