packages/vtk/src/bbvtkSegmentationConnectivity.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   bbtk
   3   Module:    $RCSfile: bbvtkSegmentationConnectivity.h,v $
   4   Language:  C++
   5   Date:      $Date: 2010/04/08 14:37:59 $
   6   Version:   $Revision: 1.6 $
   7 =========================================================================*/
   8
   9 /* ---------------------------------------------------------------------
  10
  11 * Copyright (c) CREATIS-LRMN (Centre de Recherche en Imagerie Medicale)
  12 * Authors : Eduardo Davila, Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
  13 *
  14 *  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  15 *  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  16 *  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
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  18 *  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  19 *  or in the file LICENSE.txt.
  20 *
  21 *  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
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  26 *
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  28 *  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  29 * ------------------------------------------------------------------------ */
  30
  31
  32 /**
  33  * \brief Short description in one line
  34  *
  35  * Long description which
  36  * can span multiple lines
  37  */
  38 /**
  39  * \file
  40  * \brief Pattern for the definition of a new type of Node (header)
  41  */
  42 /**
  43  * \class bbtk::NodePatern
  44  * \brief Pattern for the definition of a new type of Node
  45  */
  46
  47
  48 #ifdef _USE_VTK_
  49
  50 #ifndef __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
  51 #define __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
  52
  53 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
  54 #include <vtkImageData.h>
  55 #include <vtkImageCast.h>
  56 #include <vtkImageThreshold.h>
  57 #include <vtkImageSeedConnectivity.h>
  58
  59 namespace bbvtk
  60 {
  61
  62   class SegmentationConnectivity
  63     :
  64     public bbtk::AtomicBlackBox
  65   {
  66     BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE(SegmentationConnectivity,bbtk::AtomicBlackBox);
  67     BBTK_DECLARE_INPUT(In,vtkImageData *);
  68     BBTK_DECLARE_INPUT(PositionXYZ,std::vector<int>);
  69     BBTK_DECLARE_INPUT(ThresholdMinMax,std::vector<int>);
  70     BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,vtkImageData *);
  71     BBTK_PROCESS(DoProcess);
  72     void DoProcess();
  73
  74   protected:
  75
  76   private:
  77         vtkImageCast             *cast2;
  78         vtkImageCast             *cast4; // binary segmentation result
  79         vtkImageThreshold        *thresh2;
  80         vtkImageSeedConnectivity *connect2;
  81
  82   };
  83
  84   BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(SegmentationConnectivity,bbtk::AtomicBlackBox);
  85   BBTK_NAME("SegmentationConnectivity");
  86   BBTK_AUTHOR("eduardo.davila [at] creatis.insa-lyon.fr");
  87   BBTK_DESCRIPTION("Segmentation with min max threshold and connectivity");
  88   BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,In,"Input image",vtkImageData *,"");
  89   BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,PositionXYZ,"vector with the Position [x y z]" , std::vector<int>,"");
  90   BBTK_INPUT(SegmentationConnectivity,ThresholdMinMax,"vector with the Threshold [min max]" , std::vector<int>,"");
  91   BBTK_OUTPUT(SegmentationConnectivity,Out,"Result image",vtkImageData *,"");
  92   BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(SegmentationConnectivity);
  93
  94 } // EO namespace bbvtk
  95
  96 #endif //  __bbvtkSegmentationConnectivity_h_INCLUDED__
  97
  98 #endif //_USE_VTK_