itk/clitkCropLikeImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  20 #define CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkBoundingBoxUtils.h"
  24 #include "clitkImageCommon.h"
  25
  26 // itk
  27 #include <itkImageToImageFilter.h>
  28
  29 namespace clitk {
  30
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32   /*
  33     Perform various cropping operation on a image
  34   */
  35   //--------------------------------------------------------------------
  36
  37   template <class ImageType>
  38   class ITK_EXPORT CropLikeImageFilter: public itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType> {
  39   public:
  40     /** Standard class typedefs. */
  41     typedef CropLikeImageFilter                            Self;
  42     typedef itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType>  Superclass;
  43     typedef itk::SmartPointer<Self>                        Pointer;
  44     typedef itk::SmartPointer<const Self>                  ConstPointer;
  45
  46     /** Method for creation through the object factory. */
  47     itkNewMacro(Self);
  48
  49     /** Run-time type information (and related methods). */
  50     itkTypeMacro(CropLikeImageFilter, ImageToImageFilter);
  51
  52     /** Some convenient typedefs. */
  53     typedef typename ImageType::ConstPointer ImageConstPointer;
  54     typedef typename ImageType::Pointer      ImagePointer;
  55     typedef typename ImageType::PixelType    PixelType;
  56     typedef typename ImageType::RegionType   RegionType;
  57     typedef typename ImageType::PointType    PointType;
  58     typedef typename ImageType::IndexType    IndexType;
  59     typedef typename ImageType::SizeType     SizeType;
  60
  61     /** Image filename for Crop Like */
  62     void SetCropLikeFilename(std::string f);
  63     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like);
  64     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like, int axe);
  65
  66     // Set Background if 'like' is greater than input
  67     itkSetMacro(BackgroundValue, PixelType);
  68     itkGetConstMacro(BackgroundValue, PixelType);
  69
  70     /** ImageDimension constants */
  71     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, ImageType::ImageDimension);
  72
  73     // I dont want to verify inputs information
  74     virtual void VerifyInputInformation() ITK_OVERRIDE { }
  75
  76   protected:
  77     CropLikeImageFilter();
  78     virtual ~CropLikeImageFilter() {}
  79
  80     virtual void GenerateOutputInformation() ITK_OVERRIDE;
  81     virtual void GenerateData() ITK_OVERRIDE;
  82     virtual void GenerateInputRequestedRegion() ITK_OVERRIDE;
  83
  84     PixelType m_BackgroundValue;
  85     RegionType m_OutputRegion;
  86     RegionType m_Region;
  87     std::string m_LikeFilename;
  88     bool m_LikeFilenameIsGiven;
  89     PointType m_Origin;
  90     const itk::ImageBase<ImageDimension> * m_LikeImage;
  91     std::vector<bool> m_CropAlongThisDimension;
  92
  93     PointType m_StartPoint;         // start point in physical world
  94     IndexType m_StartSourceIndex;   // start index in "source" image
  95     IndexType m_StartDestIndex;     // start index in "destination" image
  96
  97     PointType m_StopPoint;         // stop point in physical world
  98     IndexType m_StopSourceIndex;   // stop index in "source" image
  99     IndexType m_StopDestIndex;     // stop index in "destination" image
 100
 101   private:
 102     CropLikeImageFilter(const Self&); //purposely not implemented
 103     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 104
 105   }; // end class
 106   //--------------------------------------------------------------------
 107
 108
 109   //--------------------------------------------------------------------
 110   // Convenient function
 111   template<class ImageType>
 112   typename ImageType::Pointer
 113   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 114                   const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like,
 115                   typename ImageType::PixelType BG);
 116
 117   template<class ImageType>
 118   typename ImageType::Pointer
 119   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 120                   typename itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension>::RegionType * like,
 121                   typename ImageType::PixelType BG);
 122
 123   template<class ImageType>
 124   typename ImageType::Pointer
 125   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 126                   typename itk::BoundingBox<unsigned long, ImageType::ImageDimension>::Pointer bb,
 127                   typename ImageType::PixelType BG);
 128
 129
 130 } // end namespace clitk
 131 //--------------------------------------------------------------------
 132
 133 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 134 #include "clitkCropLikeImageFilter.txx"
 135 #endif
 136
 137 #endif // # CROPLIKEIMAGEFILTER