itk/clitkCropLikeImageFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  20 #define CLITKCROPLIKEIMAGEFILTER_H
  21
  22 // clitk
  23 #include "clitkBoundingBoxUtils.h"
  24 #include "clitkImageCommon.h"
  25
  26 // itk
  27 #include <itkImageToImageFilter.h>
  28
  29 namespace clitk {
  30
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32   /*
  33     Perform various cropping operation on a image
  34   */
  35   //--------------------------------------------------------------------
  36
  37   template <class ImageType>
  38   class ITK_EXPORT CropLikeImageFilter: public itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType> {
  39   public:
  40     /** Standard class typedefs. */
  41     typedef CropLikeImageFilter                            Self;
  42     typedef itk::ImageToImageFilter<ImageType, ImageType>  Superclass;
  43     typedef itk::SmartPointer<Self>                        Pointer;
  44     typedef itk::SmartPointer<const Self>                  ConstPointer;
  45
  46     /** Method for creation through the object factory. */
  47     itkNewMacro(Self);
  48
  49     /** Run-time type information (and related methods). */
  50     itkTypeMacro(CropLikeImageFilter, ImageToImageFilter);
  51
  52     /** Some convenient typedefs. */
  53     typedef typename ImageType::ConstPointer ImageConstPointer;
  54     typedef typename ImageType::Pointer      ImagePointer;
  55     typedef typename ImageType::PixelType    PixelType;
  56     typedef typename ImageType::RegionType   RegionType;
  57     typedef typename ImageType::PointType    PointType;
  58     typedef typename ImageType::IndexType    IndexType;
  59     typedef typename ImageType::SizeType     SizeType;
  60
  61     /** Image filename for Crop Like */
  62     void SetCropLikeFilename(std::string f);
  63     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like);
  64     void SetCropLikeImage(const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like, int axe);
  65
  66     // Set Background if 'like' is greater than input
  67     itkSetMacro(BackgroundValue, PixelType);
  68     itkGetConstMacro(BackgroundValue, PixelType);
  69
  70     /** ImageDimension constants */
  71     itkStaticConstMacro(ImageDimension, unsigned int, ImageType::ImageDimension);
  72
  73     // I dont want to verify inputs information
  74 #if ITK_VERSION_MAJOR <= 4
  75     virtual void VerifyInputInformation() ITK_OVERRIDE { }
  76 #else
  77     virtual void VerifyInputInformation() const ITK_OVERRIDE { }
  78 #endif
  79
  80   protected:
  81     CropLikeImageFilter();
  82     virtual ~CropLikeImageFilter() {}
  83
  84     virtual void GenerateOutputInformation() ITK_OVERRIDE;
  85     virtual void GenerateData() ITK_OVERRIDE;
  86     virtual void GenerateInputRequestedRegion() ITK_OVERRIDE;
  87
  88     PixelType m_BackgroundValue;
  89     RegionType m_OutputRegion;
  90     RegionType m_Region;
  91     std::string m_LikeFilename;
  92     bool m_LikeFilenameIsGiven;
  93     PointType m_Origin;
  94     const itk::ImageBase<ImageDimension> * m_LikeImage;
  95     std::vector<bool> m_CropAlongThisDimension;
  96
  97     PointType m_StartPoint;         // start point in physical world
  98     IndexType m_StartSourceIndex;   // start index in "source" image
  99     IndexType m_StartDestIndex;     // start index in "destination" image
 100
 101     PointType m_StopPoint;         // stop point in physical world
 102     IndexType m_StopSourceIndex;   // stop index in "source" image
 103     IndexType m_StopDestIndex;     // stop index in "destination" image
 104
 105   private:
 106     CropLikeImageFilter(const Self&); //purposely not implemented
 107     void operator=(const Self&); //purposely not implemented
 108
 109   }; // end class
 110   //--------------------------------------------------------------------
 111
 112
 113   //--------------------------------------------------------------------
 114   // Convenient function
 115   template<class ImageType>
 116   typename ImageType::Pointer
 117   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 118                   const itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension> * like,
 119                   typename ImageType::PixelType BG);
 120
 121   template<class ImageType>
 122   typename ImageType::Pointer
 123   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 124                   typename itk::ImageBase<ImageType::ImageDimension>::RegionType * like,
 125                   typename ImageType::PixelType BG);
 126
 127   template<class ImageType>
 128   typename ImageType::Pointer
 129   ResizeImageLike(const ImageType * input,
 130                   typename itk::BoundingBox<unsigned long, ImageType::ImageDimension>::Pointer bb,
 131                   typename ImageType::PixelType BG);
 132
 133
 134 } // end namespace clitk
 135 //--------------------------------------------------------------------
 136
 137 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 138 #include "clitkCropLikeImageFilter.txx"
 139 #endif
 140
 141 #endif // # CROPLIKEIMAGEFILTER