registration/clitkDeformationListStatisticsFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef __clitkDeformationListStatistics_h
  19 #define __clitkDeformationListStatistics_h
  20 #include "clitkImageCommon.h"
  21 #include "clitkList.h"
  22 #include "clitkLists.h"
  23
  24 //itk include
  25 #include "itkLightObject.h"
  26 #include "itkImage.h"
  27 #include "itkImageRegionIterator.h"
  28 #include "itkImageRegionIteratorWithIndex.h"
  29 #include "itkNumericTraits.h"
  30 #if ITK_VERSION_MAJOR <= 4
  31 #include "itkSimpleFastMutexLock.h"
  32 #else
  33 #include <mutex>
  34 #endif
  35 #include "itkImageMaskSpatialObject.h"
  36
  37 namespace clitk
  38 {
  39
  40   template < class ListItemType >
  41   class ITK_EXPORT DeformationListStatisticsFilter : public itk::LightObject
  42
  43   {
  44   public:
  45     typedef DeformationListStatisticsFilter     Self;
  46     typedef itk::LightObject    Superclass;
  47     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  48     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  49
  50
  51     /** Method for creation through the object factory. */
  52     itkNewMacro(Self);
  53
  54      //====================================
  55     //Typedefs
  56     typedef typename ListItemType::ValueType ValueType;
  57     itkStaticConstMacro(Dimension, unsigned int, ListItemType::Dimension);
  58     //typedef itk::Vector<ValueType, Dimension> ListItemType;
  59     typedef std::vector<ValueType> ValueListType;
  60     typedef clitk::List<ListItemType> ListType;
  61     typedef clitk::Lists<ListItemType> ListsType;
  62
  63     //====================================
  64     //Get
  65     void GetStatistics( const ListType &,  ValueType & mean, ValueType & sd, ValueType & max);
  66     void GetStatistics( const ListsType &,  ValueListType & mean, ValueListType & sd, ValueListType & max);
  67     void GetStatistics( const ListsType &,  ValueType & mean , ValueType & sd, ValueType & max, ValueListType & meanList, ValueListType & sdList, ValueListType & maxList);
  68
  69     void GetStatistics( const ListType &, ListItemType & meanXYZ, ListItemType & sdXYZ, ListItemType & maxXYZ );
  70     void GetStatistics( const ListsType &, ListType & meanXYZ, ListType & sdXYZ, ListType & maxXYZ );
  71     void GetStatistics( const ListsType &, ListItemType & mean , ListItemType & sd, ListItemType & max, ListType & meanXYZList, ListType & sdXYZList, ListType & maxXYZList );
  72
  73   protected:
  74     DeformationListStatisticsFilter(){};
  75     ~DeformationListStatisticsFilter() {};
  76
  77   private:
  78
  79   };
  80
  81
  82
  83
  84
  85 } // end namespace clitk
  86 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
  87 #include "clitkDeformationListStatisticsFilter.txx"
  88 #endif
  89
  90 #endif // #define __clitkDeformationListStatistics_h