packages/vtk/src/bbvtkImageBoundaries.cxx

   1 /*
   2  # ---------------------------------------------------------------------
   3  #
   4  # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5  #                        pour la SantÈ)
   6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9  #
  10  #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11  #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15  #  or in the file LICENSE.txt.
  16  #
  17  #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18  #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19  #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20  #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21  #  liability.
  22  #
  23  #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25  # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27
  28 //=====
  29 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  30 //=====
  31 #include "bbvtkImageBoundaries.h"
  32 #include "bbvtkPackage.h"
  33 namespace bbvtk
  34 {
  35
  36 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(vtk,ImageBoundaries)
  37 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ImageBoundaries,bbtk::AtomicBlackBox);
  38 //=====
  39 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  40 //=====
  41 void ImageBoundaries::Process()
  42 {
  43         printf("bbtk:vtk::ImageBoundaries::Process start\n");
  44         if (bbGetInputIn()!=NULL){
  45                 int i,j,k;
  46                 int ext[6];
  47                 double value;
  48
  49                 bbGetInputIn()->GetWholeExtent(ext);
  50                 int maxX        = ext[1]-ext[0]+1;
  51                 int maxY        = ext[3]-ext[2]+1;
  52                 int maxZ        = ext[5]-ext[4]+1;
  53
  54                 int bXMax       = 0;
  55                 int bYMax       = 0;
  56                 int bZMax       = 0;
  57                 int bXMin       = maxX-1;
  58                 int bYMin       = maxY-1;
  59                 int bZMin       = maxZ-1;
  60
  61                 for (i=0 ; i<maxX ; i++)
  62                 {
  63                         for (j=0 ; j<maxY ; j++)
  64                         {
  65                                 for (k=0 ; k<maxZ ; k++)
  66                                 {
  67                                         value = bbGetInputIn()->GetScalarComponentAsDouble(i, j, k,0);
  68                                         if ( (value>=bbGetInputLowerValue()) && (value<=bbGetInputUpperValue())  )
  69                                         {
  70                                                 if (i<bXMin) bXMin=i;
  71                                                 if (j<bYMin) bYMin=j;
  72                                                 if (k<bZMin) bZMin=k;
  73                                                 if (i>bXMax) bXMax=i;
  74                                                 if (j>bYMax) bYMax=j;
  75                                                 if (k>bZMax) bZMax=k;
  76                                         }
  77                                 } // for k
  78                         } // for j
  79                 } // i
  80
  81                 std::vector<int> tmpIndex;
  82                 std::vector<int> tmpSize;
  83
  84                 if (bXMin>bXMax){
  85                         tmpIndex.push_back(0);
  86                         tmpIndex.push_back(0);
  87                         tmpIndex.push_back(0);
  88                         tmpSize.push_back(1);
  89                         tmpSize.push_back(1);
  90                         tmpSize.push_back(1);
  91                 } else {
  92                         tmpIndex.push_back(bXMin);
  93                         tmpIndex.push_back(bYMin);
  94                         tmpIndex.push_back(bZMin);
  95                         tmpSize.push_back(bXMax-bXMin+1);
  96                         tmpSize.push_back(bYMax-bYMin+1);
  97                         tmpSize.push_back(bZMax-bZMin+1);
  98                 }
  99
 100                 bbSetOutputIndex(tmpIndex);
 101                 bbSetOutputSize(tmpSize);
 102         } else {
 103                 printf("bbtk warnning: bbtk:vtk:ImageBoundaries box, Input image (In) not initialized..\n");
 104         }
 105         printf("bbtk:vtk::ImageBoundaries::Process end\n");
 106 }
 107 //=====
 108 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 109 //=====
 110 void ImageBoundaries::bbUserSetDefaultValues()
 111 {
 112
 113
 114 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 115    bbSetInputIn(NULL);
 116         bbSetInputLowerValue(0);
 117         bbSetInputUpperValue(5000);
 118
 119         std::vector<int> tmpIndex;
 120         tmpIndex.push_back(0);
 121         tmpIndex.push_back(0);
 122         tmpIndex.push_back(0);
 123
 124         std::vector<int> tmpSize;
 125         tmpSize.push_back(1);
 126         tmpSize.push_back(1);
 127         tmpSize.push_back(1);
 128
 129         bbSetOutputIndex(tmpIndex);
 130         bbSetOutputSize(tmpSize);
 131 }
 132 //=====
 133 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 134 //=====
 135 void ImageBoundaries::bbUserInitializeProcessing()
 136 {
 137
 138 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 139 //    Here does nothing
 140 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 141 //    if any
 142
 143
 144 }
 145 //=====
 146 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 147 //=====
 148 void ImageBoundaries::bbUserFinalizeProcessing()
 149 {
 150
 151 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 152 //    Here does nothing
 153 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 154 //    if any
 155
 156 }
 157 }
 158 // EO namespace bbvtk
 159
 160