registration/clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef _clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter_h
  19 #define _clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter_h
  20 /**
  21    =================================================
  22    * @file   clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter.h
  23    * @author Jef Vandemeulebroucke <jef@creatis.insa-lyon.fr>
  24    * @date   14 March 2009
  25    *
  26    * @brief
  27    *
  28    =================================================*/
  29
  30 // clitk
  31 #include "clitkIO.h"
  32 #include "clitkCommon.h"
  33 #include "clitkDemonsDeformableRegistration_ggo.h"
  34 #include "clitkDifferenceImageFilter.h"
  35 #include "clitkMultiResolutionPDEDeformableRegistration.h"
  36
  37 // itk include
  38 #include "itkMultiResolutionPDEDeformableRegistration.h"
  39 #include "itkPDEDeformableRegistrationFilter.h"
  40 #include "itkDemonsRegistrationFilter.h"
  41 #include "itkSymmetricForcesDemonsRegistrationFilter.h"
  42 #include "itkFastSymmetricForcesDemonsRegistrationFilter.h"
  43 #include "itkDiffeomorphicDemonsRegistrationFilter.h"
  44 #include "itkRecursiveMultiResolutionPyramidImageFilter.h"
  45 #include "itkImageFileReader.h"
  46 #include "itkImageFileWriter.h"
  47 #include "itkCommand.h"
  48 #include "itkWarpImageFilter.h"
  49 #include "itkLightObject.h"
  50
  51
  52 namespace clitk
  53 {
  54
  55   class ITK_EXPORT DemonsDeformableRegistrationGenericFilter : public itk::LightObject
  56
  57   {
  58   public:
  59     typedef DemonsDeformableRegistrationGenericFilter  Self;
  60     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  61     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  62     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  63
  64     /** Method for creation through the object factory. */
  65     itkNewMacro(Self);
  66
  67     /** Run-time type information (and related methods) */
  68     itkTypeMacro( DemonsDeformableRegistrationGenericFilter, LightObject );
  69
  70
  71     //====================================================================
  72     // Set methods
  73     void SetArgsInfo(const args_info_clitkDemonsDeformableRegistration a)
  74     {
  75       m_ArgsInfo=a;
  76       m_ReferenceFileName=m_ArgsInfo.reference_arg;
  77       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  78     }
  79
  80     //====================================================================
  81     // Update
  82     virtual void Update();
  83
  84   protected:
  85     //const char * GetNameOfClass() const { return "DemonsDeformableRegistrationGenericFilter"; }
  86
  87     //====================================================================
  88     // Constructor & Destructor
  89     DemonsDeformableRegistrationGenericFilter();
  90     ~DemonsDeformableRegistrationGenericFilter(){;}
  91
  92     //====================================================================
  93     //Protected member functions
  94     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
  95     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
  96
  97     args_info_clitkDemonsDeformableRegistration m_ArgsInfo;
  98     bool m_Verbose;
  99     std::string m_ReferenceFileName;
 100
 101   };
 102
 103 } // end namespace clitk
 104 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 105 #include "clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter.txx"
 106 #endif
 107
 108 #endif //#define _clitkDemonsDeformableRegistrationGenericFilter_h
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