]> Creatis software - bbtk.git/commitdiff
#2865 BBTK Feature New Normal - new option in CleanExternalPlane DimImage+2 (Type 1)
authorEduardo DAVILA <eduardo.davila@creatis.insa-lyon.fr>
Tue, 1 Mar 2016 14:14:58 +0000 (15:14 +0100)
committerEduardo DAVILA <eduardo.davila@creatis.insa-lyon.fr>
Tue, 1 Mar 2016 14:14:58 +0000 (15:14 +0100)
packages/std/src/bbstdFilesFromDirectory.cxx
packages/vtk/src/bbvtkCleanExternalPlane.cxx
packages/vtk/src/bbvtkCleanExternalPlane.h
packages/vtk/src/bbvtkCreateImage.cxx

index 05283bcc7017b62055760b9e5a0b1e0fe9695fa5..61fb34c9c5a4e6a2b4bd93446c9367faa5a7e6d7 100644 (file)
@@ -188,7 +188,7 @@ int FilesFromDirectory::Explore(std::string const &dirpath, bool recursive)
   // Real POSIX implementation: scandir is a BSD extension only, and doesn't 
   // work on debian for example
 
-       DIR* dir = opendir(dirName.c_str());
+       DIR* dir = opendir( dirName.c_str() );
        if (!dir)
        {
                return 0;
index c7306d06451dfd0727445ada6899869c7cabf409..b6d8a6eea98b20195626935483d6cecffaf63846 100644 (file)
@@ -35,30 +35,16 @@ namespace bbvtk
 
 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(vtk,CleanExternalPlane)
 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(CleanExternalPlane,bbtk::AtomicBlackBox);
-//===== 
-// Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
-//===== 
-void CleanExternalPlane::Process()
-{
-
-// THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
-//   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
-//   And print out the output value
-// INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
-//    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
-//    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const 
-//    Where :
-//    * NAME is the name of the input/output
-//      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
-//    * TYPE is the C++ type of the input/output
-//      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
 
+//----------------------------------------------------------------------
+void CleanExternalPlane::CleanTypeA(vtkImageData* image)
+{
        if ( bbGetInputIn()!=NULL )
        {
                int i,j;
                int ext[6];
                int dim[3];
-               bbGetInputIn()->GetWholeExtent(ext);
+               image->GetWholeExtent(ext);
                
                dim[0]=ext[1]-ext[0]+1;
                dim[1]=ext[3]-ext[2]+1;
@@ -69,36 +55,104 @@ void CleanExternalPlane::Process()
                {
                        for (j=0 ; j<dim[1] ; j++)
                        {
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (i, j, 0           , 0, 0.0);
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (i, j, dim[2]-1, 0, 0.0);
-                       }
-               }
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (i, j, 0            , 0, 0.0);
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (i, j, dim[2]-1, 0, 0.0);
+                       } // for j
+               }// for i
                
                // YZ plane
                for (i=0 ; i<dim[1] ; i++)
                {
                        for (j=0 ; j<dim[2] ; j++)
                        {
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (0                 , i, j, 0, 0.0);
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (dim[0]-1  , i, j, 0, 0.0);
-                       }
-               }
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (0                  , i, j, 0, 0.0);
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (dim[0]-1   , i, j, 0, 0.0);
+                       } // for j
+               } // for i
                
                // YZ plane
                for (i=0 ; i<dim[0] ; i++)
                {
                        for (j=0 ; j<dim[2] ; j++)
                        {
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (i, 0                      , j, 0, 0.0);
-                               bbGetInputIn()->SetScalarComponentFromDouble (i, dim[1]-1       , j, 0, 0.0);
-                       }
-               }
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (i, 0                       , j, 0, 0.0);
+                               image->SetScalarComponentFromDouble (i, dim[1]-1        , j, 0, 0.0);
+                       } // for j
+               }// for i
+       } // if In
+}
+
+//----------------------------------------------------------------------
+void CleanExternalPlane::CleanTypeB()
+{
+
+       int             ext[6]; 
+       int             dimA[3];        
+       int             dimB[3];        
+       bbGetInputIn()->GetWholeExtent(ext);
+
+       dimA[0] =       ext[1]-ext[0]+1;
+       dimA[1] =       ext[3]-ext[2]+1;
+       dimA[2] =       ext[5]-ext[4]+1;
+
+       dimB[0] =       dimA[0] + 2;
+       dimB[1] =       dimA[1] + 2;
+       dimB[2] =       dimA[2] + 2;
+
        
-               
-       }
-    
+       imageoutput->Initialize();
+       imageoutput->SetScalarType( bbGetInputIn()->GetScalarType() );  
+       imageoutput->SetSpacing( bbGetInputIn()->GetSpacing() );
+       imageoutput->SetDimensions(  dimB[0], dimB[1], dimB[2] );
+       imageoutput->AllocateScalars();
        
-       bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
+
+       int j,k;
+       long sizeBlock= dimA[0] * bbGetInputIn()->GetScalarSize();
+
+       for (j=0;j<dimA[1];j++)
+       {
+               for (k=0;k<dimA[2];k++)
+               {
+                       memcpy(   imageoutput->GetScalarPointer(1,j+1,k+1) , bbGetInputIn()->GetScalarPointer(0,j,k) , sizeBlock );
+               }
+       }
+       imageoutput->Update();
+       imageoutput->Modified();
+}
+
+
+//===== 
+// Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
+//===== 
+void CleanExternalPlane::Process()
+{
+
+// THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
+//   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
+//   And print out the output value
+// INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
+//    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
+//    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const 
+//    Where :
+//    * NAME is the name of the input/output
+//      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
+//    * TYPE is the C++ type of the input/output
+//      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
+
+       if (bbGetInputType()==0)
+       {
+               CleanTypeA( bbGetInputIn() );
+               bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
+       }
+
+       if (bbGetInputType()==1)
+       {
+               CleanTypeB();
+               CleanTypeA(imageoutput);
+               bbSetOutputOut( imageoutput );
+       }
+
 
        
        
@@ -111,7 +165,8 @@ void CleanExternalPlane::bbUserSetDefaultValues()
 
 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX 
 //    Here we initialize the input 'In' to 0
-   bbSetInputIn(0);
+   bbSetInputIn(NULL);
+   bbSetInputType(0);
   
 }
 //===== 
@@ -125,6 +180,7 @@ void CleanExternalPlane::bbUserInitializeProcessing()
 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers 
 //    if any 
 
+       imageoutput = vtkImageData::New();
   
 }
 //===== 
@@ -137,9 +193,9 @@ void CleanExternalPlane::bbUserFinalizeProcessing()
 //    Here does nothing 
 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers 
 //    if any
-  
+       imageoutput->Delete();
 }
-}
-// EO namespace bbvtk
+
+// EO namespace bbvtk
 
 
index 864cb7750738e23213867fbba37ccd04822f7749..d10d165108e36ce545bdac647943fe0a08ed7bdc 100644 (file)
@@ -48,8 +48,14 @@ class bbvtk_EXPORT CleanExternalPlane
 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 //===== 
   BBTK_DECLARE_INPUT(In,vtkImageData*);
+  BBTK_DECLARE_INPUT(Type,int);
   BBTK_DECLARE_OUTPUT(Out,vtkImageData*);
   BBTK_PROCESS(Process);
+
+  vtkImageData* imageoutput;
+  void CleanTypeA(vtkImageData*);
+  void CleanTypeB();
+
   void Process();
 //===== 
 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
@@ -62,6 +68,7 @@ BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX(CleanExternalPlane,bbtk::AtomicBlackBox);
   BBTK_DESCRIPTION("change the gray level of the externals planes of the image to 0 value.");
   BBTK_CATEGORY("filter");
   BBTK_INPUT(CleanExternalPlane,In,"Input image",vtkImageData*,"");
+  BBTK_INPUT(CleanExternalPlane,Type,"0 = (default) not modifie Dimention. 1 = Add outside plane (Dimension of image change)",int,"");
   BBTK_OUTPUT(CleanExternalPlane,Out,"Output image",vtkImageData*,"");
 BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX(CleanExternalPlane);
 //===== 
index 305fec38dac35e0d6b2f7c5d2c5c35d8b11bd57f..e408b930e474f95f4509b3ddd7c9badb96840367 100644 (file)
@@ -54,25 +54,24 @@ void CreateImage::Process()
 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
 
        
-       printf("EED CreateImage::Process Start\n");
 
        double  spc[6];
        int             dim[3]; 
        int             outputformat = VTK_UNSIGNED_SHORT;
        
 
-       if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_BIT")                        outputformat = VTK_BIT;                 // 1
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_CHAR")                  outputformat = VTK_CHAR;                // 2
+       if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_BIT")                                        outputformat = VTK_BIT;                 // 1
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_CHAR")                          outputformat = VTK_CHAR;                // 2
        else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_SIGNED_CHAR")           outputformat = VTK_SIGNED_CHAR;         // 15
        else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_UNSIGNED_CHAR")         outputformat = VTK_UNSIGNED_CHAR;       // 3
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_SHORT")                 outputformat = VTK_SHORT;               // 4
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_SHORT")                         outputformat = VTK_SHORT;               // 4
        else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_UNSIGNED_SHORT")        outputformat = VTK_UNSIGNED_SHORT;      // 5
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_INT")                   outputformat = VTK_INT;                 // 6
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_INT")                           outputformat = VTK_INT;                 // 6
        else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_UNSIGNED_INT")          outputformat = VTK_UNSIGNED_INT;        // 7 
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_LONG")                  outputformat = VTK_LONG;                // 8
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_LONG")                          outputformat = VTK_LONG;                // 8
        else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_UNSIGNED_LONG")         outputformat = VTK_UNSIGNED_LONG;       // 9
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_FLOAT")                 outputformat = VTK_FLOAT;               // 10
-       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_DOUBLE")                outputformat = VTK_DOUBLE;              // 11  
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_FLOAT")                         outputformat = VTK_FLOAT;               // 10
+       else if (bbGetInputOutputFormat()=="VTK_DOUBLE")                        outputformat = VTK_DOUBLE;              // 11  
                
        spc[0] = bbGetInputSpacing()[0];
        spc[1] = bbGetInputSpacing()[1];
@@ -113,7 +112,6 @@ void CreateImage::Process()
                imageoutput->Modified();
                bbSetOutputOut(imageoutput);
 
- printf("EED CreateImage::Process End\n");
 
 }      
        
@@ -166,9 +164,8 @@ void CreateImage::bbUserFinalizeProcessing()
 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers 
 //    if any
        imageoutput->Delete();
-
-}
 }
-// EO namespace bbvtk
+
+}// EO namespace bbvtk