packages/itk/src/bbitkBinaryThresholdImageFilter.h

   1 /*
   2  # ---------------------------------------------------------------------
   3  #
   4  # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5  #                        pour la SantÈ)
   6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9  #
  10  #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11  #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15  #  or in the file LICENSE.txt.
  16  #
  17  #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18  #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19  #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20  #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21  #  liability.
  22  #
  23  #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25  # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27 /*=========================================================================
  28   Program:   bbtk
  29   Module:    $RCSfile: bbitkBinaryThresholdImageFilter.h,v $
  30   Language:  C++
  31   Date:      $Date: 2012/11/16 08:50:39 $
  32   Version:   $Revision: 1.14 $
  33 =========================================================================*/
  34
  35 /* ---------------------------------------------------------------------
  36
  37 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  38 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  39 *
  40 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  41 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  42 *  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  43 *  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  44 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  45 *  or in the file LICENSE.txt.
  46 *
  47 *  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  48 *  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  49 *  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  50 *  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  51 *  liability.
  52 *
  53 *  The fact that you are presently reading this means that you have had
  54 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  55 * ------------------------------------------------------------------------ */
  56
  57
  58 #ifdef _USE_ITK_
  59
  60 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
  61 #include "itkBinaryThresholdImageFilter.h"
  62 #include "bbtkItkBlackBoxMacros.h"
  63 #include "bbitkImage.h"
  64
  65 namespace bbitk
  66 {
  67
  68   //===================================================
  69   template <class T>
  70   class /*BBTK_EXPORT*/ BinaryThresholdImageFilter
  71     :
  72     public bbtk::AtomicBlackBox,
  73     public itk::BinaryThresholdImageFilter<T,T>
  74   {
  75     BBTK_TEMPLATE_BLACK_BOX_INTERFACE(BinaryThresholdImageFilter,
  76                                       bbtk::AtomicBlackBox,T);
  77     typedef itk::BinaryThresholdImageFilter<T,T> itkParent;
  78     BBTK_DECLARE_ITK_INPUT(In,const T*);
  79     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(LowerThreshold,typename T::PixelType);
  80     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(UpperThreshold,typename T::PixelType);
  81     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(InsideValue,typename T::PixelType);
  82     BBTK_DECLARE_ITK_PARAM(OutsideValue,typename T::PixelType);
  83     BBTK_DECLARE_ITK_OUTPUT(Out,T*);
  84     BBTK_ITK_PROCESS();
  85     BBTK_ITK_DELETE();
  86
  87   };
  88   //===================================================
  89
  90   //===================================================
  91   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_TEMPLATE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilter,
  92                                       bbtk::AtomicBlackBox);
  93   BBTK_NAME("BinaryThresholdImageFilter<"+bbtk::TypeName<T>()+">");
  94   BBTK_AUTHOR("laurent.guigues@creatis.insa-lyon.fr");
  95   BBTK_DESCRIPTION("Binarizes an image by thresholding (bbification of itk::BinaryThresholdImageFilter)");
  96   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,In,"Input image",const T*);
  97   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,LowerThreshold,
  98                       "Lower threshold",typename T::PixelType);
  99   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,UpperThreshold,
 100                       "Upper threshold",typename T::PixelType);
 101   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,InsideValue,
 102                       "Output value for pixels inside thresholds",
 103                       typename T::PixelType);
 104   BBTK_TEMPLATE_INPUT(BinaryThresholdImageFilter,OutsideValue,
 105                       "Output value for pixels outside thresholds",
 106                       typename T::PixelType);
 107   BBTK_TEMPLATE_OUTPUT(BinaryThresholdImageFilter,Out,"Output image",T*);
 108   BBTK_END_DESCRIBE_TEMPLATE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilter);
 109   //===================================================
 110
 111
 112   //===================================================
 113   //--
 114   template <class T>
 115   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserSetDefaultValues()
 116   {
 117     bbSetInputLowerThreshold(0);
 118     bbSetInputUpperThreshold(100);
 119     bbSetInputInsideValue(255);
 120     bbSetInputOutsideValue(0);
 121   }
 122   template <class T>
 123   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserInitializeProcessing()
 124   {
 125   }
 126   template <class T>
 127   void BinaryThresholdImageFilter<T>::bbUserFinalizeProcessing()
 128   {
 129   }
 130
 131   //===================================================
 132
 133
 134
 135
 136
 137
 138
 139
 140
 141
 142
 143   //===================================================
 144   // Generic "untemplatized" filter
 145   //===================================================
 146   class /*BBTK_EXPORT*/ BinaryThresholdImageFilterGeneric
 147     :
 148     public bbtk::AtomicBlackBox
 149   {
 150     BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(BinaryThresholdImageFilterGeneric,
 151                                   bbtk::AtomicBlackBox);
 152     BBTK_DECLARE_INPUT(In,anyImagePointer);
 153     BBTK_DECLARE_INPUT(LowerThreshold,double);
 154     BBTK_DECLARE_INPUT(UpperThreshold,double);
 155     BBTK_DECLARE_INPUT(InsideValue,double);
 156     BBTK_DECLARE_INPUT(OutsideValue,double);
 157     BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,anyImagePointer);
 158     BBTK_PROCESS(ProcessSwitch);
 159   private :
 160     inline void ProcessSwitch();
 161     template <class T> void Process();
 162   };
 163   //===================================================
 164
 165
 166   //===================================================
 167
 168   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilterGeneric,
 169                                 bbtk::AtomicBlackBox);
 170   BBTK_NAME("BinaryThresholdImageFilter");
 171   BBTK_AUTHOR("laurent.guigues at creatis.insa-lyon.fr");
 172   BBTK_CATEGORY("filter;image");
 173   BBTK_DESCRIPTION("Binarizes an image by thresholding (generic bbification of itk::BinaryThresholdImageFilter)");
 174   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,In,
 175              "Input image. Can be any itk::Image<T,D>*",anyImagePointer,"");
 176   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,LowerThreshold,
 177              "Lower threshold",double,"");
 178   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,UpperThreshold,
 179              "Upper threshold",double,"");
 180   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,InsideValue,
 181              "Output value for pixels inside thresholds",double,"");
 182   BBTK_INPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,OutsideValue,
 183              "Output value for pixels outside thresholds",double,"");
 184   BBTK_OUTPUT(BinaryThresholdImageFilterGeneric,Out,
 185               "Output image. Of the same type and dimension than the input image",
 186               anyImagePointer,"");
 187   BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(BinaryThresholdImageFilterGeneric);
 188   //===================================================
 189
 190
 191
 192
 193   //===================================================
 194
 195   void BinaryThresholdImageFilterGeneric::ProcessSwitch()
 196   {
 197     BBTK_TEMPLATE_ITK_IMAGE_SWITCH(bbGetInputIn().type(), this->Process);
 198   }
 199   //===================================================
 200
 201
 202   //===================================================
 203
 204   template <class T>
 205   void BinaryThresholdImageFilterGeneric::Process()
 206   {
 207     bbtkDebugMessageInc("Core",9,
 208                         "bbitk::BinaryThresholdImageFilterGeneric::Process<"
 209                         <<bbtk::TypeName<T>()<<">()"<<std::endl);
 210
 211     typedef BinaryThresholdImageFilter<T> FilterType;
 212     typename FilterType::Pointer f = FilterType::New("Temp");
 213           typedef T* TPointer;
 214           f->bbSetInputIn( this->bbGetInputIn().get < TPointer > () );
 215     f->bbSetInputLowerThreshold ( (typename T::PixelType)
 216                                   this->bbGetInputLowerThreshold() );
 217     f->bbSetInputUpperThreshold ( (typename T::PixelType)
 218                                   this->bbGetInputUpperThreshold() );
 219     f->bbSetInputInsideValue ( (typename T::PixelType)
 220                                this->bbGetInputInsideValue() );
 221     f->bbSetInputOutsideValue ( (typename T::PixelType)
 222                                 this->bbGetInputOutsideValue() );
 223     f->bbExecute();
 224     f->bbGetOutputOut()->Register();
 225     this->bbSetOutputOut( f->bbGetOutputOut() );
 226
 227     bbtkDebugDecTab("Core",9);
 228   }
 229
 230   //===================================================
 231
 232
 233
 234
 235
 236
 237
 238
 239 }
 240 // EO namespace bbtk
 241
 242 #endif