packages/vtk/src/bbvtkUnaryOperations.cxx

   1 /*
   2  # ---------------------------------------------------------------------
   3  #
   4  # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5  #                        pour la SantÈ)
   6  # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7  # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8  # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9  #
  10  #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
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  12  #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13  #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14  #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15  #  or in the file LICENSE.txt.
  16  #
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  21  #  liability.
  22  #
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  24  #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25  # ------------------------------------------------------------------------ */
  26
  27
  28 #include "bbvtkUnaryOperations.h"
  29 #include "bbvtkPackage.h"
  30 namespace bbvtk
  31 {
  32
  33
  34 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(vtk,UnaryOperations)
  35 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(UnaryOperations,bbtk::AtomicBlackBox);
  36 void UnaryOperations::Process()
  37 {
  38
  39 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  40 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  41 //   And print out the output value
  42 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  43 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  44 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  45 //    Where :
  46 //    * NAME is the name of the input/output
  47 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  48 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  49 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  50
  51         if (bbGetInputIn1() == NULL)
  52         {
  53                 std::cout << "Set In1 at least" << std::endl;
  54                 return;
  55         }
  56
  57         ope->SetInput1((vtkDataObject*)bbGetInputIn1());
  58
  59
  60         ope->SetConstantK( bbGetInputInConstant() );
  61 //      ope->SetConstantC(bbGetInputInConstant());
  62
  63         switch (bbGetInputOperation())
  64         {
  65                 case 0:
  66                                 ope->SetOperationToAddConstant();
  67
  68                 break;
  69                 case 1:
  70                                 ope->SetConstantK( -1.0 * bbGetInputInConstant() );
  71                                 ope->SetOperationToAddConstant();
  72                 break;
  73                 case 2:
  74                                 ope->SetOperationToMultiplyByK();
  75 printf("EED UnaryOperations::Process()  2 \n");
  76
  77                 break;
  78                 case 3:
  79                                 ope->SetConstantK( 1.0/bbGetInputInConstant() );
  80                                 ope->SetOperationToMultiplyByK();
  81 printf("EED UnaryOperations::Process()  3 \n");
  82                 break;
  83                 case 4:
  84                          ope->SetOperationToInvert();
  85                 break;
  86                 case 5:
  87
  88                                 ope->SetOperationToSin();
  89                 break;
  90                 case 6:
  91
  92                         ope->SetOperationToCos();
  93
  94                 break;
  95                 case 7:
  96
  97                                 ope->SetOperationToExp();
  98                 break;
  99                 case 8:
 100
 101                                 ope->SetOperationToLog();
 102                 break;
 103                 case 9:
 104                          ope->SetOperationToAbsoluteValue();
 105                 break;
 106
 107
 108 /* EED 21Juin 2011 Borrame
 109                 case 10:
 110                         substractWithMinimum();
 111                         bbSetOutputOut(constante);
 112                         return;
 113                 break;
 114                 case 11:
 115                         MultiplyBy();
 116                         bbSetOutputOut(constante);
 117                         return;
 118                 break;
 119 */
 120
 121                 default:
 122                         std::cout << "Invalid Operation" << std::endl;
 123                         return;
 124                 break;
 125         }
 126
 127         ope->Update();
 128         vtkImageData* salida = ope->GetOutput();
 129
 130         bbSetOutputOut(salida);
 131         bbSignalOutputModification();
 132
 133 }
 134
 135 /* Borrame Eduardo - Juan Pablo
 136 void UnaryOperations::crearPredeterminado()
 137 {
 138         int ext[6];
 139         vtkImageData* inicial = bbGetInputIn1();
 140
 141
 142         if (constante == NULL)
 143         {
 144                 inicial->GetExtent(ext);
 145                 constante = vtkImageData::New();
 146                 constante->SetExtent(ext);
 147                 constante->SetScalarType(inicial->GetScalarType());
 148                 constante->AllocateScalars();
 149                 constante->Update();
 150         }
 151
 152         for (int i=ext[0]; i<=ext[1]; i++)
 153         {
 154                 for (int j=ext[2]; j<=ext[3]; j++)
 155                 {
 156                         for (int k=ext[4]; k<=ext[5]; k++)
 157                         {
 158                                 unsigned short* value = (unsigned short*)constante->GetScalarPointer(i,j,k);
 159                                 *value = bbGetInputInConstant();
 160                         }
 161                 }
 162         }
 163 }
 164 */
 165
 166
 167 void UnaryOperations::substractWithMinimum()
 168 {
 169         int ext[6];
 170         double spc[3];
 171         vtkImageData* inicial = bbGetInputIn1();
 172
 173
 174         if (constante == NULL)
 175         {
 176                 inicial->GetExtent(ext);
 177                 inicial->GetSpacing(spc);
 178                 constante = vtkImageData::New();
 179                 constante->SetExtent(ext);
 180                 constante->SetSpacing(spc);
 181                 constante->SetOrigin(inicial->GetOrigin());
 182                 constante->SetScalarType(inicial->GetScalarType());
 183                 constante->AllocateScalars();
 184                 constante->Update();
 185         }
 186
 187         for (int i=ext[0]; i<=ext[1]; i++)
 188         {
 189                 for (int j=ext[2]; j<=ext[3]; j++)
 190                 {
 191                         for (int k=ext[4]; k<=ext[5]; k++)
 192                         {
 193                                 double temp1 = lector.getPixelValue(i,j,k,inicial);
 194                                 double temp = temp1 - bbGetInputInConstant();
 195                                 if (temp < 0)
 196                                         temp = 0;
 197                                 lector.setPixelValue(i,j,k,constante,temp);
 198                         }
 199                 }
 200         }
 201 }
 202
 203
 204 void UnaryOperations::bbUserSetDefaultValues()
 205 {
 206
 207 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 208 //    Here we initialize the input 'In' to 0
 209    bbSetInputIn1(NULL);
 210    bbSetOutputOut(NULL);
 211    bbSetInputInConstant(0);
 212    bbSetInputOperation(0);
 213    ope = vtkImageMathematics::New();
 214    constante = NULL;
 215 }
 216 void UnaryOperations::bbUserInitializeProcessing()
 217 {
 218
 219 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 220 //    Here does nothing
 221 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 222 //    if any
 223
 224
 225 }
 226 void UnaryOperations::bbUserFinalizeProcessing()
 227 {
 228
 229 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 230 //    Here does nothing
 231 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 232 //    if any
 233
 234 }
 235 }
 236 // EO namespace bbvtk
 237
 238