packages/vtk/src/bbvtkUnaryOperations.cxx

   1 /*
   2  # ---------------------------------------------------------------------
   3  #
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   5  #                        pour la SantÈ)
   6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9  #
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  12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15  #  or in the file LICENSE.txt.
  16  #
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  22  #
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  24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25  # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27
  28 #include "bbvtkUnaryOperations.h"
  29 #include "bbvtkPackage.h"
  30 namespace bbvtk
  31 {
  32
  33
  34 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(vtk,UnaryOperations)
  35 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(UnaryOperations,bbtk::AtomicBlackBox);
  36 void UnaryOperations::Process()
  37 {
  38
  39 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  40 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  41 //   And print out the output value
  42 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  43 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  44 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  45 //    Where :
  46 //    * NAME is the name of the input/output
  47 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  48 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  49 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  50
  51         if (bbGetInputIn1() == NULL)
  52         {
  53                 std::cout << "Set In1 at least" << std::endl;
  54                 return;
  55         }
  56
  57         ope->SetInput1((vtkDataObject*)bbGetInputIn1());
  58
  59
  60         ope->SetConstantK( bbGetInputInConstant() );
  61 //      ope->SetConstantC(bbGetInputInConstant());
  62
  63         switch (bbGetInputOperation())
  64         {
  65                 case 0:
  66                                 ope->SetOperationToAddConstant();
  67
  68                 break;
  69                 case 1:
  70                                 ope->SetConstantK( -1.0 * bbGetInputInConstant() );
  71                                 ope->SetOperationToAddConstant();
  72                 break;
  73                 case 2:
  74                                 ope->SetOperationToMultiplyByK();
  75 printf("EED UnaryOperations::Process()  2 \n");
  76
  77                 break;
  78                 case 3:
  79                                 ope->SetConstantK( 1.0/bbGetInputInConstant() );
  80                                 ope->SetOperationToMultiplyByK();
  81 printf("EED UnaryOperations::Process()  3 \n");
  82                 break;
  83                 case 4:
  84                          ope->SetOperationToInvert();
  85                 break;
  86                 case 5:
  87
  88                                 ope->SetOperationToSin();
  89                 break;
  90                 case 6:
  91
  92                         ope->SetOperationToCos();
  93
  94                 break;
  95                 case 7:
  96
  97                                 ope->SetOperationToExp();
  98                 break;
  99                 case 8:
 100
 101                                 ope->SetOperationToLog();
 102                 break;
 103                 case 9:
 104                          ope->SetOperationToAbsoluteValue();
 105                 break;
 106                 case 10:
 107                          ope->SetOperationToSquareRoot();
 108                 break;
 109
 110
 111
 112 /* EED 21Juin 2011 Borrame
 113                 case 10:
 114                         substractWithMinimum();
 115                         bbSetOutputOut(constante);
 116                         return;
 117                 break;
 118                 case 11:
 119                         MultiplyBy();
 120                         bbSetOutputOut(constante);
 121                         return;
 122                 break;
 123 */
 124
 125                 default:
 126                         std::cout << "Invalid Operation" << std::endl;
 127                         return;
 128                 break;
 129         }
 130
 131         ope->Modified();
 132         ope->Update();
 133         vtkImageData* salida = ope->GetOutput();
 134
 135         bbSetOutputOut(salida);
 136         bbSignalOutputModification();
 137
 138 }
 139
 140 /* Borrame Eduardo - Juan Pablo
 141 void UnaryOperations::crearPredeterminado()
 142 {
 143         int ext[6];
 144         vtkImageData* inicial = bbGetInputIn1();
 145
 146
 147         if (constante == NULL)
 148         {
 149                 inicial->GetExtent(ext);
 150                 constante = vtkImageData::New();
 151                 constante->SetExtent(ext);
 152                 constante->SetScalarType(inicial->GetScalarType());
 153                 constante->AllocateScalars();
 154                 constante->Update();
 155         }
 156
 157         for (int i=ext[0]; i<=ext[1]; i++)
 158         {
 159                 for (int j=ext[2]; j<=ext[3]; j++)
 160                 {
 161                         for (int k=ext[4]; k<=ext[5]; k++)
 162                         {
 163                                 unsigned short* value = (unsigned short*)constante->GetScalarPointer(i,j,k);
 164                                 *value = bbGetInputInConstant();
 165                         }
 166                 }
 167         }
 168 }
 169 */
 170
 171
 172 void UnaryOperations::substractWithMinimum()
 173 {
 174         int ext[6];
 175         double spc[3];
 176         vtkImageData* inicial = bbGetInputIn1();
 177
 178
 179         if (constante == NULL)
 180         {
 181                 inicial->GetExtent(ext);
 182                 inicial->GetSpacing(spc);
 183                 constante = vtkImageData::New();
 184                 constante->SetExtent(ext);
 185                 constante->SetSpacing(spc);
 186                 constante->SetOrigin(inicial->GetOrigin());
 187                 constante->SetScalarType(inicial->GetScalarType());
 188                 constante->AllocateScalars();
 189                 constante->Update();
 190         }
 191
 192         for (int i=ext[0]; i<=ext[1]; i++)
 193         {
 194                 for (int j=ext[2]; j<=ext[3]; j++)
 195                 {
 196                         for (int k=ext[4]; k<=ext[5]; k++)
 197                         {
 198                                 double temp1 = lector.getPixelValue(i,j,k,inicial);
 199                                 double temp = temp1 - bbGetInputInConstant();
 200                                 if (temp < 0)
 201                                         temp = 0;
 202                                 lector.setPixelValue(i,j,k,constante,temp);
 203                         }
 204                 }
 205         }
 206 }
 207
 208
 209 void UnaryOperations::bbUserSetDefaultValues()
 210 {
 211
 212 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 213 //    Here we initialize the input 'In' to 0
 214    bbSetInputIn1(NULL);
 215    bbSetOutputOut(NULL);
 216    bbSetInputInConstant(0);
 217    bbSetInputOperation(0);
 218    ope = vtkImageMathematics::New();
 219    constante = NULL;
 220 }
 221 void UnaryOperations::bbUserInitializeProcessing()
 222 {
 223
 224 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 225 //    Here does nothing
 226 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 227 //    if any
 228
 229
 230 }
 231 void UnaryOperations::bbUserFinalizeProcessing()
 232 {
 233
 234 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 235 //    Here does nothing
 236 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 237 //    if any
 238
 239 }
 240 }
 241 // EO namespace bbvtk
 242
 243